Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5933
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5933, 311 aa
1>>>pF1KE5933 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8884+/-0.00121; mu= 12.7830+/- 0.071
mean_var=154.5772+/-50.388, 0's: 0 Z-trim(104.1): 389 B-trim: 855 in 2/46
Lambda= 0.103158
statistics sampled from 7218 (7727) to 7218 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 2.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 2073 321.1 7.1e-88
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1831 285.0 5e-77
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1271 201.8 6.6e-52
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1246 198.0 8e-51
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1245 197.8 9e-51
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1230 195.6 4.2e-50
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1221 194.3 1.1e-49
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1220 194.1 1.2e-49
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1217 193.7 1.6e-49
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1217 193.7 1.6e-49
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1187 189.2 3.6e-48
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1178 187.9 8.9e-48
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1178 187.9 9e-48
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1175 187.4 1.2e-47
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1173 187.1 1.5e-47
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1169 186.5 2.3e-47
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1029 165.7 4.2e-41
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1003 161.8 6.4e-40
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 996 160.8 1.3e-39
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 992 160.2 2e-39
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 989 159.8 2.8e-39
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 973 157.4 1.4e-38
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 972 157.2 1.5e-38
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 971 157.1 1.7e-38
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 970 156.9 1.9e-38
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 956 154.8 8e-38
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 952 154.2 1.2e-37
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 952 154.2 1.2e-37
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 952 154.3 1.3e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 948 153.6 1.8e-37
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 947 153.5 2e-37
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 947 153.5 2e-37
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 946 153.4 2.3e-37
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 941 152.6 3.8e-37
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 936 151.8 6.3e-37
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 934 151.5 7.5e-37
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 932 151.2 9.1e-37
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 931 151.1 1e-36
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 930 151.0 1.2e-36
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 928 150.6 1.4e-36
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 928 150.6 1.4e-36
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 928 150.6 1.4e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 928 150.7 1.4e-36
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 925 150.2 1.9e-36
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 924 150.1 2.2e-36
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 920 149.5 3.2e-36
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 919 149.3 3.6e-36
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 916 148.9 4.9e-36
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 915 148.7 5.4e-36
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 913 148.4 6.7e-36
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 2073 init1: 2073 opt: 2073 Z-score: 1691.1 bits: 321.1 E(32554): 7.1e-88
Smith-Waterman score: 2073; 99.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVQAVLRMQSTTGLQKV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCIYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RGAVKRLMGWE
:::::::::::
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1831 init1: 1831 opt: 1831 Z-score: 1496.4 bits: 285.0 E(32554): 5e-77
Smith-Waterman score: 1831; 88.6% identity (95.4% similar) in 306 aa overlap (6-311:4-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
: ::::: .:::.::::::.::::.:::.:::::::: ::::::::::.::::::
CCDS43 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
:::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.::::::::: ::::::::
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLRGPEKTISYAGCMVQLYFVLALGITECVLLVV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
::::::.::::::::::::::::::::..:::: ::: ::::::::::::::::: ::::
CCDS43 MSYDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVQAVLRMQSTTGLQKV
::::::::::::::::.::::::. ::::::::::::::.::::..::: ::::::::::
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCIYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
: :::::::.:::::::.::.:::::: :: ::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS43 FRTCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RGAVKRLMGWE
.::.:::.:::
CCDS43 KGAAKRLLGWEWGK
300 310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1271 init1: 1271 opt: 1271 Z-score: 1045.4 bits: 201.8 E(32554): 6.6e-52
Smith-Waterman score: 1271; 60.3% identity (85.8% similar) in 302 aa overlap (7-308:4-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
:: : :::. ::. : ::. ::. :. :..:..::: ::..:..: .:::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
::::::::::.::::::::..::.:::. . .:.:::.::. ::.. ::::.:::.::.:
CCDS46 PMYFFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
: .::..:.::::::...:: :.: ::.:::.:::.::.:.:..:. .:::::..::::
CCDS46 MCFDRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVQAVLRMQSTTGLQKV
::::::::.:::::: .:: :.. : .:.:::. ::: ::. :::::::.::. : .:.
CCDS46 FCEVPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCIYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
:::::.::..::::. :. .:::::: .:.:.::...:: ...: ::::::::::: :
CCDS46 FGTCGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RGAVKRLMGWE
. : :::.
CCDS46 KEAFKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1265 init1: 1239 opt: 1246 Z-score: 1026.0 bits: 198.0 E(32554): 8e-51
Smith-Waterman score: 1246; 59.5% identity (85.2% similar) in 304 aa overlap (5-308:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
: : :: :::.:::. :.::.:.:: ::.:::.::.::. :::.:::: :::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
::::::::::.::.:.::: :: :::: :.:::.:.::. :::. ::::.:::.::.
CCDS31 PMYFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLAD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
:. ::: :::.::::.:.:.::.:. :: ::.::...: .:..::. .::::....:::
CCDS31 MALDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVQAVLRMQSTTGLQKV
.:::::::.:.:::: ::::.:...: .::.:: :: ::: :.:::::..:. . .:.
CCDS31 ICEVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCIYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
:.::..:: .: .:. . .:::: .. .:::::::.::::.:::.:::.::::::: .
CCDS31 FSTCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RGAVKRLMGWE
. :...:.
CCDS31 KEALRKLLSGKL
300
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1264 init1: 1238 opt: 1245 Z-score: 1025.0 bits: 197.8 E(32554): 9e-51
Smith-Waterman score: 1245; 57.5% identity (87.4% similar) in 301 aa overlap (8-308:6-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
:.:: :.:.:::. : ::.:.:.::: ::.....:: .::..:. : ::::
CCDS16 MMEIANVSSPEVFVLLGFSTRPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
::::::.:: :::. .::: .::::.:::::.:::::.::..:.:. ::.::::::..
CCDS16 PMYFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLAT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
::::::::.::::::::.:::..: ::.:::..:.:.: . :..:. .::::. .:::
CCDS16 MSYDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVQAVLRMQSTTGLQKV
:::.: ...:.:::: .::. ....: .::..:: :::.::: :..:::...:. : .:.
CCDS16 FCEMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCIYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
:.::..:. .::::. . .:::: ...:..::::::::::::::.:::::::::: :
CCDS16 FNTCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RGAVKRLMGWE
..:.....
CCDS16 KSALRHMVLENCCGSAGKLAQI
300 310 320
>>CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 (316 aa)
initn: 1249 init1: 1230 opt: 1230 Z-score: 1013.0 bits: 195.6 E(32554): 4.2e-50
Smith-Waterman score: 1230; 57.0% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (7-311:2-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
:: :: :.:.:::. : :: ..::::. ::.::.:: .::.:: : .::.
CCDS46 MVNQSSPMGFLLLGFSEHPALERTLFVVVFTSYLLTLVGNTLIILLSVLYPRLHS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS34 KGALWKVL-WRGRDSG
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CCDS34 TRAFRRLLGKEMGLTQS
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CCDS46 LCEVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKA
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CCDS46 KEGFKRLVARVFLIKK
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