Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5777
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5777, 632 aa
1>>>pF1KE5777 632 - 632 aa - 632 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6015+/-0.000924; mu= 12.9741+/- 0.055
mean_var=87.9177+/-17.867, 0's: 0 Z-trim(107.5): 68 B-trim: 242 in 1/51
Lambda= 0.136784
statistics sampled from 9548 (9617) to 9548 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 4276 854.1 0
CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 1227 252.3 1.1e-66
CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 1227 252.3 1.1e-66
CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 1225 251.9 1.4e-66
CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 1218 250.6 3.7e-66
CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 1217 250.4 4.2e-66
CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 1052 217.8 2.3e-56
CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 1024 212.2 1e-54
CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 936 194.9 2e-49
CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 902 188.2 2.1e-47
CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 901 188.0 2.4e-47
CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 901 188.0 2.4e-47
CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 884 184.6 2.5e-46
CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 884 184.6 2.6e-46
CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 876 183.0 6.4e-46
CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 875 182.9 8.3e-46
CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 872 182.3 1.2e-45
CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 868 181.5 2.2e-45
CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 866 181.1 2.9e-45
CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 863 180.5 4.4e-45
CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 861 180.1 5.8e-45
CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 836 175.2 1.7e-43
CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 823 172.6 1.1e-42
CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 814 170.8 3.6e-42
CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 811 170.2 5.5e-42
CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 790 166.1 9.4e-41
CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 786 165.3 1.3e-40
CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 781 164.3 3.3e-40
CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 778 163.7 4.9e-40
CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 776 163.3 6.9e-40
CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 772 162.5 1.1e-39
CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 771 162.4 1.5e-39
CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 766 161.4 2.5e-39
CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 765 161.2 3.2e-39
CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 764 161.0 3.7e-39
CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 752 158.6 1.8e-38
CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 690 146.3 5.4e-35
CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 645 137.4 2.7e-32
CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 503 109.4 6.2e-24
CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 427 94.5 3.9e-19
CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3 ( 447) 322 73.7 5.9e-13
CCDS3251.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 471) 315 72.4 1.6e-12
CCDS58868.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 314 72.2 1.8e-12
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 302 69.8 9.3e-12
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 302 69.8 9.7e-12
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 301 69.6 1.1e-11
CCDS58869.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 441) 290 67.4 4.6e-11
CCDS58870.1 HTR3E gene_id:285242|Hs108|chr3 ( 456) 290 67.4 4.8e-11
CCDS7745.1 CHRNA10 gene_id:57053|Hs108|chr11 ( 450) 287 66.8 7.1e-11
>>CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX (632 aa)
initn: 4276 init1: 4276 opt: 4276 Z-score: 4560.6 bits: 854.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4276; 100.0% identity (100.0% similar) in 632 aa overlap (1-632:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGIRGMLRAAVILLLIRTWLAEGNYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGIRGMLRAAVILLLIRTWLAEGNYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 KILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AACSLDLHKFPMDKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AACSLDLHKFPMDKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVGNVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 SEQAQLATSESLSPLTSLSGQAPLATGESLSDLPSTSEQARHSYGVRFNGFQADDSIIPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SEQAQLATSESLSPLTSLSGQAPLATGESLSDLPSTSEQARHSYGVRFNGFQADDSIIPT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 EIRNRVEAHGHGVTHDHEDSNESLSSDERHGHGPSGKPMLHHGEKGVQEAGWDLDDNNDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EIRNRVEAHGHGVTHDHEDSNESLSSDERHGHGPSGKPMLHHGEKGVQEAGWDLDDNNDK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 SDCLAIKEQFKCDTNSTWGLNDDELMAHGQEKDSSSESEDSCPPSPGCSFTEGFSFDLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDCLAIKEQFKCDTNSTWGLNDDELMAHGQEKDSSSESEDSCPPSPGCSFTEGFSFDLFN
