Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5928
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5928, 311 aa
1>>>pF1KE5928 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0241+/-0.000444; mu= 17.3501+/- 0.028
mean_var=109.9421+/-30.885, 0's: 0 Z-trim(110.1): 392 B-trim: 1028 in 1/50
Lambda= 0.122319
statistics sampled from 17808 (18375) to 17808 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 5.500
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 926 174.9 1.9e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 910 172.1 1.4e-42
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 902 170.6 3.6e-42
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 898 169.9 5.8e-42
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 895 169.4 8.3e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 893 169.1 1.1e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 893 169.1 1.1e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 893 169.1 1.1e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 882 167.1 4.1e-41
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 876 166.0 8.6e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 876 166.0 8.6e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 876 166.1 8.7e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 857 162.7 8.8e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 850 161.5 2.1e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 838 159.3 9e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 834 158.6 1.4e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 834 158.6 1.4e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 808 154.0 3.5e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 791 151.0 2.8e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 773 147.9 2.5e-35
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 579 113.6 5.2e-25
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 574 112.8 9.6e-25
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 215 49.4 1.2e-05
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 214 49.2 1.2e-05
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 214 49.2 1.2e-05
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 214 49.2 1.2e-05
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 207 48.0 3e-05
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 207 48.0 3e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 207 48.0 3.2e-05
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 203 47.4 5.7e-05
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 47.4 5.7e-05
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 47.4 5.7e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 47.4 5.7e-05
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 47.4 5.7e-05
NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 202 47.2 6.2e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 201 47.0 6.4e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 199 46.6 8e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 194 45.8 0.00016
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 194 45.8 0.00016
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 194 45.8 0.00016
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 194 45.8 0.00016
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 194 45.8 0.00017
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 194 45.8 0.00017
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 194 45.8 0.00017
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 194 45.8 0.00017
NP_000788 (OMIM: 126452,143465,601696) D(4) dopami ( 419) 194 45.9 0.00017
NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 193 45.8 0.00022
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 190 45.0 0.00025
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 189 44.8 0.00027
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 187 44.5 0.00034
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 874 init1: 544 opt: 926 Z-score: 901.1 bits: 174.9 E(85289): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 926; 44.5% identity (76.7% similar) in 301 aa overlap (3-301:8-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPE-KTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
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pF1KE5 VMSYDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQH
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pF1KE5 YFCDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRG
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFQTCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDG--VVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKE
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VQKAVLKLRDKVAHPQRK
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NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 843 init1: 550 opt: 910 Z-score: 885.6 bits: 172.1 E(85289): 1.4e-42
Smith-Waterman score: 910; 45.1% identity (75.4% similar) in 297 aa overlap (7-298:10-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPM
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pF1KE5 YYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPS---GRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLY
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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pF1KE5 TVMSYDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQ
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pF1KE5 HYFCDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRR
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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pF1KE5 GAFQTCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDG--VVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNK
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310
pF1KE5 EVQKAVLKLRDKVAHPQRK
::..:.
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 902; 45.0% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (3-305:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTP
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pF1KE5 VMSYDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQH
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pF1KE5 YFCDAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRG
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NP_006 FFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
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pF1KE5 AFQTCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDA--MDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKE
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
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300 310
pF1KE5 VQKAVLK-LRDKVAHPQRK
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NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 898; 46.0% identity (75.0% similar) in 300 aa overlap (3-301:5-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRK-KVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMS
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pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVL-SYVSIVCSILRIRTSDGRRGAF
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NP_003 EAPALLILASTDTHASEMAIFL-MGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAF
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pF1KE5 QTCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVQKA
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NP_003 STCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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300 310
pF1KE5 VLKLRDKVAHPQRK
. :.
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 885 init1: 437 opt: 895 Z-score: 871.5 bits: 169.4 E(85289): 8.3e-42
Smith-Waterman score: 895; 43.2% identity (76.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYF
: : . .: :.: :: . : .. ..: .:.:.:..::.: .::...: .. : .:::
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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pF1KE5 LTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYD
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPN-LITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYD
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pF1KE5 RYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFCDA
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NP_001 HYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDL
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pF1KE5 PPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRGAFQTC
:.:.:::.:: :. : .. :.. :.:...::: :.:: :: .. ..:. :..::
NP_001 NPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALSTC
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pF1KE5 ASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVQKAVLK
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
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310
pF1KE5 LRDKVAHPQRK
:
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 616 init1: 498 opt: 893 Z-score: 869.5 bits: 169.1 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 893; 46.4% identity (74.8% similar) in 302 aa overlap (3-301:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
.::::::..:. ..: .::..: ... .:: :.::.:::.: ::. : : .::.
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEH-KAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRGAFQ
. ...:::.:::.::..:.:. .. : :..:::..:. .::.:.. .::. ::.
XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASH-CIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAM--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVQ
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVA-IFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KAVLKLRDKVAHPQRK
: ::
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 616 init1: 498 opt: 893 Z-score: 869.5 bits: 169.1 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 893; 46.4% identity (74.8% similar) in 302 aa overlap (3-301:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEH-KAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
70 80 90 100 110
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pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRGAFQ
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCASH-CIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAM--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVQ
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVA-IFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KAVLKLRDKVAHPQRK
: ::
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 616 init1: 498 opt: 893 Z-score: 869.5 bits: 169.1 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 893; 46.4% identity (74.8% similar) in 302 aa overlap (3-301:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEH-KAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
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NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRGAFQ
. ...:::.:::.::..:.:. .. : :..:::..:. .::.:.. .::. ::.
NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCASH-CIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAM--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVQ
::::: .:.::. : . :..: : .. . . ..::..:::.:::..:.::::::.
NP_036 TCASHLTVVALCYGVA-IFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KAVLKLRDKVAHPQRK
: ::
NP_036 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 870 init1: 493 opt: 882 Z-score: 859.0 bits: 167.1 E(85289): 4.1e-41
Smith-Waterman score: 882; 45.0% identity (74.8% similar) in 298 aa overlap (3-298:5-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
: . .: :.: :: . :. .:: .:::.:.::::::: ..:.::.::.::::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEK-KTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
:::: :: :: :. .:: . .:.:.. .: :. :.: . : .: : :.:.::
NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRGAFQ
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NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
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pF1KE5 TCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAM--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVQK
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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300 310
pF1KE5 AVLKLRDKVAHPQRK
:.
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 845 init1: 476 opt: 876 Z-score: 853.4 bits: 166.0 E(85289): 8.6e-41
Smith-Waterman score: 876; 42.8% identity (73.9% similar) in 306 aa overlap (2-305:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLVTVFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMS
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILET-QTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
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pF1KE5 YDRYLAISYPLRYTSVMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFC
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NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSANEMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRGAFQ
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NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE5 TCASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAM--DGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVQK
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NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]