Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5782
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5782, 684 aa
1>>>pF1KE5782 684 - 684 aa - 684 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4987+/-0.00113; mu= 14.5686+/- 0.068
mean_var=99.1356+/-19.615, 0's: 0 Z-trim(104.3): 29 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.128813
statistics sampled from 7790 (7815) to 7790 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 684) 4472 842.2 0
CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 642) 3954 745.9 4.1e-215
CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX ( 628) 1175 229.5 1.2e-59
CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 499) 1162 227.0 5.1e-59
CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 636) 1162 227.1 6.3e-59
CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 637) 1162 227.1 6.3e-59
CCDS47480.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 632) 947 187.1 6.7e-47
CCDS4980.1 EEF1A1 gene_id:1915|Hs108|chr6 ( 462) 745 149.5 1e-35
CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 ( 463) 739 148.4 2.2e-35
>>CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 (684 aa)
initn: 4472 init1: 4472 opt: 4472 Z-score: 4495.3 bits: 842.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4472; 100.0% identity (100.0% similar) in 684 aa overlap (1-684:1-684)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKPSVEPVEEYDYED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKPSVEPVEEYDYED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKESSNSVSNHQLSGFDQARLYSCLDHMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALSGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LKESSNSVSNHQLSGFDQARLYSCLDHMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALSGVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVSGKKQTMGFEVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 EQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVSGKKQTMGFEVPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTIQASEEQSSTPAPVKKSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 VSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTIQASEEQSSTPAPVKKSGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNINKRTMHKYEQESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNINKRTMHKYEQESK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 KAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPGHKDFIPNMITGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPGHKDFIPNMITGAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 ITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWYKGLCLLEQIDSFKPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWYKGLCLLEQIDSFKPP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 QRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 VDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 VDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 LLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFK
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KE5 ELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
670 680
>>CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 (642 aa)
initn: 3954 init1: 3954 opt: 3954 Z-score: 3975.5 bits: 745.9 E(32554): 4.1e-215
Smith-Waterman score: 4102; 93.9% identity (93.9% similar) in 684 aa overlap (1-684:1-642)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTAAQFIYSRRDKPSVEPVEEYDYED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MARHRNVRGYNYDEDFEDDDLYGQSVEDDYCISPSTA-----------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LKESSNSVSNHQLSGFDQARLYSCLDHMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALSGVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 -------------------RLYSCLDHMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALSGVL
40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVSGKKQTMGFEVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVSGKKQTMGFEVPG
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTIQASEEQSSTPAPVKKSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTIQASEEQSSTPAPVKKSGK
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNINKRTMHKYEQESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNINKRTMHKYEQESK
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 KAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPGHKDFIPNMITGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPGHKDFIPNMITGAA
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMDQVNWQQERFQE
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 ITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWYKGLCLLEQIDSFKPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWYKGLCLLEQIDSFKPP
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 QRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEP
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 VDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPV
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 LLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFK
560 570 580 590 600 610
670 680
pF1KE5 ELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
620 630 640
>>CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX (628 aa)
initn: 900 init1: 636 opt: 1175 Z-score: 1184.6 bits: 229.5 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 1179; 37.9% identity (67.9% similar) in 546 aa overlap (140-682:103-623)
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FDVQKALSGVLEQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVSG
....: ::. :: : : :. . :.
CCDS14 LRGPTQPPTLPAGSGSNDETCTGAGYPQGKRMGRGAPVEP--SREE----PLVS-LEGSN
80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 KKQTMGFEVPGVSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTIQASEEQS
. :: . : : :::. . ... .. .. .: ...::. ....:.
CCDS14 SAVTMELSEPVV---ENGEVEMALEESWEHSKEVSEAEPGGGSSGDSGPPE--ESGQEMM
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 STPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNINK
..:: ... : . : :. .:.: ::::::::::. :....: : ..:
CCDS14 EEKEEIRKS----KSVIVPSGAPK----KEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMFLTGMVDK
190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 RTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPGHK
::..:::.:.:. .. .. .:.:: . :::..: :..:: . ::: : .:..::::::
CCDS14 RTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETERKHFTILDAPGHK
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNKMD
.:.:::: ::.:::.::::..: .::::.::: :::::::..:... :: .: : .::::
CCDS14 SFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKMD
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 Q--VNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFK-ESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWYK
. :::. ::..: :: :::..::. ..:. :.: :::.: :. ...:.. ::
CCDS14 DPTVNWSIERYEECKEKLVPFLKKVGFSPKKDIHFMPCSGLTGANI---KEQSDFCPWYT
360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 GLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAMPPN
:: .. .:.. .:::: :.:: . : .::.:. . ::.:.: : :..:. :: .
CCDS14 GLPFIPYLDNLPNFNRSIDGPIRLPIVDKYKDMGT--VVLGKLESGSIFKGQQLVMMPNK
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 ETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRARIL
.. : :: : .:..: :..... : :.. .: : :.: :. .. : ..:.
