Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5927
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5927, 311 aa
1>>>pF1KE5927 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0849+/-0.00133; mu= 11.3180+/- 0.078
mean_var=132.2623+/-41.054, 0's: 0 Z-trim(101.6): 377 B-trim: 737 in 2/44
Lambda= 0.111521
statistics sampled from 6145 (6602) to 6145 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 1.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 2019 337.1 1.1e-92
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1254 214.0 1.2e-55
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1207 206.5 2.3e-53
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1024 177.0 1.6e-44
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1009 174.6 8.7e-44
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1006 174.1 1.2e-43
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 997 172.7 3.3e-43
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 995 172.3 4.2e-43
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 990 171.5 7.2e-43
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 990 171.6 8e-43
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 988 171.2 9.2e-43
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 984 170.6 1.4e-42
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 983 170.4 1.6e-42
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 979 169.8 2.5e-42
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 972 168.6 5.4e-42
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 972 168.7 5.7e-42
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 971 168.5 6e-42
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 970 168.3 6.7e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 970 168.3 7e-42
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 968 168.0 8.7e-42
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 966 167.7 1.1e-41
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 964 167.4 1.3e-41
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 963 167.2 1.5e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 960 166.7 2e-41
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 953 165.6 4.5e-41
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 953 165.6 4.6e-41
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 952 165.4 5e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 949 164.9 7e-41
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 949 164.9 7e-41
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 947 164.6 8.8e-41
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 941 163.7 1.7e-40
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 941 163.7 1.7e-40
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 940 163.5 1.9e-40
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 937 163.0 2.7e-40
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 936 162.8 3e-40
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 933 162.4 4.3e-40
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 932 162.2 4.7e-40
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 932 162.2 4.7e-40
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 932 162.2 4.7e-40
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 931 162.0 5.3e-40
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 928 161.6 7.3e-40
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 927 161.4 8.2e-40
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 925 161.1 1e-39
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 925 161.1 1e-39
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 924 161.0 1.3e-39
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 921 160.4 1.6e-39
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 920 160.3 1.8e-39
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 919 160.1 2e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 918 160.0 2.2e-39
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 916 159.6 2.8e-39
>>CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2019 init1: 2019 opt: 2019 Z-score: 1777.8 bits: 337.1 E(32554): 1.1e-92
Smith-Waterman score: 2019; 99.7% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPFIYSLRNKEIKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS31 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 ALKRLQKRKCC
:::::::::::
CCDS31 ALKRLQKRKCC
310
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1257 init1: 1234 opt: 1254 Z-score: 1112.4 bits: 214.0 E(32554): 1.2e-55
Smith-Waterman score: 1254; 58.4% identity (83.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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CCDS31 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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CCDS31 YDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
:.: .: :::.::: .:.: :... ::.:.::..:::::: ...::.:: ::.:::.
CCDS31 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPFIYSLRNKEIKD
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CCDS31 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 ALKRLQKRKCC
:... ..:
CCDS31 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
310 320
>>CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1205 init1: 1205 opt: 1207 Z-score: 1071.7 bits: 206.5 E(32554): 2.3e-53
Smith-Waterman score: 1207; 57.6% identity (82.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:3-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHT
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CCDS31 MSITKAWNSSSVTMFILLGFTDHPELQALLFVTFLGIYLTTLAWNLALIFLIRGDTHLHT
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pF1KE5 PMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTA
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CCDS31 PMYFFLSNLSFIDICYSSAVAPNMLTDFFWEQKTISFVGCAAQFFFFVGMGLSECLLLTA
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pF1KE5 MAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHF
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CCDS31 MAYDRYAAISSPLLYPTIMTQGLCTRMVVGAYVGGFLSSLIQASSIFRLHFCGPNIINHF
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pF1KE5 FCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKA
:::.: .: :::.:::. ::.. .... : .: : ..:::::: ...:: ::.:: ::
CCDS31 FCDLPPVLALSCSDTFLSQVVNFLVVVTVGGTSFLQLLISYGYIVSAVLKIPSAEGRWKA
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPFIYSLRNKEI
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CCDS31 CNTCASHLMVVTLLFGTALFVYLRPSSSYLLGRDKVVSVFYSLVIPMLNPLIYSLRNKEI
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KDALKRLQKRKCC
:::: .. .::
CCDS31 KDALWKVLERKKVFS
310
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1024 init1: 1024 opt: 1024 Z-score: 912.6 bits: 177.0 E(32554): 1.6e-44
Smith-Waterman score: 1024; 51.6% identity (79.3% similar) in 304 aa overlap (6-309:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
: : .: :.:::..: .. .:: .::::: .. ::..:.:::.::.:::::
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
::::.::::.::: .. .::::..::.:..::.:.::..:...: ... .: :. ::
CCDS31 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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CCDS31 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
: : :. :::.::.. . ...::. ... :::. ::.:. .::... :..:: .::.
