Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5847
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5847, 2253 aa
1>>>pF1KE5847 2253 - 2253 aa - 2253 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5709+/-0.00119; mu= 20.2298+/- 0.072
mean_var=106.8839+/-21.270, 0's: 0 Z-trim(104.7): 31 B-trim: 52 in 1/49
Lambda= 0.124056
statistics sampled from 7994 (8019) to 7994 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 5.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14073.1 PKDREJ gene_id:10343|Hs108|chr22 (2253) 15081 2711.6 0
CCDS73912.1 PKD1L3 gene_id:342372|Hs108|chr16 (1732) 636 126.2 1.3e-27
CCDS34633.1 PKD1L1 gene_id:168507|Hs108|chr7 (2849) 566 113.8 1.2e-23
CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 ( 805) 407 85.0 1.5e-15
CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 ( 968) 390 82.0 1.5e-14
CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 613) 353 75.3 9.9e-13
CCDS78062.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 624) 353 75.3 1e-12
>>CCDS14073.1 PKDREJ gene_id:10343|Hs108|chr22 (2253 aa)
initn: 15081 init1: 15081 opt: 15081 Z-score: 14579.6 bits: 2711.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 15081; 100.0% identity (100.0% similar) in 2253 aa overlap (1-2253:1-2253)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRPGPALLLLGVGLSLSVGRLPLPPVPRGAQAAVSGAPGGLLRGAPGLGVRGGRALLSLR
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CCDS14 MRPGPALLLLGVGLSLSVGRLPLPPVPRGAQAAVSGAPGGLLRGAPGLGVRGGRALLSLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PSAVRAGGAVLSGRGSLCFPHGGTGRRWYCLDLRVLLSAQRLPWPAAPALALVDLQLSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSAVRAGGAVLSGRGSLCFPHGGTGRRWYCLDLRVLLSAQRLPWPAAPALALVDLQLSAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GGRLSLTWSVRLPRSPGRLAWAFRLRLLGPGAARPASPAARVSPRSAAPGPRPQQGFVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGRLSLTWSVRLPRSPGRLAWAFRLRLLGPGAARPASPAARVSPRSAAPGPRPQQGFVAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TECPTDGPARVMLQAVNSSSHRAVESSVSCQINACVIQRVRINTDQKGAPVRLSMQAEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TECPTDGPARVMLQAVNSSSHRAVESSVSCQINACVIQRVRINTDQKGAPVRLSMQAEAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 INASVQLDCPAARAIAQYWQVFSVPAVGQAPDWTQPLDLPQLEIRNSPLFIHIPNNSLQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 INASVQLDCPAARAIAQYWQVFSVPAVGQAPDWTQPLDLPQLEIRNSPLFIHIPNNSLQW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GVYVFNFTVSITTGNPKMPEVKDSDAVYVWIVRSSLQAVMLGDANITANFTEQLILDGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GVYVFNFTVSITTGNPKMPEVKDSDAVYVWIVRSSLQAVMLGDANITANFTEQLILDGST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 SSDPDADSPLQGLQFFWYCTTDPRNYGGDRIILGSKEVCHPEQANLKWPWASGPVLTLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSDPDADSPLQGLQFFWYCTTDPRNYGGDRIILGSKEVCHPEQANLKWPWASGPVLTLLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 ETLKGDHVYFFRMVIRKDSRTAFSDKRVHVLQGPKAIAHITCIENCERNFIVSDRFSLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ETLKGDHVYFFRMVIRKDSRTAFSDKRVHVLQGPKAIAHITCIENCERNFIVSDRFSLFL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 NCTNCASRDFYKWSILSSSGGEMLFDWMGETVTGRNGAYLSIKAFAFRHFLEAEFSISLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NCTNCASRDFYKWSILSSSGGEMLFDWMGETVTGRNGAYLSIKAFAFRHFLEAEFSISLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LACWSGVTSVFRHSFIINHGPQIGECKINPAKGIALITKFVVQCSNFRDKHVPLTYKIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LACWSGVTSVFRHSFIINHGPQIGECKINPAKGIALITKFVVQCSNFRDKHVPLTYKIIV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 SDLHSVGEISSVKENTLGTILYLGPQSTVPPSFLPVGMLASQYGLKIYAQVYDSLGAFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDLHSVGEISSVKENTLGTILYLGPQSTVPPSFLPVGMLASQYGLKIYAQVYDSLGAFSQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 