Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5910
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5910, 310 aa
1>>>pF1KE5910 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3278+/-0.00134; mu= 9.9859+/- 0.078
mean_var=125.2249+/-37.229, 0's: 0 Z-trim(101.8): 363 B-trim: 778 in 2/46
Lambda= 0.114612
statistics sampled from 6222 (6685) to 6222 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 2023 346.5 1.5e-95
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1188 208.5 5.6e-54
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1151 202.3 4e-52
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1129 198.7 5e-51
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1128 198.5 5.6e-51
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1127 198.4 6.5e-51
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1115 196.4 2.4e-50
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1111 195.7 3.8e-50
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1093 192.7 3e-49
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1093 192.7 3e-49
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1092 192.6 3.4e-49
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1090 192.3 4.7e-49
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1088 191.9 5.5e-49
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1085 191.4 7.7e-49
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1083 191.1 9.4e-49
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1082 190.9 1.1e-48
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1081 190.8 1.2e-48
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1076 189.9 2.1e-48
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1063 187.8 9.3e-48
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1062 187.6 1e-47
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1062 187.6 1e-47
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1038 183.7 1.6e-46
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1032 182.7 3.3e-46
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1031 182.5 3.6e-46
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1031 182.5 3.6e-46
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1029 182.2 4.6e-46
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1029 182.2 5.1e-46
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1022 181.0 1e-45
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1018 180.3 1.6e-45
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1017 180.2 1.9e-45
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1016 180.0 2e-45
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1015 179.8 2.3e-45
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1013 179.5 2.9e-45
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1012 179.4 3.2e-45
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1006 178.4 6.4e-45
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1006 178.4 6.4e-45
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1004 178.0 8.4e-45
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1003 177.9 8.9e-45
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1002 177.7 1e-44
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 1001 177.5 1.1e-44
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1000 177.4 1.3e-44
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 992 176.0 3.2e-44
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 991 175.9 3.6e-44
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 991 175.9 3.6e-44
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 986 175.1 6.8e-44
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 985 174.9 7.1e-44
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 983 174.6 8.9e-44
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 982 174.4 1e-43
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 981 174.2 1.1e-43
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 979 173.9 1.4e-43
>>CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 2023 init1: 2023 opt: 2023 Z-score: 1828.8 bits: 346.5 E(32554): 1.5e-95
Smith-Waterman score: 2023; 99.7% identity (99.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKLKNKILF
::::::::::
CCDS31 LKKLKNKILF
310
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1211 init1: 1166 opt: 1188 Z-score: 1082.5 bits: 208.5 E(32554): 5.6e-54
Smith-Waterman score: 1188; 57.7% identity (83.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:11-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQ
: . .:.:.:::...::... .:::.:: .:. :. .::::::::..:
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LHTPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLL
:::::::::: ::: : ::... :::::.:.:.::.: :.::: :: : : .::.:
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LSVMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEI
:..::.::: :: ::::: : .:.:.:.::.. .:.: ..: :: ..::: :::::.:
CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NHFFCDIPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGR
:::.:: :::: ::::::. : .:... .:: .: . :.::: :...::.. : :::
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FKALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRN
::.:::.:.: ::.:: ::.::::.::.::::..:::..:.:::...:.::::::::.:
CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KDVKEALKKLKNKILF
::::.::::.
CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
>>CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 (320 aa)
initn: 1165 init1: 1142 opt: 1151 Z-score: 1049.4 bits: 202.3 E(32554): 4e-52
Smith-Waterman score: 1151; 58.7% identity (82.6% similar) in 293 aa overlap (11-303:15-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLH
.: :::::: ...:.:: . : ::.... .:.:: .::::: .::
CCDS35 MNSENLTRAAVAPAEFVLLGITNRWDLRVALFLTCLPVYLVSLLGNMGMALLIRMDARLH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLS
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CCDS35 TPMYFFLANLSLLDACYSSAIGPKMLVDLLLPRATIPYTACALQMFVFAGLADTECCLLA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINH
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CCDS35 AMAYDRYVAIRNPLLYTTAMSQRLCLALLGASGLGGAVSAFVHTTLTFRLSFCRSRKINS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FFCDIPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFK
::::::::: .:::::..:::.::.. :::. .:. .. .:: .: .:....:.:: .
