Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5792
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5792, 656 aa
1>>>pF1KE5792 656 - 656 aa - 656 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0048+/-0.000858; mu= 16.5742+/- 0.052
mean_var=81.0285+/-15.849, 0's: 0 Z-trim(107.7): 19 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.142480
statistics sampled from 9734 (9744) to 9734 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 2.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31073.1 CHML gene_id:1122|Hs108|chr1 ( 656) 4366 907.3 0
CCDS14454.1 CHM gene_id:1121|Hs108|chrX ( 653) 3143 655.9 4.9e-188
CCDS48139.1 CHM gene_id:1121|Hs108|chrX ( 110) 566 125.8 3.1e-29
CCDS7071.1 GDI2 gene_id:2665|Hs108|chr10 ( 445) 438 99.8 8.4e-21
CCDS35452.1 GDI1 gene_id:2664|Hs108|chrX ( 447) 435 99.2 1.3e-20
>>CCDS31073.1 CHML gene_id:1122|Hs108|chr1 (656 aa)
initn: 4366 init1: 4366 opt: 4366 Z-score: 4848.0 bits: 907.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4366; 100.0% identity (100.0% similar) in 656 aa overlap (1-656:1-656)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KNPSLGVSNTFTEVLDSALPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNPSLGVSNTFTEVLDSALPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLYS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCKA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 IIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEINE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 EELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQEI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE5 FPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
610 620 630 640 650
>>CCDS14454.1 CHM gene_id:1121|Hs108|chrX (653 aa)
initn: 2894 init1: 2359 opt: 3143 Z-score: 3489.4 bits: 655.9 E(32554): 4.9e-188
Smith-Waterman score: 3143; 72.0% identity (88.8% similar) in 653 aa overlap (1-652:1-650)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
:::.::.::::..:::::::::.::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS14 MADTLPSEFDVIVIGTGLPESIIAAACSRSGRRVLHVDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
:::.:.:: .: : ::: : :.::::.: .::.::::.:.:::::::....::: ::::
CCDS14 EYQENSDIVSDSPV-WQDQILENEEAIALSRKDKTIQHVEVFCYASQDLHEDVEEAGALQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 KNPSLGVSNTFTEVLDSA-LPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKE
:: .: .: . ::. ::: :: :.. : :: ...: .:: : .:::. .: . :::
CCDS14 KNHALVTSANSTEAADSAFLPTEDESLSTMSCEMLTEQTPSSDPENALEVNGAEVTGEKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KYCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLY
..: ::::. ..: .: .:. .:: ...: .::::::::.::::::::::::::::
CCDS14 NHCDDKTCVPSTSAED--MSENVPIAEDTTEQPKKNRITYSQIIKEGRRFNIDLVSKLLY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SQGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMK
:.::::::::::.::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::
CCDS14 SRGLLIDLLIKSNVSRYAEFKNITRILAFREGRVEQVPCSRADVFNSKQLTMVEKRMLMK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FLTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNA
:::::.:::..::::..... .: :::::.:::::::..:.::::::::.. .:::::.:
CCDS14 FLTFCMEYEKYPDEYKGYEEITFYEYLKTQKLTPNLQYIVMHSIAMTSETASSTIDGLKA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TKNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCK
:::::.::::.::::::::::::::.:: ::::::::::::::::.:::.:::::: .::
CCDS14 TKNFLHCLGRYGNTPFLFPLYGQGELPQCFCRMCAVFGGIYCLRHSVQCLVVDKESRKCK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 AIIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIV
::::.::::: ...:.:::::. :. :: :::.::::::::::.:.:::: ::: ::: :
CCDS14 AIIDQFGQRIISEHFLVEDSYFPENMCSRVQYRQISRAVLITDRSVLKTDSDQQISILTV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 PPAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEIN
: :::. :::: ::::::::::: ::::::::.:::::::::::::.:::.:::: ::.
CCDS14 PAEEPGTFAVRVIELCSSTMTCMKGTYLVHLTCTSSKTAREDLESVVQKLFVPYTEMEIE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 EEELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQE
.:.. :::.:::::::::::: :::: :: :::::::::::::::::..:::::::::::
CCDS14 NEQVEKPRILWALYFNMRDSSDISRSCYNDLPSNVYVCSGPDCGLGNDNAVKQAETLFQE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 IFPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
: :.:.::::::::::::.:::. :::: .. . :. :. .:: :: . :.
CCDS14 ICPNEDFCPPPPNPEDIILDGDSLQPEASESSAIPEANSETFKESTNLGNLEESSE
600 610 620 630 640 650
>>CCDS48139.1 CHM gene_id:1121|Hs108|chrX (110 aa)
initn: 580 init1: 441 opt: 566 Z-score: 638.4 bits: 125.8 E(32554): 3.1e-29
Smith-Waterman score: 566; 75.2% identity (91.7% similar) in 109 aa overlap (1-109:1-108)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
:::.::.::::..:::::::::.::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS48 MADTLPSEFDVIVIGTGLPESIIAAACSRSGRRVLHVDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
:::.:.:: .: : ::: : :.::::.: .::.::::.:.:::: . .