VTLHATAQAPTDKNSSKTVLNQLLSFTVGPSSLLSTLIQKKDFLPAGYLLYIVASVLNNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VTLHATAQAPTDKNSSKTVLNQLLSFTVGPSSLLSTLIQKKDFLPAGYLLYIVASVLNNM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 KTELPLRDDRVNLRKHLIDQSFLLPVSTLVEIGQVVMTITKLTQKPSEFTWDAQKRATMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KTELPLRDDRVNLRKHLIDQSFLLPVSTLVEIGQVVMTITKLTQKPSEFTWDAQKRATMR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 VWQANQALQEYQQKDKRFRSEQIEIVSTGILMSLSNILKMTSPHQVVKDPFYVIESLSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWQANQALQEYQQKDKRFRSEQIEIVSTGILMSLSNILKMTSPHQVVKDPFYVIESLSDT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 ILANKVPGNKTTSMRTPNFNMYVKKVEKWGINQLFRNEKHCRNCFYPTLNVSSVPGLSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILANKVPGNKTTSMRTPNFNMYVKKVEKWGINQLFRNEKHCRNCFYPTLNVSSVPGLSAN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 GPISTMFCDFTNDLFPWLNDQENTSVEVSGFRMTGVADNGSVLEITPDVAEVYLVRKNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPISTMFCDFTNDLFPWLNDQENTSVEVSGFRMTGVADNGSVLEITPDVAEVYLVRKNLT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 FAAFNLTVGPNSEVDGSLKKTTGGFSFQVDSTVLREVLVHIVTEVMVLFTVLVYTGSQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FAAFNLTVGPNSEVDGSLKKTTGGFSFQVDSTVLREVLVHIVTEVMVLFTVLVYTGSQIT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE5 PTALVATFLVPHDIPPFASQSALFDPACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PTALVATFLVPHDIPPFASQSALFDPACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE5 LQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLDMYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLDMYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVRA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE5 RRQLGTIGLTGIHLHTHYVMAKVIVIPNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVGL
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CCDS14 RRQLGTIGLTGIHLHTHYVMAKVIVIPNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVGL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE5 AFWALYRDEMDQHLRGHVIVLPDNDPYDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AFWALYRDEMDQHLRGHVIVLPDNDPYDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVST
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE5 SDVHCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTTKSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDVHCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTTKSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENLF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE5 SRHIWLFICQKWLSVDTTLDRTFHVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIFASVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SRHIWLFICQKWLSVDTTLDRTFHVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIFASVV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE5 AKTFNRLQRLSCCLAMLLSSLLCNIMFFNLNRQEQTESRERKYMRSMMIGIESVLITIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKTFNRLQRLSCCLAMLLSSLLCNIMFFNLNRQEQTESRERKYMRSMMIGIESVLITIPV
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE5 QLLITFLFTCSQRKPQADLKEVSPQKHPLMSEASEHWEEYLRKWHAYETAKVHPREVAKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QLLITFLFTCSQRKPQADLKEVSPQKHPLMSEASEHWEEYLRKWHAYETAKVHPREVAKP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE5 ASKGKPRLPKASPKATSKPKHRHRKAQIKTPETLGPNTNSNNNIEDDQDVHSEQHPSQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASKGKPRLPKASPKATSKPKHRHRKAQIKTPETLGPNTNSNNNIEDDQDVHSEQHPSQKD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE5 LQQLKKKPRIVLPWWCVYVAWFLVFATSSISSFFIVFYGLTYGYDKSIEWLFASFCSFCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQQLKKKPRIVLPWWCVYVAWFLVFATSSISSFFIVFYGLTYGYDKSIEWLFASFCSFCQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE5 SVLLVQPSKIILLSGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVLLVQPSKIILLSGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE5 RGTRMYQPLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RGTRMYQPLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYN
