Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5785
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5785, 763 aa
1>>>pF1KE5785 763 - 763 aa - 763 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5716+/-0.000756; mu= 14.6443+/- 0.046
mean_var=87.5093+/-17.469, 0's: 0 Z-trim(110.4): 13 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.137103
statistics sampled from 11603 (11610) to 11603 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11444.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 763) 5275 1053.3 0
CCDS74071.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 634) 4335 867.4 0
CCDS11443.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 ( 756) 3430 688.4 1.1e-197
CCDS45690.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 ( 729) 2672 538.5 1.5e-152
CCDS62198.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 220) 1536 313.6 2.2e-85
CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 ( 751) 1344 275.8 1.8e-73
CCDS64797.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 ( 770) 907 189.4 1.9e-47
>>CCDS11444.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 (763 aa)
initn: 5275 init1: 5275 opt: 5275 Z-score: 5634.7 bits: 1053.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5275; 100.0% identity (100.0% similar) in 763 aa overlap (1-763:1-763)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 AEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 RGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 SDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE5 DSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLPAFSHGGFSHN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLPAFSHGGFSHN
730 740 750 760
>>CCDS74071.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 (634 aa)
initn: 4335 init1: 4335 opt: 4335 Z-score: 4631.1 bits: 867.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4335; 100.0% identity (100.0% similar) in 629 aa overlap (1-629:1-629)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 AEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 RGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDF
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERIWWPG
610 620 630
>>CCDS11443.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 (756 aa)
initn: 1817 init1: 1817 opt: 3430 Z-score: 3662.5 bits: 688.4 E(32554): 1.1e-197
Smith-Waterman score: 3430; 65.4% identity (84.9% similar) in 762 aa overlap (1-760:1-756)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF
:. : .:..: :..::::::. :::.. ::. :: ::::::: :::: ::::::::
CCDS11 MHLKIVLAFLALSLITIFALAYVLLTSPGGS----SQPPHCPSVSHRAQPWPHPGQSQLF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQAQPSDNCIFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID
::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. ..
CCDS11 AREALAIVLFGGQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLRAEFTQMW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL
. . . :::.: .: ... : .:... ..::::.:::::::..::.::::.:.::
CCDS11 RHLKEVELPKAPIFLSST--FNYNGSTLAAVHATPRGLRSGDRATWMALYHNISGVGLFL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW
: ::::::..:.:::::.::.:.::: :.:: .:.::: .:..: ..:: .: .:.
CCDS11 HPVGLELLLDHRALDPAHWTVQQVFYLGHYYADLGQLEREFKSGRLEVVRVPLPPPNGAS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV
::.: ::: ::::: ::: ..::::. :.::::.:.:: :.::: :::::::::::..
CCDS11 SLRSRNSPGPLPPLQFSPQGSQYSVQGNLVVSSLWSFTFGHGVFSGLRIFDVRFQGERIA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ
::.:.:: ..:::..:: .: :::.:..::.:. . :.::::::: ::.:: :.:. .
CCDS11 YEVSVQECVSIYGADSPKTMLTRYLDSSFGLGRNSRGLVRGVDCPYQATMVDIHILVGKG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH
: . . : ::::. :::::::::. : .:..:::: ..:::::.:.. ::::.:: :..
CCDS11 AVQLLPGAVCVFEEAQGLPLRRHHNYLQNHFYGGLASSALVVRSVSSVGNYDYIWDFVLY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE5 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGK--YGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENW
:.::.: : .:::::..::: :. .::.:.:..:::::::. :::.:::::::.::
CCDS11 PNGALEGRVHATGYINTAFLKGGEEGLLFGNRVGERVLGTVHTHAFHFKLDLDVAGLKNW
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 VWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWG
: :::.:: :.:.::.::: ::: :.::..: :. .:: .:: :::::::::..: ::
CCDS11 VVAEDVVFKPVAAPWNPEHWLQRPQLTRQVLGKEDLTAFSLGSPLPRYLYLASNQTNAWG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 HPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTV
: ::::::. : : .: .:.: :..:: ::::.:::::::: .:::...::: :.:::
CCDS11 HQRGYRIQIHSPLGIHIPLESDMERALSWGRYQLVVTQRKEEESQSSSIYHQNDIWTPTV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 DFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFY
:.:::::::. :.::::::::.:::::::::::::::.:: :::.::::::::::::..
CCDS11 TFADFINNETLLGEDLVAWVTASFLHIPHAEDIPNTVTLGNRVGFLLRPYNFFDEDPSIF
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760
pF1KE5 SADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLPAFSHGGFSHN
: :.::. :::: : .::.::::. :::.:::: ::. ::
CCDS11 SPGSVYFEKGQDAGLCSINPVACLPDLAACVPDLPPFSYHGF
720 730 740 750
>>CCDS45690.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 (729 aa)
initn: 2362 init1: 1246 opt: 2672 Z-score: 2852.4 bits: 538.5 E(32554): 1.5e-152
Smith-Waterman score: 3286; 63.6% identity (82.4% similar) in 762 aa overlap (1-760:1-729)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF
:. : .:..: :..::::::. :::.. ::. :: ::::::: :::: ::::::::
CCDS45 MHLKIVLAFLALSLITIFALAYVLLTSPGGS----SQPPHCPSVSHRAQPWPHPGQSQLF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQAQPSDNCIFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID
::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. ..
