Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5781
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5781, 644 aa
1>>>pF1KE5781 644 - 644 aa - 644 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7694+/-0.000834; mu= 16.3871+/- 0.050
mean_var=66.0694+/-13.296, 0's: 0 Z-trim(106.6): 117 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.157788
statistics sampled from 8975 (9094) to 8975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 644) 4447 1021.4 0
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 4428 1017.1 0
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 4428 1017.1 0
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 4065 934.5 0
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 2185 506.5 6.2e-143
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 2185 506.5 6.2e-143
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 2185 506.5 6.2e-143
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 2185 506.6 6.3e-143
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 2185 506.6 6.4e-143
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 1998 463.9 2.6e-130
CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 ( 449) 546 133.4 6.8e-31
CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 387) 541 132.2 1.3e-30
CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 470) 539 131.8 2.1e-30
CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 480) 539 131.8 2.2e-30
CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 343) 528 129.2 9.1e-30
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 475 117.3 1e-25
CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 ( 449) 397 99.4 1.1e-20
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 407 102.0 1.5e-20
CCDS45345.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 335) 381 95.8 1e-19
CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX ( 216) 356 90.0 3.6e-18
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 358 90.7 1.1e-17
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 353 89.5 1.8e-17
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 353 89.5 2.3e-17
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 348 88.3 3.1e-17
CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (2351) 356 90.3 3.2e-17
CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224) 354 89.9 4.2e-17
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 334 85.2 4.1e-16
CCDS58460.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 518) 327 83.5 7.8e-16
CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3 ( 775) 327 83.6 1.1e-15
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 328 83.9 1.4e-15
CCDS42444.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 156) 305 78.4 8.5e-15
CCDS12000.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18 ( 533) 308 79.2 1.6e-14
CCDS10727.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16 ( 525) 305 78.5 2.6e-14
CCDS34522.1 DCBLD1 gene_id:285761|Hs108|chr6 ( 539) 286 74.2 5.2e-13
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 281 73.1 1.6e-12
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 280 72.9 1.9e-12
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 280 72.9 2.1e-12
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 280 72.9 2.1e-12
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 280 72.9 2.2e-12
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 919) 280 72.9 2.2e-12
CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331) 281 73.2 2.6e-12
CCDS3127.1 PCOLCE2 gene_id:26577|Hs108|chr3 ( 415) 270 70.5 5.2e-12
CCDS2193.1 TNFAIP6 gene_id:7130|Hs108|chr2 ( 277) 260 68.2 1.7e-11
CCDS12604.2 MEGF8 gene_id:1954|Hs108|chr19 (2778) 264 69.4 7.5e-11
CCDS62693.1 MEGF8 gene_id:1954|Hs108|chr19 (2845) 264 69.4 7.7e-11
>>CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (644 aa)
initn: 4447 init1: 4447 opt: 4447 Z-score: 5464.9 bits: 1021.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4447; 99.8% identity (100.0% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS31 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIRSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQYSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQYSTN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVKTYKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVKTYKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 DVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGISMRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGISMRFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 VYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPAPHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPAPHSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 INEWLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMIMDDSKRKAKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 INEWLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMIMDDSKRKAKSF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 EGNNNYDTPELRTFPALSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEAPTAGPTTPNGNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EGNNNYDTPELRTFPALSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEAPTAGPTTPNGNLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE5 DECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLATEKPTVIDSTIQSGIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLATEKPTVIDSTIQSGIK
610 620 630 640
>>CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (906 aa)
initn: 4428 init1: 4428 opt: 4428 Z-score: 5439.1 bits: 1017.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4428; 99.8% identity (100.0% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS81 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIRSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQYSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQYSTN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVKTYKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVKTYKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 DVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGISMRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGISMRFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 VYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPAPHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPAPHSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 INEWLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMIMDDSKRKAKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 INEWLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMIMDDSKRKAKSF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 EGNNNYDTPELRTFPALSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEAPTAGPTTPNGNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EGNNNYDTPELRTFPALSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEAPTAGPTTPNGNLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE5 DECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLATEKPTVIDSTIQSGIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLATEKPTVIDSTIQSEFPTYGFNCEFGWGSHKTF
610 620 630 640 650 660
CCDS81 CHWEHDNHVQLKWSVLTSKTGPIQDHTGDGNFIYSQADENQKGKVARLVSPVVYSQNSAH
670 680 690 700 710 720
>>CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (923 aa)
initn: 4428 init1: 4428 opt: 4428 Z-score: 5438.9 bits: 1017.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4428; 99.8% identity (100.0% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS71 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGRYCGQKTPGRIRSSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQYSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITASSQYSTN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVKTYKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 WSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKKKYYVKTYKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 DVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGISMRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DVSSNGEDWITIKEGNKPVLFQGNTNPTDVVVAVFPKPLITRFVRIKPATWETGISMRFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 VYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPAPHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VYGCKITDYPCSGMLGMVSGLISDSQITSSNQGDRNWMPENIRLVTSRSGWALPPAPHSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 INEWLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMIMDDSKRKAKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 INEWLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHRENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMIMDDSKRKAKSF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 EGNNNYDTPELRTFPALSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEAPTAGPTTPNGNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EGNNNYDTPELRTFPALSTRFIRIYPERATHGGLGLRMELLGCEVEAPTAGPTTPNGNLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE5 DECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLATEKPTVIDSTIQSGIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DECDDDQANCHSGTGDDFQLTGGTTVLATEKPTVIDSTIQSEFPTYGFNCEFGWGSHKTF
610 620 630 640 650 660
CCDS71 CHWEHDNHVQLKWSVLTSKTGPIQDHTGDGNFIYSQADENQKGKVARLVSPVVYSQNSAH
670 680 690 700 710 720
>>CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 (609 aa)
initn: 4407 init1: 4058 opt: 4065 Z-score: 4995.3 bits: 934.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4112; 94.4% identity (94.6% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-609)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS31 IKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECTYIVFVP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]