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE5 QFIRDRFSMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSKILGLPLMRQVRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QFIRDRFSMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSKILGLPLMRQVRAK
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE5 SSEKMCLPAEKFVQNSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKP
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CCDS14 SSEKMCLPAEKFVQNSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE5 QGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE5 FNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVV
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE5 DEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPF
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE5 HAVSQVDHIMRIILGFLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HAVSQVDHIMRIILGFLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYF
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE5 FVYMAFGYLVFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSYCVSAFQNTEFSNNRILGVLFLSSFMLVMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FVYMAFGYLVFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSYCVSAFQNTEFSNNRILGVLFLSSFMLVMI
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE5 CVLINLFQAVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKLRTMFSFLTSQSKAKDEPEFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CVLINLFQAVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKLRTMFSFLTSQSKAKDEPEFF
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250
pF1KE5 IDMLYGQPEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVYLVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IDMLYGQPEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVYLVV
2230 2240 2250
>>CCDS73912.1 PKD1L3 gene_id:342372|Hs108|chr16 (1732 aa)
initn: 657 init1: 376 opt: 636 Z-score: 609.1 bits: 126.2 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 936; 23.0% identity (53.2% similar) in 1220 aa overlap (1077-2216:608-1715)
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE5 ACTVKKARVVCLPVSLLQLIAQHSHSPHCTVSIVLQAPRFVMKLNDKLVRISIFSVQCLD
.. ::. . . . .:: . .::
CCDS73 LPKDKVWQKDEEYTWVLNPEHLQHGIGTYYITAVLSERQEGAQQTPSLVSVITAVTQCYY
580 590 600 610 620 630
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE5 MYGIQSEWREGYCILGEKTSWYEVHCICKNVVRARRQLGTIGLTGIHLHTHYVMAKVIVI
.. : . : .: ... ...:.:.... . .:. ... .
CCDS73 WEIHNQTWSSAGCQVGPQSTILRTQCLCNHLT-------------FFASDFFVVPRTVNV
640 650 660 670 680
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE5 PNPVDLRLNIIKSLHQNPVTLFTVLFIILLYVGLAFWALYRDEMDQHLRGHVIVLPDNDP
. . : : . . ::: . . .. .:: . :: .:. :.. . .: :: ::::
CCDS73 EDTIKLFLRVTN----NPVGVSLLASLLGFYVITVVWARKKDQADMQ-KVKVTVLADNDP
690 700 710 720 730
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE5 YDNLCYLVTIFTGSRWGSGTRANVFVQLRGTVSTSDVHCLSHPHFTTLYRGSINTFLLTT
.. ::. ..:: : ...: :.: . : :. . :. : : :. :.. ::....:::::
CCDS73 SAQFHYLIQVYTGYRRSAATTAKVVITLYGSEGRSEPHHLCDPQKTVFERGGLDVFLLTT
740 750 760 770 780 790
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE5 KSDLGDIHSIRVWHNNEGRSPSWYLSRIKVENLFSRHIWLFICQKWLSVDT---TLDRTF
..::..::.:.::.: : :::::.:.. : .. .. : :.:. ::.:: :::.:
CCDS73 WTSLGNLHSLRLWHDNSGVSPSWYVSQVIVCDMAVKRKWHFLCNCWLAVDLGDCELDRVF
800 810 820 830 840 850
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE5 HVTHPDERLTRKDFFFIDVSSNLRKNHMWFSIFASVVAKTFNRLQRLSCCLAMLLSSLLC
. : .. . .: . .. ....:.:: . . :.:.::::::...:: ...