CCDS35 FFCDIPPLLAISCSDTSLNELLLFAICGFIQTATVLAITVSYGFIAGAVIHMRSVEGSRR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKD
: :: :::.:::.. :::.:::.::::::.:: :::.:.:::::.: :::::::::::.
CCDS35 AASTGGSHLTAVAMMYGTLIFMYLRPSSSYALDTDKMASVFYTLVIPSLNPLIYSLRNKE
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VKEALKKLKNKILF
:::::..
CCDS35 VKEALRQTWSRFHCPGQGSQ
310 320
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1117 init1: 1097 opt: 1129 Z-score: 1029.6 bits: 198.7 E(32554): 5e-51
Smith-Waterman score: 1129; 55.9% identity (83.3% similar) in 299 aa overlap (10-308:10-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
:.:...:.:. ..:::: ::: :: ... .:. .:.:. .. .:. :::
CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
.:::.::: :. ::: ::::...::. ::: ::::::.. : :::.:::.:..::.
CCDS31 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
::: :: ::::::. :: ::: ... .:. : . .:.:. :.::: ::::: .::::::
CCDS31 DRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
::::: :::.:::.:.:.::.. .::. ::. .:::: :...:: :.:. :: :..::
CCDS31 IPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
:.::: ::..: :.:::::..:..::::: ::....:::.: ::.::.:::.::::::.:
CCDS31 CASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKLKNKILF
:::: ..:
CCDS31 LKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
310 320
>>CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 1119 init1: 1095 opt: 1128 Z-score: 1028.7 bits: 198.5 E(32554): 5.6e-51
Smith-Waterman score: 1128; 54.9% identity (82.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:13-316)
10 20 30 40
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVL
.. .: . .: :.:...:.. ...: :: .:::.:.... .:::..:
CCDS31 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 IRMDYQLHTPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFA
: :. ::.:::.::. ::: :.::::.. :::::..::::::: : ::: :... : :.
CCDS31 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 DSECLLLSVMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCF
.::.::..::.::: :: :::::.:.:: :: :.:. :...: : :: . .: : :
CCDS31 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLSF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 CGSNEINHFFCDIPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEI
:::::: : ::..:::: .:::::.: .:..: : ::. :: :.::: .:.:..:..
CCDS31 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 HSAEGRFKALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPL
.::::: :..::: .::..:.:..::.:::: ::::::. :.: ..:.:::.:.:::::.
CCDS31 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 IYSLRNKDVKEALKKLKNKILF
::::::::::::.:.:
CCDS31 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
310 320
>>CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 (340 aa)
initn: 1104 init1: 1080 opt: 1127 Z-score: 1027.6 bits: 198.4 E(32554): 6.5e-51
Smith-Waterman score: 1127; 56.1% identity (82.1% similar) in 301 aa overlap (4-304:34-334)
10 20 30
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLA
.: . .: :.: :.:.. :..: :: .:.:
CCDS31 TFTGYNLYNLQVKTEMDKLSSGLDIYRNPLKNKTEVTMFILTGFTDDFELQVFLFLLFFA
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 IYLFTLIGNLGLVVLVIEDSWLHNPMYYFLSVLSFLDACYSTVVTPKMLVNFLAKNKSIS
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CCDS31 LHATIHIVATFSLSFCGSNEIRHVFCDMPPLLAISCSDTHTNQLLLFYFVGSIEIVTILI
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280 290 300 310
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CCDS31 VSIFYTIVIPKLNPIIYSLRNKEVKKAVKKMLKLVYK
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CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
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CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
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CCDS31 IPPLLALSCSDTRISKLVVF-VAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
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CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
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CCDS31 LWKILNKLYPQY
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CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTPVY
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CCDS31 FFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVMAY
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CCDS31 DRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFFCD
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CCDS31 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTPMY
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CCDS31 FLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVMAY
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CCDS31 VKRAIEMKHFLC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]