Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5902
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5902, 309 aa
1>>>pF1KE5902 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0874+/-0.0015; mu= 11.3293+/- 0.088
mean_var=145.8514+/-48.349, 0's: 0 Z-trim(99.1): 377 B-trim: 317 in 1/49
Lambda= 0.106199
statistics sampled from 5164 (5609) to 5164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16
Scan time: 1.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 1993 318.2 5.1e-87
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1049 173.5 1.8e-43
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1044 172.8 3e-43
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1031 170.8 1.2e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1004 166.7 2.1e-41
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 991 164.7 8.5e-41
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 990 164.5 9.4e-41
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 984 163.6 1.8e-40
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 982 163.3 2.2e-40
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 981 163.2 2.6e-40
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 975 162.2 4.6e-40
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 974 162.1 5.1e-40
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 973 161.9 5.7e-40
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 968 161.1 9.7e-40
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 964 160.5 1.5e-39
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 963 160.4 1.7e-39
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 962 160.2 1.8e-39
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 954 159.0 4.3e-39
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 950 158.4 6.9e-39
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 950 158.5 7.2e-39
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 949 158.3 7.5e-39
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 948 158.1 8.1e-39
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 945 157.6 1.1e-38
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 944 157.5 1.2e-38
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 942 157.2 1.5e-38
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 942 157.2 1.5e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 940 156.9 1.9e-38
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 939 156.7 2.2e-38
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 937 156.4 2.6e-38
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 935 156.1 3.2e-38
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 935 156.1 3.2e-38
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 935 156.1 3.3e-38
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 933 155.8 4e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 932 155.6 4.5e-38
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 931 155.5 4.9e-38
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 931 155.5 5.4e-38
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 929 155.2 6.2e-38
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 928 155.0 6.8e-38
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 927 154.9 7.5e-38
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 926 154.7 8.3e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 921 154.0 1.5e-37
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 918 153.5 2e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 918 153.5 2e-37
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 914 152.9 3e-37
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 907 151.8 6.2e-37
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 907 151.8 6.3e-37
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 903 151.2 9.8e-37
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 899 150.6 1.5e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 898 150.4 1.6e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 898 150.4 1.7e-36
>>CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1993 init1: 1993 opt: 1993 Z-score: 1675.7 bits: 318.2 E(32554): 5.1e-87
Smith-Waterman score: 1993; 99.4% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTLGNSTEVTEFYLLGFGAQHEFWCILFIVFLLIYVTSIMGNTGIILLINTDSRFQTLTY
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CCDS31 MTLGNSTEVTEFYLLGFGAQHEFWCILFIVFLLIYVTSIMGNSGIILLINTDSRFQTLTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLQHLAFVDICYTSAITPKMLQSFTEEKNLILFQGCVIQFLVYATFATSDCYLLAMMAV
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLQHLAFVDICYTSAITPKMLQSFTEEKNLMLFQGCVIQFLVYATFATSDCYLLAMMAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DPYVAICKPLHYTVIMSRTVCIRLVAGSYIMGSINASVQTGFTCSLSFCKSNSINHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DPYVAICKPLHYTVIMSRTVCIRLVAGSYIMGSINASVQTGFTCSLSFCKSNSINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPILALSCSNVDINIMLLVVFVGSNLIFTGLVVIFSYIYIMATILKMSSSAGRKKSFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPPILALSCSNVDINIMLLVVFVGSNLIFTGLVVIFSYIYIMATILKMSSSAGRKKSFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAVTIFYGTLSYMYLQSHSNNSQENMKVAFIFYGTVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLTAVTIFYGTLSYMYLQSHSNNSQENMKVAFIFYGTVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LKVIGKKLF
:::::::::
CCDS31 LKVIGKKLF
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1058 init1: 653 opt: 1049 Z-score: 894.0 bits: 173.5 E(32554): 1.8e-43
Smith-Waterman score: 1049; 52.9% identity (79.1% similar) in 306 aa overlap (5-309:3-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTLGNSTEVTEFYLLGFGAQHEFWCILFIVFLLIYVTSIMGNTGIILLINTDSRFQTLTY
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CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLQHLAFVDICYTSAITPKMLQSFTEEKNLILFQGCVIQFLVYATFATSDCYLLAMMAV
:::..:..::. :.::..:: . .. . : ..::. ::. .. ::: .::::: ::
CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DPYVAICKPLHYTVIMSRTVCIRLVAGSYIMGSINASVQTGFTCSLSFCKSNSINHFFCD
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CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 VPPILALSCSNVDINIMLLVVFV-GSNLIFTGLVVIFSYIYIMATILKMSSSAGRKKSFS
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CCDS31 IPPLLALSCS--DTRISKLVVFVAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLTAVTIFYGTLSYMYLQSHSNNSQENMKVAFIFYGTVIPMLNPLIYSLRNKEVKE
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CCDS31 TCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKS
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 ALKVIGKKLF
:: : .::.
