Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5919
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5919, 310 aa
1>>>pF1KE5919 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0496+/-0.00117; mu= 11.4105+/- 0.068
mean_var=152.5765+/-50.140, 0's: 0 Z-trim(103.6): 378 B-trim: 445 in 1/48
Lambda= 0.103832
statistics sampled from 6998 (7474) to 6998 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 2059 321.0 7.2e-88
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 2027 316.2 2e-86
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 1625 256.0 2.7e-68
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1444 228.9 3.9e-60
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1444 228.9 3.9e-60
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1329 211.7 5.9e-55
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1279 204.2 1.1e-52
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 1267 202.4 3.8e-52
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1247 199.4 3e-51
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 905 148.2 7.8e-36
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 881 144.6 9.4e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 881 144.6 9.5e-35
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 877 144.0 1.5e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 877 144.0 1.6e-34
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 872 143.2 2.5e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 869 142.8 3.4e-34
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 868 142.6 3.7e-34
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 867 142.5 4e-34
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 861 141.6 7.6e-34
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 861 141.6 7.8e-34
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 860 141.4 8.5e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 859 141.3 9.5e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 856 140.8 1.3e-33
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 854 140.5 1.6e-33
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 854 140.5 1.6e-33
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 854 140.5 1.6e-33
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 853 140.4 1.7e-33
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 853 140.4 1.7e-33
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 847 139.5 3.3e-33
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 845 139.2 4e-33
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 845 139.2 4e-33
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 845 139.2 4e-33
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 845 139.2 4e-33
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 844 139.1 4.5e-33
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 841 138.6 6e-33
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 841 138.6 6e-33
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 839 138.3 7.5e-33
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 837 138.0 9.1e-33
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 837 138.0 9.2e-33
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 837 138.0 9.5e-33
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 836 137.8 1e-32
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 836 137.9 1e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 836 137.9 1.1e-32
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 835 137.7 1.1e-32
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 835 137.7 1.1e-32
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 835 137.7 1.1e-32
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 835 137.7 1.1e-32
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 835 137.8 1.2e-32
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 834 137.5 1.3e-32
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 833 137.4 1.4e-32
>>CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 2059 init1: 2059 opt: 2059 Z-score: 1691.1 bits: 321.0 E(32554): 7.2e-88
Smith-Waterman score: 2059; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
::::::::::
CCDS55 KRVLGVERAL
310
>>CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 (310 aa)
initn: 2027 init1: 2027 opt: 2027 Z-score: 1665.1 bits: 316.2 E(32554): 2e-86
Smith-Waterman score: 2027; 99.0% identity (99.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS51 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
::::::::::
CCDS51 KRVLGVERAL
310
>>CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1758 init1: 1623 opt: 1625 Z-score: 1339.7 bits: 256.0 E(32554): 2.7e-68
Smith-Waterman score: 1625; 80.2% identity (89.3% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
:: : ::::::::::::.::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::.::::
CCDS43 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::: ::.:::.:::::::::::::::: : : ::: .:: ::::::::::::
CCDS43 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
:::::::::: .::::.::::::.::: ::::.:.:::::::: :: :::. ::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
.:::::::::::::: ::::::.: ::: . . :.::. ::::::.::: : .::: :
CCDS43 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
:::::.:::::::::::: :.: .::::::::::::::::::::::: ::::.::..::
CCDS43 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
::.: .:
CCDS43 KRMLEKKRTS
310
>>CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1494 init1: 1444 opt: 1444 Z-score: 1193.2 bits: 228.9 E(32554): 3.9e-60
Smith-Waterman score: 1444; 71.3% identity (87.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
::.: : .:::::::: .::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::.::::
CCDS43 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::. ::::.::.::::::::::::: : :::: .:. .::::::.::::
CCDS43 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
:::::::::: .:::::::::::::::: : ::.: :.::.: ::: :..: ::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
:.::.:::::: .:. ...:. . :::: : ..::: :: :::.::: : .:::: ::
CCDS43 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
:::::.:::.:.:::::..:. .:.::.: ..::.:.::: ::::: ::::.:::..:
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
.:.:: :
CCDS43 RRALGKESHS
310
>>CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1494 init1: 1444 opt: 1444 Z-score: 1193.2 bits: 228.9 E(32554): 3.9e-60
Smith-Waterman score: 1444; 71.3% identity (87.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
::.: : .:::::::: .::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::.::::
CCDS56 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
::::::::::::. ::::.::.::::::::::::: : :::: .:. .::::::.::::
CCDS56 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
:::::::::: .:::::::::::::::: : ::.: :.::.: ::: :..: ::::::
CCDS56 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
:.::.:::::: .:. ...:. . :::: : ..::: :: :::.::: : .:::: ::
CCDS56 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
:::::.:::.:.:::::..:. .:.::.: ..::.:.::: ::::: ::::.:::..:
CCDS56 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLGVERAL
.:.:: :
CCDS56 RRALGKESHS
310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1323 init1: 928 opt: 1329 Z-score: 1100.0 bits: 211.7 E(32554): 5.9e-55
Smith-Waterman score: 1329; 65.5% identity (84.8% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
: : : .:::.:::::.. :::::: :::::.:::::::::.::::: ::::::.::::
CCDS43 MTKNQTWVTEFILLGFPLSLRIQMLLSGLFSLLYVFTLLGNGAILGLIWLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNL-LHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSY
::::::..::.:: :.::.::.:: :. : :::. :::::. .:: ::::.::.:::
CCDS43 FLSHLAIIDISYASNNVPKMLTNLGLNKRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DLYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCE
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300 310
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310
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310
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CCDS43 KRVLWKQRSM
310
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pF1KE5 KRVLGVERAL
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CCDS43 HRALQRKRSMRTVYGLCL
310
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CCDS43 RRALRKERLT
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>>CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 (312 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]