Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5930
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5930, 311 aa
1>>>pF1KE5930 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1440+/-0.000531; mu= 17.2540+/- 0.033
mean_var=153.5383+/-45.777, 0's: 0 Z-trim(107.7): 385 B-trim: 911 in 1/52
Lambda= 0.103506
statistics sampled from 15178 (15792) to 15178 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 5.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 815 134.5 2.6e-31
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 788 130.5 4.3e-30
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 768 127.5 3.4e-29
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 760 126.3 7.7e-29
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 750 124.9 2.2e-28
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 750 124.9 2.2e-28
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 750 124.9 2.2e-28
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 735 122.6 1e-27
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 735 122.6 1e-27
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 735 122.6 1e-27
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 731 122.0 1.6e-27
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 715 119.6 8.2e-27
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 704 118.0 2.5e-26
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 696 116.8 5.8e-26
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 684 115.0 2e-25
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 683 114.9 2.3e-25
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 653 110.4 5e-24
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 650 109.9 6.8e-24
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 641 108.6 1.7e-23
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 634 107.5 3.5e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 479 84.4 3.4e-16
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 451 80.2 6.1e-15
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 223 46.2 0.00011
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 223 46.3 0.00012
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 223 46.3 0.00012
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 214 44.8 0.00027
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 214 44.9 0.00029
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 213 44.9 0.00035
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 210 44.4 0.00047
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 210 44.4 0.00047
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 208 43.9 0.00051
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 209 44.2 0.00052
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 208 44.0 0.00056
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 207 43.9 0.00061
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 207 43.9 0.00061
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 207 43.9 0.00061
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 207 43.9 0.00061
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 207 43.9 0.00063
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 207 43.9 0.00063
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 207 43.9 0.00063
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 207 43.9 0.00063
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 207 43.9 0.00064
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 207 44.0 0.00066
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 207 44.0 0.00066
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 207 44.0 0.00066
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 204 43.3 0.00076
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 204 43.3 0.00079
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 204 43.4 0.00079
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 205 43.7 0.00083
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 204 43.4 0.00083
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 781 init1: 781 opt: 815 Z-score: 683.1 bits: 134.5 E(85289): 2.6e-31
Smith-Waterman score: 815; 40.7% identity (74.7% similar) in 300 aa overlap (3-302:6-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMS
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFR
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKT
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE5 AMWRLFVKIYFLQK
:. ::
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 800 init1: 780 opt: 788 Z-score: 661.3 bits: 130.5 E(85289): 4.3e-30
Smith-Waterman score: 788; 42.9% identity (69.1% similar) in 301 aa overlap (3-303:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 SYDRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFF
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pF1KE5 RDIPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 TAMWRLFVKIYFLQK
: ...
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 829 init1: 716 opt: 768 Z-score: 645.1 bits: 127.5 E(85289): 3.4e-29
Smith-Waterman score: 768; 40.8% identity (71.1% similar) in 311 aa overlap (1-310:3-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGI-WELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPM
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pF1KE5 YFFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMS
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pF1KE5 YDRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFR
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DIPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE5 TCSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKT
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE5 AMWRLFVKIYFLQK
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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
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Smith-Waterman score: 760; 41.2% identity (72.5% similar) in 306 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMY
.:::....:::. .: ::: . :::: .::....:::::: ... ..:::::::
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pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY
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pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFIL--MMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAF
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NP_001 PAQVLK-VACSNTLLNNIVLYVATAL-LGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAF
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pF1KE5 STCSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIK
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NP_001 STCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 TAMWRLFVKIYFLQK
:. ::. .
NP_001 GALERLLSRADSCP
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 750; 38.5% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMY
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pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 MWRLFVKIYFLQK
.:. :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 774 init1: 750 opt: 750 Z-score: 630.6 bits: 124.9 E(85289): 2.2e-28
Smith-Waterman score: 750; 38.5% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MWRLFVKIYFLQK
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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 774 init1: 750 opt: 750 Z-score: 630.6 bits: 124.9 E(85289): 2.2e-28
Smith-Waterman score: 750; 38.5% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)
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pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MWRLFVKIYFLQK
.:. :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 758 init1: 712 opt: 735 Z-score: 618.6 bits: 122.6 E(85289): 1e-27
Smith-Waterman score: 735; 37.9% identity (69.6% similar) in 306 aa overlap (3-308:5-310)
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pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY
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pF1KE5 DRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTA
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pF1KE5 MWRLFVKIYFLQK
. .. .. :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 758 init1: 712 opt: 735 Z-score: 618.6 bits: 122.6 E(85289): 1e-27
Smith-Waterman score: 735; 37.9% identity (69.6% similar) in 306 aa overlap (3-308:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MWRLFVKIYFLQK
. .. .. :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 758 init1: 712 opt: 735 Z-score: 618.4 bits: 122.6 E(85289): 1e-27
Smith-Waterman score: 735; 37.9% identity (69.6% similar) in 306 aa overlap (3-308:15-320)
10 20 30 40
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVIT
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LNQHLHTPMYFFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASA
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 ELAFLTVMSYDRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCR
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 SNVIHQFFRDIPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]