Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5747
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5747, 638 aa
1>>>pF1KE5747 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4803+/-0.000726; mu= 11.7819+/- 0.044
mean_var=148.8205+/-29.513, 0's: 0 Z-trim(115.0): 16 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.105134
statistics sampled from 15572 (15588) to 15572 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.479), width: 16
Scan time: 3.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44037.2 SCNN1D gene_id:6339|Hs108|chr1 ( 802) 4319 666.6 3.7e-191
CCDS8543.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 669) 1196 192.8 1.2e-48
CCDS53739.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 692) 1196 192.8 1.3e-48
CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 728) 1196 192.9 1.3e-48
CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16 ( 649) 928 152.2 2.1e-36
CCDS10609.1 SCNN1B gene_id:6338|Hs108|chr16 ( 640) 858 141.6 3.2e-33
>>CCDS44037.2 SCNN1D gene_id:6339|Hs108|chr1 (802 aa)
initn: 4314 init1: 4314 opt: 4319 Z-score: 3545.5 bits: 666.6 E(32554): 3.7e-191
Smith-Waterman score: 4319; 97.8% identity (98.4% similar) in 636 aa overlap (3-638:172-802)
10 20 30
pF1KE5 MAEHRSMDGRMEAATRGGSHLQAAAQTPPRPG
.:: . .:: . : :::::::::::
CCDS44 GEWKQPHGGALTSRSPGPVAPQRPCHLKGWQHRPT--QHNAACKQG---QAAAQTPPRPG
150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 PPSAPPPPPKEGHQEGLVELPASFRELLTFFCTNATIHGAIRLVCSRGNRLKTTSWGLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PPSAPPPPPKEGHQEGLVELPASFRELLTFFCTNATIHGAIRLVCSRGNRLKTTSWGLLS
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 LGALVALCWQLGLLFERHWHRPVLMAVSVHSERKLLPLVTLCDGNPRRPSPVLRHLELLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGALVALCWQLGLLFERHWHRPVLMAVSVHSERKLLPLVTLCDGNPRRPSPVLRHLELLD
260 270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 EFARENIDSLYNVNLSKGRAALSATVPRHEPPFHLDREIRLQRLSHSGSRVRVGFRLCNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EFARENIDSLYNVNLSKGRAALSATVPRHEPPFHLDREIRLQRLSHSGSRVRVGFRLCNS
320 330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TGGDCFYRGYTSGVAAVQDWYHFHYVDILALLPAAWEDSHGSQDGHFVLSCSYDGLDCQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGGDCFYRGYTSGVAAVQDWYHFHYVDILALLPAAWEDSHGSQDGHFVLSCSYDGLDCQA
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 RQFRTFHHPTYGSCYTVDGVWTAQRPGITHGVGLVLRVEQQPHLPLLSTLAGIRVMVHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RQFRTFHHPTYGSCYTVDGVWTAQRPGITHGVGLVLRVEQQPHLPLLSTLAGIRVMVHGR
440 450 460 470 480 490
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 NHTPFLGHHSFSVRPGTEATISIREDEVHRLGSPYGHCTAGGEGVEVELLHNTSYTRQAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NHTPFLGHHSFSVRPGTEATISIREDEVHRLGSPYGHCTAGGEGVEVELLHNTSYTRQAC
500 510 520 530 540 550
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 LVSCFQQLMVETCSCGYYLHPLPAGAEYCSSARHPAWGHCFYRLYQDLETHRLPCTSRCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LVSCFQQLMVETCSCGYYLHPLPAGAEYCSSARHPAWGHCFYRLYQDLETHRLPCTSRCP
560 570 580 590 600 610
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 RPCRESAFKLSTGTSRWPSAKSAGWTLATLGEQGLPHQSHRQRSSLAKINIVYQELNYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RPCRESAFKLSTGTSRWPSAKSAGWTLATLGEQGLPHQSHRQRSSLAKINIVYQELNYRS
620 630 640 650 660 670
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 VEEAPVYSVPQLLSAMGSLCSLWFGASVLSLLELLELLLDASALTLVLGGRRLRRAWFSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEEAPVYSVPQLLSAMGSLCSLWFGASVLSLLELLELLLDASALTLVLGGRRLRRAWFSW
680 690 700 710 720 730
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 PRASPASGASSIKPEASQMPPPAGGTSDDPEPSGPHLPRVMLPGVLAGVSAEESWAGPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PRASPASGASSIKPEASQMPPPAGGTSDDPEPSGPHLPRVMLPGVLAGVSAEESWAGPQP
740 750 760 770 780 790
pF1KE5 LETLDT
::::::
CCDS44 LETLDT
800
>>CCDS8543.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 (669 aa)
initn: 1521 init1: 675 opt: 1196 Z-score: 986.6 bits: 192.8 E(32554): 1.2e-48
Smith-Waterman score: 1570; 38.2% identity (68.6% similar) in 631 aa overlap (32-632:32-651)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 AEHRSMDGRMEAATRGGSHLQAAAQTPPRPGP-PSAPPPPPKEGHQEGLVELPASFRELL
:: :.:: : : .:.:.:. :.:::.
