Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5929
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5929, 311 aa
1>>>pF1KE5929 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9282+/-0.00129; mu= 11.9717+/- 0.075
mean_var=146.9436+/-52.083, 0's: 0 Z-trim(101.3): 375 B-trim: 742 in 2/46
Lambda= 0.105803
statistics sampled from 5988 (6461) to 5988 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 2044 324.7 5.6e-89
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1431 231.1 8.2e-61
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1402 226.7 1.8e-59
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1305 211.9 5.2e-55
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1304 211.8 5.7e-55
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1201 196.0 3e-50
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1102 180.9 1.1e-45
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1061 174.7 8.3e-44
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1043 171.9 5.6e-43
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1038 171.2 9.8e-43
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1030 169.9 2.2e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1029 169.8 2.5e-42
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1026 169.3 3.4e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1023 168.9 4.7e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1023 168.9 4.8e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1022 168.7 5.2e-42
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1019 168.3 7.1e-42
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1014 167.5 1.2e-41
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 998 165.0 6.5e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 993 164.3 1.1e-40
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 991 164.0 1.4e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 991 164.0 1.4e-40
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 990 163.8 1.5e-40
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 990 163.8 1.5e-40
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 989 163.7 1.8e-40
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 986 163.2 2.3e-40
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 984 162.9 2.9e-40
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 982 162.7 3.8e-40
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 981 162.4 3.9e-40
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 980 162.3 4.4e-40
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 979 162.2 4.9e-40
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 977 161.8 6.1e-40
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 976 161.7 6.7e-40
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 976 161.7 6.9e-40
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 975 161.5 7.5e-40
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 974 161.4 8.4e-40
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 969 160.6 1.4e-39
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 968 160.5 1.6e-39
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 966 160.2 1.9e-39
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 964 159.9 2.4e-39
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 964 159.9 2.6e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 961 159.4 3.4e-39
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 959 159.1 4e-39
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 958 158.9 4.5e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 957 158.8 5e-39
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 957 158.8 5e-39
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 950 157.7 1.1e-38
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 941 156.4 2.8e-38
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 934 155.4 6.2e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 930 154.7 9e-38
>>CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2044 init1: 2044 opt: 2044 Z-score: 1710.8 bits: 324.7 E(32554): 5.6e-89
Smith-Waterman score: 2044; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAFD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 IKELSMKIYFS
:::::::::::
CCDS31 IKELSMKIYFS
310
>>CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1425 init1: 1425 opt: 1431 Z-score: 1205.2 bits: 231.1 E(32554): 8.2e-61
Smith-Waterman score: 1431; 70.9% identity (89.4% similar) in 302 aa overlap (4-305:3-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMYF
: : :::::::::::::: :.:.: .::..:..:..::.::.:::... :. ::::
CCDS31 MLNFTDVTEFILLGLTSRREWQVLFFIIFLVVYIITMVGNIGMMVLIKVSPQLNNPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAFD
:::::::::. ::::::::::: .::.::.:.: .:::::..:::::::::.:::.::::
CCDS31 FLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLLSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHVEIFILAAMAFD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCAD
::::: :::::::.::. :: ::: ::.:: ::.: :.:::.: ::: :::::::::
CCDS31 RYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCGKIEINHFYCAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFSTC
:::::.::. :. :: .:.:.:: :...:: .: ::::.:. :::..::.::::::::::
CCDS31 PPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRSAEGRQKAFSTC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEAL
::::::: :::.::.::::: :..::::::::::::::::::::: .:::::::.::.:.