CCDS45 AREALAIVLFGGQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLRAEFTQMW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL
. . . :::.: .: ... : .:... ..::::.:::::::..::.::::.:.::
CCDS45 RHLKEVELPKAPIFLSST--FNYNGSTLAAVHATPRGLRSGDRATWMALYHNISGVGLFL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW
: ::::::..:.:::::.::.:.::: :.:: .:.::: .:..: ..:: .: .:.
CCDS45 HPVGLELLLDHRALDPAHWTVQQVFYLGHYYADLGQLEREFKSGRLEVVRVPLPPPNGAS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV
::.: ::: ::::: ::: ..::::. :.::::.:.:: :.::: :::::::::::..
CCDS45 SLRSRNSPGPLPPLQFSPQGSQYSVQGNLVVSSLWSFTFGHGVFSGLRIFDVRFQGERIA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ
::.:.:: ..:::..:: .: :::.:..::.:. . :.::::::: ::.:: :.:. .
CCDS45 YEVSVQECVSIYGADSPKTMLTRYLDSSFGLGRNSRGLVRGVDCPYQATMVDIHILVGKG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH
: . . : ::::. :::::::::. : .:..:::: ..:::::.:.. ::::.:: :..
CCDS45 AVQLLPGAVCVFEEAQGLPLRRHHNYLQNHFYGGLASSALVVRSVSSVGNYDYIWDFVLY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE5 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGK--YGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENW
:.::.: : .:::::..::: :. .::.:.:..:::::::. :::.:::::::.::
CCDS45 PNGALEGRVHATGYINTAFLKGGEEGLLFGNRVGERVLGTVHTHAFHFKLDLDVAGLKNW
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 VWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWG
: :::.:: :.:.::.::: ::: :.::..: :. .:: .:: :::::::::..: ::
CCDS45 VVAEDVVFKPVAAPWNPEHWLQRPQLTRQVLGKEDLTAFSLGSPLPRYLYLASNQTNAWG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 HPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTV
: ::: ::.:::::::: .:::...::: :.:::
CCDS45 HQRGY---------------------------QLVVTQRKEEESQSSSIYHQNDIWTPTV
600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 DFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFY
:.:::::::. :.::::::::.:::::::::::::::.:: :::.::::::::::::..
CCDS45 TFADFINNETLLGEDLVAWVTASFLHIPHAEDIPNTVTLGNRVGFLLRPYNFFDEDPSIF
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KE5 SADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLPAFSHGGFSHN
: :.::. :::: : .::.::::. :::.:::: ::. ::
CCDS45 SPGSVYFEKGQDAGLCSINPVACLPDLAACVPDLPPFSYHGF
690 700 710 720
>>CCDS62198.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 (220 aa)
initn: 1536 init1: 1536 opt: 1536 Z-score: 1646.5 bits: 313.6 E(32554): 2.2e-85
Smith-Waterman score: 1536; 100.0% identity (100.0% similar) in 220 aa overlap (544-763:1-220)
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 HTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEE
10 20 30
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 QAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLA
40 50 60 70 80 90
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 VTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPN
100 110 120 130 140 150
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 TVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLP
160 170 180 190 200 210
760
pF1KE5 AFSHGGFSHN
::::::::::
CCDS62 AFSHGGFSHN
220
>>CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 (751 aa)
initn: 1438 init1: 631 opt: 1344 Z-score: 1432.6 bits: 275.8 E(32554): 1.8e-73
Smith-Waterman score: 1850; 40.1% identity (66.0% similar) in 736 aa overlap (46-759:21-746)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 TIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLFADLSREELTAVMRFL
:: : : : .. .:.::: .:: :: ::
CCDS43 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPS--PGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 TQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPPAREALAIVFFGRQPQ
.. : .. . . : :: .:. :: : .: ::.: :.::: :..::: : .
CCDS43 WSKKELRLQPSSTTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEH
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 PNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDIDQMIFNRELPQASGLL
:::.:..::::: : ::: .. : : . ::. :: . . . . : . .:
CCDS43 PNVTEFAVGPLPGPCYMRALS-PRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 HHC--CFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFLHHVGLELLVNHKA
. : . : :. .::::. ::.: .:. . . :.::: .::::::.: .
CCDS43 NTTGFSFQDCHDRCLAFTDVAPRGVASGQRRSWLIIQRYVE--GYFLHPTGLELLVDHGS
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KE5 LDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSWSLKSPVPP-----
: ..:....:.:.:..: : .: .. : :.::.. : ::. .. ::
CCDS43 TDAGHWAVEQVWYNGKFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSH
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE5 ---G--PAP-----PLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGER
: :.: : :.:::: ..:. : . :.:.: : . :: ....:.: :::
CCDS43 KPRGDFPSPIHVSGPRLVQPHGPRFRLEGNAVLYGGWSFAFRLRSSSGLQVLNVHFGGER
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LVYEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLE
..::.:.:::.:.:::..::.: :.:.: :.:.:. : :. :.::: ::..: .
