Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5926
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5926, 311 aa
1>>>pF1KE5926 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1751+/-0.00127; mu= 10.4312+/- 0.073
mean_var=154.3123+/-52.281, 0's: 0 Z-trim(102.6): 420 B-trim: 429 in 1/46
Lambda= 0.103246
statistics sampled from 6526 (7036) to 6526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 2018 313.4 1.5e-85
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1677 262.6 2.9e-70
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1651 258.7 4.2e-69
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1380 218.3 6e-57
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1375 217.6 1e-56
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1351 214.0 1.2e-55
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1222 194.8 7.3e-50
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1133 181.5 7e-46
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1107 177.7 1e-44
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1100 176.6 2.1e-44
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1090 175.1 6e-44
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1085 174.4 1e-43
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1079 173.5 1.9e-43
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1078 173.3 2.1e-43
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1076 173.1 2.7e-43
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1074 172.7 3.1e-43
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1074 172.7 3.1e-43
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1061 170.8 1.2e-42
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1059 170.6 1.6e-42
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1057 170.3 1.9e-42
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1056 170.1 2e-42
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1046 168.6 5.6e-42
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1046 168.6 5.7e-42
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1045 168.4 6.3e-42
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1043 168.1 7.6e-42
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1034 166.8 2e-41
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1034 166.8 2e-41
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1033 166.6 2.2e-41
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1029 166.0 3.3e-41
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1026 165.6 4.4e-41
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1022 165.0 6.7e-41
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1018 164.4 1e-40
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1018 164.4 1e-40
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1007 162.8 3.2e-40
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1005 162.5 4e-40
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1004 162.3 4.3e-40
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1003 162.3 5.3e-40
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 994 160.8 1.2e-39
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 988 159.9 2.2e-39
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 986 159.6 2.8e-39
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 984 159.3 3.4e-39
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 973 157.7 1.1e-38
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 973 157.7 1.1e-38
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 973 157.7 1.1e-38
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 967 156.8 2e-38
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 958 155.5 5.2e-38
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 934 151.9 6e-37
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 895 146.1 3.3e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 889 145.2 6.3e-35
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 886 144.7 8.5e-35
>>CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2018 init1: 2018 opt: 2018 Z-score: 1649.5 bits: 313.4 E(32554): 1.5e-85
Smith-Waterman score: 2018; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKRRLVPSERE
:::::::::::
CCDS31 LKRRLVPSERE
310
>>CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1673 init1: 1673 opt: 1677 Z-score: 1375.0 bits: 262.6 E(32554): 2.9e-70
Smith-Waterman score: 1677; 82.3% identity (93.5% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
:. : :::::: :::.:::.. : ::: :: :::::::.::.::::::::::.::::::
CCDS31 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
::::::.:::::::: ::::::.::::. ::::...:.::.:.::::::::.::::::::
CCDS31 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
: :.::::::::.::::::.::.:: :::.:::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
:::::::.:::::.::.:::::::::. . :.:::.::::::: :::..: :::::::::
CCDS31 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
:::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::.:::::::::: :::.
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKRRLVPSERE
::::: :::
CCDS31 LKRRLGQSERILIQ
310
>>CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1758 init1: 1651 opt: 1651 Z-score: 1354.1 bits: 258.7 E(32554): 4.2e-69
Smith-Waterman score: 1651; 81.4% identity (92.9% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
::. : :::::::::::::... :::::::: :::.::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MEMENCTRVKEFIFLGLTQNREVSLVLFLFLLLVYVTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
:::.::.: :::::: :.::::.::::..::::.. :.::.:::::.::.:.:::::::.
CCDS53 FLLHNLSIADICFSSITVPKVLVDLLSERKTISFNHCFTQMFLFHLIGGVDVFSLSVMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
: :.::::::::.::::: .: .: :.:.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVAISKPLHYATIMSRDHCIGLTVAAWLGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
: .::::. :: : ::.::::::::.:::::..::::: ::: .:::: :::::::::
CCDS53 VHRVLKLAHTDIFILELLMISNNGLLTTLWFFLLLVSYIVILSLPKSQAGEGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
:::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS53 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPMDKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNHEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKRRLVPSERE
::::::::.:.
CCDS53 LKRRLVPSDRK
310
>>CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1377 init1: 1377 opt: 1380 Z-score: 1135.9 bits: 218.3 E(32554): 6e-57
Smith-Waterman score: 1380; 66.3% identity (86.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
:. : : ::::.:: ::.:.. . ::. . ::..:.::: ::.::.:::::::::::
CCDS31 MDQINHTNVKEFFFLELTRSRELEFFLFVVFFAVYVATVLGNALIVVTITCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
::::: ..::: ::: :.:: :.:::: .:::::..::.:::.::. :::::: :::::.
CCDS31 FLLRNKSVLDIVFSSITVPKFLVDLLSDRKTISYNDCMAQIFFFHFAGGADIFFLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
: :.::.:::::::.: . .::. :::..: .:::.:. :.::.::::::.::.:::
CCDS31 DRYLAIAKPLHYVTMMRKEVWVALVVASWVSGGLHSIIQVILMLPFPFCGPNTLDAFYCY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
: ::.::.::::::::..::::::::: :::..:: ::::::. :::..: :: ::.:::
CCDS31 VLQVVKLACTDTFALELFMISNNGLVTLLWFLLLLGSYTVILVMLRSHSGEGRNKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
:::. :::::::::.:.: ::: .:: . .::.. :::.:.:::.::.::::::::::.:
CCDS31 TSHMLVVTLHFVPCVYIYCRPFMTLPMDTTISINNTVITPMLNPIIYSLRNQEMKSAMQR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKRRLVPSERE
:.::: :::
CCDS31 LQRRLGPSESRKWG
310
>>CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 (310 aa)
initn: 1375 init1: 1375 opt: 1375 Z-score: 1131.9 bits: 217.6 E(32554): 1e-56
Smith-Waterman score: 1375; 63.4% identity (89.2% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
:: :.:.:. :..::..:.:. . :::.. :::.::..:::::::::: . :::::::
CCDS42 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
:::::::..:.:.:..:.::.:.:.: . ::::: .::.:::.::::::. .: :::::.
CCDS42 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
: :.:::.::.:::::. :..:. :.:.:::::::::..:.:::::::::.::.::::
CCDS42 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
:::::.:.:::: ::::::::.::.. .::..::.::::::. :::..: .:::: :::
CCDS42 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
:.:: ::.. :.::::.:. ::: . .::.:...::..:.:::.:::::::.::.::::
CCDS42 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKRRLVPSERE
: . ::
CCDS42 LGKCLVICRE
310
>>CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 (307 aa)
initn: 1398 init1: 1346 opt: 1351 Z-score: 1112.6 bits: 214.0 E(32554): 1.2e-55
Smith-Waterman score: 1351; 63.8% identity (87.6% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
:: ::.: :..:.::::.:... . :::.. .::.::..::.::..::: .:.::::::
CCDS32 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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250 260 270 280 290 300
310
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: : :::
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CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
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CCDS31 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
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: ::
CCDS31 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
310
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CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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CCDS32 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
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310
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:
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CCDS31 FFLAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAY
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CCDS31 MYPLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTC
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CCDS31 SSHMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKK
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CCDS31 LWRRDLISSST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]