Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5786
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5786, 707 aa
1>>>pF1KE5786 707 - 707 aa - 707 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3390+/-0.00102; mu= 14.1826+/- 0.061
mean_var=76.5201+/-14.926, 0's: 0 Z-trim(104.3): 50 B-trim: 38 in 1/50
Lambda= 0.146618
statistics sampled from 7794 (7841) to 7794 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 3.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53868.1 SETDB2 gene_id:83852|Hs108|chr13 ( 707) 4759 1016.7 0
CCDS9417.1 SETDB2 gene_id:83852|Hs108|chr13 ( 719) 4330 925.9 0
CCDS972.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1290) 857 191.4 7.4e-48
CCDS44217.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1291) 857 191.4 7.4e-48
>>CCDS53868.1 SETDB2 gene_id:83852|Hs108|chr13 (707 aa)
initn: 4759 init1: 4759 opt: 4759 Z-score: 5437.7 bits: 1016.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4759; 99.7% identity (99.9% similar) in 707 aa overlap (1-707:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGEKNGDAKTFWMELEDDGKVDFIFEQVQNVLQSLKQKIKDGSATNKEYIQAMILVNEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MGEKNGDAKTFWMELEDDGKVDFIFEQVQNVLQSLKQKIKDGSATNKEYIQAMILVNEAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IINSSTSIKDPMPVTQKEQENKSNAFPSTSCENSFPEDCTFLTTGNKEILSLEDKVVDFR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS53 IINSSTSIKDPMPVTQKEQENKSNAFPSTSCENSFPEDCTFLTTENKEILSLEDKVVDFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EKDSSSNLSYQSHDCSGACLMKMPLNLKGENPLQLPIKCHFQRRHAKTNSHSSALHVSYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EKDSSSNLSYQSHDCSGACLMKMPLNLKGENPLQLPIKCHFQRRHAKTNSHSSALHVSYK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TPCGRSLRNVEEVFRYLLETECNFLFTDNFSFNTYVQLARNYPKQKEVVSDVDISNGVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TPCGRSLRNVEEVFRYLLETECNFLFTDNFSFNTYVQLARNYPKQKEVVSDVDISNGVES
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VPISFCNEIDSRKLPQFKYRKTVWPRAYNLTNFSSMFTDSCDCSEGCIDITKCACLQLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VPISFCNEIDSRKLPQFKYRKTVWPRAYNLTNFSSMFTDSCDCSEGCIDITKCACLQLTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 RNAKTSPLSSDKITTGYKYKRLQRQIPTGIYECSLLCKCNRQLCQNRVVQHGPQVRLQVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RNAKTSPLSSDKITTGYKYKRLQRQIPTGIYECSLLCKCNRQLCQNRVVQHGPQVRLQVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KTEQKGWGVRCLDDIDRGTFVCIYSGRLLSRANTEKSYGIDENGRDENTMKNIFSKKRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KTEQKGWGVRCLDDIDRGTFVCIYSGRLLSRANTEKSYGIDENGRDENTMKNIFSKKRKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 EVACSDCEVEVLPLGLETHPRTAKTEKCPPKFSNNPKELTMETKYDNISRIQYHSVIRDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS53 EVACSDCEVEVLPLGLETHPRTAKTEKCPPKFSNNPKELTVETKYDNISRIQYHSVIRDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 ESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPEDNDGFKPPREHLNSKTKGAQKDSSSNHVDEFEDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPEDNDGFKPPREHLNSKTKGAQKDSSSNHVDEFEDNL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LIESDVIDITKYREETPPRSRCNQATTLDNQNIKKAIEVQIQKPQEGRSTACQRQQVFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LIESDVIDITKYREETPPRSRCNQATTLDNQNIKKAIEVQIQKPQEGRSTACQRQQVFCD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 EELLSETKNTSSDSLTKFNKGNVFLLDATKEGNVGRFLNHSCCPNLLVQNVFVETHNRNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EELLSETKNTSSDSLTKFNKGNVFLLDATKEGNVGRFLNHSCCPNLLVQNVFVETHNRNF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE5 PLVAFFTNRYVKARTELTWDYGYEAGTVPEKEIFCQCGVNKCRKKIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PLVAFFTNRYVKARTELTWDYGYEAGTVPEKEIFCQCGVNKCRKKIL
670 680 690 700