CCDS85 EGNKLEEQDSSPPQSTPGLMKGNKREEQGLGPEPAAPQQPTAE--EEALIEFHRSYRELF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TFFCTNATIHGAIRLVCSRGNRLKTTSWGLLSLGALVALCWQLGLLFERHWHRPVLMAVS
:::.:.:::::::::::. ::.::. :..: : .. . ::.:::: ... :: . ..
CCDS85 EFFCNNTTIHGAIRLVCSQHNRMKTAFWAVLWLCTFGMMYWQFGLLFGEYFSYPVSLNIN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 VHSERKLLPLVTLCDGNPRRPSPVLRHLELLDEFARENIDSLYN-------VNLSKGRAA
..:.. ..: ::.: :: : . ..:: ::....... .::. : :..:
CCDS85 LNSDKLVFPAVTICTLNPYRYPEIKEELEELDRITEQTLFDLYKYSSFTTLVAGSRSRRD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE5 LSATVP------RHEPPFHLDREIR--LQRLSHSGSRV-----RVGFRLCNSTGGDCFYR
: .:.: : :: : :. : . : .. .: ..::.:::.. .::::.
CCDS85 LRGTLPHPLQRLRVPPPPHGARRARSVASSLRDNNPQVDWKDWKIGFQLCNQNKSDCFYQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 GYTSGVAAVQDWYHFHYVDILALLPAAWEDSHGSQDGHFVLSCSYDGLDCQARQFRTFHH
:.::: ::..::.:::..::. :: . . . . :.:...: .. ..:. .. :::
CCDS85 TYSSGVDAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE5 PTYGSCYTVD-----GVWTAQRPGITHGVGLVLRVEQQPHLPLLSTLAGIRVMVHGRNHT
: ::.::: . ..: .. :::..:..:.::.::. .:::::..: ::::::...
CCDS85 PMYGNCYTFNDKNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTVTGARVMVHGQDEP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 PFLGHHSFSVRPGTEATISIREDEVHRLGSPYGHCTAGGEGVEVELLHNTSYTRQACLVS
:. .:..:::.:..::.:.. . :::. :: :: .: : :: :. ..::.:.:. :
CCDS85 AFMDDGGFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNGSDVPVENLYPSKYTQQVCIHS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 CFQQLMVETCSCGYYLHPLPAGAEYCSSARHPAWGHCFYRLYQDLETHRLPCTSRCPRPC
:::. :.. :.:.: ..: : ..:::. .: .::.:.:.: :. . .: : ..: .::
CCDS85 CFQESMIKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDFSSDHLGCFTKCRKPC
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 RESAFKLSTGTSRWPSAKSAGWTLATLGEQGLPHQSHRQRSSLAKINIVYQELNYRSVEE
....::.: :::::. : :.. :..:. . . .:...::.:: ..::::.. :
CCDS85 SVTSYQLSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQN-NYTVNNKRNGVAKVNIFFKELNYKTNSE
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 APVYSVPQLLSAMGSLCSLWFGASVLSLLELLELLLDASALTLVLGGRRLRRAWFSWPRA
.: .. ::: .:: :::::.::::..:. ::..: .. ... ::.: . : .
CCDS85 SPSVTMVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLVIMFLMLLRRFRSRY--WSPG
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 SPASGASSIKPEASQMPP----PAGGTSDDPEPSGPHLPRVMLPGVLAGVSAEESWAGPQ
. ::. . .. :: : . . .: :: : :.. : : . ::.
CCDS85 RGGRGAQEVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQP-GPA-PS---PALTAPPPAYATL-GPR
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 PLETLDT
:
CCDS85 PSPGGSAGASSSTCPLGGP
660
>>CCDS53739.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 (692 aa)
initn: 1521 init1: 675 opt: 1196 Z-score: 986.4 bits: 192.8 E(32554): 1.3e-48
Smith-Waterman score: 1570; 38.2% identity (68.6% similar) in 631 aa overlap (32-632:55-674)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 AEHRSMDGRMEAATRGGSHLQAAAQTPPRPGP-PSAPPPPPKEGHQEGLVELPASFRELL
:: :.:: : : .:.:.:. :.:::.
