Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5915
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5915, 309 aa
1>>>pF1KE5915 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9323+/-0.00046; mu= 17.7122+/- 0.028
mean_var=119.9839+/-32.536, 0's: 0 Z-trim(110.2): 409 B-trim: 1086 in 1/48
Lambda= 0.117088
statistics sampled from 17841 (18455) to 17841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 7.130
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 922 167.6 3e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 922 167.6 3e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 922 167.6 3e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 903 164.4 2.7e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 884 161.1 2.5e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 881 160.7 3.6e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 868 158.4 1.6e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 855 156.2 7.6e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 854 156.1 8.3e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 845 154.6 2.5e-37
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 812 149.0 1.2e-35
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 812 149.0 1.2e-35
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 812 149.0 1.2e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 785 144.4 2.7e-34
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 781 143.8 4.4e-34
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 778 143.2 6.3e-34
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 760 140.2 5.3e-33
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 756 139.5 8.2e-33
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 752 138.8 1.3e-32
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 694 129.0 1.2e-29
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 523 100.2 5.8e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 501 96.5 7.7e-20
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 245 53.2 8e-07
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 218 48.8 2.2e-05
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 218 48.8 2.2e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 218 48.8 2.2e-05
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 218 48.8 2.2e-05
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 218 48.8 2.2e-05
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 215 48.3 3e-05
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 210 47.4 5.3e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 210 47.4 5.3e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 210 47.5 5.6e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 204 46.5 0.00012
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 204 46.5 0.00012
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 202 46.0 0.00013
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 197 45.1 0.00023
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 197 45.3 0.00026
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 196 45.1 0.00028
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 194 44.7 0.00034
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 194 44.7 0.00034
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 194 44.7 0.00034
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 194 44.7 0.00034
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 194 44.7 0.00035
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 194 44.7 0.00035
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 194 44.7 0.00035
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 194 44.7 0.00035
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 194 44.7 0.00036
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 194 44.8 0.00037
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 194 44.8 0.00037
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 194 44.8 0.00037
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 922; 45.2% identity (77.9% similar) in 303 aa overlap (4-305:5-307)
10 20 30 40 50
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300
pF1KE5 LRRALRKERLT
.. : :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 922; 45.2% identity (77.9% similar) in 303 aa overlap (4-305:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSY
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pF1KE5 DRYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF-CE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 ILSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFST
.:.:..:::.:: :.:.:... . .:. :.::::.::..:...::.::: :::.::: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRRALRKERLT
.. : :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 922; 45.2% identity (77.9% similar) in 303 aa overlap (4-305:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF-CE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 ILSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFST
.:.:..:::.:: :.:.:... . .:. :.::::.::..:...::.::: :::.::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRRALRKERLT
.. : :
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 903; 45.8% identity (78.3% similar) in 299 aa overlap (4-301:5-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMY
:.: .:.. : .. :: : :: .. . : .:.::: ...... .: .::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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::: .:...:. ...: ::. :..:......:.: : . ...: :. ..: .:.::::
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pF1KE5 DRYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF-CE
:::. ::.:::: .:.:.::. ::..::. ..:...: ..:::::. : . : :: ::
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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..: :: .:: ....:: : ::. :. :.:::: ::........: : :::::
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:.::: :: ::.::::.:::.::: ..:.: .:.::.. .:::::::::::: .::.:
NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSS--KQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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300
pF1KE5 LRRALRKERLT
::.
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 884; 45.1% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (4-306:3-306)
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pF1KE5 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMYF
:.. . : :. :.:: : . . : :::.:: .:. . :: :::.::::
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYF
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pF1KE5 FLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYD
:::.:...:. .... ::.::.:: . ..::::. : .: :..:... .::..:.::..:
NP_009 FLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFD
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pF1KE5 RYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF-CEI
::. .:.::.: .. :.: :: ..::.... ..: :.:::: .... : ::.
NP_009 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV
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pF1KE5 LSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
....:.: :: :.. . .: ::::: :: :.:::: : :.:::.:..::::::.::
NP_009 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC
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pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGAL
:::: :: ::..:.:..:. ::. . .:. : ..:::.. .: ::::::.::: :: :.
