Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5770
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5770, 600 aa
1>>>pF1KE5770 600 - 600 aa - 600 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9948+/-0.00122; mu= 6.9705+/- 0.073
mean_var=168.0660+/-32.750, 0's: 0 Z-trim(107.0): 60 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.098931
statistics sampled from 9262 (9319) to 9262 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 3.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 3939 575.0 9.4e-164
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 774 123.4 1.2e-27
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 710 114.2 5.6e-25
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 535 89.1 1.4e-17
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 520 87.0 7.9e-17
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 515 86.4 1.4e-16
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 504 84.8 4.2e-16
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 504 84.8 4.5e-16
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 500 84.2 6.8e-16
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 462 78.8 2.4e-14
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 453 77.6 7.7e-14
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 453 77.6 7.7e-14
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 439 75.6 3.5e-13
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 439 75.6 3.5e-13
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 423 73.1 9.3e-13
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 424 73.3 9.6e-13
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 424 73.4 1.1e-12
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 424 73.4 1.1e-12
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 424 73.4 1.2e-12
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 415 72.1 2.8e-12
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 415 72.1 2.8e-12
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 403 70.3 8.1e-12
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 403 70.3 8.1e-12
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 401 70.0 9.5e-12
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 388 68.2 3.5e-11
>>CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 (600 aa)
initn: 3939 init1: 3939 opt: 3939 Z-score: 3053.3 bits: 575.0 E(32554): 9.4e-164
Smith-Waterman score: 3939; 100.0% identity (100.0% similar) in 600 aa overlap (1-600:1-600)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSHFTKHFPEFSQILWIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSHFTKHFPEFSQILWIGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 RNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAASSAQKTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAASSAQKTPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 RLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GKMKYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GKMKYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMKPQRNTADLLPKLKSMALADRAVFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 RIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMKPQRNTADLLPKLKSMALADRAVFEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLRMPKMPELRGKQFPDFVPVDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLRMPKMPELRGKQFPDFVPVDVN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 TDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGRRKFIKNKAWSKQKAKKEKKKKMNEKRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 TDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGRRKFIKNKAWSKQKAKKEKKKKMNEKRKR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 EEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEEEFEKGLLTTGKRTIKTVDLGISDLEDDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 EEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEEEFEKGLLTTGKRTIKTVDLGISDLEDDC
550 560 570 580 590 600
>>CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 (875 aa)
initn: 877 init1: 321 opt: 774 Z-score: 609.6 bits: 123.4 E(32554): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 1054; 36.3% identity (67.8% similar) in 559 aa overlap (15-568:75-600)
10 20 30 40
pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFM
:: ..: .:.: . .: .:. :: : .
CCDS83 EWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLAL
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 RNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSH
..::: . : :::::::::..:.:: : : . . . .:..::.:::::: : ::: .
CCDS83 QGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWT-STDGLGVLIISPTRELAYQTFEVLRK
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FTKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRS
:. .:: : :::.. ...::... ::.: ::::: ... : ... . .
CCDS83 VGKNH-DFSAGLIIGGKDLKHEAERINNI--NILVCTPGRL---LQHMDETVSFHA--TD
170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVS
:..::::::::.::::: ..:...: :::.:.: :::::::. :..:.: .:.:: :
CCDS83 LQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVW
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 VKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYG
:.:: . .::. ::. :.::. ..:.. : :::.: ..: .::::.: :.:
CCDS83 VHEK-----AKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 KALEVLVKGVKIMCIHGKMK-YKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQY
... : ::.:. .::... ..: ... :: . ....: ::. :::.:.: ::::::.
CCDS83 RVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQF
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMK--PQRNTA
: : .:....:: ::::: . : ::..::: :..... : ...: :..:.: :..
CCDS83 DCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQL-LQKKVPVKEIKINPEK-LI
400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 DLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLRMP
:. ::.:. :. . :.... :::::.. . . .: .. : . : ...: :
CCDS83 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 KMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGRRKFIKNKAW
.. :. : : :. .: .: .:..: : . :. ..: .:.
CCDS83 RVRFLQKMQ------------KQPTKELVR-SQADKVIEP-RAPSLTNDEVEEF---RAY
510 520 530 540 550
530 540 550 560 570
pF1KE5 SKQKAKKEKK--KKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEEEFEKGLL
..: . .: :... ..:.... ..:. :: .. .. .:: :.:
CCDS83 FNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTS
560 570 580 590 600 610
580 590 600
pF1KE5 TTGKRTIKTVDLGISDLEDDC
CCDS83 EAQKIKEVPTQFLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTLQKKEPSKSSIKKKMTKV
620 630 640 650 660 670
>>CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 (670 aa)
initn: 836 init1: 264 opt: 710 Z-score: 561.9 bits: 114.2 E(32554): 5.6e-25
Smith-Waterman score: 991; 35.9% identity (68.5% similar) in 518 aa overlap (8-520:178-662)
10 20 30
pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQS
:. :: .. ..: :..:.:: :: .:
CCDS21 ENNVEKPDNDEDESEVPSLPLGLTGAFEDTSFASLCNLVNENTLKAIKEMGFTNMTEIQH
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 ATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQ
.: .....:. : : :::::::::.:: .:.... . . .. .:..:..::::::.:
CCDS21 KSIRPLLEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIVKLRF-MPRNGTGVLILSPTRELAMQ
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 IDEVLSHF-TKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGL
::... :.: .. :. :: : . ..... . : :::::::::: : .. .. :.