CCDS31 GSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKKAM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 IKELSMKIYFS
.: .:
CCDS31 MKVISRSC
300
>>CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1417 init1: 1395 opt: 1402 Z-score: 1181.2 bits: 226.7 E(32554): 1.8e-59
Smith-Waterman score: 1402; 67.6% identity (87.9% similar) in 306 aa overlap (4-309:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMYF
: : :::: ::::: :.:::.:.:..:::.::.:. ::.:::.::. . :. ::::
CCDS31 MPNFTDVTEFTLLGLTCRQELQVLFFVVFLAVYMITLLGNIGMIILISISPQLQSPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAFD
:::::::.:.:::::::::::: .::: :.::: .::::::.:::.::::.:::::::::
CCDS31 FLSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHVEVYILAVMAFD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCAD
:::: ::::::::.::..:: ::.:::::: ..:. :.:::.: ::: :::::::::
CCDS31 RYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCGNFEINHFYCAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFSTC
::::..::. .. ::..:...:: :...:: .. ::: : :.:..::..::.::::::
CCDS31 PPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRSADGRRKAFSTC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEAL
:::::::..::.: .::::: :..::::::::::::::::::::: .:::::::.::::.
CCDS31 GSHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIYSLRNKDVKEAV
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 IKELSMKIYFS
: .. : :
CCDS31 NKAIT-KTYVRQ
300 310
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1319 init1: 1291 opt: 1305 Z-score: 1101.2 bits: 211.9 E(32554): 5.2e-55
Smith-Waterman score: 1305; 64.1% identity (86.9% similar) in 306 aa overlap (4-309:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMY
: :.::::::::::. :. .:: .:::::..:.:::: ::.::..:. :. :::
CCDS53 MLSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSQLQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAF
:::.::::::.:.::::::.::. ::::.:.::: .:..:: :::::: .:.:.:: ::.
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYFLASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCA
:::.:::.:: :.:::::..: :.::::.:: :.:: .:. :..:.::: ::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFST
::::: :::::: :...::.:::..:: ::::: .:::.:: ::..:::.:::.:::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEA
:.:::: ::.::.::: ::.::::..:::..:..::::: . :::: .::::::..: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNRDVILA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIKELSMKIYFS
. . . : .
CCDS53 IQQMIRGKSFCKIAV
310
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1317 init1: 1289 opt: 1304 Z-score: 1100.3 bits: 211.8 E(32554): 5.7e-55
Smith-Waterman score: 1304; 63.7% identity (86.6% similar) in 306 aa overlap (4-309:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMY
: :.::::::::::. :. .:: .:::::..:.:::: ::.::..:. :. :::
CCDS53 MFSPNHTIVTEFILLGLTDDPVLEKILFGVFLAIYLITLAGNLCMILLIRTNSHLQTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHVEIYILAVMAF
:::.::::::.:.::::::.::. ::::.:.::: .:..:: :::::: .:.:::: ::.
CCDS53 FFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVITEFYILASMAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCGPNEINHFYCA
:::.:::.:: :.:::::..: :.:.::.:: :.:. ... :..:.::: ::::::::
CCDS53 DRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCGSLEINHFYCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DPPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRSTEGRQKAFST
::::: :::::: :...::.:::.::: ::::: .:::.:: ::..:::.:::.:::::
CCDS53 DPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRSAEGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIYSLRNKNVKEA
:.:::: ::.::.::: ::.::::..:::..:..::::: . :::: .:::::: .: :
CCDS53 CASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIYSLRNTDVILA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIKELSMKIYFS
. . . : .
CCDS53 MQQMIRGKSFHKIAV
310
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 884 init1: 884 opt: 1201 Z-score: 1015.5 bits: 196.0 E(32554): 3e-50
Smith-Waterman score: 1201; 60.3% identity (84.5% similar) in 297 aa overlap (4-300:5-300)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRRNCTLVTEFILLGLTSRRELQILLFTLFLAIYMVTVAGNLGMIVLIQANAWLHMPMY
: . .:::::::::. ::: :::.:::..:.::. ::::::.:.. .. :: :::
CCDS53 MSNTNGSAITEFILLGLTDCPELQSLLFVLFLVVYLVTLLGNLGMIMLMRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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:
CCDS53 LKNVLR
300
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CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
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: :
CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
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CCDS31 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
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CCDS31 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
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CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
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CCDS31 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
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: : : :
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CCDS31 FLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYD
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CCDS31 RYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDA
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CCDS31 KKTVGKAKASIGFIF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]