CCDS53 EGNKLEEQDSSPPQSTPGLMKGNKREEQGLGPEPAAPQQPTAE--EEALIEFHRSYRELF
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TFFCTNATIHGAIRLVCSRGNRLKTTSWGLLSLGALVALCWQLGLLFERHWHRPVLMAVS
:::.:.:::::::::::. ::.::. :..: : .. . ::.:::: ... :: . ..
CCDS53 EFFCNNTTIHGAIRLVCSQHNRMKTAFWAVLWLCTFGMMYWQFGLLFGEYFSYPVSLNIN
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170
pF1KE5 VHSERKLLPLVTLCDGNPRRPSPVLRHLELLDEFARENIDSLYN-------VNLSKGRAA
..:.. ..: ::.: :: : . ..:: ::....... .::. : :..:
CCDS53 LNSDKLVFPAVTICTLNPYRYPEIKEELEELDRITEQTLFDLYKYSSFTTLVAGSRSRRD
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220
pF1KE5 LSATVP------RHEPPFHLDREIR--LQRLSHSGSRV-----RVGFRLCNSTGGDCFYR
: .:.: : :: : :. : . : .. .: ..::.:::.. .::::.
CCDS53 LRGTLPHPLQRLRVPPPPHGARRARSVASSLRDNNPQVDWKDWKIGFQLCNQNKSDCFYQ
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 GYTSGVAAVQDWYHFHYVDILALLPAAWEDSHGSQDGHFVLSCSYDGLDCQARQFRTFHH
:.::: ::..::.:::..::. :: . . . . :.:...: .. ..:. .. :::
CCDS53 TYSSGVDAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHH
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330
pF1KE5 PTYGSCYTVD-----GVWTAQRPGITHGVGLVLRVEQQPHLPLLSTLAGIRVMVHGRNHT
: ::.::: . ..: .. :::..:..:.::.::. .:::::..: ::::::...
CCDS53 PMYGNCYTFNDKNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTVTGARVMVHGQDEP
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 PFLGHHSFSVRPGTEATISIREDEVHRLGSPYGHCTAGGEGVEVELLHNTSYTRQACLVS
:. .:..:::.:..::.:.. . :::. :: :: .: : :: :. ..::.:.:. :
CCDS53 AFMDDGGFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNGSDVPVENLYPSKYTQQVCIHS
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 CFQQLMVETCSCGYYLHPLPAGAEYCSSARHPAWGHCFYRLYQDLETHRLPCTSRCPRPC
:::. :.. :.:.: ..: : ..:::. .: .::.:.:.: :. . .: : ..: .::
CCDS53 CFQESMIKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDFSSDHLGCFTKCRKPC
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 RESAFKLSTGTSRWPSAKSAGWTLATLGEQGLPHQSHRQRSSLAKINIVYQELNYRSVEE
....::.: :::::. : :.. :..:. . . .:...::.:: ..::::.. :
CCDS53 SVTSYQLSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQN-NYTVNNKRNGVAKVNIFFKELNYKTNSE
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 APVYSVPQLLSAMGSLCSLWFGASVLSLLELLELLLDASALTLVLGGRRLRRAWFSWPRA
.: .. ::: .:: :::::.::::..:. ::..: .. ... ::.: . : .
CCDS53 SPSVTMVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLVIMFLMLLRRFRSRY--WSPG
570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 SPASGASSIKPEASQMPP----PAGGTSDDPEPSGPHLPRVMLPGVLAGVSAEESWAGPQ
. ::. . .. :: : . . .: :: : :.. : : . ::.
CCDS53 RGGRGAQEVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQP-GPA-PS---PALTAPPPAYATL-GPR
620 630 640 650 660 670
pF1KE5 PLETLDT
:
CCDS53 PSPGGSAGASSSTCPLGGP
680 690
>>CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 (728 aa)
initn: 1521 init1: 675 opt: 1196 Z-score: 986.1 bits: 192.9 E(32554): 1.3e-48
Smith-Waterman score: 1570; 38.2% identity (68.6% similar) in 631 aa overlap (32-632:91-710)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 AEHRSMDGRMEAATRGGSHLQAAAQTPPRPGP-PSAPPPPPKEGHQEGLVELPASFRELL
:: :.:: : : .:.:.:. :.:::.
