Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5912
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5912, 310 aa
1>>>pF1KE5912 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5857+/-0.00141; mu= 13.8484+/- 0.083
mean_var=133.5845+/-44.186, 0's: 0 Z-trim(100.1): 360 B-trim: 699 in 2/45
Lambda= 0.110968
statistics sampled from 5545 (5978) to 5545 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 1.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 2052 341.0 7e-94
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 1404 237.3 1.2e-62
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1318 223.5 1.7e-58
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 985 170.2 1.9e-42
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 980 169.4 3.3e-42
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 967 167.3 1.4e-41
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 946 164.0 1.4e-40
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 897 156.1 3.2e-38
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 889 154.8 7.9e-38
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 878 153.1 2.8e-37
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 872 152.1 5.2e-37
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 870 151.8 6.5e-37
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 855 149.4 3.4e-36
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 846 147.9 9.3e-36
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 846 147.9 9.4e-36
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 838 146.7 2.3e-35
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 823 144.3 1.2e-34
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 807 141.7 7.1e-34
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 804 141.2 1e-33
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 789 138.8 5.2e-33
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 785 138.2 8.2e-33
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 784 138.1 9.8e-33
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 773 136.2 3.1e-32
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 770 135.8 4.3e-32
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 767 135.3 6.1e-32
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 752 132.9 3.2e-31
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 748 132.3 5e-31
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 748 132.3 5.1e-31
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 740 131.0 1.2e-30
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 740 131.0 1.2e-30
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 740 131.0 1.2e-30
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 736 130.3 1.9e-30
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 731 129.5 3.3e-30
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 729 129.2 4.1e-30
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 717 127.3 1.5e-29
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 699 124.4 1.2e-28
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 683 121.8 6.7e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 663 118.6 6.3e-27
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 655 117.4 1.6e-26
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 643 115.4 5.7e-26
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 638 114.6 1e-25
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 634 114.0 1.6e-25
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 620 111.7 7.3e-25
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 613 110.6 1.6e-24
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 613 110.7 1.7e-24
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 582 105.7 5e-23
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 580 105.4 6.2e-23
CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 576 104.8 1e-22
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 559 102.0 6.3e-22
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 551 100.7 1.5e-21
>>CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 2052 init1: 2052 opt: 2052 Z-score: 1798.9 bits: 341.0 E(32554): 7e-94
Smith-Waterman score: 2052; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSLHEPMYYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSLHEPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQSFIHSLAIVESGILLVLAYDCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQSFIHSLAIVESGILLVLAYDCF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGSRALLHTFCLHQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGSRALLHTFCLHQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASGQEEAKSLNTCVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASGQEEAKSLNTCVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPIIYSIKTKQIQRSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPIIYSIKTKQIQRSI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 IRLFSGQSRA
::::::::::
CCDS77 IRLFSGQSRA
310
>>CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 992 init1: 992 opt: 1404 Z-score: 1238.2 bits: 237.3 E(32554): 1.2e-62
Smith-Waterman score: 1404; 67.6% identity (88.1% similar) in 312 aa overlap (1-310:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSLHEPMYYF
: :.::. : :::: : : .:. : . ... :.:.:.:::::: :: :::.::::::::
CCDS31 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNLHEPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQS-FIHSLAIVESGILLVLAYDC
::::: ::::.:.:::::::::: ::.:::.:.:::.:. :::.:...:::.::..::::
CCDS31 LAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVMESGVLLAMAYDC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FIAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGSRALLHTFCLHQ
::.::.::::. ::::..::.::. :: :. .::.::.. :. .::: :..: :.:::::
CCDS31 FITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRSHVLSHAFCLHQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DVIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASGQEEAKSLNTCV
:::::::::::::..::.. :.:: :::.:::::::::::::.:: :.::.:::::
CCDS31 DVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSGGERAKALNTCV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPIIYSIKTKQIQRS
::: :.:::..::. :.::::::::.:::: :::::.:::::::.::.:::::::::: .
CCDS31 SHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFIYSIKTKQIQSG
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IIRLFS-GQSRA
:.:::: .:::
CCDS31 ILRLFSLPHSRA
310
>>CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1319 init1: 904 opt: 1318 Z-score: 1163.8 bits: 223.5 E(32554): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1318; 64.7% identity (87.3% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSLHEPMYYF
: ..:. ::::::: : : .:. ::. :. .:.:.::::::::.:: .::.::::::.:
CCDS31 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQS-FIHSLAIVESGILLVLAYDC
::::: ::::...:::::::::: ::.:::. ::::.:. :::::...::::::..:::
CCDS31 LAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFIHSLSFLESGILLAMAYDR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FIAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGSRALLHTFCLHQ
:::: .::::. .:::.::..::::::::::.:..: : :: . :: :..: :.:::::
CCDS31 FIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRPLYFFLYCHSHVLSHAFCLHQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DVIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASGQEEAKSLNTCV
::::::::: :::..:: . . . :: :::..::.::::::..::: .:.::.: :::
CCDS31 DVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKALITCV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPIIYSIKTKQIQRS
::: :::::..::.:::.::::::..::.: . :::..:::::..::: ::.:::::: .
CCDS31 SHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQIQNA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IIRLFSGQSRA
:..::.
CCDS31 ILHLFTTHRIGT
310
>>CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 729 init1: 729 opt: 985 Z-score: 875.6 bits: 170.2 E(32554): 1.9e-42
Smith-Waterman score: 985; 49.3% identity (78.1% similar) in 302 aa overlap (5-305:16-317)
10 20 30 40
pF1KE5 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWN
.. . :::::: : : . .:. : :: ::.:: .: .::.
CCDS31 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DHSLHEPMYYFLAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQS-FIHSLAIVE
. :::.::.:::.::: ::: : ..:. ::::.: :::. .:..:: :::.:...:
CCDS31 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 SGILLVLAYDCFIAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGS
:..::..:.: .::: .::::. ::::::...::: .. :.:. : : :. : . ::
CCDS31 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 RALLHTFCLHQDVIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASG
. : :.::::::...:::.:: :: : .. . ..:::..:.::::::::.:...::
CCDS31 HILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVASQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 QEEAKSLNTCVSHISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPII
.:. : ..::.::: ::::.: ...:...:::::: :. . .. ...::::..::::
CCDS31 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 YSIKTKQIQRSIIRLFSGQSRA
::.::.::. ..::::
CCDS31 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
310 320
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 986 init1: 707 opt: 980 Z-score: 871.4 bits: 169.4 E(32554): 3.3e-42
Smith-Waterman score: 980; 50.7% identity (76.4% similar) in 296 aa overlap (10-304:17-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSL
:::.:. : : .: ::. . .:. . :: :.: .: ...::
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HEPMYYFLAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQSF-IHSLAIVESGIL
::::: ::.::: :::... :.:::::.. . :::.: :::.: : :: ....::..:
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LVLAYDCFIAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGSRALL
: .:.: :.:: ::.: ::::. . ::: : :. :.:. . : .::::: .:
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HTFCLHQDVIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASGQEEA
:..::::.:.::::::. : :: .. :: .:.:.:.::: :::.::..::: :.
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KSLNTCVSHISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPIIYSIK
:.:::::::: ::.:. ..::: ::::::.:::.: ..:.....:::: .:::.::.:
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TKQIQRSIIRLFSGQSRA
::::. . . :
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 983 init1: 676 opt: 967 Z-score: 860.1 bits: 167.3 E(32554): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 967; 47.9% identity (76.2% similar) in 311 aa overlap (2-309:4-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MWYNNSA-GP-FLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSLHEP
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310
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