Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5768
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5768, 943 aa
1>>>pF1KE5768 943 - 943 aa - 943 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8552+/- 0.001; mu= 17.9462+/- 0.061
mean_var=72.9948+/-14.789, 0's: 0 Z-trim(104.9): 22 B-trim: 54 in 1/46
Lambda= 0.150116
statistics sampled from 8128 (8137) to 8128 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 4.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS708.1 CLCA2 gene_id:9635|Hs108|chr1 ( 943) 6273 1368.6 0
CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 ( 914) 2532 558.4 2.3e-158
CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 ( 919) 2472 545.4 1.9e-154
>>CCDS708.1 CLCA2 gene_id:9635|Hs108|chr1 (943 aa)
initn: 6273 init1: 6273 opt: 6273 Z-score: 7335.1 bits: 1368.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6273; 100.0% identity (100.0% similar) in 943 aa overlap (1-943:1-943)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN
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CCDS70 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNSKIKQESYEKANVIVTDWYGAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNSKIKQESYEKANVIVTDWYGAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNND
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KPFYINGQNQIKVTRCSSDITGIFVCEKGPCPQENCIISKLFKEGCTFIYNSTQNATASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 KPFYINGQNQIKVTRCSSDITGIFVCEKGPCPQENCIISKLFKEGCTFIYNSTQNATASI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS70 MFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMNGTELPPPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIASFDSKGEI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYGSVMILVTS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISNSNSMIDAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISNSNSMIDAF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 SRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQASGPPEIIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQASGPPEIIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 FDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVTVTSRASNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 FDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVTVTSRASNS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 AVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPVTLRLLDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 AVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPVTLRLLDDG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 AGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPGSHAMYVPGYTANGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 AGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPGSHAMYVPGYTANGN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 IQMNAPRKSVGRNEEERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKIIDLEAVKVEEE
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CCDS70 IQMNAPRKSVGRNEEERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKIIDLEAVKVEEE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 LTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQQAGIREIFTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQQAGIREIFTFS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 PQISTNGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLFIPPNSDPVPARDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 PQISTNGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLFIPPNSDPVPARDY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KE5 LILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL
910 920 930 940
>>CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 (914 aa)
initn: 2084 init1: 581 opt: 2532 Z-score: 2956.7 bits: 558.4 E(32554): 2.3e-158
Smith-Waterman score: 2623; 45.6% identity (75.8% similar) in 906 aa overlap (8-899:2-878)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN
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CCDS70 MGPFKSSVFILILHLLEGALS--NSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNS-KIKQESYEKANVIVTDWYGA
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CCDS70 IKDMVTQASLYLLEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 HGDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNN
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CCDS70 GNDEPYTEQMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKL-AEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DKPFYI-NGQNQIKVTRCSSDITGIFV---CEKGPCPQENCIISK---LFKEGCTFIYNS
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CCDS70 DEKFYLSNGR--IQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TQNATASIMFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMN
:. ::::: : ..:.::::. ..::.:::: ::: :.:::.:.:: :: ::... ::
CCDS70 RQTEKASIMFAQHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPM-
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTELPPPPTFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIA
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CCDS70 -TTQPPNPTFSLLQIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SFDSKGEIRAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYG
.::: .... .: ::::..:: :.. ::...:. : ::::::...: :..: . . :
CCDS70 TFDSAAHVQNELIQINSGSDRDTLAKRLPAAASGGT--SICSGLRSAFTVIRK-KYPTDG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 SVMILVTSGDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISN
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CCDS70 SEIVLLTDGEDNTISGCFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 SNSMIDAFSRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQA
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CCDS70 NNGLIDAFGALSSGNGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTM
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 SGPPEIILFDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVT
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CCDS70 Q-PPQILLWDPSGQKQ--GGFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQA---SSQTLTLT
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 VTSRASNSAVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPV
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CCDS70 VTSRASNATLPPITVTSKTNKDTSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTV
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 TLRLLDDGAGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPG-SHAMY
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CCDS70 TLELLDNGAGADATKDDGVYSRYFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAAR-RRVIPQQSGALY
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE5 VPGYTANGNIQMNAPRKSVGRNEEERKW-GFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKII
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CCDS70 IPGWIENDEIQWNPPRPEINKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQIT
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820
pF1KE5 DLEA-VKVEEELTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQ
::.: .. ..:.:::::.:.:.: : .: ::.: :. ...: ::... :::. :.
CCDS70 DLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDYDHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPK
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KE5 QAGIREIFTFSPQIST--NGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLF
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CCDS70 EANSEEVFLFKPENITFENGTD------------LFIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLF
820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KE5 IPPNSDP-VPARDYLILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL
:::.. : .:. :
CCDS70 IPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILKIMWKWIGELQLSIA
870 880 890 900 910
>>CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 (919 aa)
initn: 2090 init1: 793 opt: 2472 Z-score: 2886.4 bits: 545.4 E(32554): 1.9e-154
Smith-Waterman score: 2555; 43.6% identity (74.2% similar) in 908 aa overlap (33-922:24-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 QRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISNIK
..:..::.. ..:.:.:.:::....: .:.
