Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5926
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5926, 311 aa
1>>>pF1KE5926 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2698+/-0.000523; mu= 15.6525+/- 0.032
mean_var=96.1710+/-24.293, 0's: 0 Z-trim(108.0): 371 B-trim: 997 in 1/50
Lambda= 0.130783
statistics sampled from 15631 (16109) to 15631 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 7.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1018 203.2 5.5e-52
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 818 165.5 1.3e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 818 165.5 1.3e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 818 165.5 1.3e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 803 162.6 8.9e-40
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NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 790 160.2 4.9e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 787 159.6 7.4e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 785 159.2 9.4e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 772 156.8 5.2e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 764 155.3 1.5e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 764 155.3 1.5e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 764 155.3 1.5e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 760 154.5 2.5e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 755 153.6 4.7e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 755 153.6 4.8e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 745 151.7 1.8e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 726 148.1 2.1e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 717 146.4 6.9e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 521 109.5 9.5e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 444 94.9 2.3e-19
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 231 54.9 3.7e-07
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 231 55.0 4e-07
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 218 52.3 1.6e-06
XP_016861772 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 203 49.6 1.5e-05
XP_011531954 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 203 49.6 1.5e-05
XP_016861773 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 203 49.6 1.5e-05
NP_000852 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor [Ho ( 487) 203 49.6 1.5e-05
NP_001091682 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 203 49.6 1.5e-05
NP_001091681 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 203 49.6 1.5e-05
NP_001091683 (OMIM: 600167) histamine H1 receptor ( 487) 203 49.6 1.5e-05
XP_011531955 (OMIM: 600167) PREDICTED: histamine H ( 487) 203 49.6 1.5e-05
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 198 48.6 2.4e-05
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 198 48.6 2.5e-05
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 198 48.7 2.8e-05
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 198 48.7 3e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 195 48.0 3.3e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 193 47.6 4e-05
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 193 47.6 4.2e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 193 47.6 4.5e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 193 47.6 4.6e-05
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 193 47.7 4.8e-05
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 193 47.7 5e-05
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 191 47.3 6e-05
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 191 47.3 6.4e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 189 46.9 7.3e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 188 46.6 7.6e-05
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 187 46.6 0.00011
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 187 46.6 0.00011
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1015 init1: 1015 opt: 1018 Z-score: 1054.3 bits: 203.2 E(85289): 5.5e-52
Smith-Waterman score: 1018; 48.0% identity (80.0% similar) in 300 aa overlap (5-304:3-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
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pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
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pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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NP_001 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
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pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
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pF1KE5 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LKRRLVPSERE
: :
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
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pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
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pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMT-LRSQAGGGRRKAIST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEK--AISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRRLKRRLVPSERE
.... :.: :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 818; 40.7% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (5-308:5-311)
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pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
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pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
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pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMT-LRSQAGGGRRKAIST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEK--AISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300 310
pF1KE5 MRRLKRRLVPSERE
.... :.: :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 816 init1: 603 opt: 818 Z-score: 850.3 bits: 165.5 E(85289): 1.3e-40
Smith-Waterman score: 818; 41.0% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (5-308:7-313)
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pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTP
: : : :::.::. . ..::::.. .: :.::. .:. . . .:.::
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pF1KE5 MYFLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVM
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pF1KE5 AFDCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFY
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pF1KE5 CDVPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMT-LRSQAGGGRRKAI
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STCTSHITVVTLHFVPCIYVYARP-FTALP-TEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 SAMRRLKRRLVPSERE
.: ... : : :
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 799 init1: 611 opt: 818 Z-score: 850.1 bits: 165.5 E(85289): 1.3e-40
Smith-Waterman score: 818; 40.7% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (5-308:15-321)
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pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVT
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 CESRLHTPMYFLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGA
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 DIFSLSVMAFDCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCG
: : :.:::.: ..:. .::::.. :.. :. :... :. . .. ... :. :: ::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 PNVLDTFYCDVPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMT-LRSQA
:.. :.::: .:::.:.:: : ...:...:: :. .:.:: : : :. .
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 GGGRRKAISTCTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEK--AISVTFTVISPLLNPLIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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pF1KE5 TLRNQEMKSAMRRLKRRLVPSERE
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 803; 39.7% identity (74.7% similar) in 300 aa overlap (5-301:2-301)
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pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
: . : :::.::::.. . . ..:::. .::....:::.::... .. ::::::
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pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
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pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
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pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYT-VILMTLRSQAGGGRRKAIST
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NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
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pF1KE5 CTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTE--KAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSA
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NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
240 250 260 270 280 290
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pF1KE5 MRRLKRRLVPSERE
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NP_001 IRKVFAFLKH
300
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initn: 686 init1: 557 opt: 797 Z-score: 828.8 bits: 161.5 E(85289): 2e-39
Smith-Waterman score: 797; 40.1% identity (73.8% similar) in 309 aa overlap (1-304:1-307)
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pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
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pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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pF1KE5 SAMRRLKRRLVPSERE
.:. . :
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 794 init1: 575 opt: 790 Z-score: 821.8 bits: 160.2 E(85289): 4.9e-39
Smith-Waterman score: 790; 39.2% identity (72.8% similar) in 309 aa overlap (4-304:5-308)
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pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPM
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pF1KE5 FDCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DVPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWF-----IFLLVSYTVILMT-LRSQAGGGR
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pF1KE5 RKAISTCTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPT--EKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRN
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NP_001 SKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRN
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pF1KE5 QEMKSAMRRLKRRLVPSERE
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NP_001 KEIKDALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 792 init1: 544 opt: 787 Z-score: 818.6 bits: 159.6 E(85289): 7.4e-39
Smith-Waterman score: 787; 41.6% identity (73.1% similar) in 305 aa overlap (1-300:1-304)
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pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQ--SQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTP
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSL-LFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSP
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pF1KE5 MYFLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVM
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NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
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pF1KE5 AFDCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFY
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NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
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NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
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NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
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pF1KE5 SAMRRLKRRLVPSERE
.:. :
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 759 init1: 551 opt: 785 Z-score: 816.7 bits: 159.2 E(85289): 9.4e-39
Smith-Waterman score: 785; 41.1% identity (72.2% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-308)
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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NP_003 RKVATRNFP
300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]