FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5906, 310 aa
1>>>pF1KE5906 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5199+/-0.000521; mu= 14.6013+/- 0.032
mean_var=112.1242+/-30.736, 0's: 0 Z-trim(108.5): 315 B-trim: 2008 in 2/46
Lambda= 0.121122
statistics sampled from 16102 (16553) to 16102 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 5.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 990 184.7 2.1e-46
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 826 156.0 9e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 822 155.3 1.4e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 802 151.8 1.7e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 798 151.1 2.7e-36
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 798 151.1 2.7e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 797 150.9 3e-36
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 793 150.3 5e-36
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NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 779 147.8 2.7e-35
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 772 146.6 6.3e-35
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 759 144.3 3e-34
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 750 142.7 9.2e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 741 141.2 2.7e-33
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 736 140.3 4.9e-33
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 726 138.5 1.6e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 714 136.4 7e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 504 99.7 7.9e-21
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 435 87.7 3.4e-17
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 222 50.5 5.6e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 212 48.8 1.9e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 208 48.2 3.6e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 199 46.5 9.2e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 182 43.5 0.0007
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XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 180 43.2 0.00097
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 180 43.2 0.00098
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 180 43.2 0.001
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 180 43.3 0.0011
NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 176 42.5 0.0015
NP_009163 (OMIM: 604525) histamine H3 receptor [Ho ( 445) 177 42.8 0.0016
XP_005260323 (OMIM: 604525) PREDICTED: histamine H ( 453) 177 42.8 0.0016
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 176 42.6 0.0018
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 176 42.6 0.0018
NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 174 42.1 0.0019
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 172 41.8 0.0025
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 171 41.7 0.003
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 170 41.4 0.003
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 169 41.2 0.0033
XP_016874705 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 170 41.5 0.0035
XP_011518927 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 170 41.5 0.0035
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 170 41.5 0.0035
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 169 41.3 0.0035
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XP_016874701 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 170 41.5 0.0036
XP_011518926 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 170 41.5 0.0036
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 990; 47.5% identity (75.6% similar) in 303 aa overlap (4-306:2-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSL-GSPM
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pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
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NP_001 YDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMC
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:: ...::: ::..: ... ..::.. : : :::.::.::: ..: .. . :::::
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NP_001 CVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIR
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310
pF1KE5 KLQNRRVTFQ
:: .:.
NP_001 KLCSRKDISGDK
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSS
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pF1KE5 MAYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSF
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pF1KE5 FCDLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKA
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NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFS--VDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEM
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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300 310
pF1KE5 KAAMKKLQNRRVTFQ
: : .:. .:
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 822; 39.9% identity (75.7% similar) in 301 aa overlap (5-302:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS
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pF1KE5 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSV--DKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA
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NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA
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pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ
...:.
NP_001 GIRKVFAFLKH
300
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCT-SRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSP
:.. .:::.: .. . ..:...:. :. .:.. . :: ::......:: ::: :
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHS-P
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NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
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NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
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pF1KE5 STCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVD--KLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMK
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NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
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pF1KE5 AAMKKLQNRRVTFQ
:...
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
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NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS
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NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSV--DKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ
: .::
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
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pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
::.: ::...:. :. ..:... ::...: : : .: ::.:: :: :.:::. ::
XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ
: .::
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 594 init1: 455 opt: 798 Z-score: 772.6 bits: 151.1 E(85289): 2.7e-36
Smith-Waterman score: 798; 42.3% identity (71.8% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM
10 20 30 40 50
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSV--DKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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300 310
pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ
: .::
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 689 init1: 501 opt: 797 Z-score: 771.7 bits: 150.9 E(85289): 3e-36
Smith-Waterman score: 797; 40.5% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (5-302:8-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHS
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pF1KE5 SPMYFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLV
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pF1KE5 SMAYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDS
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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pF1KE5 FFCDLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSK
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pF1KE5 ALSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVD--KLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEE
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pF1KE5 MKAAMKKLQNRRVTFQ
...:.:.:
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 539 init1: 429 opt: 793 Z-score: 768.0 bits: 150.2 E(85289): 4.9e-36
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pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHT-PM
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pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
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XP_011 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
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XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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:. ..::.: ::.. .:..:...:. .. :: .: :: : .. . . . ::.:
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pF1KE5 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDK--LLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA
::..:. :: ::.. : :: :.: :..: . .:.::. ::.:::.::.:::. .:.
XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ
:.::. .: :
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 539 init1: 429 opt: 793 Z-score: 768.0 bits: 150.2 E(85289): 4.9e-36
Smith-Waterman score: 793; 39.7% identity (71.9% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
:. : : ::::.: :: . . :...:.::...:.: .::::::...: : :::. ::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHT-PM
10 20 30 40 50
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pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
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NP_036 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
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NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTS-KALS
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NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
180 190 200 210 220 230
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NP_036 ALKKVVGRVVFSV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]