Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5787
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5787, 751 aa
1>>>pF1KE5787 751 - 751 aa - 751 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4925+/-0.00118; mu= 18.9291+/- 0.070
mean_var=68.8782+/-13.884, 0's: 0 Z-trim(101.0): 34 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.154537
statistics sampled from 6311 (6333) to 6311 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33885.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 ( 751) 4962 1116.3 0
CCDS82867.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 ( 591) 3874 873.6 0
CCDS77851.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 ( 770) 3439 776.7 0
CCDS47232.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 ( 513) 721 170.6 5.4e-42
CCDS4023.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 ( 779) 721 170.7 7.7e-42
CCDS4024.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 ( 732) 650 154.9 4.2e-37
CCDS3468.1 GUF1 gene_id:60558|Hs108|chr4 ( 669) 348 87.5 7.3e-17
CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1120) 304 77.8 1e-13
>>CCDS33885.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 (751 aa)
initn: 4962 init1: 4962 opt: 4962 Z-score: 5975.0 bits: 1116.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4962; 100.0% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRLLGAAAVAALGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MRLLGAAAVAALGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TLTERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TLTERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TPGHVDFTIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TPGHVDFTIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SNPARALQQMRSKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFGQIVRYGEIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SNPARALQQMRSKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFGQIVRYGEIPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLAFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLAFKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 EVGRFGQLTYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARMHADMMEDVEEVYAGDICAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVGRFGQLTYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARMHADMMEDVEEVYAGDICAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 FGIDCASGDTFTDKANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKGIGRFTREDPTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FGIDCASGDTFTDKANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKGIGRFTREDPTF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 KVYFDTENKETVISGMGELHLEIYAQRLEREYGCPCITGKPKVAFRETITAPVPFDFTHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KVYFDTENKETVISGMGELHLEIYAQRLEREYGCPCITGKPKVAFRETITAPVPFDFTHK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 KQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPEDYTKLEFSDETFGSNIPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPEDYTKLEFSDETFGSNIPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 GHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIRAGEGALKQALANATLCILEPIMAVEVVAPNEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIRAGEGALKQALANATLCILEPIMAVEVVAPNEF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 QGQVIAGINRRHGVITGQDGVEDYFTLYADVPLNDMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYSRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGQVIAGINRRHGVITGQDGVEDYFTLYADVPLNDMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYSRY
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE5 QPCLPSTQEDVINKYLEATGQLPVKKGKAKN
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QPCLPSTQEDVINKYLEATGQLPVKKGKAKN
730 740 750
>>CCDS82867.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 (591 aa)
initn: 3874 init1: 3874 opt: 3874 Z-score: 4665.6 bits: 873.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3874; 100.0% identity (100.0% similar) in 588 aa overlap (1-588:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRLLGAAAVAALGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MRLLGAAAVAALGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TLTERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TLTERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TPGHVDFTIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TPGHVDFTIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SNPARALQQMRSKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFGQIVRYGEIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SNPARALQQMRSKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFGQIVRYGEIPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLAFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLAFKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 EVGRFGQLTYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARMHADMMEDVEEVYAGDICAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EVGRFGQLTYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARMHADMMEDVEEVYAGDICAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 FGIDCASGDTFTDKANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKGIGRFTREDPTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FGIDCASGDTFTDKANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKGIGRFTREDPTF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 KVYFDTENKETVISGMGELHLEIYAQRLEREYGCPCITGKPKVAFRETITAPVPFDFTHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KVYFDTENKETVISGMGELHLEIYAQRLEREYGCPCITGKPKVAFRETITAPVPFDFTHK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 KQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPEDYTKLEFSDETFGSNIPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPEDYTKLEFSDETFGSNIPKQFVPAVEKVNF
