Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5916
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5916, 310 aa
1>>>pF1KE5916 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5378+/-0.00127; mu= 14.7365+/- 0.074
mean_var=184.7870+/-68.041, 0's: 0 Z-trim(102.2): 398 B-trim: 771 in 2/46
Lambda= 0.094349
statistics sampled from 6307 (6843) to 6307 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 2053 292.8 2.3e-79
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1606 231.9 4.8e-61
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1563 226.1 2.8e-59
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 1529 221.4 7e-58
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1452 210.9 9.9e-55
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1452 210.9 9.9e-55
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 1358 198.2 7e-51
CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 1279 187.4 1.2e-47
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 1264 185.4 5e-47
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1017 151.8 7.1e-37
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 991 148.2 7.7e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 987 147.7 1.1e-35
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 977 146.3 2.9e-35
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 977 146.3 2.9e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 977 146.3 2.9e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 973 145.8 4.2e-35
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 972 145.6 4.7e-35
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 964 144.5 9.8e-35
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 964 144.5 9.8e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 962 144.3 1.2e-34
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 958 143.7 1.7e-34
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 958 143.8 1.8e-34
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 957 143.6 2e-34
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 956 143.4 2.1e-34
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 956 143.4 2.1e-34
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 951 142.8 3.3e-34
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 951 142.8 3.4e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 950 142.6 3.7e-34
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 949 142.5 4e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 947 142.2 4.8e-34
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 945 142.0 6e-34
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 944 141.8 6.5e-34
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 944 141.8 6.5e-34
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 944 141.8 6.7e-34
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 939 141.1 1e-33
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 939 141.2 1.1e-33
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 938 141.0 1.1e-33
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 936 140.7 1.4e-33
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 935 140.6 1.5e-33
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 935 140.6 1.5e-33
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 934 140.5 1.7e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 933 140.3 1.9e-33
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 931 140.0 2.2e-33
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 931 140.0 2.2e-33
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 930 139.9 2.5e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 929 139.8 2.7e-33
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 929 139.8 2.7e-33
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 929 139.8 2.7e-33
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 929 139.8 2.8e-33
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 927 139.6 3.4e-33
>>CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 2053 init1: 2053 opt: 2053 Z-score: 1538.2 bits: 292.8 E(32554): 2.3e-79
Smith-Waterman score: 2053; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLWKQRSM
::::::::::
CCDS43 KRVLWKQRSM
310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1239 init1: 1239 opt: 1606 Z-score: 1209.4 bits: 231.9 E(32554): 4.8e-61
Smith-Waterman score: 1606; 76.8% identity (91.6% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
: .::::.:: ::::: .. ....: :.: :.: .::.::: :::::.::::::::::
CCDS43 MTKNQTWVTEFILLGFPLSLRIQMLLSGLFSLLYVFTLLGNGAILGLIWLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHK-KVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCY
:::::::.:.::::..:::::.:: ..: :.:::.:: .:::::.::: ::::::::: :
CCDS43 FLSHLAIIDISYASNNVPKMLTNLGLNKRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQ
:::.::::::::..:: : :::::: : : . ::::::..::::::::::..::::::.