CCDS31 ALWKILNKLYPQY
300
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1077 init1: 1030 opt: 1044 Z-score: 889.8 bits: 172.8 E(32554): 3e-43
Smith-Waterman score: 1044; 52.8% identity (79.5% similar) in 303 aa overlap (5-306:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTLGNSTEVTEFYLLGFGAQHEFWCILFIVFLLIYVTSIMGNTGIILLINTDSRFQTLTY
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLQHLAFVDICYTSAITPKMLQSFTEEKNLILFQGCVIQFLVYATFATSDCYLLAMMAV
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CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
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pF1KE5 DPYVAICKPLHYTVIMSRTVCIRLVAGSYIMGSINASVQTGFTCSLSFCKSNSINHFFCD
: :.:.:::::::. :. .:: :. :::: : .:::..:: : ::::.:: ..:::::
CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
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pF1KE5 VPPILALSCSNVDINIMLLVVFVGSNLIFTGLVVIFSYIYIMATILKMSSSAGRKKSFST
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAVTIFYGTLSYMYLQSHSNNSQENMKVAFIFYGTVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
::::::::.::::: .:::. .:.. . . :.: .::. ::::::::.::::::::: :
CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LK-VIGKKLF
.: ..::
CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
>>CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1081 init1: 1024 opt: 1031 Z-score: 879.0 bits: 170.8 E(32554): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 1031; 51.2% identity (79.2% similar) in 303 aa overlap (5-307:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTLGNSTEVTEFYLLGFGAQHEFWCILFIVFLLIYVTSIMGNTGIILLINTDSRFQTLTY
:.::::.: :::. . :. :::.: .::. ...:: :::.:: :: ... :
CCDS31 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLQHLAFVDICYTSAITPKMLQSFTEEKNLILFQGCVIQFLVYATFATSDCYLLAMMAV
:::..:..::.::.::.:: .. .: : ..: ...:. :. ....::: . :::: ::
CCDS31 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 DPYVAICKPLHYTVIMSRTVCIRLVAGSYIMGSINASVQTGFTCSLSFCKSNSINHFFCD
: :.:.:::::::. :. ::: ::. :::. : .:::..:: : :::::::: ..:::::
CCDS31 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 VPPILALSCSNVDINIMLLVVFVGSNLIFTGLVVIFSYIYIMATILKMSSSAGRKKSFST
.: ...::::. :. ..:. :. :.... ::...:: .:. ::::: :.. .: .::
CCDS31 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAVTIFYGTLSYMYLQSHSNNSQENMKVAFIFYGTVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
::::. :: :::::. .:::: :..:... :.: .:: ::::::::.::::::::: :
CCDS31 CASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LKVIGKKLF
.: . .:
CCDS31 FKKVVEKAKLSVGWSV
300 310
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 997 init1: 997 opt: 1004 Z-score: 856.7 bits: 166.7 E(32554): 2.1e-41
Smith-Waterman score: 1004; 49.7% identity (77.3% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTLGNSTEVTEFYLLGFGAQHEFWCILFIVFLLIYVTSIMGNTGIILLINTDSRFQTLTY
:: : : .::: :::.. :. :::. ::.::. ...:: :.:::: ::...: :
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLQHLAFVDICYTSAITPKMLQSFTEEKNLILFQGCVIQFLVYATFATSDCYLLAMMAV
::: .:.:::.: ...:::::: .. ::. : : :: .:. . ..::..: :...::
CCDS31 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DPYVAICKPLHYTVIMSRTVCIRLVAGSYIMGSINASVQTGFTCSLSFCKSNSINHFFCD
: :.:::.:: :..:::::: ....::.. : .: :.:. . ::::: :: :.:::::
CCDS31 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPPILALSCSNVDINIMLLVVFVGSNLIFTGLVVIFSYIYIMATILKMSSSAGRKKSFST
::.. ::::.. .. . ...: :.. : ::.. :: :.. .:..: :. ::...:::
CCDS31 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHLTAVTIFYGTLSYMYLQSHSNNSQENMKVAFIFYGTVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
:::::::. .::.: : ::. :. : .. ::: .:: .:::::::::::::.::::.:
CCDS31 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 L-KVIGKKLF
: .::..:
CCDS31 LANVISRKRTSSFL
310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1028 init1: 981 opt: 991 Z-score: 845.9 bits: 164.7 E(32554): 8.5e-41
Smith-Waterman score: 991; 49.2% identity (76.4% similar) in 305 aa overlap (5-308:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MTLGNSTEVTEFYLLGFGAQHEFWCILFIVFLLIYVTSIMGNTGIILLINTDSRFQTL
: : :::: :::: .. :. .::..:: .:. ..:: :..::: : ..::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TYFFLQHLAFVDICYTSAITPKMLQSFTEEKNLILFQGCVIQFLVYATFATSDCYLLAMM
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