Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5930
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5930, 311 aa
1>>>pF1KE5930 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0988+/-0.00128; mu= 11.4834+/- 0.074
mean_var=209.2728+/-72.378, 0's: 0 Z-trim(102.0): 447 B-trim: 378 in 1/47
Lambda= 0.088658
statistics sampled from 6190 (6749) to 6190 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 1.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 ( 311) 2007 270.4 1.2e-72
CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 ( 309) 1037 146.4 2.7e-35
CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 ( 312) 1025 144.8 8e-35
CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 ( 321) 951 135.4 5.7e-32
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 825 119.2 4e-27
CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 ( 328) 823 119.0 4.9e-27
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 818 118.4 7.5e-27
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 816 118.1 9e-27
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 815 118.0 9.7e-27
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 803 116.4 2.8e-26
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 803 116.4 2.9e-26
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 799 115.9 4e-26
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 797 115.7 4.8e-26
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 792 115.1 8.1e-26
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 791 114.9 8.2e-26
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 789 114.6 9.8e-26
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 788 114.5 1.1e-25
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 786 114.3 1.3e-25
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 785 114.1 1.4e-25
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 779 113.4 2.4e-25
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 778 113.2 2.6e-25
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 777 113.1 2.8e-25
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 776 113.0 3.2e-25
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 775 112.9 3.4e-25
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 774 112.8 3.8e-25
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 768 111.9 6.2e-25
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 768 112.0 6.3e-25
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 764 111.4 9e-25
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 762 111.2 1.1e-24
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 760 110.9 1.3e-24
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 760 111.0 1.3e-24
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 757 110.6 1.7e-24
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 756 110.4 1.8e-24
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 755 110.3 2e-24
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 752 109.9 2.6e-24
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 752 109.9 2.6e-24
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 749 109.5 3.4e-24
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 749 109.5 3.4e-24
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 748 109.4 3.7e-24
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 748 109.4 3.8e-24
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 747 109.3 4.1e-24
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 746 109.1 4.4e-24
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 746 109.2 4.5e-24
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 745 109.0 4.8e-24
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 745 109.0 4.8e-24
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 745 109.0 4.8e-24
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 744 108.9 5.3e-24
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 743 108.8 5.8e-24
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 741 108.5 7e-24
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 739 108.2 8.3e-24
>>CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 2007 init1: 2007 opt: 2007 Z-score: 1417.5 bits: 270.4 E(32554): 1.2e-72
Smith-Waterman score: 2007; 99.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMYFF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::
CCDS31 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAVLVGNLLIIAVITLDQHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRDIP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS31 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSSVIHQFFRDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAMW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RLFVKIYFLQK
:::::::::::
CCDS31 RLFVKIYFLQK
310
>>CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1036 init1: 857 opt: 1037 Z-score: 747.0 bits: 146.4 E(32554): 2.7e-35
Smith-Waterman score: 1037; 53.2% identity (78.2% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMYFF
: ::: ::::.:: :: .. .::. ::::::: ::.::.::: . ::..:::::.:::
CCDS31 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
::::: :::: ::::.:::: ::: . .:::.::::.::... . ::::: .:::::.::
CCDS31 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRDIP
:.::::::.: ..: . : : :...:: :..::.. : : ::..:::: :::
CCDS31 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 HVLALVSC-EVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTC
..:: .:: : .. :. . .. : . :::...:.: ..:::: .::: ....::.: :
CCDS31 QLLA-ISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSIC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAM
:.:.:. :::.::..: : : ... :: : ::.. ::.::: .:::::::::: ::.:.
CCDS31 LPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVAL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 WRLFVKIYFLQK
...: . .:
CCDS31 G-MLIKGKLTKK
300
>>CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1064 init1: 1006 opt: 1025 Z-score: 738.7 bits: 144.8 E(32554): 8e-35
Smith-Waterman score: 1025; 50.2% identity (77.3% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMYFF
: : : : :::::.:: .: ::.::.. :...::..:.::.::..: : .. :: :::::
CCDS31 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
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pF1KE5 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
:.:::.:: :::::::: : ::: ..:: ::::::.. :. .:: :::.:..::
CCDS31 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
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pF1KE5 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRDIP
:::.:.::.: ....: : ::.... :: . ::..:::. :. :::::::::: :::
CCDS31 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
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pF1KE5 HVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLG-CFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTC
.: : :: : . . ...:. : : :::... ::..:::::: .: : .:.::::::
CCDS31 SLLKL-SCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAM
:...:. .::.. . : : : . :::... :...::..::::::::::.::.:.
CCDS31 IPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 WRLFVKIYFLQK
... .:..
CCDS31 KKIMKRIFYSENV
300 310
>>CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 945 init1: 945 opt: 951 Z-score: 687.4 bits: 135.4 E(32554): 5.7e-32
Smith-Waterman score: 951; 48.1% identity (77.9% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPMYFF
: :::... :::: :: .::.::: .::. :: ::.::::::..::....::.:::.:
CCDS34 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
::.::.::::.::::::.:: ::: . :: . :. ::.:: :.::.:.:.::::::::
CCDS34 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFRDIP
:.:::.::.:...: .: . ....:.. . .:.. : .: . :::::: :.:
CCDS34 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 HVLALVSCEVFFVEFLTLA-LSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTC
..: : .: :.. ..:: ... .. :.: ...::..::::::::::...:.:.::::
CCDS34 QMLKL-ACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAM
:.:.: .::... : : . . : :::... :::.:: :::.:::::: .:.:.
CCDS34 LPHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAAL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 WRLFVKIYFLQK
... : . :.
CCDS34 RKMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
300 310 320
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 789 init1: 789 opt: 825 Z-score: 600.4 bits: 119.2 E(32554): 4e-27
Smith-Waterman score: 825; 43.4% identity (74.0% similar) in 311 aa overlap (2-311:4-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGI-WELQVLHAGLFLLIYLAALVGNLLIIAVITLNQHLHTPM
.: : :.::.:. ::.. :::.: ::: :::..:.::.::: : .. :..::
CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMS
::::.::: :.. . : ::: . . . . ..::.:::..:.::: :..:: .:..:.
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YDRYVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSNVIHQFFR
:::::::: ::.: ..: .: :.:...:.: :: :.:.: .: : : ...::
CCDS77 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DIPHVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFS
: : :.::: .. :. .:. . ..: :.:.. :: .:.::..:.::.... .:::
CCDS77 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKT
::: .:.:. :: .:.... . : ..: : . ...:. ::. :.::::::: ::::.:.
CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 AMWRLFVKIYFLQK
:. ::. . ::
CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
>>CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 (328 aa)
initn: 803 init1: 803 opt: 823 Z-score: 598.8 bits: 119.0 E(32554): 4.9e-27
Smith-Waterman score: 823; 43.4% identity (73.7% similar) in 304 aa overlap (1-303:21-323)
10 20 30 40
pF1KE5 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAALVGN
:.: : ::::.:. :: : .:. . ::..: .::.::
CCDS31 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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310
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