Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5911
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5911, 310 aa
1>>>pF1KE5911 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5335+/-0.00123; mu= 14.2238+/- 0.072
mean_var=179.9858+/-64.581, 0's: 0 Z-trim(102.7): 411 B-trim: 418 in 1/49
Lambda= 0.095599
statistics sampled from 6552 (7062) to 6552 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 1.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 ( 310) 2064 297.9 6.5e-81
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 1628 237.8 8.3e-63
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 895 136.7 2.2e-32
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 871 133.4 2.2e-31
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 870 133.2 2.4e-31
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 867 132.8 3.2e-31
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 859 131.8 7.2e-31
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 843 129.5 3.2e-30
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 837 128.7 5.8e-30
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 833 128.1 8.3e-30
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 829 127.6 1.2e-29
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 823 126.8 2.2e-29
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 821 126.5 2.6e-29
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 814 125.5 5.2e-29
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 811 125.1 6.9e-29
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 805 124.3 1.2e-28
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 804 124.2 1.4e-28
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 802 123.9 1.6e-28
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 799 123.4 2.1e-28
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 796 123.1 2.9e-28
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 786 121.7 7.5e-28
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 782 121.1 1.1e-27
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 782 121.1 1.1e-27
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 774 120.0 2.4e-27
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 774 120.0 2.4e-27
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 767 119.1 4.7e-27
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 765 118.8 5.6e-27
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 764 118.6 6.2e-27
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 761 118.2 8.4e-27
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 761 118.3 8.6e-27
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 760 118.1 9e-27
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 760 118.1 9e-27
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 757 117.7 1.2e-26
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 756 117.5 1.3e-26
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 754 117.2 1.6e-26
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 754 117.2 1.6e-26
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 752 117.0 2e-26
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 751 116.8 2.1e-26
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 749 116.6 2.6e-26
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 749 116.6 2.6e-26
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 747 116.3 3.1e-26
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 746 116.1 3.4e-26
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 746 116.2 3.5e-26
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 745 116.1 3.9e-26
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 744 115.9 4.1e-26
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 744 115.9 4.2e-26
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 744 115.9 4.3e-26
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 743 115.7 4.6e-26
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 742 115.6 5e-26
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 742 115.6 5.1e-26
>>CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 2064 init1: 2064 opt: 2064 Z-score: 1566.1 bits: 297.9 E(32554): 6.5e-81
Smith-Waterman score: 2064; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLLFLGCRQYLSLHVSLNFSCGTMEFALLGVMAVDRYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLLFLGCRQYLSLHVSLNFSCGTMEFALLGVMAVDRYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AVCNPLRYNIIMNSSTCIWVVIVSWVFGFLSEIWPIYATFQFTFRKSNSLDHFYCDRGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVCNPLRYNIIMNSSTCIWVVIVSWVFGFLSEIWPIYATFQFTFRKSNSLDHFYCDRGQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LKLSCDNTLLTEFILFLMAVFILIGSLIPTIVSYTYIISTILKIPSASGRRKAFSTFASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKLSCDNTLLTEFILFLMAVFILIGSLIPTIVSYTYIISTILKIPSASGRRKAFSTFASH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQGVEYNKIVSLLVSVLTPFLNPFIFTLRNDKVKEALRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQGVEYNKIVSLLVSVLTPFLNPFIFTLRNDKVKEALRDG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 MKRCCQLLKD
::::::::::
CCDS34 MKRCCQLLKD
310
>>CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 (314 aa)
initn: 1641 init1: 1137 opt: 1628 Z-score: 1241.1 bits: 237.8 E(32554): 8.3e-63
Smith-Waterman score: 1628; 78.3% identity (92.4% similar) in 314 aa overlap (1-310:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
:. :.::::::.:::::::. ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS43 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLLFLGCRQ-YLS---LHVSLNFSCGTMEFALLGVMAV
::.:::.:::::::::::.::::::. : . ::: ... : .. :: ::::::.:::
CCDS43 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAVCNPLRYNIIMNSSTCIWVVIVSWVFGFLSEIWPIYATFQFTFRKSNSLDHFYCD
::::::::::::::::: :: .::.:::::::: .:::.:. ::.:. ::: ...:.::
CCDS43 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RGQLLKLSCDNTLLTEFILFLMAVFILIGSLIPTIVSYTYIISTILKIPSASGRRKAFST
:::::::::.:::.:::::::::::.:.::::::::: .:::::::::::.:::::.:::
CCDS43 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQGVEYNKIVSLLVSVLTPFLNPFIFTLRNDKVKEA
:::::::::::::::::::::::::...:: .:::.:::.:::::::::::::::: ::
CCDS43 CASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVIEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRDGMKRCCQLLKD
::::.::::::...
