Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5932
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5932, 311 aa
1>>>pF1KE5932 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5571+/-0.000422; mu= 20.1852+/- 0.026
mean_var=102.4825+/-27.471, 0's: 0 Z-trim(110.9): 377 B-trim: 1094 in 1/51
Lambda= 0.126692
statistics sampled from 18801 (19361) to 18801 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 6.470
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 927 180.5 3.8e-45
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 908 177.0 4.2e-44
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 907 176.8 4.8e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 907 176.9 4.9e-44
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 907 176.9 4.9e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 907 176.9 4.9e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 900 175.6 1.2e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 892 174.1 3.2e-43
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 871 170.3 4.6e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 871 170.3 4.6e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 871 170.3 4.7e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 868 169.7 6.8e-42
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 865 169.2 9.8e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 847 165.9 9.6e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 835 163.7 4.3e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 831 163.0 7.3e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 820 160.9 2.9e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 804 158.0 2.2e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 782 154.0 3.6e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 776 152.9 7.8e-37
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 594 119.7 8.1e-27
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 589 118.7 1.5e-26
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 217 50.7 4.3e-06
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 217 50.7 4.3e-06
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 217 50.7 4.3e-06
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 208 49.1 1.4e-05
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 206 48.9 2.1e-05
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 206 48.9 2.1e-05
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 206 48.9 2.1e-05
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 206 48.9 2.1e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 206 48.9 2.1e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 205 48.6 2.2e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 204 48.5 2.5e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 204 48.5 2.5e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 204 48.5 2.5e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 204 48.5 2.5e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 204 48.5 2.6e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 204 48.5 2.6e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 204 48.5 2.6e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 204 48.5 2.7e-05
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 200 47.6 3.9e-05
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 200 47.6 3.9e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 195 46.7 7.3e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 195 46.7 7.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 190 45.8 0.00014
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 187 45.3 0.00021
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 187 45.3 0.00022
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 187 45.3 0.00022
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 183 44.5 0.00033
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 183 44.5 0.00033
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 565 init1: 406 opt: 927 Z-score: 931.5 bits: 180.5 E(85289): 3.8e-45
Smith-Waterman score: 927; 44.2% identity (76.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYD
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPN-LITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYD
70 80 90 100 110
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pF1KE5 RYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLCDA
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pF1KE5 PPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQTC
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NP_001 NPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALSTC
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pF1KE5 ASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAVLK
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
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310
pF1KE5 LRDKVAHSQGE
:
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 854 init1: 534 opt: 908 Z-score: 912.7 bits: 177.0 E(85289): 4.2e-44
Smith-Waterman score: 908; 44.2% identity (76.9% similar) in 294 aa overlap (10-301:15-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPE-KTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
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pF1KE5 VMSYDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQH
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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pF1KE5 YLCDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHR
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFQTCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDG--VVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKE
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VKKAVLKLRDKVAHSQGE
:. :: .:
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 907; 47.5% identity (75.1% similar) in 297 aa overlap (4-298:7-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPM
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pF1KE5 SYDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYL
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NP_003 AYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFF
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NP_003 CDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF
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pF1KE5 QTCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVV--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVK
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NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
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300 310
pF1KE5 KAVLKLRDKVAHSQGE
::.
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 907; 47.7% identity (75.8% similar) in 298 aa overlap (7-301:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQ
. ...:::.:::.::..:.:. .. : :..:::..:. .::.:.. :::..::.
XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCASH-CIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVV--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVK
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVA-IFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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300 310
pF1KE5 KAVLKLRDKVAHSQGE
: ::
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 872 init1: 499 opt: 907 Z-score: 911.6 bits: 176.9 E(85289): 4.9e-44
Smith-Waterman score: 907; 47.7% identity (75.8% similar) in 298 aa overlap (7-301:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEH-KAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQ
. ...:::.:::.::..:.:. .. : :..:::..:. .::.:.. :::..::.
XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVA-IFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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pF1KE5 KAVLKLRDKVAHSQGE
: ::
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 907; 47.7% identity (75.8% similar) in 298 aa overlap (7-301:9-304)
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pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
:. ::: :: . :: .:::.::.::::: ::.:.::.::.::::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
.::::::..:. ..: .::..: ... ..: :.::.:::.: ::. : : .::.
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEH-KAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLC
::::.:. :::...: :. :: :: ..:.:: . : ::: .::.::.: . :.: :
NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQ
. ...:::.:::.::..:.:. .. : :..:::..:. .::.:.. :::..::.
NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASH-CIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVV--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVK
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVA-IFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KAVLKLRDKVAHSQGE
: ::
NP_036 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 839 init1: 547 opt: 900 Z-score: 904.6 bits: 175.6 E(85289): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 900; 44.4% identity (75.4% similar) in 297 aa overlap (7-298:10-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPS---GRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLY
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 TVMSYDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQ
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HYLCDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRH
:..::. :.:.:.:.: :. :.. :. .. : . . :::.:. ....: .. ::.
NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 RAFQTCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDG--VVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNK
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 EVKKAVLKLRDKVAHSQGE
:::.:.
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 887 init1: 495 opt: 892 Z-score: 896.9 bits: 174.1 E(85289): 3.2e-43
Smith-Waterman score: 892; 44.8% identity (75.0% similar) in 308 aa overlap (5-308:9-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYYFLTNLSFIDM-WFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYT
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDI-VPKMLVNFLSEN-KSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VMSYDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQH
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NP_006 AMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YLCDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHR
..:: ::.:::.:.::. :: .. . . : ::..:..:: :. :.:.:.. ::..
NP_006 FFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFQTCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGS--RDVVDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKE
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VKKAVLK-LRDKVAHSQGE
:: :. : ::.:: :
NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 844 init1: 481 opt: 871 Z-score: 876.2 bits: 170.3 E(85289): 4.6e-42
Smith-Waterman score: 871; 42.7% identity (73.8% similar) in 309 aa overlap (2-308:4-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
.. : :. :.: :: . : . :: .:: .:. ::::::::.: . .:: ::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
.::.::::.:. :: .:::::: . . . .:::: .:..:.:: .. . . :: .::.
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILET-QTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLC
::...:. .::.::. :. . ::::... :. ..:. ..:.: : .:. : : :..:
XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQ
:. :.:::.:.:: ::..:. . .:: :: :. ::. :.:..:.. ...:: .::.
XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVV--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKK
::.:: ::: :. . .:. : : . : .....:::.::.::: .:.:::. .:
XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AVLKLRDKVAHSQGE
:. :. .:. :
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 844 init1: 481 opt: 871 Z-score: 876.2 bits: 170.3 E(85289): 4.6e-42
Smith-Waterman score: 871; 42.7% identity (73.8% similar) in 309 aa overlap (2-308:4-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSKTSLVTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
.. : :. :.: :: . : . :: .:: .:. ::::::::.: . .:: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRTISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
.::.::::.:. :: .:::::: . . . .:::: .:..:.:: .. . . :: .::.
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILET-QTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATSTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYLC
::...:. .::.::. :. . ::::... :. ..:. ..:.: : .:. : : :..:
NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGLVASGCFLLIVLSYVSIVCSILRIHTSEGRHRAFQ
:. :.:::.:.:: ::..:. . .:: :: :. ::. :.:..:.. ...:: .::.
NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVV--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKK
::.:: ::: :. . .:. : : . : .....:::.::.::: .:.:::. .:
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AVLKLRDKVAHSQGE
:. :. .:. :
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
311 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:03:43 2016 done: Tue Nov 8 08:03:44 2016
Total Scan time: 6.470 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]