Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5923
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5923, 311 aa
1>>>pF1KE5923 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4382+/-0.00115; mu= 15.0582+/- 0.067
mean_var=181.3641+/-64.070, 0's: 0 Z-trim(104.0): 423 B-trim: 423 in 1/46
Lambda= 0.095235
statistics sampled from 7179 (7698) to 7179 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 1.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 2067 297.1 1.1e-80
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1241 183.7 1.7e-46
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1215 180.1 2e-45
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1205 178.7 5.2e-45
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1197 177.6 1.1e-44
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1192 176.9 1.8e-44
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1175 174.6 9e-44
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1163 172.9 2.9e-43
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1123 167.4 1.3e-41
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1120 167.1 1.8e-41
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1109 165.5 4.9e-41
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1109 165.5 4.9e-41
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1093 163.3 2.2e-40
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1087 162.5 3.9e-40
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1076 161.0 1.1e-39
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1069 160.1 2.3e-39
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1067 159.7 2.6e-39
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1066 159.6 2.9e-39
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1060 158.8 5.1e-39
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1058 158.5 6.2e-39
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1057 158.4 6.8e-39
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1057 158.4 6.9e-39
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1056 158.2 7.5e-39
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1051 157.5 1.2e-38
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1038 155.8 4.2e-38
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1037 155.6 4.6e-38
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1031 154.8 8e-38
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1026 154.1 1.3e-37
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1025 154.0 1.5e-37
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1022 153.5 1.9e-37
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1007 151.5 8.4e-37
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 977 147.4 1.4e-35
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 969 146.3 3e-35
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 958 144.7 8.4e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 958 144.8 8.6e-35
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 954 144.2 1.2e-34
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 954 144.2 1.2e-34
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 948 143.4 2.3e-34
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 933 141.3 9.2e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 931 141.0 1.1e-33
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 929 140.8 1.3e-33
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 925 140.2 2e-33
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 924 140.1 2.2e-33
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 917 139.1 4.2e-33
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 916 139.0 4.6e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 913 138.6 6.1e-33
CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 ( 328) 910 138.2 8.4e-33
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 908 137.9 1e-32
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 904 137.3 1.4e-32
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 903 137.2 1.6e-32
>>CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 2067 init1: 2067 opt: 2067 Z-score: 1561.7 bits: 297.1 E(32554): 1.1e-80
Smith-Waterman score: 2067; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCDIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 YVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCDIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGALK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RLFSHRSIVSS
:::::::::::
CCDS68 RLFSHRSIVSS
310
>>CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 (330 aa)
initn: 1241 init1: 1241 opt: 1241 Z-score: 948.1 bits: 183.7 E(32554): 1.7e-46
Smith-Waterman score: 1241; 60.1% identity (82.7% similar) in 301 aa overlap (3-303:22-322)
10 20 30 40
pF1KE5 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNL
::...:.:.: :.: ::.: :::::: :::::..:::
CCDS35 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 LIILAIGSDLHLHTPMYFFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYF
::::::.:: ::::::::::::::..: .::... :::.::.:. . :::.:::.:.::
CCDS35 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FLMFGDLDSFFLAAMAYDRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLM
.:::: ::. .::.::::::::::.:: ::: : ::.:::::..:::::: :: ::.:.
CCDS35 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 ARLSFCVTGEIAHFFCDITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVP
.:..::. : ::.:: . .:::.:::::.::.:....: : ::.: :: ::..:
CCDS35 TRVAFCAQKAIPHFYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 AILRVRTRGGVGKAFSTCSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTP
:.. . . :: ::::::.::: :: .:::.:...:: ::: : :.. ::..: .. :
CCDS35 AVFVISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 MLNPFIYSLRNKDMKGALKRLFSHRSIVSS
::::::::::.::: :: .::
CCDS35 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
310 320 330
>>CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 (313 aa)
initn: 1212 init1: 1212 opt: 1215 Z-score: 929.1 bits: 180.1 E(32554): 2e-45
Smith-Waterman score: 1215; 56.3% identity (82.8% similar) in 309 aa overlap (3-311:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
::.: :.:.: :.: :::. ::..:.::::: ..:::::::::. : :::::::
CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAY
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CCDS32 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCD
::.::::::: :. .: ..: :... :... ...::: .::::: :: . :. :.:::
CCDS32 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFST
.::.:.:::.:: .:........: :. .::.::..:: .:. ::..: . :: :::::
CCDS32 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGA
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CCDS32 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LKRLFSHRSIVSS
:..: . :.:.::
CCDS32 LRKLVN-RKITSSS
310
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 1293 init1: 1203 opt: 1205 Z-score: 921.6 bits: 178.7 E(32554): 5.2e-45
Smith-Waterman score: 1205; 57.0% identity (81.3% similar) in 305 aa overlap (2-306:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
.::.:::.:.: :. ::::. ...:: :::.:: ::::::. : : :::::::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAY
.::.:::: :. ..: :. :.: :.:.. .: :. :::::::::.::::.::.:.::::
CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCD
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CCDS11 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFST
.. .:::. :::..:: ..:..:: .:..::: :. :: .:: .::.: . :. :::::
CCDS11 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGA
:.::: :: .::::... ::: . .: :: . : :::.::::::::::::::.:::::
CCDS11 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LKRLFSHRSIVSS
:.:.. ..
CCDS11 LSRVIHQKKTFFSL
310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1222 init1: 1197 opt: 1197 Z-score: 915.7 bits: 177.6 E(32554): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1197; 54.4% identity (83.2% similar) in 309 aa overlap (2-310:4-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
:::::.:::.: . :::: .: .:: :::.:. ::::::: : : ::::::.
CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAY
:::..:...:..:.: :: :::...::. ..: :.::.::::::..: :::.:.:..:::
CCDS35 FFLSHLALTDISLSSVTVPKMLLSMQTQDQSILYAGCVTQMYFFIFFTDLDNFLLTSMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCD
:::::::::: :.:.:. .: :.... :.:. ::.::.:.:.::::. . : :::::
CCDS35 DRYVAICHPLRYTTIMKEGLCNLLVTVSWILSCTNALSHTLLLAQLSFCADNTIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFST
.. .::::::: .::...:..: .:. .:..::. :: :: .::.. . :. ::.::
CCDS35 LVALLKLSCSDISLNELVIFTVGQAVITLPLICILISYGHIGVTILKAPSTKGIFKALST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGA
:.::: :: ..:::... :. : : :: .::. :..:::..::.::::::::::.:.:::
CCDS35 CGSHLSVVSLYYGTIIGLYFLPSSSASSDKDVIASVMYTVITPLLNPFIYSLRNRDIKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LKRLFSHRSIVSS
:.:::.. ...:
CCDS35 LERLFNRATVLSQ
310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1279 init1: 1192 opt: 1192 Z-score: 912.0 bits: 176.9 E(32554): 1.8e-44
Smith-Waterman score: 1192; 58.3% identity (83.3% similar) in 300 aa overlap (3-302:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
::::.:::.: :.: :.::. :: .:: :::.:. :::::::... : ::::::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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CCDS35 LGKLFSRATFFSW
310
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CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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CCDS35 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
310 320
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CCDS11 MEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGSFLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMY
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CCDS11 DCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWIMNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCD
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CCDS11 LRKLIWVRKIHSP
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CCDS32 MEPEKQTEISEFFLQGLSEKPEHQTLLFTMFLSTYLVTIIGNALIILAIITDSHLHTPMY
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