>>CCDS9417.1 SETDB2 gene_id:83852|Hs108|chr13 (719 aa)
initn: 4745 init1: 4325 opt: 4330 Z-score: 4947.2 bits: 925.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4725; 98.1% identity (98.2% similar) in 719 aa overlap (1-707:1-719)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGEKNGDAKTFWMELEDDGKVDFIFEQVQNVLQSLKQKIKDGSATNKEYIQAMILVNEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MGEKNGDAKTFWMELEDDGKVDFIFEQVQNVLQSLKQKIKDGSATNKEYIQAMILVNEAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE5 IINSSTSIK------------DPMPVTQKEQENKSNAFPSTSCENSFPEDCTFLTTGNKE
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS94 IINSSTSIKGASQKEVNAQSSDPMPVTQKEQENKSNAFPSTSCENSFPEDCTFLTTENKE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 ILSLEDKVVDFREKDSSSNLSYQSHDCSGACLMKMPLNLKGENPLQLPIKCHFQRRHAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ILSLEDKVVDFREKDSSSNLSYQSHDCSGACLMKMPLNLKGENPLQLPIKCHFQRRHAKT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 NSHSSALHVSYKTPCGRSLRNVEEVFRYLLETECNFLFTDNFSFNTYVQLARNYPKQKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NSHSSALHVSYKTPCGRSLRNVEEVFRYLLETECNFLFTDNFSFNTYVQLARNYPKQKEV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 VSDVDISNGVESVPISFCNEIDSRKLPQFKYRKTVWPRAYNLTNFSSMFTDSCDCSEGCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 VSDVDISNGVESVPISFCNEIDSRKLPQFKYRKTVWPRAYNLTNFSSMFTDSCDCSEGCI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 DITKCACLQLTARNAKTSPLSSDKITTGYKYKRLQRQIPTGIYECSLLCKCNRQLCQNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DITKCACLQLTARNAKTSPLSSDKITTGYKYKRLQRQIPTGIYECSLLCKCNRQLCQNRV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 VQHGPQVRLQVFKTEQKGWGVRCLDDIDRGTFVCIYSGRLLSRANTEKSYGIDENGRDEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 VQHGPQVRLQVFKTEQKGWGVRCLDDIDRGTFVCIYSGRLLSRANTEKSYGIDENGRDEN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 TMKNIFSKKRKLEVACSDCEVEVLPLGLETHPRTAKTEKCPPKFSNNPKELTMETKYDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS94 TMKNIFSKKRKLEVACSDCEVEVLPLGLETHPRTAKTEKCPPKFSNNPKELTVETKYDNI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 SRIQYHSVIRDPESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPEDNDGFKPPREHLNSKTKGAQKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SRIQYHSVIRDPESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPEDNDGFKPPREHLNSKTKGAQKDS
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 SSNHVDEFEDNLLIESDVIDITKYREETPPRSRCNQATTLDNQNIKKAIEVQIQKPQEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SSNHVDEFEDNLLIESDVIDITKYREETPPRSRCNQATTLDNQNIKKAIEVQIQKPQEGR
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 STACQRQQVFCDEELLSETKNTSSDSLTKFNKGNVFLLDATKEGNVGRFLNHSCCPNLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 STACQRQQVFCDEELLSETKNTSSDSLTKFNKGNVFLLDATKEGNVGRFLNHSCCPNLLV
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE5 QNVFVETHNRNFPLVAFFTNRYVKARTELTWDYGYEAGTVPEKEIFCQCGVNKCRKKIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 QNVFVETHNRNFPLVAFFTNRYVKARTELTWDYGYEAGTVPEKEIFCQCGVNKCRKKIL
670 680 690 700 710
>>CCDS972.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1290 aa)
initn: 1159 init1: 764 opt: 857 Z-score: 972.7 bits: 191.4 E(32554): 7.4e-48
Smith-Waterman score: 857; 36.3% identity (62.7% similar) in 391 aa overlap (128-513:571-955)
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 DCTFLTTGNKEILSLEDKVVDFREKDSSSNLSYQSHDCSGACLMKM-PL---NLKGENPL
: : : :: .:: .. :. . .:.:::
CCDS97 ALPAPPAPPVFHGMLERAPAEPSYRAPMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRNEQYRGKNPL
550 560 570 580 590 600
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 QLPIKCHFQRRHAKTN-SHSSALHVSYKTPCGRSLRNVEEVFRYLLETECNFLFTDNFSF
.:. :.: :. ... ..:: :::::: ::...:. :::.:: :.::: . : .
