Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5920
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5920, 310 aa
1>>>pF1KE5920 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9797+/-0.00139; mu= 11.9801+/- 0.081
mean_var=156.1010+/-48.477, 0's: 0 Z-trim(100.6): 387 B-trim: 703 in 2/46
Lambda= 0.102653
statistics sampled from 5708 (6183) to 5708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.512), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1998 308.8 3.4e-84
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1205 191.4 7.7e-49
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1191 189.3 3.2e-48
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1160 184.7 7.8e-47
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1130 180.3 1.7e-45
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1103 176.3 2.8e-44
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1094 174.9 6.8e-44
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1074 172.0 5.3e-43
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1068 171.1 9.9e-43
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1058 169.6 2.8e-42
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1056 169.3 3.3e-42
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1056 169.3 3.4e-42
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1055 169.2 3.7e-42
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1053 168.9 4.6e-42
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1051 168.6 5.6e-42
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1049 168.3 6.9e-42
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1046 167.8 9.5e-42
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1046 167.9 1e-41
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 1043 167.4 1.3e-41
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1038 166.7 2.2e-41
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1035 166.2 2.9e-41
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1035 166.2 2.9e-41
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1034 166.1 3.2e-41
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1027 165.0 6.6e-41
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1027 165.0 6.7e-41
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1027 165.1 7e-41
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1026 164.9 7.3e-41
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1022 164.3 1.1e-40
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1015 163.3 2.3e-40
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1013 162.9 2.8e-40
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 1013 163.0 2.8e-40
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1010 162.5 3.8e-40
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1008 162.2 4.6e-40
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1005 161.8 6.4e-40
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1000 161.0 1.1e-39
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 999 160.9 1.2e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 997 160.6 1.5e-39
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 988 159.2 3.6e-39
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 985 158.8 5e-39
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 983 158.5 6e-39
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 983 158.5 6.2e-39
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 982 158.4 6.7e-39
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 980 158.1 8.3e-39
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 971 156.8 2.2e-38
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 967 156.1 3.1e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 967 156.2 3.2e-38
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 966 156.0 3.5e-38
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 966 156.0 3.5e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 962 155.4 5.3e-38
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 960 155.1 6.4e-38
>>CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1998 init1: 1998 opt: 1998 Z-score: 1625.1 bits: 308.8 E(32554): 3.4e-84
Smith-Waterman score: 1998; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY
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CCDS31 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSINHFFCDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSINHFFCDT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRVIHRKLFP
::::::::::
CCDS31 LRVIHRKLFP
310
>>CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1133 init1: 822 opt: 1205 Z-score: 990.4 bits: 191.4 E(32554): 7.7e-49
Smith-Waterman score: 1205; 58.1% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY
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CCDS31 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY
:::..:.:::. ::...:::.:.:. .. :::.:::.::.::: : :::::.::::
CCDS31 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSI-NHFFCD
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CCDS31 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST
:. .:::::.::. :.. .::: ::. ::. :...:. :.:.::.:.:..:.:::.::
CCDS31 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA
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CCDS31 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LLRVIHRKLFP
:.::..:.
CCDS31 LIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1096 init1: 791 opt: 1191 Z-score: 979.1 bits: 189.3 E(32554): 3.2e-48
Smith-Waterman score: 1191; 57.8% identity (85.7% similar) in 308 aa overlap (1-307:2-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPM
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CCDS31 MMGRRNDTNVADFILTGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
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pF1KE5 YFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMA
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CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-ISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMA
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pF1KE5 YNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSI-NHFFC
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CCDS31 YDRYAAICSPLHYTVIMPKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFC
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pF1KE5 DTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFS
::. .:::::.:: .:::. :..:: ::. ::. :...:. :.:.::.:.:..:.:::::
CCDS31 DTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFS
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pF1KE5 TCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKN
::.:::..::::::..:::::.: .. :: . ::: :::::::::::::::::::..:::
CCDS31 TCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALLRVIHRKLFP
::.::..:.
CCDS31 ALIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1098 init1: 783 opt: 1160 Z-score: 954.3 bits: 184.7 E(32554): 7.8e-47
Smith-Waterman score: 1160; 56.8% identity (86.0% similar) in 308 aa overlap (1-307:2-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPM
:. : :.:. ::: :.. :.:..::..::.:::.:.:::.:.: .::.: ::::::
CCDS31 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMA
::::..:.:::. ::..::::.:.:. .. :::.:::.::.::. : ::.::.:::
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-ISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSS-INHFFC
..:: :::.:: :.:.::... : . :::::: .:...: .: : : ::. :.::::
CCDS31 HDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFYDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFS
::. .:::::.::..::.. :...: ::. ::. :...:..:. .::.:.:..:.:::::
CCDS31 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKN
::.:::..:::::..::::::.: .. :: . ::::::::::::.:::::::::::.:::
CCDS31 TCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPVLNPLIYSLRNKEVKN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALLRVIHRKLFP
:..::..:.
CCDS31 AVIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 665 init1: 614 opt: 1130 Z-score: 930.3 bits: 180.3 E(32554): 1.7e-45
Smith-Waterman score: 1130; 53.9% identity (82.1% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY
:. .:.: .: :.: :.:. :::. :::.:: :: .:::::::.: :::.:::::::::
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY
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CCDS31 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSS-INHFFCD
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CCDS31 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST
. :. ::: ::. : .: .::: .....::.: .: .. .:. ..:. ::..::::
CCDS31 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA
::::: :. .::.. :.:::.:... ::.: .:::::::.:::::::::::::.:.::.:
CCDS31 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LLRVIHRKLFP
: :: ::
CCDS31 LANVISRKRTSSFL
310
>>CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 1103 init1: 1103 opt: 1103 Z-score: 908.5 bits: 176.3 E(32554): 2.8e-44
Smith-Waterman score: 1103; 53.4% identity (80.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:18-326)
10 20 30 40
pF1KE5 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNL
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CCDS31 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
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50 60 70 80 90 100
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CCDS31 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
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CCDS31 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
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170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SSLAFCDSSINHFFCDTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISA
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CCDS31 LKLPYCEHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILSS
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230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ILRIQSAAGRQKAFSTCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPM
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CCDS31 ILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIPM
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290 300 310
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CCDS31 LNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
310 320
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CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
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300 310
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CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
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CCDS31 IPPLLALSCSDTRISKLVVFV-AGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
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CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
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300
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CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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CCDS31 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRNA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]