CCDS43 DRYMAICHPLQYSVIMRWGVCTVLAVTSWACGSLLALVHVVLILRLPFCGPHEINHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IMSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFST
:.::.::::::: :::::.::.:.:::::::::::::: .::.:::::::::::::::::
CCDS43 ILSVLKLACADTWLNQVVIFAASVFILVGPLCLVLVSYSRILAAILRIQSGEGRRKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGA
::::::.::::::::::::::::: : .:..:.::::::::::.::::::::::::::::
CCDS43 CSSHLCMVGLFFGSAIVMYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LKRVLWKQRSM
::::::::::
CCDS43 LKRVLWKQRSK
310
>>CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1638 init1: 1563 opt: 1563 Z-score: 1177.8 bits: 226.1 E(32554): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1563; 74.7% identity (91.2% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
::.:.::::.. : ::: ::::..: :.: ::.:::.:::.:.:.: :: .::::::
CCDS43 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
:::::::::.::::. :::::.::. ....::: :::.::::::::: .::::::.: ::
CCDS43 FLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
::. :::::.:. .:.:::::::: . :.:::::::: ..::: ::::::..::::::.:
CCDS43 RYADICHPLRYNSLMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILSLPFCGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
.::.::::::: :::::.::. .:::::::::::::::.::.::::::::::::::::::
CCDS43 LSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGAL
:::::::::::::::: :::::: : .:..:.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLWKQRSM
.:.: :.:
CCDS43 RRALRKERLT
310
>>CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 (318 aa)
initn: 1529 init1: 1529 opt: 1529 Z-score: 1152.6 bits: 221.4 E(32554): 7e-58
Smith-Waterman score: 1529; 70.3% identity (91.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
::.::::::.. :::::: ::: ..: :.: .::.:::.:::.:.:.: :::.::::::
CCDS43 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
:::::::.::::::..::::::::. .:..:::.:::.:::::::::.:::::::.: ::
CCDS43 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
::::::::.:::.::.:::::.:. : : .: :.::: :.::::::::. .::.::.:
CCDS43 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
.::.::::::: .::::.:: .:.::::: :.::::.::: :::.::. ::: ::::::
CCDS43 LSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGAL
:::::::::::: :.:.::.: :.. .:..:.::::.:.:::.:::::::::::..::::
CCDS43 SSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLWKQRSM
.:.: ..:::
CCDS43 HRALQRKRSMRTVYGLCL
310
>>CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1471 init1: 1449 opt: 1452 Z-score: 1096.1 bits: 210.9 E(32554): 9.9e-55
Smith-Waterman score: 1452; 69.7% identity (87.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
: ::: .:: .:::: . : ....:::.: ::: .::.::: ::::: ::::::::::
CCDS56 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
::::::.::..:. .:::.:::::. : :::: :. :::: :.:. .:::.::.: ::
CCDS56 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
:::::::::.:..::.:::: .:: : : . ::::.:..::::::: ::..::::::.:
CCDS56 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
.::..:::::: :::::.::. .:.:::: :::::: :::.::::::::::::::::::
CCDS56 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIVMYMAPKSSHSQERRKILSLFYSLFNPILNPLIYSLRNAEVKGAL
:::::::::::::::.::::::: : .:..:.. ::::.::: ::::::::::.::::::
CCDS56 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRVLWKQRSM
.:.: :.
CCDS56 RRALGKESHS
310
>>CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1471 init1: 1449 opt: 1452 Z-score: 1096.1 bits: 210.9 E(32554): 9.9e-55
Smith-Waterman score: 1452; 69.7% identity (87.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
: ::: .:: .:::: . : ....:::.: ::: .::.::: ::::: ::::::::::
CCDS43 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
::::::.::..:. .:::.:::::. : :::: :. :::: :.:. .:::.::.: ::
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250 260 270 280 290 300
310
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310
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CCDS43 KRMLEKKRTS
310
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CCDS55 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
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CCDS55 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
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pF1KE5 KRVLWKQRSM
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310
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CCDS51 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
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pF1KE5 FLSHLAIVDMSYASSTVPKMLANLVMHKKVISFAPCILQTFLYLAFAITECLILVMMCYD
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CCDS51 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
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pF1KE5 RYVAICHPLQYTLIMNWRVCTVLASTCWIFSFLLALVHITLILRLPFCGPQKINHFFCQI
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CCDS51 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
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pF1KE5 MSVFKLACADTRLNQVVLFAGSAFILVGPLCLVLVSYLHILVAILRIQSGEGRRKAFSTC
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CCDS51 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
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CCDS51 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
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pF1KE5 KRVLWKQRSM
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CCDS51 KRVLGVERAL
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CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]