FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5935, 311 aa
1>>>pF1KE5935 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4116+/-0.00128; mu= 14.8994+/- 0.075
mean_var=145.3649+/-50.896, 0's: 0 Z-trim(101.3): 377 B-trim: 785 in 2/45
Lambda= 0.106376
statistics sampled from 5977 (6466) to 5977 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 2070 330.4 1.1e-90
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CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1315 214.5 8.6e-56
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1283 209.6 2.6e-54
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1267 207.1 1.4e-53
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CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1102 181.8 6e-46
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1094 180.6 1.4e-45
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1092 180.3 1.8e-45
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1076 177.8 9.5e-45
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1072 177.2 1.5e-44
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CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1037 171.9 6.3e-43
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1034 171.4 8.2e-43
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1017 168.8 5.1e-42
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1017 168.8 5.2e-42
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1008 167.4 1.3e-41
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CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 917 153.4 2.1e-37
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 903 151.3 9.3e-37
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 890 149.3 4e-36
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 879 147.6 1.2e-35
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 876 147.1 1.7e-35
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 851 143.3 2.3e-34
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 803 135.9 3.9e-32
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 794 134.5 1e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 790 133.9 1.6e-31
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 786 133.4 2.6e-31
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 749 127.6 1.2e-29
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 748 127.5 1.4e-29
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 736 125.6 4.8e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 708 121.3 9.6e-28
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 683 117.5 1.4e-26
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 627 108.9 5.2e-24
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 609 106.1 3.5e-23
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2070 init1: 2070 opt: 2070 Z-score: 1741.4 bits: 330.4 E(32554): 1.1e-90
Smith-Waterman score: 2070; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RERVLYVFTKK
:::::::::::
CCDS31 RERVLYVFTKK
310
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1351 init1: 1327 opt: 1334 Z-score: 1130.8 bits: 217.4 E(32554): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 1334; 59.4% identity (87.4% similar) in 310 aa overlap (1-310:5-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQT
: :.. ::: .:.:.::::::: :.::. :: :::::::::...:.::..::.
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LREPMFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEV
:.:::.::::.:..:::.:::...:.:::::::...::..:.:...::.:: ::.::. :
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LLAMAFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHII
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CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 AHSYCEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQL
:.::::::::.:.:..:..: .:: .:...:...:: .::: :: ::: ::: .:.:
CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVR
:::.:::.:.::: .:. :. ::::::::::.:: ::::..::::...::.:::.:::::
CCDS31 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TKQIRERVLYVFTKK
::::::::: .: :
CCDS31 TKQIRERVLRIFLKTNH
310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1309 init1: 1280 opt: 1315 Z-score: 1115.1 bits: 214.5 E(32554): 8.6e-56
Smith-Waterman score: 1315; 58.0% identity (87.3% similar) in 307 aa overlap (5-311:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
: . :.: :.:.:::::. .:.::: ::: :::.:..:: :::.:::.:..:..:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
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pF1KE5 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
::::::.:: :::.:::...:.:::::::. .::..:.:. :::.:: :::::. .:..:
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
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pF1KE5 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
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CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
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pF1KE5 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
::: :.: :.:. :.:: ::::.:.:.......::. ::: ::::::::::.:..:::..
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
:::.:: :. :: :. :::.:::::..:: :::::.::::...::.:::.:::::::::
CCDS31 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RERVLYVFTKK
::... .:..:
CCDS31 REQIVKIFVQKE
310
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 1345 init1: 1281 opt: 1283 Z-score: 1088.4 bits: 209.6 E(32554): 2.6e-54
Smith-Waterman score: 1283; 56.3% identity (85.9% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
:: : . ::: .:.:.:::::: .:.::. :::.::..::.:: :::::::....:..:
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
::::::.:.: :..:::...:.::::::.. . : . ::..:::.:: :: ::. ::.::
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
:.: :::.: ::.:..:::..:. :.. . .: .....: . :: ::::: :.: :.:
CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
:::::.:.:::..:.:: :::: .. .:.....:..:::.:: ::::::.:.:.::.::
CCDS31 CEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSLS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
:::.:: :: .:: :..:::.:::::...: :::::.::::...:: :::.:::::::::
CCDS31 TCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RERVLYVFTKK
. : .. ..
CCDS31 YKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
310 320
>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1284 init1: 1262 opt: 1267 Z-score: 1075.3 bits: 207.1 E(32554): 1.4e-53
Smith-Waterman score: 1267; 57.5% identity (85.6% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
: . :: .:.:.::::::: :.::. :: ::::.::::::.:..::..::.:.::
CCDS53 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
:.: ::.:..:::.:::...:.:::::::. .::..:. ..:::.:: :: ::. ::.::
CCDS53 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
:::::.:.: :: :. ::::... :. :.: . ...:.:.:. ::::: .:: :.:
CCDS53 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
:::::::.:.:..:..: ..:: .:...:...:: .:.. :: ::: ::: .:.::::.
CCDS53 CEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
:::.:.::: .: :. :::.:: :::.:: ::::..::::...::.:::.:::::::.:
CCDS53 TCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RERVLYVFTKK
:: :: .: :
CCDS53 RETVLRIFFKTDH
310
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1201 init1: 754 opt: 1206 Z-score: 1024.7 bits: 197.8 E(32554): 9.4e-51
Smith-Waterman score: 1206; 56.9% identity (85.2% similar) in 297 aa overlap (11-305:12-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLRE
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CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHA
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]