CCDS21 TFGVLKELMTHHVHTYGLIM--GGSNRSAEAQKLGN-GINIIVATPGRLLDHMQ-NTPGF
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 DLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAG
..:. ::.:::::.::.::: .. :...:: .:.: :::::::..::.:.: .
CCDS21 ----MYKNLQCLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLLPTRRQTMLFSATQTRKVEDLARIS
330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LRN-PVRVSVKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFS
:.. :. : :: ..:. : . ::. :.:: ....: : ::......: .::::
CCDS21 LKKEPLYV-----GVDDDKANATVDGLEQGYVVCPSEKRFLLLFTFLKKNRKKKLMVFFS
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 TCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIHGKMKY-KRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDI
.: :.:. . :. . . .. ::::.: ::. :..: . .:: :.:::: :::.::
CCDS21 SCMSVKYHYELLNYI--DLPVLAIHGKQKQNKRTTTFFQFCNADSGTLLCTDVAARGLDI
440 450 460 470 480 490
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 PEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHG-GSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQE
:::.:..:::::.. . ..:: ::::: .: : ::..: : : ... .: ..: ::.:
CCDS21 PEVDWIVQYDPPDDPKEYIHRVGRTARGLNGRGHALLILRPEELGFLRYLK-QSKVPLSE
500 510 520 530 540 550
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 MK-PQRNTADLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLA
. . .:. .:... . . .....:. ::..:: .: . :: ...:.. ..:
CCDS21 FDFSWSKISDIQSQLEKLIEKNYFLHKSAQEAYKSYIRAYDSHSLKQIFNVNNLNLPQVA
560 570 580 590 600 610
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 RGFALLRMPKMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGR
.: : . : :: ..::.. . : ... . :. .:.:.
CCDS21 LSF------------GFKVPPFVDLNVNSN----EGKQKKRGGGGGFGYQKTKKVEKSKI
620 630 640 650
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 RKFIKNKAWSKQKAKKEKKKKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEE
: :..:.
CCDS21 FKHISKKSSDSRQFSH
660 670
>>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa)
initn: 612 init1: 216 opt: 535 Z-score: 429.3 bits: 89.1 E(32554): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 689; 37.0% identity (68.1% similar) in 351 aa overlap (23-372:38-367)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFMRNKDVAAE
: .::. : .: .::: ....:. .
CCDS86 DSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 AVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSHFTKHFPEF
: :::::: ::..:::. ::. ..: :...:::::::.::.: . . . .
CCDS86 AETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLF-----ALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRSLDVLVLDE
: .. .:: . . . .. .::.:::::: : .. ...:..: :.: ::.::
CCDS86 SAVI-VGGIDSMSQSLALAKKP-HIIIATPGRLIDHLE-NTKGFNL----RALKYLVMDE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAA
:::.:.: ::. .. ::. .:..:.: :::::.:..:..: ::.:.:::. .:
CCDS86 ADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAV-------
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVK
:: .: .:..::. . : . ::..: . .. ..: ::: .. . :. :
CCDS86 SSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNL--
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GVKIMCIHGKM-KYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASA
: . .::.: . :: . .:. .::. ::: .::.:::.:. :...: :....
CCDS86 GFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKD
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMKPQRNTADLLPKLKSMA
..:: ::::: :..:.:..:.
CCDS86 YIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEA
350 360 370 380 390 400
>>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 (648 aa)
initn: 506 init1: 155 opt: 520 Z-score: 415.6 bits: 87.0 E(32554): 7.9e-17
Smith-Waterman score: 603; 31.8% identity (66.6% similar) in 359 aa overlap (17-372:250-591)
10 20 30 40
pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFMRN
.:.:. ... :: ::.:: . :. ...
CCDS49 NFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQG
220 230 240 250 260 270
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 KDVAAEAVTGSGKTLAFVIP-ILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSHF
:. . : ::.:::: ...: .....:. : .... : ...:::::::.:.. ..
CCDS49 IDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKY
280 290 300 310 320 330
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 TKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRSL
. . . .. :: : :..:..:. : .::.::::::.:. . .. ..: ...
CCDS49 S--YKGLRSVCVYGGGNRDEQIEELKK-GVDIIIATPGRLNDL--QMSNFVNL----KNI
340 350 360 370 380 390
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVSV
:::::::..:::::: .: :: . .:.: . ::: . :. :... :..:. : :
CCDS49 TYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYV
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230 240 250 260 270 280
pF1KE5 KEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQ-EKHLVFFSTCACVEYYG
..: :. : .: .: .::.... ::.. .. .: .:: : : ... .