CCDS41 MGLFRGFVFLLVLCLLHQSNTSFIKLNNNGFEDIVIVIDPSVPEDEKIIEQIE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNSK-IKQESYEKANVIVTDWYGAHG
.:.: :: :::.::..: ::.:..:::: .:: : . : :.:....:.:::.
CCDS41 DMVTTASTYLFEATEKRFFFKNVSILIPENWKENPQYKRPKHENHKHADVIVAPPTLPGR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNNDK
:.::: :. ::..:.::::::..::. . . :: :..:::::::::::::::::.:.
CCDS41 DEPYTKQFTECGEKGEYIHFTPDLLLGKKQNE-YGPPGKLFVHEWAHLRWGVFDEYNEDQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 PFYINGQNQIKVTRCSSDITG---IFVCEKGPCPQENCII---SKLFKEGCTFIYNSTQN
::: ...:..::::. :.: .. :. : : .. : : .::. . : :. ...:.
CCDS41 PFYRAKSKKIEATRCSAGISGRNRVYKCQGGSCLSRACRIDSTTKLYGKDCQFFPDKVQT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ATASIMFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMNGTE
::::::::..::::::: .:::::::.::: :..::.:.::..: ::....:: .
CCDS41 EKASIMFMQSIDSVVEFCNEKTHNQEAPSLQNIKCNFRSTWEVISNSEDFKNTIPM--VT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LPPPPTFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIASFD
::::.:::.. ....:::::: :..:. ::: ...:::. .:.: :: ..::.. ::
CCDS41 PPPPPVFSLLKISQRIVCLVLDKSGSMGGKDRLNRMNQAAKHFLLQTVENGSWVGMVHFD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SKGEIRAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYGSVM
: . : .: ::.:.:.:. :.. ::: . : :::::.: .:.:. .:... :: .
CCDS41 STATIVNKLIQIKSSDERNTLMAGLPTYPLGGT--SICSGIKYAFQVIGELHSQLDGSEV
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 ILVTSGDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISNSNS
.:.:.:.:. ..:. : .::. .: :::: .: . :.:..::: .:.: : ...:.
CCDS41 LLLTDGEDNTASSCIDEVKQSGAIVHFIALGRAADEAVIEMSKITGGSHFYVSDEAQNNG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 MIDAFSRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQASGP
.::::. ..::. :. :. .:::: : ... . ...:: .:.:::.::.::.::. : :
CCDS41 LIDAFGALTSGNTDLSQKSLQLESKGLTLNSNAWMNDTVIIDSTVGKDTFFLITWN-SLP
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 PEIILFDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVTVTS
: : :.::.: .:: .. : . : : :::::: : :.:.:. . ..: .::::
CCDS41 PSISLWDPSGT--IMENFTVDATSKMAYLSIPGTAKVGTWAYNLQAKANP-ETLTITVTS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 RASNSAVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPVTLR
::.::.::: ::.: ...: :: :...::.. ::. :.:.:.::: .: ..: .:.
CCDS41 RAANSSVPPITVNAKMNKDVNSFPSPMIVYAEILQGYVPVLGANVTAFIESQNGHTEVLE
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 LLDDGAGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPGSHAMYVPGY
:::.::::: .::::.::::: ... ::::::::... . . . : ..: :.::.
CCDS41 LLDNGAGADSFKNDGVYSRYFTAYTENGRYSLKVRAHGGANTARLKLRPPLNRAAYIPGW
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE5 TANGNIQMNAPRKSVGRNEEERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKIIDLEAV
..::.:. : :: . .. . :::..:::.: : ::. : :: .:: .: ::.:.
CCDS41 VVNGEIEANPPRPEIDEDTQTTLEDFSRTASGGAFVVSQVPSLPLPDQYPPSQITDLDAT
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 KVEEELTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQQAGIRE
:... :.:::::..:: :.. : ::.: :. ...:.:..:. :::. .:..:. .:
CCDS41 VHEDKIILTWTAPGDNFDVGKVQRYIIRISASILDLRDSFDDALQVNTTDLSPKEANSKE
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880
pF1KE5 IFTFSPQ-ISTNGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLFIP-----
:.:.:. :: .. : :..::...:...: : ::::::. ::::
CCDS41 SFAFKPENISEENATH-----------IFIAIKSIDKSNLTSKVSNIAQVTLFIPQANPD
830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KE5 -----PNSDPVPARDYLILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL
:. :.:. : .:: . ....: ...:
CCDS41 DIDPTPTPTPTPTPDKSHNSGVNISTLVLSVIGSVVIVNFILSTTI
880 890 900 910
943 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:01:08 2016 done: Tue Nov 8 05:01:09 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]