FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5934, 311 aa
1>>>pF1KE5934 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8627+/-0.00109; mu= 18.1237+/- 0.065
mean_var=134.1980+/-45.677, 0's: 0 Z-trim(103.0): 364 B-trim: 391 in 1/47
Lambda= 0.110714
statistics sampled from 6790 (7224) to 6790 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 2016 334.2 7.7e-92
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1237 209.8 2.2e-54
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1164 198.2 7.3e-51
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1130 192.7 3.1e-49
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 1129 192.6 3.5e-49
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1076 184.1 1.2e-46
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1062 181.8 5.8e-46
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1057 181.1 1e-45
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1055 180.7 1.2e-45
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1054 180.6 1.4e-45
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1051 180.1 1.9e-45
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1043 178.8 4.7e-45
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1042 178.7 5.5e-45
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1039 178.2 7.3e-45
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1039 178.2 7.3e-45
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1033 177.2 1.4e-44
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1033 177.2 1.5e-44
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1032 177.1 1.6e-44
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1028 176.4 2.5e-44
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1027 176.3 2.8e-44
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1022 175.5 4.8e-44
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1016 174.5 9.2e-44
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1012 173.9 1.5e-43
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1009 173.4 2.1e-43
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1007 173.2 2.7e-43
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1005 172.8 3.2e-43
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 996 171.3 8.5e-43
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 995 171.1 9.6e-43
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 994 171.1 1.2e-42
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 993 170.8 1.2e-42
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 993 170.9 1.2e-42
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 989 170.2 1.9e-42
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 987 169.9 2.3e-42
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 986 169.7 2.6e-42
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 985 169.5 2.9e-42
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 985 169.5 2.9e-42
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 984 169.4 3.2e-42
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 981 168.9 4.5e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 977 168.3 7.2e-42
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 970 167.1 1.5e-41
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 970 167.2 1.5e-41
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 966 166.5 2.4e-41
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 962 165.9 3.7e-41
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 960 165.6 4.6e-41
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 960 165.6 4.7e-41
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 959 165.4 5.1e-41
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 959 165.4 5.2e-41
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 958 165.2 5.7e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 957 165.1 6.6e-41
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 954 164.6 9e-41
>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2016 init1: 2016 opt: 2016 Z-score: 1762.3 bits: 334.2 E(32554): 7.7e-92
Smith-Waterman score: 2016; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVNKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVNKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKVMGSKIHS
:::::::::::
CCDS31 LRKVMGSKIHS
310
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1249 init1: 1228 opt: 1237 Z-score: 1089.8 bits: 209.8 E(32554): 2.2e-54
Smith-Waterman score: 1237; 62.3% identity (84.6% similar) in 305 aa overlap (7-311:8-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTPV
:. . : :::.:: :::.: :::.:: ::.::.:.:.:. ..:... .::::.
CCDS31 MLLTDRNTSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVMA
:::::.::::::::::::.::::.:. ::..::::::.:::..::: ::: :::::::
CCDS31 YFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFFC
::::::::::::: :.::::: : :. : :. ::: . ::.. :. :.::::::
CCDS31 YDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAFS
.. ::::.:::. .:. :::..::.:: :..:.:::: .:..::::..:. .:.::::
CCDS31 EFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVNK
::::::::::. :::::..:: :.: :: . :::.::::::::::::::::::::::.
CCDS31 TCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALRKVMGSKIHS
.. ... .:. :
CCDS31 TVTEILDTKVFSY
310
>>CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 1163 init1: 1141 opt: 1164 Z-score: 1026.6 bits: 198.2 E(32554): 7.3e-51
Smith-Waterman score: 1164; 57.8% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:3-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTP
. ..: :. : : :::.:: ::.. ::..:: .:: ....:::: ..:... .::::
CCDS31 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VYFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVM
.::::.:::::::::::::.: ::.:. .:..::: ::.:::..::: :::..:.:::
CCDS31 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
:::.:::::::::: :..:::: . :. : :..::: . ::.. :. :.:::::
CCDS31 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
:.: :.::. : ... ::: :::.:: :..:::::: .:..: ::. :: ...:.:
CCDS31 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
:::::::::::. :::::..:: :.: :: . :::.::::::::.:::::::::::::.
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KALRKVMGSKIHS
:.::....:
CCDS31 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
310 320
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1117 init1: 1117 opt: 1130 Z-score: 997.4 bits: 192.7 E(32554): 3.1e-49
Smith-Waterman score: 1130; 54.7% identity (82.1% similar) in 307 aa overlap (5-311:7-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTP
: : :.::::::. :::.. :::.:: .:.. :..:.:. ::... .:.::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VYFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVM
.:::::.:::::.:: : ::::::.:.....:.::. :: .:::.::: . :: :.::.:
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 AYDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
::::.::::::::: :.::. . ..: :. :.. ::.:.:.:. . . .:::::::
CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
:::::::.:.:.:.:.:: :: .. : . ..::. ::..:: ..:::.: .:.:.:
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
::::::::..:. .::.:.:: ::: : ..::. .::::. ::.:::::::::::::.
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KALRKVMGSKIHS
: .::. ::. :
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1145 init1: 1121 opt: 1129 Z-score: 996.5 bits: 192.6 E(32554): 3.5e-49
Smith-Waterman score: 1129; 56.7% identity (80.0% similar) in 305 aa overlap (5-309:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTP
: . : :::..: :.:.. :::.:::.: .:...:::: .:... ..:::
CCDS31 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VYFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVM
.:::::::::::::::::..::.: :. ::.: ...::.:..: :: ::: ::::::
CCDS31 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
:::::::::::::: :.:::.: . :.. :. : :. :::. : :::::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
:. :.:.. ::. . . ::: ::.:: :..::::::..:..:.:::.:. .:::::
CCDS31 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
:: :::::.::. :::::..:: :.: :: .. :::.:::::: :::::::::::::::.
CCDS31 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KALRKVMGSKIHS
:. :.. ...
CCDS31 DAFWKLIHTQVPFH
310
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1115 init1: 1073 opt: 1076 Z-score: 950.8 bits: 184.1 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 1076; 52.6% identity (79.6% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTPVY
: :::.....:.:::... ::..: :: .:: .: ... ::::: .::... .::::.:
CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 IPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
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CCDS31 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
250 260 270 280 290 300
310
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:.:.
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310
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CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
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310
pF1KE5 LRKVMGSKIHS
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CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
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CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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CCDS31 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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CCDS31 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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310
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310
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CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
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