NP_009 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAF
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300
pF1KE5 RRALRKERLT
:: : ::
NP_009 RRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 902 init1: 441 opt: 881 Z-score: 824.1 bits: 160.7 E(85289): 3.6e-39
Smith-Waterman score: 881; 45.6% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (3-305:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEGNKTWITDITLPRFQVGPA-LEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPM
:: : :... : :. :. .. :: : ..: .:: ::..:. . : ::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMS
:::: .:....:.. ::::: .:. :..::::. : : .... :. .::..:..:.
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF-C
::::. :: ::.: ..:. :. . ::.::: .: .: : . .. .:::: ...::: :
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EILSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFS
. ::::.:::: : .. ... ..... : :.: :: :: ::::.: :..:..::::
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKG
:::::: ::.::. :. .::. ::: . :..:.::: :.. .:::::.::::::.:::.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 ALRRALRKERLT
:: :...:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 864 init1: 497 opt: 868 Z-score: 812.3 bits: 158.4 E(85289): 1.6e-38
Smith-Waterman score: 868; 44.1% identity (76.6% similar) in 290 aa overlap (16-303:20-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHT
:. : ::... . :: .::.:: :. . :: .:::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVV
:::::::.:...:. :... .:..:.:: . :.:::. :..: .. ::.. .::..:::
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSYDRYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF
::::::: .:.::.:..:: : : .::::::: .: . . . . .:.:: ....::
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 -CEILSVLKLACADTWLNQV-VIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRK
::. ..:.:.:.:: .:.. ..... .:.:. :: :.:.:: :. ::::.:: : .:
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLI-PLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFSTCSSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAE
.:.::..:: .:.::: :. :. : : . ..: : ..:::.. .: ::::::.:::
NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 VKGALRRALRKERLT
:.::..: .
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 858 init1: 466 opt: 855 Z-score: 800.5 bits: 156.2 E(85289): 7.6e-38
Smith-Waterman score: 855; 42.3% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEG-NKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMY
::. : : .. . : .. : :. .: ::: ..: .:.::: .:. . : .::::::
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSY
::::.:..::: . :. :::::.... . . ::.. :. :... . :: .. ..:.::.:
NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF-CE
::.. :::::.:...:. .: .:..::: . : ..:: ..:. :: : :: :: ::
NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ILSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFST
.:::.::..: ::..:...: ... : :. .: :: .:..... ..: .:. :::::
NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGA
:.::::::.::.:... .:.. : ..... :..:.. .:::::.:::::: .::::
NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRRALRKERLT
:.: : .
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 885 init1: 437 opt: 854 Z-score: 799.7 bits: 156.1 E(85289): 8.3e-38
Smith-Waterman score: 854; 44.6% identity (75.5% similar) in 294 aa overlap (4-296:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMYF
:.. . : :. :.:: : . . : :::.:: .:. . :: :::.::::
XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYD
:::.:...:. .... ::.::.:: . ..::::. : .: :..:... .::..:.::..:
XP_011 FLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 RYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILRLPFCGPHEINHF-CEI
::. .:.::.: .. :.: :: ..::.... ..: :.:::: .... : ::.
XP_011 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
....:.: :: :.. . .: ::::: :: :.:::: : :.:::.:..::::::.::
XP_011 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 SSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGAL
:::: :: ::..:.:..:. ::. . .:. : ..:::.. .: ::::::.::: : :
XP_011 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRG
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 RRALRKERLT
XP_011 S
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 844 init1: 465 opt: 845 Z-score: 791.3 bits: 154.6 E(85289): 2.5e-37
Smith-Waterman score: 845; 43.7% identity (73.3% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEG-NKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMY
:.: : . : . : :. : :: .: .. : :::.:: .:. . :: .::::::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSY
:::.::...:.:.... .:..: :: . ..:::.. : .: ::.:... ::::.:.::.:
NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYADICHPLRYNILMSWRVCTVLAVASWVFSFL--LALVPLVLILRLPFCGPHEINHFC
:: . ::.::.: ..:. :.: :. ..: . ::. :.. :::: :: ::..::
NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVT--LRLPRCGHHEVDHFL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 -EILSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAF
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NP_001 REMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVK
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::: : : .:
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]