CCDS43 IAYEVSVQEAVALYGGHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYD
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 SQAPKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYS---HYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVW
.. : :.:.::. :.::::: .. .. ....:: :::.:. ::. ::::.:
CCDS43 ADDPVHYPRALCLFEMPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIW
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 DTVFHPSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGL
: .:.:.:..: ...::::. ..: ..:... : .:..::: .:..:::::::
CCDS43 DFIFYPNGVMEAKMHATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGT
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 ENWVWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSN
.: . .: . .. ::::.:.. . . . :.:::: :.:: ..: . :
CCDS43 KNSFQTLQMKLENITNPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQEN
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 KWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWA
::: : ::.:. :.: . :: . . ....: :: ::::. .: : :::...:::::
CCDS43 PWGHKRTYRLQIHSMADQVLPPGWQEEQAITWARYPLAVTKYRESELCSSSIYHQNDPWH
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 PTVDFSDFI-NNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNGVGFFLRPYNFFDED
: : : .:. :::.: ..:::::::.:::::::.::::::.: ::.:::.:::.::: ::
CCDS43 PPVVFEQFLHNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPED
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760
pF1KE5 PSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACA-PDLPAFSHGGFSHN
::. : :.. .: : :. .:. :. : : ::..:
CCDS43 PSLASRDTVIVW-PRDNGPNYVQRW--IPEDRDCSMP--PPFSYNGTYRPV
710 720 730 740 750
>>CCDS64797.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 (770 aa)
initn: 1700 init1: 490 opt: 907 Z-score: 965.3 bits: 189.4 E(32554): 1.9e-47
Smith-Waterman score: 1802; 39.1% identity (64.4% similar) in 755 aa overlap (46-759:21-765)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 TIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLFADLSREELTAVMRFL
:: : : : .. .:.::: .:: :: ::
CCDS64 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPS--PGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 TQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPPAREALAIVFFGRQPQ
.. : .. . . : :: .:. :: : .: ::.: :.::: :..::: : .
CCDS64 WSKKELRLQPSSTTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEH
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 PNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDIDQMIFNRELPQASGLL
:::.:..::::: : ::: .. : : . ::. :: . . . . : . .:
CCDS64 PNVTEFAVGPLPGPCYMRALS-PRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 HHC--CFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFLHHVGLELLVNHKA
. : . : :. .::::. ::.: .:. . . :.::: .::::::.: .
CCDS64 NTTGFSFQDCHDRCLAFTDVAPRGVASGQRRSWLIIQRYVE--GYFLHPTGLELLVDHGS
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KE5 LDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSWSLKSPVPP-----
: ..:....:.:.:..: : .: .. : :.::.. : ::. .. ::
CCDS64 TDAGHWAVEQVWYNGKFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSH
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE5 ---G--PAP-----PLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGER
: :.: : :.:::: ..:. : . :.:.: : . :: ....:.: :::
CCDS64 KPRGDFPSPIHVSGPRLVQPHGPRFRLEGNAVLYGGWSFAFRLRSSSGLQVLNVHFGGER
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LVYEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLE
..::.:.:::.:.:::..::.: :.:.: :.:.:. : :. :.::: ::..: .
CCDS64 IAYEVSVQEAVALYGGHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYD
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 SQAPKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYS---HYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVW
.. : :.:.::. :.::::: .. .. ....:: :::.:. ::. ::::.:
CCDS64 ADDPVHYPRALCLFEMPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIW
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 DTVFHPSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGL
: .:.:.:..: ...::::. ..: ..:... : .:..::: .:..:::::::
CCDS64 DFIFYPNGVMEAKMHATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGT
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 ENWVWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSN
.: . .: . .. ::::.:.. . . . :.:::: :.:: ..: . :
CCDS64 KNSFQTLQMKLENITNPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQEN
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630
pF1KE5 KWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWER-------------------YQLAVTQ
::: : ::.:. :.: . :: . . ....: : : ::::.
CCDS64 PWGHKRTYRLQIHSMADQVLPPGWQEEQAITWARTEGGQPRALSQAASPVPGRYPLAVTK
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 RKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDFSDFI-NNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTV
.: : :::...::::: : : : .:. :::.: ..:::::::.:::::::.::::::.
CCDS64 YRESELCSSSIYHQNDPWHPPVVFEQFLHNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTA
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 TVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACA-PDLPA
: ::.:::.:::.::: ::::. : :.. .: : :. .:. :. : :
CCDS64 TPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASRDTVIVW-PRDNGPNYVQRW--IPEDRDCSMP--PP
710 720 730 740 750 760
760
pF1KE5 FSHGGFSHN
::..:
CCDS64 FSYNGTYRPV
770
763 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:38:23 2016 done: Tue Nov 8 06:38:24 2016
Total Scan time: 3.990 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]