CCDS48 EYQENSDIVSDSPV-WQDQILENEEAIALSRKDKTIQHVEVFCYARSTLLL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KNPSLGVSNTFTEVLDSALPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKEK
>>CCDS7071.1 GDI2 gene_id:2665|Hs108|chr10 (445 aa)
initn: 455 init1: 204 opt: 438 Z-score: 486.9 bits: 99.8 E(32554): 8.4e-21
Smith-Waterman score: 438; 24.3% identity (62.3% similar) in 334 aa overlap (226-549:69-392)
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 GDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLYSQGLLIDLLIKSDVSR
:: .:.::. :.:...: :. .:. ..:.:
CCDS70 YGGESASITPLEDLYKRFKIPGSPPESMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTR
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 YVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMKFLTFCLEY-EQHPDEY
:..:: . .... ::. .:: ..:... :. . . ::: . :::.. .. :. : .
CCDS70 YLDFKVTEGSFVYKGGKIYKVPSTEAEALASSLMGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTF
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360
pF1KE5 QAF--RQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTS-----ESSCTTIDGLNATKNFLQCL
... .. .. . : : .. :. :..:. .. : . .: : . . :
CCDS70 EGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQPC--YETINRIKLYSESL
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCKAIIDHFGQ
.:.:..:.:.:::: ::.:::: :. :..:: : : . .. ..: ..:. .. .. :.
CCDS70 ARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPIEEIIV--QNGKVIGVKSE-GE
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 RINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIVPPAEPGAC
: .: . ::..... . :. :.. : .. : .:. : .. .:.: . .
CCDS70 IARCKQLICDPSYVKDRVE---KVGQVIRVICILSHPIKNTN-DANSCQIIIPQNQVNRK
280 290 300 310 320
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 A-VRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCS-SSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEINEEELTK
. . : . . . . :.. .. . .: ..... ... :. : . .. .:
CCDS70 SDIYVCMISFAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALE-LLEPIEQKFVSISDLLV
330 340 350 360 370 380
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 PRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQEIFPTEE
:. :
CCDS70 PKDLGTESQIFISRTYDATTHFETTCDDIKNIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED
390 400 410 420 430 440
>>CCDS35452.1 GDI1 gene_id:2664|Hs108|chrX (447 aa)
initn: 456 init1: 213 opt: 435 Z-score: 483.5 bits: 99.2 E(32554): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 435; 25.2% identity (59.7% similar) in 330 aa overlap (226-546:69-389)
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 GDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLYSQGLLIDLLIKSDVSR
:: .:.::. :.:...: :. .:. ..:.:
CCDS35 YGGESSSITPLEELYKRFQLLEGPPESMGRGRDWNVDLIPKFLMANGQLVKMLLYTEVTR
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 YVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMKFLTFCLEYEQH-PDEY
:..:: : .... ::. .:: ...... :. . : ::: . :::.: ..... : .
CCDS35 YLDFKVVEGSFVYKGGKIYKVPSTETEALASNLMGMFEKRRFRKFLVFVANFDENDPKTF
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360
pF1KE5 QAF--RQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTS-----ESSCTTIDGLNATKNFLQCL
.. . :. . . : .. :. :..:. .. : .. .: : . . :
CCDS35 EGVDPQTTSMRDVYRKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQPC--LETVNRIKLYSESL
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCKAIIDHFGQ
.:.:..:.:.:::: ::.:::: :. :..:: : : . :. ... :.:. .. .. :.
CCDS35 ARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFARLSAIYGGTYMLNKPVDDIIM--ENGKVVGVKSE-GE
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 RINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIVPPAEPGAC
: .: . ::. ... . :. : . : .. : .:. : .. .:.: . .
CCDS35 VARCKQLICDPSYIPDRV---RKAGQVIRIICILSHPIKNTN-DANSCQIIIPQNQVNRK
280 290 300 310 320
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 A-VRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEINEEELTKP
. . : . . . . :.. . . : : . .:. : . . .: .:
CCDS35 SDIYVCMISYAHNVAAQGKYIAIASTTVETTDPEKEVEPALELLEPIDQKFVAISDLYEP
330 340 350 360 370 380
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 RLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQEIFPTEEF
CCDS35 IDDGCESQVFCSCSYDATTHFETTCNDIKDIYKRMAGTAFDFENMKRKQNDVFGEAEQ
390 400 410 420 430 440
656 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:41:39 2016 done: Tue Nov 8 06:41:40 2016
Total Scan time: 2.490 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]