FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5924, 311 aa
1>>>pF1KE5924 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2066+/-0.00117; mu= 10.0202+/- 0.067
mean_var=138.9464+/-41.845, 0's: 0 Z-trim(103.0): 369 B-trim: 806 in 2/47
Lambda= 0.108805
statistics sampled from 6741 (7210) to 6741 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 2082 339.2 2.4e-93
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1272 212.1 4.6e-55
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1217 203.4 1.8e-52
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1212 202.7 3.1e-52
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1197 200.4 1.7e-51
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1180 197.6 1e-50
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1170 196.1 3e-50
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1164 195.1 5.9e-50
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1153 193.4 1.9e-49
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1145 192.1 4.6e-49
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CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1130 189.8 2.4e-48
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CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1115 187.4 1.2e-47
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1097 184.6 8.5e-47
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1097 184.6 8.6e-47
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1003 169.9 2.4e-42
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 989 167.6 1.1e-41
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CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 938 159.6 2.7e-39
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 938 159.6 2.7e-39
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 935 159.2 3.9e-39
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CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 931 158.5 5.9e-39
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CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 925 157.6 1.2e-38
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CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 909 155.1 6.5e-38
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 906 154.6 9e-38
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 905 154.5 1e-37
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 904 154.3 1.1e-37
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 903 154.2 1.3e-37
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 900 153.7 1.8e-37
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 900 153.7 1.8e-37
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 900 153.7 1.9e-37
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 899 153.6 2.1e-37
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 898 153.4 2.4e-37
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 895 152.9 3e-37
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 893 152.6 3.8e-37
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 893 152.6 3.8e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 893 152.6 3.8e-37
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 891 152.3 4.9e-37
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 885 151.3 8.9e-37
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 884 151.2 9.9e-37
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 882 150.9 1.2e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 881 150.7 1.4e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 881 150.8 1.5e-36
>>CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 (311 aa)
initn: 2082 init1: 2082 opt: 2082 Z-score: 1789.3 bits: 339.2 E(32554): 2.4e-93
Smith-Waterman score: 2082; 99.7% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHRLNHFFCEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHRLNHFFCEM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGTC
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PVFLKLACADTEGTEAKMFVARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 WKVLWRGRDSG
:::::::::::
CCDS34 WKVLWRGRDSG
310
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 1265 init1: 728 opt: 1272 Z-score: 1102.1 bits: 212.1 E(32554): 4.6e-55
Smith-Waterman score: 1272; 59.6% identity (84.9% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
: :.: : ::.:.:::: :::: .::..:. :: :.:.::: .: . :: :::::::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
::::.:: .:.:::::..::::... :.:.. :::::::.. ..:::.::.::.:::.
CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFCE
::::::::::.:.:::::..: .:: ..: .:...:::: .:.. .:::::: :.:.:::
CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 MPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
.::..::::.:: .::..:.: :. . ::. ::: :: :..::::.::.:::.:::::
CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
:.:::.::..:::. :. ::: . :. .::::.:::::.::.:::.::::::::::::
CCDS31 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
: ..: : .:
CCDS31 L-RTLILGSAAGQSHKD
310
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1231 init1: 769 opt: 1217 Z-score: 1055.5 bits: 203.4 E(32554): 1.8e-52
Smith-Waterman score: 1217; 56.9% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (2-305:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHT
:. :.: : :::::::.::.:: ..:: ..::: .::.:: .:: ::.:: .:::
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVV
:::::::.::.::::.:::..::::.:: : ..::. .::. ::.. ::::.::::::::
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MAFDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHF
:..:::::::::::: ..:::..:. ::.::: .::.:: ....... .:::::: ..::
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCEMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKA
:::.:..:.:.:.::. .: .... : : .: ::: :: :..:.::..::.: .:.
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FGTCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDV
:::::.::..: ::. :. ::: . :. .:::.:::::..:: ::::::::::: :
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KGALWKVL-WRGRDSG
.::. ... :
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1212; 60.0% identity (82.3% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
:: : : :::.:::: :.:: .::::...:: ::: :: :: .:.:: ::::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
::::.:::::.::::: .:: :.:: .::: :::::::.: ::::::::.::. ::.
CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
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pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCG-HRLNHFFCE
::: :::.::::..::.:.::: :: :: .:...:::.. ... .:::: :::.::.::
CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 MPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
.:..:::::.:: .: .:.. :. :..: ::: :: :..::::.::. .:.:::.:
CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
:.::: ::..:::. ::.::: .:.. .:::..::::..:: :::.::::::::.: :
CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
: :.:
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1184 init1: 708 opt: 1197 Z-score: 1037.8 bits: 200.4 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1197; 58.4% identity (82.3% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
:. : : . :::. ::: : :: ::.... : ::.::: :: .: .:..::::::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
::::.:::::::.:::::::.:.:.:.. ..:. :::::::::.::::::::.::.:: :
CCDS46 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFCE
::..:.:::::: ::: .:: :: ::: .:: ::..:. .. ::::::. ..:::::
CCDS46 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 MPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
.:..:::.:.:: ..::..:. :. . .:..::: ::. :..::::..:. :.::::::
CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
:::::.:: ::::.:: ::: :. .::.:.:: ::.:.:::::::::::.:: :
CCDS46 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
. ...
CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
>>CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 745 init1: 745 opt: 1180 Z-score: 1024.1 bits: 197.6 E(32554): 1e-50
Smith-Waterman score: 1180; 57.4% identity (82.2% similar) in 303 aa overlap (5-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPM
:.: :: :::.:::.::::: .::: :.::: .:: :: .:: ::..: .:::::
CCDS43 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHRL-NHFFC
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CCDS43 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG
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CCDS43 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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CCDS43 TCGAHLMVVSLFFIPVMCMYLQPPSENSPDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKHVKG
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALWKVL-WRGRDSG
: ..: :
CCDS43 AAKRLLGWEWGK
310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS10 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF
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CCDS10 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIACLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
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CCDS10 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
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CCDS10 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
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300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
: ..: .::. :
CCDS10 LRRLLGKGREVG
310
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10 20 30 40 50
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pF1KE5 YFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMA
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CCDS16 YFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
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pF1KE5 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFC
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CCDS16 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
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pF1KE5 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG
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CCDS16 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
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pF1KE5 TCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKG
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CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
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pF1KE5 ALWKVLWRGRDSG
::
CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
310 320
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CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
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CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
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CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
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CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
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CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
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310
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CCDS31 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
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