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE5 PDYVPKVDKWSRFLFPLAFGLFNIVYWVYHMY
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDYVPKVDKWSRFLFPLAFGLFNIVYWVYHMY
610 620 630
>>CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 (474 aa)
initn: 1313 init1: 1211 opt: 1227 Z-score: 1310.9 bits: 252.3 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 1227; 52.3% identity (84.8% similar) in 310 aa overlap (54-363:31-340)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 NYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPV
.: ..:.. .::.:. ::.::::.::: ::
CCDS43 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVCAQSVNDPSNMSLVKETVDRLLKGYDIRLRPDFGGPPV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 PVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDC
: ..: ..::...::.:::::.::.:.:.:.:.::.: :::::: :. ..:::::
CCDS43 AVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLDNRVADQLWVPDT
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 YFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVES
::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: :.: .::
CCDS43 YFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIES
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 YGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQR
::::..:: ..: . ::. . ....:::... . .:.: : :::: :: :.:...:
CCDS43 YGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVFSTGSYPRLSLSFKLKR
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 EVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNIS
... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.:
CCDS43 NIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIP
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330 340 350 360 370 380
pF1KE5 CIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVG
.::::.:.. :. :::..::::. .::.:..:::.:: .
CCDS43 YVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAASANNEKMRLDVNKM
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 NVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAP
CCDS43 DPHENILLSTLEIKNEMATSEAVMGLGDPRSTMLAYDASSIQYRKAGLPRHSFGRNALER
370 380 390 400 410 420
>>CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 (512 aa)
initn: 1313 init1: 1211 opt: 1227 Z-score: 1310.3 bits: 252.3 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 1227; 52.3% identity (84.8% similar) in 310 aa overlap (54-363:31-340)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 NYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANEAVVQKILDRVLSRYDVRLRPNFGGAPV
.: ..:.. .::.:. ::.::::.::: ::
CCDS43 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVCAQSVNDPSNMSLVKETVDRLLKGYDIRLRPDFGGPPV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 PVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNLTLDYRMHEKLWVPDC
: ..: ..::...::.:::::.::.:.:.:.:.::.: :::::: :. ..:::::
CCDS43 AVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLDNRVADQLWVPDT
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 YFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLHKFPMDKQACNLVVES
::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::...:.:.: :.: .::
CCDS43 YFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIES
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 YGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQR
::::..:: ..: . ::. . ....:::... . .:.: : :::: :: :.:...:
CCDS43 YGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVFSTGSYPRLSLSFKLKR
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 EVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNIS
... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.:
CCDS43 NIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIP
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 CIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRPRRVIARYRYQQVVVG
.::::.:.. :. :::..::::. .::.:..:::.:: .
CCDS43 YVKAIDMYLMGCFVFVFMALLEYALVNYIFFGRGPQRQKKAAEKAASANNEKMRLDVNKI
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 NVQDGLINVEDGVSSLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQAQLATSESLSPLTSLSGQAP
CCDS43 FYKDIKQNGTQYRSLWDPTGNLSPTRRTTNYDFSLYTMDPHENILLSTLEIKNEMATSEA
370 380 390 400 410 420
>>CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 (474 aa)
initn: 1318 init1: 1196 opt: 1225 Z-score: 1308.8 bits: 251.9 E(32554): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 1225; 45.0% identity (78.4% similar) in 398 aa overlap (43-431:17-413)
20 30 40 50 60
pF1KE5 LLLIRTWLAEGNYPSPIPKFHFEFSSAVPEVVLNLFNCKNCANE----AVVQKILDRVLS
:.... : . .:: . :.. .::.:.
CCDS34 MWTVQNRESLGLLSFPVMITMVCCAHSTNEPSNMSYVKETVDRLLK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RYDVRLRPNFGGAPVPVRISIYVTSIEQISEMNMDYTITMFFHQTWKDSRLAYYETTLNL
::.::::.::: :: : . : :.::...::.:::::.::.:.:.:::.::.: :::
CCDS34 GYDIRLRPDFGGPPVDVGMRIDVASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQSWKDKRLSYSGIPLNL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TLDYRMHEKLWVPDCYFLNSKDAFVHDVTVENRVFQLHPDGTVRYGIRLTTTAACSLDLH
::: :. ..::::: ::::.: .::: :::.::...::::::: ::.:.:::::: .::.