CCDS43 LRDGVKRCCQLFRN
310
>>CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 886 init1: 473 opt: 895 Z-score: 694.7 bits: 136.7 E(32554): 2.2e-32
Smith-Waterman score: 895; 44.8% identity (77.1% similar) in 315 aa overlap (2-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
: : :..::. :..::. .. ::... : .: :: .:: .. .:.:::.::::
CCDS31 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLL-------FLGCRQYLSLHVSLNFSCGTMEFALLGV
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CCDS31 FLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCM----IQTYFYFFLGTVEFILLAV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAVDRYVAVCNPLRYNIIMNSSTCIWVVIVSWVFGFLSEIWPIYATFQFTFRKSNSLDHF
:. :::.:.:.::.:..:::: .:. .:. :: .::: ..: .. .. . ... ..::
CCDS31 MSFDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YCDRGQLLKLSCDNTLLTEFILFLMAVFILIGSLIPTIVSYTYIISTILKIPSASGRRKA
.:: . ::...: :: : : : ::........:: : ::.:::::::.:::..::.::
CCDS31 FCDIAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTFASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQGVEYNKIVSLLVSVLTPFLNPFIFTLRNDKV
::: :::.: : :..:: .:.::.:.:.....:.:....:..:.::.:::::..:::.::
CCDS31 FSTCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLITVVTPLLNPFIYSLRNEKV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KEALRDGMKRCCQLLKD
.:.::. ..: :..
CCDS31 QEVLRETVNRIMTLIQRKT
300 310
>>CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 (313 aa)
initn: 888 init1: 624 opt: 871 Z-score: 676.8 bits: 133.4 E(32554): 2.2e-31
Smith-Waterman score: 871; 44.4% identity (73.3% similar) in 315 aa overlap (2-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
: : :. .:: :::: . :. .:.. :...::...::::.:::.: .: .:..::::
CCDS47 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLL-------FLGCRQYLSLHVSLNFSCGTMEFALLGV
::...: :::::: :: :: :: : :: . .: :: :. : .:
CCDS47 FLGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFH----FSLGSTSFLILTD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAVDRYVAVCNPLRYNIIMNSSTCIWVVIVSWVFGFLSEIWPIYATFQFTFRKSNSLDHF
::.::.::.:.::::. .:. . :. .. ..:. ::. . . . .. . ... ..::
CCDS47 MALDRFVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAMVPTVLSRAHLDYCHGDVINHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YCDRGQLLKLSCDNTLLTEFILFLMAVFILIGSLIPTIVSYTYIISTILKIPSASGRRKA
.:: ::.:::..: : :: ::::. ....:.. :..:: ::..:.:.:::::. .::
CCDS47 FCDNEPLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTFASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQGVEYNKIVSLLVSVLTPFLNPFIFTLRNDKV
::: .::.: : :::.: .::::.: ....:. :.:.:..:::::::::::.:. :. :
CCDS47 FSTCGSHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KEALRDGMKRCCQLLKD
: .:. :.: : :
CCDS47 KTVLQGQMQRLKGLCKAQ
300 310
>>CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 907 init1: 677 opt: 870 Z-score: 676.1 bits: 133.2 E(32554): 2.4e-31
Smith-Waterman score: 870; 44.1% identity (72.3% similar) in 311 aa overlap (2-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
: ::. : :::. :. :. .:: ..:. :.... :: .::... ::..:..::::
CCDS31 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLLFLGCRQYLSLHVSLNFSC---GTMEFALLGVMAVD
:: ..: ::. ::. .: .:... . . .: : :. :: ::..:. :
CCDS31 FLRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 RYVAVCNPLRYNIIMNSSTCIWVVIVSWVFGFLSEIWPIYATFQFTFRKSNSLDHFYCDR
::::.:.::.: .:::. .: .:. :: :.. . :. .:. : ::..::: ::
CCDS31 RYVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GQLLKLSCDNTLLTEFILFLMAVFILIGSLIPTIVSYTYIISTILKIPSASGRRKAFSTF
: :::.::..: . : ...::::: :: .:. .:.:: ::. ::::.::.. :.:::::
CCDS31 GPLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQGVEYNKIVSLLVSVLTPFLNPFIFTLRNDKVKEAL
.::. : :.::::.:.:.::. . : :: ::.:.. ..:.:::::.:::: .::.:.
CCDS31 SSHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAF
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 RDGMKRCCQLLKD
:..:: : :
CCDS31 SDSIKRIAFLSKK
300 310
>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 880 init1: 671 opt: 867 Z-score: 673.9 bits: 132.8 E(32554): 3.2e-31
Smith-Waterman score: 867; 42.8% identity (72.8% similar) in 313 aa overlap (2-307:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMDNHSSATEFHLLGFPGSQGLHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIVIVCVDKRLQSPMYF
: :.. :: :::. .. :. ..: ..:. :.....:: .::... .: .::.::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYF
10 20 30 40 50
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pF1KE5 FLSHLSTLEILVTTIIVPMMLWGLL-------FLGCRQYLSLHVSLNFSCGTMEFALLGV
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