CCDS53 EGNKLEEQDSSPPQSTPGLMKGNKREEQGLGPEPAAPQQPTAE--EEALIEFHRSYRELF
70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TFFCTNATIHGAIRLVCSRGNRLKTTSWGLLSLGALVALCWQLGLLFERHWHRPVLMAVS
:::.:.:::::::::::. ::.::. :..: : .. . ::.:::: ... :: . ..
CCDS53 EFFCNNTTIHGAIRLVCSQHNRMKTAFWAVLWLCTFGMMYWQFGLLFGEYFSYPVSLNIN
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170
pF1KE5 VHSERKLLPLVTLCDGNPRRPSPVLRHLELLDEFARENIDSLYN-------VNLSKGRAA
..:.. ..: ::.: :: : . ..:: ::....... .::. : :..:
CCDS53 LNSDKLVFPAVTICTLNPYRYPEIKEELEELDRITEQTLFDLYKYSSFTTLVAGSRSRRD
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220
pF1KE5 LSATVP------RHEPPFHLDREIR--LQRLSHSGSRV-----RVGFRLCNSTGGDCFYR
: .:.: : :: : :. : . : .. .: ..::.:::.. .::::.
CCDS53 LRGTLPHPLQRLRVPPPPHGARRARSVASSLRDNNPQVDWKDWKIGFQLCNQNKSDCFYQ
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 GYTSGVAAVQDWYHFHYVDILALLPAAWEDSHGSQDGHFVLSCSYDGLDCQARQFRTFHH
:.::: ::..::.:::..::. :: . . . . :.:...: .. ..:. .. :::
CCDS53 TYSSGVDAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHH
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330
pF1KE5 PTYGSCYTVD-----GVWTAQRPGITHGVGLVLRVEQQPHLPLLSTLAGIRVMVHGRNHT
: ::.::: . ..: .. :::..:..:.::.::. .:::::..: ::::::...
CCDS53 PMYGNCYTFNDKNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTVTGARVMVHGQDEP
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 PFLGHHSFSVRPGTEATISIREDEVHRLGSPYGHCTAGGEGVEVELLHNTSYTRQACLVS
:. .:..:::.:..::.:.. . :::. :: :: .: : :: :. ..::.:.:. :
CCDS53 AFMDDGGFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNGSDVPVENLYPSKYTQQVCIHS
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 CFQQLMVETCSCGYYLHPLPAGAEYCSSARHPAWGHCFYRLYQDLETHRLPCTSRCPRPC
:::. :.. :.:.: ..: : ..:::. .: .::.:.:.: :. . .: : ..: .::
CCDS53 CFQESMIKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDFSSDHLGCFTKCRKPC
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 RESAFKLSTGTSRWPSAKSAGWTLATLGEQGLPHQSHRQRSSLAKINIVYQELNYRSVEE
....::.: :::::. : :.. :..:. . . .:...::.:: ..::::.. :
CCDS53 SVTSYQLSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQN-NYTVNNKRNGVAKVNIFFKELNYKTNSE
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 APVYSVPQLLSAMGSLCSLWFGASVLSLLELLELLLDASALTLVLGGRRLRRAWFSWPRA
.: .. ::: .:: :::::.::::..:. ::..: .. ... ::.: . : .
CCDS53 SPSVTMVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLVIMFLMLLRRFRSRY--WSPG
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 SPASGASSIKPEASQMPP----PAGGTSDDPEPSGPHLPRVMLPGVLAGVSAEESWAGPQ
. ::. . .. :: : . . .: :: : :.. : : . ::.
CCDS53 RGGRGAQEVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQP-GPA-PS---PALTAPPPAYATL-GPR
660 670 680 690 700
pF1KE5 PLETLDT
:
CCDS53 PSPGGSAGASSSTCPLGGP
710 720
>>CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16 (649 aa)
initn: 1040 init1: 464 opt: 928 Z-score: 767.1 bits: 152.2 E(32554): 2.1e-36
Smith-Waterman score: 1092; 31.3% identity (61.8% similar) in 610 aa overlap (55-616:24-621)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 AQTPPRPGPPSAPPPPPKEGHQEGLVELPASFRELLTFFCTNATIHGAIRLVCSRGNRLK
...::. ..: :.. :: :.: ::: ::.
CCDS10 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRG-RLR
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 TTSWGLLSLGALVALCWQLGLLFERHWHRPVLMAVSVHSERKLLPLVTLCDGNPRRPSPV
: ..: :.. . :: .:: . : ....:: .. .: ::.:. :: . : :
CCDS10 RLLWIGFTLTAVALILWQCALLVFSFY--TVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTV
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