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 GHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIRAGEGALKQALANATLCILEPIMAVEVVAPNEF
>>CCDS77851.1 GFM1 gene_id:85476|Hs108|chr3 (770 aa)
initn: 4957 init1: 3439 opt: 3439 Z-score: 4139.7 bits: 776.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4914; 97.5% identity (97.5% similar) in 770 aa overlap (1-751:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRLLGAAAVAALGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MRLLGAAAVAALGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TLTERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TLTERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TPGHVDFTIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TPGHVDFTIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 SNPARALQQMRSKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFG----------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SNPARALQQMRSKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFGHFLRDFLPLL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE5 ---------QIVRYGEIPAELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 WNWDRRSGSQIVRYGEIPAELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 AIRRATLKRSFTPVFLGSALKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AIRRATLKRSFTPVFLGSALKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 LMNSSRDNSHPFVGLAFKLEVGRFGQLTYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LMNSSRDNSHPFVGLAFKLEVGRFGQLTYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARM
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 HADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFTDKANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFTDKANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKN
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 DLEKFSKGIGRFTREDPTFKVYFDTENKETVISGMGELHLEIYAQRLEREYGCPCITGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DLEKFSKGIGRFTREDPTFKVYFDTENKETVISGMGELHLEIYAQRLEREYGCPCITGKP
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 KVAFRETITAPVPFDFTHKKQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPEDYTKLEFSDETFGSNIPKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KVAFRETITAPVPFDFTHKKQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPEDYTKLEFSDETFGSNIPKQ
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 FVPAVEKGFLDACEKGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIRAGEGALKQALANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FVPAVEKGFLDACEKGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIRAGEGALKQALANA
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE5 TLCILEPIMAVEVVAPNEFQGQVIAGINRRHGVITGQDGVEDYFTLYADVPLNDMFGYST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TLCILEPIMAVEVVAPNEFQGQVIAGINRRHGVITGQDGVEDYFTLYADVPLNDMFGYST
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750
pF1KE5 ELRSCTEGKGEYTMEYSRYQPCLPSTQEDVINKYLEATGQLPVKKGKAKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ELRSCTEGKGEYTMEYSRYQPCLPSTQEDVINKYLEATGQLPVKKGKAKN
730 740 750 760 770
>>CCDS47232.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 (513 aa)
initn: 822 init1: 444 opt: 721 Z-score: 867.4 bits: 170.6 E(32554): 5.4e-42
Smith-Waterman score: 893; 41.1% identity (64.3% similar) in 414 aa overlap (42-440:66-456)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 LGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKTTLTERVLYYTG
: ::::::: ::::.:::: :::.:::.:
CCDS47 KPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYSG
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 RIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIIDTPGHVDFTIEV
.. .: : .: : : ::.:::::::::. :: .:.::::::::::.::
CCDS47 YTRSLGDVDDGD---TVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEV
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 ERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMGSNPARALQQMR
:: :::::::: :. : .::. ::.:: :: ..:.: . :.::.:. :.. :....:
CCDS47 ERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQADKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIR
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240
pF1KE5 SKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYF-----DG-DFGQIVRYGEIPAELRAA
::. . ..:.:.: .:::.::.. .. . . :: :: . ::
CCDS47 EKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGVVDVVMKEKLLWNCNSNDGKDFERKPLLEMNDPELLKE
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290
pF1KE5 ATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEE------KIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGS
.:. :. ::: ::. :...... ::: .:. :. ::.:.:: .. .::. ::
CCDS47 TTEARNALIEQVADLDDEFADLVLEEFSENFDLLPA-EKLQTAIHRVTLAQTAVPVLCGS
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 ALKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILN--KEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLA
::::::.::::::: :::.: : .:: .:. :.: :.: ...:
CCDS47 ALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEE-RNYEFLQWYKDDLCALAFKVLHDKQR----------
340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FKLEVGRFGQLTYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARMHADMMEDVEEVYAGDI
: :...: :.: .: .:.: :..:: ::. .. . ::.:
CCDS47 --------GPLVFMRIYSGTIKPQLAIHNINGNCTERISRLLLPFADQHVEIPSLTAGNI
390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 CALFGID-CASGDTFTDKANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKGIGRFTRE
:. :.:::.... .:.:.