CCDS97 LVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTPCGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCL
610 620 630 640 650 660
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 NTYVQLARNYPKQKEVVSDVDISNGVESVPISFCNEIDSRKLPQFKYRKTVWPRAYNLTN
. :: . :.. : .::. : :.::.: ::::. :: : : : . :
CCDS97 DPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVNEIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFIN
670 680 690 700 710 720
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 FSSMFTDSCDCSEGCIDITKCACLQLTARNAKTSPLSSDKITTGYKYKRLQRQIPTGIYE
. : .:::..:: : .:::: ::: . . .: .. . ..::.::::.. .:::.::
CCDS97 TGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQINPNSGYQYKRLEECLPTGVYE
730 740 750 760 770 780
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 CSLLCKCNRQLCQNRVVQHGPQVRLQVFKTEQKGWGVRCLDDIDRGTFVCIYSGRLLSRA
:. :::. ..: ::.:::: :::::.:::..::::.:::::: .:.:::::.:..:.
CCDS97 CNKRCKCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAKGSFVCIYAGKILTDD
790 800 810 820 830 840
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 NTEKSYGIDENGRDENTMKNIFSKKRKLEVACSDCEVEVLPLGLETHPRTAKTEKCPPKF
..: :.. . . .. .: : . : :: : . .. : .. .
CCDS97 FADKE-GLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDA-----PCSSDSSGVDLKDQEDGNSG
850 860 870 880 890
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 SNNPKELTMETKYDNISRIQYHSVIRDPESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPEDNDGFKP
...:.: . ... ::. . . :. .: .. : :.: . .: . . :
CCDS97 TEDPEESNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDSHPPDLGP
900 910 920 930 940 950
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 PREHLNSKTKGAQKDSSSNHVDEFEDNLLIESDVIDITKYREETPPRSRCNQATTLDNQN
:
CCDS97 PHIPVPPSIPVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSHSSFKTNEGGEGRA
960 970 980 990 1000 1010
>--
initn: 381 init1: 210 opt: 380 Z-score: 427.4 bits: 90.5 E(32554): 1.7e-17
Smith-Waterman score: 380; 31.8% identity (59.7% similar) in 233 aa overlap (477-707:1073-1290)
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 KCPPKFSNNPKELTMETKYDNISRIQYHSVIRDPESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPED
.: : :::.. :..... ..: . .:.:
CCDS97 EDTDDRNKMSVVTESSRNYGYNPSPVKPEGLRRPPSKTSM--HQSRRL--MASAQSNPDD
1050 1060 1070 1080 1090
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 NDGFKPPREHLNSKTKGAQKDSSSNHVDEFEDNLLIESDVIDITKYREETPPRSRCNQAT
.. .....: . : . . . . . .:. :.. : ... :..
CCDS97 VLTLSS-----STESEGESGTSRKPTAGQTSATAVDSDDIQTISSGSEGDDFEDKKNMTG
1100 1110 1120 1130 1140 1150
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 TLDNQNIKKAIEVQIQKPQEGRSTACQRQQVFCDEELLSETKNTSSDSLTKFNKG--NVF
. : :. . : .: . . : ::: .: : . .
CCDS97 PMKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTR-----QFYDGEESCY
1160 1170 1180 1190 1200
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 LLDATKEGNVGRFLNHSCCPNLLVQNVFVETHNRNFPLVAFFTNRYVKARTELTWDYGYE
..:: :::.::.::::: :::.::::::.::. :: ::::... ..: :::::::.::
CCDS97 IIDAKLEGNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASK-IRAGTELTWDYNYE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
690 700
pF1KE5 AGTVPEKEIFCQCGVNKCRKKIL
.:.: ::..: ::. .:: ..:
CCDS97 VGSVEGKELLCCCGAIECRGRLL
1270 1280 1290
>>CCDS44217.1 SETDB1 gene_id:9869|Hs108|chr1 (1291 aa)
initn: 1181 init1: 764 opt: 857 Z-score: 972.7 bits: 191.4 E(32554): 7.4e-48
Smith-Waterman score: 857; 36.3% identity (62.7% similar) in 391 aa overlap (128-513:571-955)
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 DCTFLTTGNKEILSLEDKVVDFREKDSSSNLSYQSHDCSGACLMKM-PL---NLKGENPL
: : : :: .:: .. :. . .:.:::
CCDS44 ALPAPPAPPVFHGMLERAPAEPSYRAPMEKLFYLPHVCSYTCLSRVRPMRNEQYRGKNPL
550 560 570 580 590 600
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 QLPIKCHFQRRHAKTN-SHSSALHVSYKTPCGRSLRNVEEVFRYLLETECNFLFTDNFSF
.:. :.: :. ... ..:: :::::: ::...:. :::.:: :.::: . : .
