Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5903
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5903, 309 aa
1>>>pF1KE5903 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6523+/-0.00049; mu= 19.5831+/- 0.030
mean_var=83.4479+/-18.693, 0's: 0 Z-trim(107.3): 218 B-trim: 909 in 1/50
Lambda= 0.140400
statistics sampled from 15026 (15322) to 15026 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.18), width: 16
Scan time: 6.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 2025 420.7 1.9e-117
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 850 182.7 8.5e-46
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 850 182.7 8.5e-46
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 850 182.7 8.7e-46
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 820 176.6 5.7e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 787 169.9 5.9e-42
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 783 169.1 1e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 782 168.9 1.2e-41
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 781 168.7 1.4e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 780 168.5 1.6e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 780 168.5 1.6e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 780 168.5 1.6e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 780 168.5 1.6e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 774 167.3 3.6e-41
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 774 167.3 3.7e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 762 164.8 2e-40
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 759 164.2 2.9e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 757 163.8 4e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 754 163.2 6.3e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 750 162.4 1.1e-39
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 538 119.5 9.1e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 492 110.2 5.8e-24
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 201 51.2 3.3e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 180 47.0 6.5e-05
NP_001707 (OMIM: 601613) C-X-C chemokine receptor ( 372) 173 45.6 0.00018
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 168 44.7 0.00043
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 168 44.8 0.00046
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 162 43.4 0.00089
NP_116743 (OMIM: 601613) C-X-C chemokine receptor ( 327) 157 42.3 0.0016
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 156 42.3 0.0023
NP_004221 (OMIM: 605111,610419,610419) sphingosine ( 353) 153 41.5 0.0029
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 152 41.4 0.0036
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 152 41.4 0.0036
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 150 40.8 0.004
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 150 40.8 0.004
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 150 40.8 0.004
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 150 40.9 0.0043
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 149 40.8 0.0056
NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine ( 466) 149 40.9 0.0061
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic ( 466) 149 40.9 0.0061
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 149 40.9 0.0063
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 149 40.9 0.0067
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 147 40.3 0.0069
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 2025 init1: 2025 opt: 2025 Z-score: 2229.5 bits: 420.7 E(85289): 1.9e-117
Smith-Waterman score: 2025; 99.0% identity (99.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SRKDISGDK
:::::::::
NP_001 SRKDISGDK
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 836 init1: 626 opt: 850 Z-score: 943.2 bits: 182.7 E(85289): 8.5e-46
Smith-Waterman score: 850; 39.6% identity (77.9% similar) in 303 aa overlap (3-302:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDK--AVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRKLCSRKDISGDK
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XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 836 init1: 626 opt: 850 Z-score: 943.2 bits: 182.7 E(85289): 8.5e-46
Smith-Waterman score: 850; 39.6% identity (77.9% similar) in 303 aa overlap (3-302:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDK--AVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNA
: :..::.::. : ::. : .. .: ....::..::::::.::.::: .:.:
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KE5 IRKLCSRKDISGDK
..:. .:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 836 init1: 626 opt: 850 Z-score: 943.0 bits: 182.7 E(85289): 8.7e-46
Smith-Waterman score: 850; 39.6% identity (77.9% similar) in 303 aa overlap (3-302:15-317)
10 20 30 40
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTIT
:.....::.::::...:..:...:: :. .:. ::.: .::.....
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 ASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGA
. : .:::. :. :::.: :.: ...:..... . ..: : ::.::.. .:
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EGILLTVMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCG
...::.::::::.::.:.:::: . :.. .::::.. .:. . :.. .. :.. : ::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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170 180 190 200 210 220
pF1KE5 PNVIDHFMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 LEARHKALSTCVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPIDK--AVAIFYTMITPMLNPLIY
..: ::.::: :..::.::. : ::. : .. .: ....::..::::::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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290 300
pF1KE5 TLRNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 813 init1: 562 opt: 820 Z-score: 910.4 bits: 176.6 E(85289): 5.7e-44
Smith-Waterman score: 820; 39.9% identity (75.1% similar) in 301 aa overlap (3-299:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
:.. .:::..::::..:..: :::. :...:... .: .::... . .: .:::.
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 LAYLSFIDA-CYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYD
: :. .: : .:. :... : ....: . :::.:.: . ::: .:.:.::::
NP_001 LLTLAVVDIICTTSI-IPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYD
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pF1KE5 HYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDL
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NP_001 RYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEI
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 NPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSY-VVILCSLRTHSLEARHKALSTC
::: :.:. ... :... . . . . .: : .:: .:. :: ...:...::.:::
NP_001 PPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTC
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pF1KE5 VFHITVVILFFVPYIFVYMRPAA--TLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNAI
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NP_001 SSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGI
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300
pF1KE5 RKLCSRKDISGDK
::.
NP_001 RKVFAFLKH
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 761 init1: 579 opt: 787 Z-score: 874.2 bits: 169.9 E(85289): 5.9e-42
Smith-Waterman score: 787; 38.6% identity (71.4% similar) in 308 aa overlap (3-306:7-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSP
: . .:::.:::. :..: ..:..:...: : ..: . ... : .: : .:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 MYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVM
::. :. :::.: :: : .:..... : .:.: . :: : . :. .:...:..:
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFM
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATL-P-IDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 NAIRK-LCSRKDISGDK
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 775 init1: 508 opt: 783 Z-score: 869.8 bits: 169.1 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 783; 39.9% identity (73.1% similar) in 308 aa overlap (2-306:4-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE5 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRT-HSLEARHKALST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE5 CVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPI--DKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKNA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300
pF1KE5 IRKLCSRKDISGDK
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NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 770 init1: 554 opt: 782 Z-score: 868.8 bits: 168.9 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 782; 39.1% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (3-303:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TCVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAA--TLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQMKN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300
pF1KE5 AIRKLCSRKDISGDK
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 725 init1: 530 opt: 781 Z-score: 867.7 bits: 168.7 E(85289): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 781; 37.9% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (3-299:8-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYG-KKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVN-LWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
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pF1KE5 VMAYDHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDH
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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pF1KE5 FMCDLNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSY-VVILCSLRTHSLEARHK
:.:.. :: :.:.:::. :: . .:... :. . :.:.:: ... :: .: . .:
NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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pF1KE5 ALSTCVFHITVVILFFVPYIFVYMRPAATLPID--KAVAIFYTMITPMLNPLIYTLRNAQ
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
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300
pF1KE5 MKNAIRKLCSRKDISGDK
...:...:
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 704 init1: 559 opt: 780 Z-score: 866.5 bits: 168.5 E(85289): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 780; 40.9% identity (72.1% similar) in 301 aa overlap (2-299:4-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 LSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]