Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5906
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5906, 310 aa
1>>>pF1KE5906 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6169+/-0.00134; mu= 8.3852+/- 0.077
mean_var=177.4220+/-59.234, 0's: 0 Z-trim(102.6): 394 B-trim: 403 in 1/46
Lambda= 0.096288
statistics sampled from 6537 (7022) to 6537 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 2052 298.2 5.3e-81
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1382 205.2 5.9e-53
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1343 199.7 2.3e-51
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1335 198.6 5.1e-51
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1293 192.8 3e-49
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1289 192.2 4.3e-49
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1265 188.9 4.6e-48
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1233 184.4 9.3e-47
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1229 183.9 1.4e-46
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1225 183.3 2e-46
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1222 182.9 2.7e-46
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1214 181.8 5.9e-46
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1199 179.7 2.5e-45
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1165 175.0 6.6e-44
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1163 174.7 8e-44
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1157 173.9 1.4e-43
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1143 171.9 5.4e-43
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1137 171.1 9.7e-43
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1133 170.6 1.4e-42
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1132 170.4 1.6e-42
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1117 168.3 6.7e-42
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1117 168.3 6.7e-42
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1117 168.3 6.7e-42
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1116 168.2 7.4e-42
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1116 168.2 7.4e-42
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1112 167.6 1.1e-41
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1089 164.4 1e-40
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1074 162.4 4.2e-40
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1075 162.6 4.3e-40
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1071 161.9 5.6e-40
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1068 161.5 7.5e-40
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1066 161.2 9.1e-40
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1036 157.1 1.7e-38
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1033 156.7 2.2e-38
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1030 156.3 3.1e-38
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1028 156.0 3.5e-38
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1018 154.6 9.2e-38
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1009 153.3 2.2e-37
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1006 152.9 2.9e-37
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1006 152.9 2.9e-37
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 1005 152.8 3.2e-37
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 990 150.7 1.4e-36
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 988 150.4 1.6e-36
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 984 149.8 2.4e-36
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 980 149.3 3.6e-36
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 970 147.9 9.3e-36
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 954 145.7 4.4e-35
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 935 143.1 2.8e-34
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 922 141.2 9.4e-34
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 920 141.0 1.2e-33
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 2052 init1: 2052 opt: 2052 Z-score: 1567.7 bits: 298.2 E(32554): 5.3e-81
Smith-Waterman score: 2052; 99.7% identity (99.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KLQNRRVTFQ
::::::::::
CCDS32 KLQNRRVTFQ
310
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1386 init1: 1203 opt: 1382 Z-score: 1064.1 bits: 205.2 E(32554): 5.9e-53
Smith-Waterman score: 1382; 66.9% identity (88.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:25-328)
10 20 30
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYV
:. :.: :.:::: :: .::.:: :.:. : .:.
CCDS32 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 AIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPMYFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFG
::.:::.::..:: :: ::. ::::::.::.:.:. .::::::::: ::: ..: :::
CCDS32 AILLGNFLIILTVTSDSRLHT-PMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFD
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 GCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVH
.:.:::::.:. :.::::::::::::::::::::::::.:: ..:. :: :: :::.:
CCDS32 ACLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIH
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFCDLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLL
. ::.:::::::.::::.::::::::::: ::::.::::.......:::.:::: ::::.
CCDS32 TTSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 ISYTVILLAIRQRAAGSTSKALSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFY
.::::::...:.:...: .:: :: .::: :::::::::::.:: ::: .::::.:.:::
CCDS32 VSYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KE5 TIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMKKLQNRRVTFQ
:::: .:::.::::::.:.::::.::..:
CCDS32 TIFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
300 310 320 330 340
>>CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 (304 aa)
initn: 1172 init1: 1172 opt: 1343 Z-score: 1035.5 bits: 199.7 E(32554): 2.3e-51
Smith-Waterman score: 1343; 67.4% identity (87.0% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
:. :.:.::::.: :: :..:: .::. : :.:.:.:::::::::: : ::. ::
CCDS32 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHT-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
::::.::. .:: :::::::::: ::: ..: ::. ::..:.::.:. ::.::.:::.::
CCDS32 YFLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
::::::::::::::.:: .. .:.:..:::::: ::.:: ..::.:::: .:::::
CCDS32 IDRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
:::::::::: :::.: ...:.::::::: ::::::.:: ::....: :::. .:::.::
CCDS32 DLPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSSKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
:::: ::::::.::.:.:: ::::.::::.:::::::::::::::::::::.:.:::.:
CCDS32 LSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNQEVKAAIK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 KLQNRRVTFQ
:
CCDS32 KRLCI
300
>>CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 (314 aa)
initn: 1377 init1: 1160 opt: 1335 Z-score: 1029.4 bits: 198.6 E(32554): 5.1e-51
Smith-Waterman score: 1335; 61.5% identity (86.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
:: : : .::::: :: .: .:: :::. : .::: :.:: ::..::: :: ::: ::
CCDS32 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHS-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
:::: ::...:: :::::::::: :.:. .: ::: ::..::::::. :.:..::..:.
CCDS32 YFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
.:::.:::::::: ...: :.:. :.:::..: .::.::: :...::.::: :::::::
CCDS32 FDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
:::.:..:::.::::::..::: ::...::::..:. ::...:........ ..::::::
CCDS32 DLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
:.::..:: ::::::::.:. :.: : .::.:::::::::: ::::::::::.:.: ::.
CCDS32 CTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 KLQNRRVTFQ
::.:: ..:
CCDS32 KLKNRFLNFNKAMPS
300 310
>>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa)
initn: 1329 init1: 1119 opt: 1293 Z-score: 997.7 bits: 192.8 E(32554): 3e-49
Smith-Waterman score: 1293; 62.2% identity (85.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
:: .: :.:::::: :::.:..:: :.: :: .:..:.::::::..:: :: ::: ::
CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHS-PM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
:::::::.:.:. ::::::::: :::: .. :::.::.:::::.:. :.:::::::::
CCDS32 YFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
:::::::::::.:...:: .:: :. ::.:..::..::..::::::.:::: ::::::
CCDS32 YDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
::: : ::::.:.:.. :... .::.:::: : ::. :: .::... ..... .::.::
CCDS32 DLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
..:: :: ::::::::.:: ::. .::.:..:::.:::.::::::::::..::::..
CCDS32 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 KLQNRRVTFQ
:. :
CCDS32 KIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
300 310 320
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 1320 init1: 1174 opt: 1289 Z-score: 994.9 bits: 192.2 E(32554): 4.3e-49
Smith-Waterman score: 1289; 63.2% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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CCDS32 YFLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMA
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CCDS32 YDRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
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CCDS32 DLPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALST
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310
pF1KE5 KLQNRRVTFQ
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CCDS32 KLRNRHVNSWKN
300 310
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pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGV
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CCDS32 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI
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40 50 60 70 80 90
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CCDS32 FAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGL
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CCDS32 LHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFII
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pF1KE5 LLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSV
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CCDS32 LLISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKFLAV
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CCDS32 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIR
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310
pF1KE5 KLQNRRVTFQ
.:.
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300
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
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120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
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CCDS32 DLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALST
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CCDS32 RLRKWDAHSSVKF
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310 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]