Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5922
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5922, 311 aa
1>>>pF1KE5922 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9454+/-0.000532; mu= 17.5816+/- 0.033
mean_var=96.7286+/-25.374, 0's: 0 Z-trim(107.2): 358 B-trim: 855 in 1/49
Lambda= 0.130406
statistics sampled from 14764 (15255) to 14764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 5.260
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 972 194.1 3.1e-49
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 837 168.7 1.4e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 837 168.7 1.4e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 831 167.6 3e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 831 167.6 3e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 831 167.6 3e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 826 166.6 5.7e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 817 164.9 1.8e-40
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NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 806 162.9 7.8e-40
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XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 785 158.9 1.2e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 782 158.3 1.8e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 762 154.6 2.4e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 762 154.6 2.4e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 732 149.0 1.2e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 708 144.5 2.8e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 516 108.3 2.1e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 458 97.4 4e-20
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 203 49.5 1.2e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 201 49.1 1.5e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 196 48.1 2.8e-05
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NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 193 47.6 4.3e-05
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 192 47.7 7.1e-05
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NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 188 46.7 9e-05
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 188 46.7 9.1e-05
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NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 188 46.7 9.2e-05
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 188 46.7 9.3e-05
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 188 46.8 9.4e-05
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 188 46.8 9.4e-05
NP_001286 (OMIM: 601159) C-C chemokine receptor ty ( 355) 187 46.5 9.6e-05
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 188 46.8 9.8e-05
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 188 46.8 0.0001
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 188 46.8 0.0001
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 188 46.8 0.0001
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 188 46.8 0.0001
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 187 46.6 0.00011
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 185 46.0 0.00011
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 185 46.0 0.00011
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 185 46.0 0.00011
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 185 46.1 0.00012
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 184 45.9 0.00014
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 184 46.0 0.00016
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 972; 47.1% identity (77.1% similar) in 297 aa overlap (5-301:3-299)
10 20 30 40 50 60
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310
pF1KE5 LRNCHVNSWKN
:
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 AAMWKLRNCHVNSWKN
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
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pF1KE5 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
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pF1KE5 LTAHITVVILFFGPCIYFYIWPFRRLPVDK--FLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAA
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pF1KE5 MWKLRNCHVNSWKN
. :.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGV-RCRSSSGSSKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 MWKLRNCHVNSWKN
. :.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 837; 43.1% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (1-301:11-314)
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pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIIS
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pF1KE5 EMMLLVAMAYDRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCG
. .::..::::.:.:.:.::::.. :...::...:. :.:. :. . : . . : ::.
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pF1KE5 SLRNEDVKAAMWKLRNCHVNSWKN
::::. .:.:. :.
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 831; 41.4% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)
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pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
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310
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::
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 822 init1: 609 opt: 831 Z-score: 861.5 bits: 167.6 E(85289): 3e-41
Smith-Waterman score: 831; 41.4% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)
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::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 833 init1: 601 opt: 817 Z-score: 847.4 bits: 164.9 E(85289): 1.8e-40
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
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NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
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NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]