CCDS47 ALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAARRAEREGEKKHRQNNEAERLLLAGVEIPEPVFFC
440 450 460 470 480 490
>>CCDS4023.1 GFM2 gene_id:84340|Hs108|chr5 (779 aa)
initn: 1075 init1: 457 opt: 721 Z-score: 864.6 bits: 170.7 E(32554): 7.7e-42
Smith-Waterman score: 1288; 35.8% identity (61.3% similar) in 737 aa overlap (42-734:66-774)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 LGRGRAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKTTLTERVLYYTG
: ::::::: ::::.:::: :::.:::.:
CCDS40 KPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYSG
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 RIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIIDTPGHVDFTIEV
.. .: :: .: : : ::.:::::::::. :: .:.::::::::::.::
CCDS40 YTRSLGDV--DDG-DTVTDFMAQERERGITIQSAAVTFDWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEV
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 ERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMGSNPARALQQMR
:: :::::::: :. : .::. ::.:: :: ..:.: . :.::.:. :.. :....:
CCDS40 ERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQADKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIR
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240
pF1KE5 SKLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYF-----DG-DFGQIVRYGEIPAELRAA
::. . ..:.:.: .:::.::.. .. . . :: :: . ::
CCDS40 EKLKAKPLLLQLPIGEAKTFKGVVDVVMKEKLLWNCNSNDGKDFERKPLLEMNDPELLKE
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290
pF1KE5 ATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEE------KIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGS
.:. :. ::: ::. :...... ::: .:. :. ::.:.:: .. .::. ::
CCDS40 TTEARNALIEQVADLDDEFADLVLEEFSENFDLLPA-EKLQTAIHRVTLAQTAVPVLCGS
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 ALKNKGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILN--KEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLA
::::::.::::::: :::.: : .:: .:. :.: :.: ...:
CCDS40 ALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEE-RNYEFLQWYKDDLCALAFKVLHDKQR----------
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360 370 380 390 400 410
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: :...: :.: .: .:.: :..:: ::. .. . ::.:
CCDS40 --------GPLVFMRIYSGTIKPQLAIHNINGNCTERISRLLLPFADQHVEIPSLTAGNI
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420 430 440 450
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CCDS40 ALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAARRAEREGEKKHRQNNEAERLLLAGVEIPEPVFFC
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460 470 480 490 500 510
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...: :.. :::. : . ::::..:: .: .. .::. ::::::.:: .:..:
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:... .. : :.:.:. .:: .::: : .. . ..:.. . : .. ..:
CCDS40 EYAESINEGLLKVSQEAIENGIHSACLQGPLLGSPIQDVAITLHSLTIH--PGTSTTMIS
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630 640 650 660 670 680
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: . ...:: .: .:::.: .::.. .. . :.: . .:.: : . .: ..
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750
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: ::::::: ::::.:::: :::.:::.:
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80 90 100 110 120 130
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140 150 160 170 180 190
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250 260 270 280 290
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CCDS40 ALKNKGIQPLLDAVTMYLPSPEE-RNYEFLER------ISRLLL--------PFADQHVE
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. :... . . . . :::: .... . .: : .. .:.
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: . ....:.::. ...: :.. :::. : . ::
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::..:: .: .. .::. ::::::.:: .:..:::: : .::.:::: :
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CCDS40 DTLDRTLGDKRHLVTVEVEARPIETSSVMPVIEFEYAESINEGLLKVSQEAIENGIHSAC
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:.. .. . :.: . .:.: : . .: .. . ::: ...:::: ::. : :.. .
CCDS40 VTVARDYLSPVLADLAQRRGNIQEIQTRQDNKVVIGFVPLAEIMGYSTVLRTLTSGSATF
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pF1KE5 TMEYSRYQPCLPSTQEDVINKYLEATGQLPVKKGKAKN
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CCDS40 ALELSTYQAMNPQDQNTLLNRRSGLT
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: ::.. . .. . :::.: ...: :. .:...
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:.. . ::. .:. .:.:..: .: :
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: ...... .. . . ....:::.. :. :. .. :::. . . . ...
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CCDS34 PVVLGTIITPDEYTGKIMMLCEARRAVQKNMIFIDQNRVMLKYLFPLNEIVVDFYDSLKS
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:.:. :: ..:. :: :: ::..: :: :. . :::.::. .: .:
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..... :.. :.
CCDS42 SHLKNILEQINALTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]