CCDS73 IPVSKRELFSFRHLFSSMIVEKFTQDYLWLSIATRHPWNQFTRVQRLSCCMTLLLCNMVI
860 870 880 890 900 910
1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE5 NIMFFNLNRQEQTESRERKYMRS-------MMIGIESVLITIPVQLLITFLFTCSQRKPQ
:.::...: .: ... . :: ....:....: .:..:.: :: . ::
CCDS73 NVMFWKIN---STTAKRDEQMRPFAVAWSELLVSIHTAVILFPINLVIGRLFPLIE--PQ
920 930 940 950 960 970
1460 1470 1480 1490
pF1KE5 ADLKEVSPQKHPLMSEAS----------EHWEEYLR----------------KWHAYETA
: : . .:.:: :. .: .: : ... .
CCDS73 ETLPLFPPIQASCLSDASVEPLSATMVVEELKETVRFLLRRNTYLLSKCEQPPWSSWDIT
980 990 1000 1010 1020 1030
1500 1510 1520 1530
pF1KE5 KVHPREVAKPAS---------KGKPRLPKASPKATSKPK-HRHRKAQ-IKTPE-TLGPNT
:. . .: .:. . .. :. . . :: : .:. ::: .
CCDS73 KLVKLLSSLVSSHLEGQGCHQQGERHWARVVPENHHHFCCYLHRVLQRLKSHLGTLGLTQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1540 1550 1560 1570
pF1KE5 --------NSNNNIEDDQDV---H---SEQHPSQK-------DLQQLKKKPRIVLPWWCV
.. .... :.. : .::.::.. . .. :: : : .
CCDS73 GHQSCDFLDAASQLQKLQELLETHILPTEQEPSREVTSFAILSSEEGKKPISNGLSKWLT
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KE5 YVAWFLVFATSSISSFFIVFYGLTYGYDKSIEWLFASFCSFCQSVLLVQPSKII----LL
: :.:. :: :.:: ..:.: . :.. :... . : :.... :: :.. :
CCDS73 SVCWLLLGFTSLASAFFTALYSLELSKDQATSWMISIILSVLQNIFISQPVKVVFFTFLY
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KE5 SGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMHPEEMQRIHDQIVRIRGTRMYQPLTEDE
: . . :. :. .:: . . : .: ... : . . . .: . :
CCDS73 SLMMSRMPRLNKENEQQTK-RILALLAKCSSSVP--GSRDKNNPVYV-APAINSPTKHPE
1220 1230 1240 1250 1260 1270
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:.. . :: : :.. . ...::. . :: : .:.. :. . :
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.. . . :.:. .. : .:. : ... : . : .. . :: :. . .:.
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..:: ..:. .. : .:. .:... : . . ... . . : .::.
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:.:: .: ... :. :: . .. . :. :. . .::.... . ...:. :.:::
CCDS73 -LLFGCSISDYRTFFSSAVTVVGLLMGISHQEEVFALDPVLGTFLILTSVILMVLVVINL
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: ..:: :. . .. . .: . . : .:: ..... :. ....
CCDS73 FVSAILMAFGKERKSLKKEAA----LIDTLLQKLSNLLGISWPQKTSSEQAATTAVGSDT
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CCDS73 EVLDELP
1730
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CCDS34 HTVFSVFCMSGKPDFHYEFSYQIGNTSKHTLYHGRDTQYYFVLPAGEHLDNYKVMVSTEI
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....:: .. . .. : . . : ...:: .. : . . :..
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. ..: .. :.::. .:. :: :..:: ... .. . :
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. .:. :.:.. . : . . ..: :. . ::.
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. : . :... ..:: . . ::. :: .:.: . ..:..
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..: .:.. . .. :..:...: .:. .::. . .: .
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..:.: . :.... . : .: : :.: :: : . ..:.. : : . :..
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.. . . ::. .. :: : . . ::: . . :. .:. .:.. :
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:...:: :.. : . .: :.. :: . :. . . .: :. .::. .:
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:: .:. . :: ..:. : : :.. . . .... :. :
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::. . . : . ::: : : . ..: :. : . .: .. ..:: . :
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. : ....:: . :.. :: :... . ..: .:. ..:.. ..