CCDS49 GTLDLVAVSSVK-----QNI-IVTTEEEKWSHMQTFLQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLS
460 470 480 490 500
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 KALEVLVKGVKIMCIHG-KMKYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQY
. .... .... .:: . . :.: . .:. . ::. ::. .::.:. .:. : ..
CCDS49 S--DLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNF
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350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMKPQRNTADL
: : : .::: :::.: :. : ... :
CCDS49 DFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQSIPEELVSMAE
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10 20 30
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::.. ..:. ... :. : :. :.
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: :. ...::. :.: ::.:::..:.::..: : : .: .:::. ... .:::::
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:::.. : .::::.:..::.:: ... :.. : .: ::::: : :
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.... ... .. .... .::. . .:. . :. ... . :. .. .
CCDS72 YKVAKKYMKS----RYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSE
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. ..: : : . :.. .: . .:.:: . .. .: .. ::. . .:: :.
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: :::.:::::. :.: .::... ...:: :::.: :. : . : : :.. . . ..
CCDS72 VAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRY--VE
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:: . . .: ::. : :::
CCDS72 QKAGITFKRVGVPSTMDLV-KSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALA
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:. :. . .::. :.: ::.:::..:.::..: : :. ... . :: ....:::
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::: :... .: .:: ..: . :: : . ::... : .:.:.::::..: ..
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: :... ... . .. . ....::: .:. . :. .. ...... .
CCDS73 WVFNVAKKYMKS----TYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSG
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: : . ..: : .. .. . .: . .:: . :. .: .. ::. . :.::
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:.: :::.:::::. :.: .::... ...:: :::.: :. : . : :: ...
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..:: ..
CCDS73 QVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEA
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pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPV
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CCDS31 PHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPIS--EETIKLLKGRGVTFLFPI
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:. :. . .::. :.: ::.:::..:.::..: : :. ... . :: ....:::
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CCDS31 K--LDLTK----LKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPH
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: :... ... . .. . ....::: .:. . :. .. ...... .
CCDS31 WVFNVAKKYMKS----TYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSG
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pF1KE5 HKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIHGKMKYKRNKIFME-FRKLQSGILV
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CCDS31 H-QGRTIIFCETKKEAQELSQ--NSAIKQ-DAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLV
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:.: :::.:::::. :.: .::... ...:: :::.: :. : . : :: ...
CCDS31 ATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEE--YQLV
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..:: ..
CCDS31 QVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEA
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CCDS13 CNITTCLAVGGLDV-KSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLH-NCPSFHLSS----IEVLI
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::::::.:: :: ... :... ..:.: :::::.:.::..:. ..:.::::. :. .
CCDS13 LDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIFVNSNT
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.: .. :.. ..:.. .: : .. :...:. . . :
CCDS13 DVAPFLRQEFIRIRPNR---EGDRE--AIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMHILLG
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CCDS13 LM-GLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPNT
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pF1KE5 ASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQ-EMKPQRNTADLLPKL
. .::: ::::: :..: .. .. :..... .. : :.. .. :: . :.
CCDS13 IKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKARILPQDVILKFRDKI
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pF1KE5 KSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARG-FALLRMPKMPEL
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CCDS13 EKMEKDVYAVLQ--LEAEEKEMQQ-SEAQINTAKRL-------LEKGKEAVVQEPERSWF
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pF1KE5 RGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTE--NEGRRKF--IKNKAWS
. :. . . : .: :...: . .. ..: : : : .: .: . ..
CCDS13 QTKE--ERKKEKIAKALQEFDLALRGKKKRKKFMKDAKKKGEMTAEERSQFEILKAQMFA
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pF1KE5 KQKAKKEKKKK----MNEK-------RKREEGS-DIEDEDMEELLNDTR-LLKKLKKGKI
.. ::.... : : :. .:...:. .. : ::: : .. ::. . :
CCDS13 ERLAKRNRRAKRARAMPEEEPVRGPAKKQKQGKKSVFD---EELTNTSKKALKQYRAGPS
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pF1KE5 TEEEFEKGLLTTGKRTIKTVDLGISDLEDDC
::. . ::
CCDS13 FEERKQLGLPHQRRGGNFKSKSRYKRRK
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CCDS44 VLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFP--AAILRGLKKKGIHHPTPIQI
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:: .. ..:. . : :::::::.:..:.. . :..:..: :. ..:: :.:::
CCDS44 QGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSREL
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CCDS44 ARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRH-GVHMMVATPGRLMDLL
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CCDS44 QKKMVSLDI--C----RYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKI
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CCDS44 VLIFAEKKADVDAIHEYL--LLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVA
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CCDS44 SKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVL----MDL
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: : : : . . : :. . .:..... :
CCDS44 KALLLEAKQK-----VPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQT
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pF1KE5 FASLARGFALLRMPKMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKT
CCDS44 KQVSNIGRKDYLAHSSMDF
610 620
600 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 04:56:47 2016 done: Tue Nov 8 04:56:47 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]