CCDS14 HNVEVLGILSDDTETDFVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPSNLCHSGRTFDVQIV
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 IFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALVELQ
:.. . : :. ..:: .: : . : :::...:..:: .: .:.:. . : ...:.
CCDS14 IIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALISLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLR
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680
pF1KE5 TQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
: : :: .::: ..::: :: :.::: : : ..
CCDS14 TAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
590 600 610 620
>>CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (499 aa)
initn: 951 init1: 637 opt: 1162 Z-score: 1173.0 bits: 227.0 E(32554): 5.1e-59
Smith-Waterman score: 1167; 39.0% identity (68.4% similar) in 503 aa overlap (185-682:9-494)
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 ESEIVPKVAKMTVSGKKQTMGFEVPGVSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASK
:::.. .:... .. :. .. .
CCDS45 MELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLG
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 SANPPHTI--QASEEQSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAG
.. ::. . ::. : : ... . : :. .:.: :::::::
CCDS45 DGRPPEESAHEMMEEEEEIPKP--------KSVVAPPGAPK----KEHVNVVFIGHVDAG
40 50 60 70 80
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 KSTLMGHMLYLLGNINKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTK
:::. :...:: : ..:::..:::.:.:. .. .. .:.:: . :::..: :..:: .
CCDS45 KSTIGGQIMYLTGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAY
90 100 110 120 130 140
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 FETTTKVITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLL
::: : .:..::::::.:.:::: ::.:::.::::..: .::::.::: :::::::..:
CCDS45 FETEKKHFTILDAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAML
150 160 170 180 190 200
400 410 420 430 440
pF1KE5 VRSLGVTQLAVAVNKMDQ--VNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFK-ESDVGFIPTSGLSG
... :: .: : .::::. :::..::..: :: :::..::. ..:. :.: :::.:
CCDS45 AKTAGVKHLIVLINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTG
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 ENLITRSQSSELTKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKI
:: ...:.. :: :: .. .:.. .::.: :.:: . : .::.:. . ::.
CCDS45 ANL---KEQSDFCPWYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGT--VVLGKL
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 EAGYIQTGDRLLAMPPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFC
:.: : :..:. :: ... : :: : .: .: :..... : :.. .: : :.:
CCDS45 ESGSICKGQQLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILC
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 GPKVPIKACTRFRARILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTK
:. .. : :.:.:.. . : :. ..:: .: : . : :: ...:..:: .:
CCDS45 DPNNLCHSGRTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSK
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 KKPKFLTKGQNALVELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
.:.:. . : ...:.: : :: .::: ..::: :: :.::: : : ..
CCDS45 TRPRFVKQDQVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
450 460 470 480 490
>>CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (636 aa)
initn: 926 init1: 637 opt: 1162 Z-score: 1171.4 bits: 227.1 E(32554): 6.3e-59
Smith-Waterman score: 1167; 39.0% identity (68.4% similar) in 503 aa overlap (185-682:146-631)
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 ESEIVPKVAKMTVSGKKQTMGFEVPGVSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASK
:::.. .:... .. :. .. .
CCDS45 RAAPVESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLG
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 SANPPHTI--QASEEQSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAG
.. ::. . ::. : : ... . : :. .:.: :::::::
CCDS45 DGRPPEESAHEMMEEEEEIPKP--------KSVVAPPGAPK----KEHVNVVFIGHVDAG
180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 KSTLMGHMLYLLGNINKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTK
:::. :...:: : ..:::..:::.:.:. .. .. .:.:: . :::..: :..:: .
CCDS45 KSTIGGQIMYLTGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAY
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 FETTTKVITLMDAPGHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLL
::: : .:..::::::.:.:::: ::.:::.::::..: .::::.::: :::::::..:
CCDS45 FETEKKHFTILDAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAML
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440
pF1KE5 VRSLGVTQLAVAVNKMDQ--VNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFK-ESDVGFIPTSGLSG
... :: .: : .::::. :::..::..: :: :::..::. ..:. :.: :::.:
CCDS45 AKTAGVKHLIVLINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTG
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 ENLITRSQSSELTKWYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKI
:: ...:.. :: :: .. .:.. .::.: :.:: . : .::.:. . ::.
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: ... : :: : .: .: :..... : :.. .: : :.: :. .. : :
CCDS45 PNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDA
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CCDS45 QIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIA
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pF1KE5 ELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
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CCDS45 RLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKESSNSVSNHQLSGFDQARLYSCLDHMREVLGDAVPDEILIEAVLKNKFDVQKALSGVL
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CCDS47 EQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGVLFSSSEVSADNVQSSYPQSANHLDYSSKPFDFASS
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CCDS49 SAQKAQKAK
460
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CCDS13 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGI
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290 300 310 320 330 340
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CCDS13 DKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAPG
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CCDS13 MDSTEPAYSEKRYDEIVKEVSAYIKKIGYNPATVPFVPISGWHGDNMLEPSPNMPWFKGW
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CCDS13 KVERKEGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGILRP
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CCDS13 PQEAAQFTSQVIILNHPGQISAGYSPVIDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDNPKS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]