CCDS34 TLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KFPMDKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFY
..:.:.: :.: .::::::..:: ..:. . .:. ......:::... ..::.: :
CCDS34 RYPLDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWNGGEGAVTGVNKIELPQFSIVDYKMVSKKVEFT
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TGSYIRLILKFQVQREVNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLIL
::.: :: :.:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .
CCDS34 TGAYPRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSTLITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQ-PRRHRR
:::..:::. ::.: .::::::.. :. ::::.::::...::.:...::... .. .
CCDS34 TTISTHLRETLPKIPYVKAIDIYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGKGPQKKGASKQDQ
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 PRRVIARYRYQQVVV---GNVQDGLINVEDGVS-SLPITPAQAPLASPESLGSLTSTSEQ
. ....: : ::. . ..... .: : .: .. : :. : : .: . .
CCDS34 SANEKNKLEMNKVQVDAHGNILLSTLEIRNETSGSEVLTSVSDPKATMYSYDS-ASIQYR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 AQLATSESLSPLTSLSGQAPLATGESLSDLPSTSEQARHSYGVRFNGFQADDSIIPTEIR
:.. :.
CCDS34 KPLSSREAYGRALDRHGVPSKGRIRRRASQLKVKIPDLTDVNSIDKWSRMFFPITFSLFN
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20 30 40 50 60
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:.. . : . .:. . :.. .:..:.
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..:.:.: :.: .::::::..:: ..: . .:. .:....:::... . ..:..: :
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::.: :: :.:...:... ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .
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: . :.. .:..:. ::.::::.::: ::
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CCDS10 FLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIESY
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pF1KE5 GYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFYTGSYIRLILKFQVQRE
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CCDS10 GYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLKRN
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pF1KE5 VNSYLVQVYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISC
.. ...:.: :..: :: ::.:::.:::.:::::..:.:..: .:::..:::. ::.:
CCDS10 IGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKIPY
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CCDS10 VKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNRVD
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CCDS10 AHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRSLP
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CCDS53 MWATYQTEEDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDN
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CCDS53 THLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAK
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CCDS53 NDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPRE
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CCDS53 MYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQ
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CCDS53 LWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNC
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CCDS53 TLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSL
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CCDS53 SFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRE
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CCDS53 TLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSK
220 230 240 250 260 270
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CCDS53 SESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRF
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CCDS36 SIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRLSYNHTNETLGLDSRFVDKLWLPDTFIVNAKSAW
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CCDS36 FHDVTVENKLIRLQPDGVILYSIRITSTVACDMDLAKYPMDEQECMLDLESYGYSSEDIV
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CCDS36 YYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAGQFPRLSLHFHLRRNRGVYIIQ
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pF1KE5 VYWPTVLTTITSWISFWMNYDSSAARVTIGLTSMLILTTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIY
: :.:: . ::.:::.. . :::..:.:..: .::. :..:: : :::.:.:
CCDS36 SYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTTLMVSARSSLPRASAIKALDVY
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CCDS36 FWICYVFVFAALVEYAFAHFNADYRKKQKAKVKVSRPRAEMDVRNAIVLFSLSAAGVTQE
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CCDS43 WETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNFKGPPVNVSCNI
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CCDS43 FINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAYNEYPDDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANE
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CCDS43 KGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMDLKNFPMDVQTCIMQLESFGYTM
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CCDS43 YLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKA
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CCDS43 IDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHKELLRFRRKRRHHKEDEAGEGRFNFSAYGMG
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CCDS43 PACLQAKDG-ISVKGANNSNTTNPPPAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMAFLI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]