Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5917
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5917, 310 aa
1>>>pF1KE5917 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3589+/-0.00105; mu= 15.3902+/- 0.061
mean_var=185.3803+/-64.866, 0's: 0 Z-trim(104.8): 399 B-trim: 455 in 1/49
Lambda= 0.094198
statistics sampled from 7566 (8079) to 7566 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 1.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 2045 291.0 7.6e-79
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 2045 291.0 7.6e-79
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1663 239.1 3.2e-63
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 1562 225.4 4.4e-59
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1537 222.0 4.6e-58
CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 1485 214.9 6.2e-56
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1476 213.7 1.4e-55
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 1470 212.9 2.6e-55
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 1462 211.8 5.5e-55
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1024 152.3 4.6e-37
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1014 150.9 1.2e-36
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1006 150.0 2.7e-36
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1004 149.6 3e-36
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 999 148.9 4.8e-36
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 998 148.8 5.2e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 993 148.1 8.4e-36
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 992 148.0 9.2e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 990 147.7 1.1e-35
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 989 147.6 1.2e-35
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 987 147.3 1.5e-35
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 987 147.3 1.6e-35
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 983 146.7 2.1e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 983 146.8 2.3e-35
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 981 146.4 2.6e-35
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 980 146.3 2.8e-35
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 973 145.4 5.6e-35
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 973 145.4 5.6e-35
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 972 145.2 6.1e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 969 144.8 8.1e-35
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 968 144.7 8.9e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 964 144.1 1.3e-34
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 963 144.0 1.4e-34
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 961 143.7 1.7e-34
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 960 143.6 1.9e-34
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 959 143.5 2.1e-34
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 959 143.5 2.2e-34
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 954 142.8 3.3e-34
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 954 142.8 3.3e-34
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 953 142.6 3.6e-34
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 952 142.5 4e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 952 142.5 4e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 951 142.4 4.5e-34
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 951 142.4 4.6e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 949 142.1 5.3e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 948 142.0 5.8e-34
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 948 142.0 5.8e-34
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 946 141.7 7.1e-34
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 945 141.6 7.7e-34
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 945 141.6 7.7e-34
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 944 141.4 8.5e-34
>>CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 2045 init1: 2045 opt: 2045 Z-score: 1529.0 bits: 291.0 E(32554): 7.6e-79
Smith-Waterman score: 2045; 98.7% identity (99.4% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::::::::::::
CCDS56 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRALGKESHS
::::::::::
CCDS56 RRALGKESHS
310
>>CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 2045 init1: 2045 opt: 2045 Z-score: 1529.0 bits: 291.0 E(32554): 7.6e-79
Smith-Waterman score: 2045; 98.7% identity (99.4% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: ::::::::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRALGKESHS
::::::::::
CCDS43 RRALGKESHS
310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1680 init1: 1244 opt: 1663 Z-score: 1248.4 bits: 239.1 E(32554): 3.2e-63
Smith-Waterman score: 1663; 81.2% identity (92.2% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
: .::: ::::.:::: :. :::::: :::::.:.::::::::::::: :::::::::::
CCDS43 MTKNQTWVTEFILLGFPLSLRIQMLLSGLFSLLYVFTLLGNGAILGLIWLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANL-LHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSY
::::::..::.:: :.::.::.:: :. : :::. : :::: ..:.:.:::.::.:::
CCDS43 FLSHLAIIDISYASNNVPKMLTNLGLNKRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
:::.::::::.::::: : :: .::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRYMAICHPLQYSVIMRWGVCTVLAVTSWACGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFST
:::::.:::::::::::::::: ::.:::: :::::::.::::::::::::::::::::
CCDS43 ILSVLKLACADTWLNQVVIFAASVFILVGPLCLVLVSYSRILAAILRIQSGEGRRKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGA
::::::.:::::::::.::::::::::::::::. ::::.::: ::::::::::.:::::
CCDS43 CSSHLCMVGLFFGSAIVMYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRRALGKESHS
:.:.: :.
CCDS43 LKRVLWKQRSK
310
>>CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1614 init1: 1562 opt: 1562 Z-score: 1174.2 bits: 225.4 E(32554): 4.4e-59
Smith-Waterman score: 1562; 74.5% identity (89.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
:: ::: .:::::::: .:::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::
CCDS43 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
::::::::::: ::.::::::.::::::::::::::::: :: :::.:.::::::.::::
CCDS43 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCEI
::::::::::::.::::.::::::.::: : ::::::.::.: : ::::...:::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
..::.:::::: .:.:...:. : ::: ...:: ::: :::.:::::: .:::: :
CCDS43 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
::::::::::.:.:::::. :. . :.::.: ..::.:.::: :::::::::: ::.:.:
CCDS43 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRALGKESHS
.: : :. :
CCDS43 KRMLEKKRTS
310
>>CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1515 init1: 1515 opt: 1537 Z-score: 1155.8 bits: 222.0 E(32554): 4.6e-58
Smith-Waterman score: 1537; 74.6% identity (87.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
: :.: .:.. : : .:: ...:: :::: :: .::::::.:.:.: :: .:::::::
CCDS43 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
::::::.:::.:: : ::.::.::.. . ::: :. :::: :.:.: :::.::.::::
CCDS43 FLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCEI
::. :::::::. .:.:::: .:::.::. . ::::: .:::: ::::::::::::::::
CCDS43 RYADICHPLRYNSLMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILSLPFCGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
::::.:::::::::::::::::::.:::: :::::: .:::::::::::::::::::::
CCDS43 LSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
:::::::::::::::. :::::::::::::::. ::::.::: ::::::::::.::::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RRALGKESHS
:::: ::
CCDS43 RRALRKERLT
310
>>CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1555 init1: 1485 opt: 1485 Z-score: 1117.7 bits: 214.9 E(32554): 6.2e-56
Smith-Waterman score: 1485; 72.3% identity (88.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
::.: : .:::::::: .::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::.::::
CCDS55 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
::::::::::::::::::.::.::::::::::::: : :::: .:. .::::::.::::
CCDS55 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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310
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.:.:: :
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310
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310
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pF1KE5 RRALGKESHS
.:.:: :
CCDS51 KRVLGVERAL
310
>>CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 (318 aa)
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CCDS43 HRALQRKRSMRTVYGLCL
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>>CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 (330 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]