CCDS31 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPFIYSLRNKEIKD
::::::::. :::.. :..:: ::. : . :. ::::::::::::::.:::::.::.:
CCDS31 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 ALKRLQKRKCC
:: . .::
CCDS31 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 555 init1: 555 opt: 1009 Z-score: 899.6 bits: 174.6 E(32554): 8.7e-44
Smith-Waterman score: 1009; 50.7% identity (77.8% similar) in 306 aa overlap (4-309:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
:.:.::.: ::: ::.. :.. :: .:: ::. .. ::.::.::::::.:::::
CCDS31 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
:::::::.:::. : :...:: : :. .....:.::::..:...: . : :. .::
CCDS31 YFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
:.:: ::::::::: .:: . :. . :. :.:.::... .. .: :: :. : ::::
CCDS31 YNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSS-INHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
: :: :::.::: ..... .:. : ..: :.: ..: : .:..: :: ::.:::.
CCDS31 DTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPFIYSLRNKEIKD
:::::: ::..:: : ::.::. .. .: . . ::::::.:::::::.:::::::..:.
CCDS31 TCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 ALKRLQKRKCC
:: :. .::
CCDS31 ALLRVIHRKLFP
300 310
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1051 init1: 996 opt: 1006 Z-score: 896.9 bits: 174.1 E(32554): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 1006; 49.8% identity (78.3% similar) in 299 aa overlap (11-309:11-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
: : ::::::.:.. :: .::.:: ... :..:::.:... .:::::
CCDS31 MLLTDRNTSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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70 80 90 100 110 120
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CCDS31 YDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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CCDS31 EFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS31 TCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 ALKRLQKRKCC
.. .. :
CCDS31 TVTEILDTKVFSY
310
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPM
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CCDS31 YFFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMA
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CCDS31 YDRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFC
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CCDS31 DAPPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFS
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CCDS31 TCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKS
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310
pF1KE5 ALKRLQKRKCC
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CCDS31 AFKKTVGKAKASIGFIF
300 310
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CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPFIYSLRNKEIK
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CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 DALKRLQKRKCC
:: ... . :
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
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CCDS77 YIFLCHLAFVDIGYSSSVTPVMLMSFLRKETSLPVAGCVAQLCSVVTFGTAECFLLAAMA
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CCDS77 DYSPLLKLACSHDFTFEIIPAISSGSIIVATVCVIAISYIYILITILKMHSTKGRHKAFS
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CCDS77 TCTSHLTAVTLFYGTITFIYVMPKSSYSTDQNKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKG
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CCDS77 ALKRELRIKIFS
300 310
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10 20 30
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CCDS32 RIKPSQSPRCSTSFMVVPSFSIAEHWRRMKGANLSQGMEFELLGLTTDPQLQRLLFVVFL
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CCDS32 GMYTATLLGNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSSTVVPQTLVNFLAKRKVI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]