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CCDS34 SSCSIPDCAGEVEKVLAARQQARHLRWAHPPSKAQLRGTRQRMRRESRTRAALRDISMDI
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.:. .: .. :: ..::... ...: : . : ...:: :
CCDS34 GGTPSARVPGAQPGALGGKCYLIGSSVIRQLKV-FPRHLCKPPRPFSALIEDSIPT---C
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:. : ::. : .: . . . :: : : . . :
CCDS34 SPEVG-GPENP--YL-----IDPENQNVTLNG----PGGCG---TREDCVLSLG------
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. : .. :..:. : :.:..: :: ...: .:: .:: :.:. :. : .
CCDS34 -----RTRTEAHTALSRLRASMWIDRSTRAVSVHFTLYNPPTQLFTSVSLRVEILPTGSL
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pF1KE5 NTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYVAILIFFLAYVVDEGCII---MQERA--SYVRSVY
: ..:::. : .. . .:.. :.: :: . . :. :.... :: :.
CCDS34 VPSSLVESFSI--FRSDSALQYHLMLPQLVF-LALSLIHLCVQLYRMMDKGVLSYWRKPR
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2000 2010 2020 2030 2040 2050
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: :. :. . . : . :. :: . .:. . . :. . ... .. : . :
CCDS34 NWLE--LSVVGVSLTYYAVSGHLVTLAGDVTNQFHRGLCRAFMDLTLMASWNQRARWLRG
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2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KE5 FLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQAALPGICHMAFVVSVYFFVYMAFGYLVFGQHE
.:::: :: . . . . .. .::.:
CCDS34 ILLFLFTLKCVYLPGIQNTMASCSSMMRHSLPSIFVAGLVGALMLAALSHLHRFLLSMWV
2620 2630 2640 2650 2660 2670
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CCDS34 LPPGTFTDAFPGLLFHFPRRSQKDCLLGLSKSDQRAMACYFGILLIVSATLCFGMLRGFL
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CCDS74 PLQPQPKKPEDEPQETAYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTT----
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pF1KE5 LSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRF-------SMDLATVTKLEDIYRW
: .:....::. . .: . .. .::.. . . : .... ..... :.. .
CCDS74 LRELLVYIVFLVDICLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDF
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.. :: :. : : ..: . .::.: .::...... :. : : .
CCDS74 AQGPLLDSLYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDS--CVVHEDFRE
170 180 190 200 210
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pF1KE5 NSIRREIHCHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAIDESTNGFTYKPQGTQWLYYSYGLLH
. . :. :. : :. .. : . ...::. : . .: :
CCDS74 DIL----SCYDVYSPDKEEQLPFGPF-----------NGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLT
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pF1KE5 TYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDEKTWAVVLELTTFNPDINLFCSISVI
.:..::: : . : .: .:. :. :::. :::. : .: ......: .::::: . ..
CCDS74 SYSGGGYYLDL-P-GSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLV
270 280 290 300 310 320
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KE5 FEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIY-LYVAILIFFLAYVVDEGCIIMQERASY
: : . : .... .: . . . : : . .:.. :::.: . .: :
CCDS74 VEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRY
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pF1KE5 VRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPFHAV----SQVDHI
. :..:.:.... . : . . . . . .. .. :..:. . :. . .: ...
CCDS74 LSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNM
390 400 410 420 430 440
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CCDS74 QFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEI
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CCDS78 KVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQLYNLKNSSR
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CCDS78 IYYENILLGVPRVRQLKVRNN--TCKVYSSF--QSLMSE--CYGKYTSANEDLSNF-GLQ
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CCDS78 INTEWRYSTSNTN--------SPW---HWGFLGVYRNGGY--IFTLSKSKSETKNKFIDL
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CCDS78 DFNFAGIQQANPILGPIYFITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]