Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5916
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5916, 310 aa
1>>>pF1KE5916 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5621+/-0.000556; mu= 20.2126+/- 0.034
mean_var=117.9783+/-32.388, 0's: 0 Z-trim(107.5): 378 B-trim: 1969 in 2/50
Lambda= 0.118079
statistics sampled from 14983 (15548) to 14983 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 5.320
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1000 182.3 1.1e-45
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 1000 182.3 1.1e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 1000 182.3 1.1e-45
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 964 176.2 7.7e-44
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 958 175.1 1.6e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 947 173.3 5.7e-43
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 938 171.7 1.6e-42
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 931 170.5 3.8e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 931 170.5 3.8e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 931 170.6 3.9e-42
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 926 169.7 6.8e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 908 166.6 5.7e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 907 166.5 6.5e-41
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 893 164.1 3.4e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 892 163.9 3.8e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 875 161.0 2.8e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 869 160.0 5.7e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 840 155.1 1.8e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 826 152.7 9.2e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 771 143.3 6e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 543 104.5 3e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 543 104.5 3e-22
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 239 52.7 1.2e-06
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 212 48.2 3.3e-05
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 212 48.2 3.3e-05
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 212 48.2 3.3e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 212 48.2 3.3e-05
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 212 48.2 3.3e-05
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 207 47.3 5.3e-05
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 207 47.3 5.3e-05
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 207 47.3 5.5e-05
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 207 47.3 5.5e-05
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 207 47.3 5.5e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 203 46.6 8.3e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 199 45.9 0.00014
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 198 46.1 0.00021
NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 195 45.2 0.00022
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 187 43.8 0.00055
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 187 43.8 0.00055
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 188 44.2 0.00056
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 186 43.8 0.00067
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 186 43.8 0.0007
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 184 43.3 0.00077
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMY
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pF1KE5 VFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCY
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300 310
pF1KE5 LKRVLWKQRSM
...:::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMY
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pF1KE5 VFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCY
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pF1KE5 IMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFST
...: .:::.:: :.:.....: .:. :.::::.::..:. .::.::: :::.::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 LKRVLWKQRSM
...:::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1000; 48.2% identity (79.9% similar) in 303 aa overlap (4-306:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 VFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQ
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pF1KE5 IMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFST
...: .:::.:: :.:.....: .:. :.::::.::..:. .::.::: :::.::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE5 LKRVLWKQRSM
...:::
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
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pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
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pF1KE5 KRVLWKQRSM
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NP_009 RRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 958; 45.6% identity (80.7% similar) in 296 aa overlap (12-306:16-311)
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pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MCYDRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE5 FCQIMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE5 FSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310
pF1KE5 KGALKRVL-WKQRSM
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 947; 47.0% identity (79.3% similar) in 300 aa overlap (4-303:5-302)
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pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMY
::: .:: .:::.. : : .:: .: : .:..:: ....:...::.::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 VFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQ
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFST
... :: .::. .....: .. ::. :. :.:::: .:.:......: : :::::
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQE--KSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LKRVLWKQRSM
:..:
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 978 init1: 938 opt: 938 Z-score: 884.3 bits: 171.7 E(85289): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 938; 47.6% identity (77.2% similar) in 294 aa overlap (4-297:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYF
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pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
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XP_011 FLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFD
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pF1KE5 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
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XP_011 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV
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pF1KE5 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
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XP_011 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC
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pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGAL
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XP_011 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRG
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310
pF1KE5 KRVLWKQRSM
XP_011 S
300
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 992 init1: 929 opt: 931 Z-score: 877.7 bits: 170.5 E(85289): 3.8e-42
Smith-Waterman score: 931; 43.0% identity (77.5% similar) in 302 aa overlap (3-304:4-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 VFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQ
:..::.::::.:: :. ..:..:.. :. . : .:.: :. : ::. . :.::::.
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300 310
pF1KE5 LKRVLWKQRSM
::.:.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 992 init1: 929 opt: 931 Z-score: 877.7 bits: 170.5 E(85289): 3.8e-42
Smith-Waterman score: 931; 43.0% identity (77.5% similar) in 302 aa overlap (3-304:4-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMY
.::. ..: .:::.. .: . .:: ::: .: :..:: .:. . .:: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 VFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCY
:::.:..::. .. .:::::::: ... ..::: :. : .. . :. . ..:..: :
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQ
:..::.::::.:: :. ..:..:.. :. . : .:.: :. : ::. . :.::::.
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFST
. ..::.:.::.::.:.... .:.... :. .:.::.:: ..:.. : .:: :::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE5 LKRVLWKQRSM
::.:.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 992 init1: 929 opt: 931 Z-score: 877.5 bits: 170.6 E(85289): 3.9e-42
Smith-Waterman score: 931; 43.0% identity (77.5% similar) in 302 aa overlap (3-304:14-315)
10 20 30 40
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIY
.::. ..: .:::.. .: . .:: ::: .: :..:: .:. .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LDSRLHTPMYVFLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAIT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 ECLILVMMCYDRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 PQKINHFFCQIMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 GEGRRKAFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]