CCDS44 LVPLLYDFRRMTARRRVNRKMGFHVIYKTPCGLCLRTMQEIERYLFETGCDFLFLEMFCL
610 620 630 640 650 660
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 NTYVQLARNYPKQKEVVSDVDISNGVESVPISFCNEIDSRKLPQFKYRKTVWPRAYNLTN
. :: . :.. : .::. : :.::.: ::::. :: : : : . :
CCDS44 DPYVLVDRKFQPYKPFYYILDITYGKEDVPLSCVNEIDTTPPPQVAYSKERIPGKGVFIN
670 680 690 700 710 720
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 FSSMFTDSCDCSEGCIDITKCACLQLTARNAKTSPLSSDKITTGYKYKRLQRQIPTGIYE
. : .:::..:: : .:::: ::: . . .: .. . ..::.::::.. .:::.::
CCDS44 TGPEFLVGCDCKDGCRDKSKCACHQLTIQATACTPGGQINPNSGYQYKRLEECLPTGVYE
730 740 750 760 770 780
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 CSLLCKCNRQLCQNRVVQHGPQVRLQVFKTEQKGWGVRCLDDIDRGTFVCIYSGRLLSRA
:. :::. ..: ::.:::: :::::.:::..::::.:::::: .:.:::::.:..:.
CCDS44 CNKRCKCDPNMCTNRLVQHGLQVRLQLFKTQNKGWGIRCLDDIAKGSFVCIYAGKILTDD
790 800 810 820 830 840
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 NTEKSYGIDENGRDENTMKNIFSKKRKLEVACSDCEVEVLPLGLETHPRTAKTEKCPPKF
..: :.. . . .. .: : . : :: : . .. : .. .
CCDS44 FADKE-GLEMGDEYFANLDHIESVENFKEGYESDA-----PCSSDSSGVDLKDQEDGNSG
850 860 870 880 890
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 SNNPKELTMETKYDNISRIQYHSVIRDPESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPEDNDGFKP
...:.: . ... ::. . . :. .: .. : :.: . .: . . :
CCDS44 TEDPEESNDDSSDDNFCKDEDFSTSSVWRSYATRRQTRGQKENGLSETTSKDSHPPDLGP
900 910 920 930 940 950
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 PREHLNSKTKGAQKDSSSNHVDEFEDNLLIESDVIDITKYREETPPRSRCNQATTLDNQN
:
CCDS44 PHIPVPPSIPVGGCNPPSSEETPKNKVASWLSCNSVSEGGFADSDSHSSFKTNEGGEGRA
960 970 980 990 1000 1010
>--
initn: 415 init1: 367 opt: 391 Z-score: 440.0 bits: 92.8 E(32554): 3.5e-18
Smith-Waterman score: 391; 31.8% identity (59.7% similar) in 233 aa overlap (477-707:1073-1291)
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 KCPPKFSNNPKELTMETKYDNISRIQYHSVIRDPESKTAIFQHNGKKMEFVSSESVTPED
.: : :::.. :..... ..: . .:.:
CCDS44 EDTDDRNKMSVVTESSRNYGYNPSPVKPEGLRRPPSKTSM--HQSRRL--MASAQSNPDD
1050 1060 1070 1080 1090
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 NDGFKPPREHLNSKTKGAQKDSSSNHVDEFEDNLLIESDVIDITKYREETPPRSRCNQAT
.. .....: . : . . . . . .:. :.. : ... :..
CCDS44 VLTLSS-----STESEGESGTSRKPTAGQTSATAVDSDDIQTISSGSEGDDFEDKKNMTG
1100 1110 1120 1130 1140 1150
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 TLDNQNIKKAIEVQIQKPQEGRSTACQRQQVFCDEELLSETKNTSSDSLTKFNKG--NVF
. : :. . : .: . . : ::: .: : . .
CCDS44 PMKRQVAVKSTRGFALKSTHGIAIKSTNMASVDKGESAPVRKNTR-----QFYDGEESCY
1160 1170 1180 1190 1200
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 LLDATKEGNVGRFLNHSCCPNLLVQNVFVETHNRNFPLVAFFTNRYVKARTELTWDYGYE
..:: :::.::.::::: :::.::::::.::. :: ::::... ..: :::::::.::
CCDS44 IIDAKLEGNLGRYLNHSCSPNLFVQNVFVDTHDLRFPWVAFFASKRIRAGTELTWDYNYE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
690 700
pF1KE5 AGTVPEKEIFCQCGVNKCRKKIL
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CCDS44 VGSVEGKELLCCCGAIECRGRLL
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