Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5738
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5738, 703 aa
1>>>pF1KE5738 703 - 703 aa - 703 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6457+/-0.000911; mu= 14.6670+/- 0.056
mean_var=101.9674+/-20.137, 0's: 0 Z-trim(108.8): 13 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.127012
statistics sampled from 10443 (10446) to 10443 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 3.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8690.1 GYS2 gene_id:2998|Hs108|chr12 ( 703) 4789 888.2 0
CCDS12747.1 GYS1 gene_id:2997|Hs108|chr19 ( 737) 3547 660.7 2.2e-189
CCDS54292.1 GYS1 gene_id:2997|Hs108|chr19 ( 673) 2810 525.6 9.2e-149
>>CCDS8690.1 GYS2 gene_id:2998|Hs108|chr12 (703 aa)
initn: 4789 init1: 4789 opt: 4789 Z-score: 4743.8 bits: 888.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4789; 99.9% identity (100.0% similar) in 703 aa overlap (1-703:1-703)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRGRSLSVTSLGGLPQWEVEELPVEELLLFEVAWEVTNKVGGIYTVIQTKAKTTADEWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MLRGRSLSVTSLGGLPQWEVEELPVEELLLFEVAWEVTNKVGGIYTVIQTKAKTTADEWG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ENYFLIGPYFEHNMKTQVEQCEPVNDAVRRAVDAMNKHGCQVHFGRWLIEGSPYVVLFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ENYFLIGPYFEHNMKTQVEQCEPVNDAVRRAVDAMNKHGCQVHFGRWLIEGSPYVVLFDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GYSAWNLDRWKGDLWEACSVGIPYHDREANDMLIFGSLTAWFLKEVTDHADGKYVVAQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GYSAWNLDRWKGDLWEACSVGIPYHDREANDMLIFGSLTAWFLKEVTDHADGKYVVAQFH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EWQAGIGLILSRARKLPIATIFTTHATLLGRYLCAANIDFYNHLDKFNIDKEAGERQIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 EWQAGIGLILSRARKLPIATIFTTHATLLGRYLCAANIDFYNHLDKFNIDKEAGERQIYH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RYCMERASVHCAHVFTTVSEITAIEAEHMLKRKPDVVTPNGLNVKKFSAVHEFQNLHAMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RYCMERASVHCAHVFTTVSEITAIEAEHMLKRKPDVVTPNGLNVKKFSAVHEFQNLHAMY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 KARIQDFVRGHFYGHLDFDLEKTLFLFIAGRYEFSNKGADIFLESLSRLNFLLRMHKSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KARIQDFVRGHFYGHLDFDLEKTLFLFIAGRYEFSNKGADIFLESLSRLNFLLRMHKSDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 TVVVFFIMPAKTNNFNVETLKGQAVRKQLWDVAHSVKEKFGKKLYDALLRGEIPDLNDIL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TVMVFFIMPAKTNNFNVETLKGQAVRKQLWDVAHSVKEKFGKKLYDALLRGEIPDLNDIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 DRDDLTIMKRAIFSTQRQSLPPVTTHNMIDDSTDPILSTIRRIGLFNNRTDRVKVILHPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DRDDLTIMKRAIFSTQRQSLPPVTTHNMIDDSTDPILSTIRRIGLFNNRTDRVKVILHPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 FLSSTSPLLPMDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSVTTNLSGFGCFMQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FLSSTSPLLPMDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSVTTNLSGFGCFMQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 HVADPTAYGIYIVDRRFRSPDDSCNQLTKFLYGFCKQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 HVADPTAYGIYIVDRRFRSPDDSCNQLTKFLYGFCKQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWRY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 LGRYYQHARHLTLSRAFPDKFHVELTSPPTTEGFKYPRPSSVPPSPSGSQASSPQSSDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LGRYYQHARHLTLSRAFPDKFHVELTSPPTTEGFKYPRPSSVPPSPSGSQASSPQSSDVE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE5 DEVEDERYDEEEEAERDRLNIKSPFSLSHVPHGKKKLHGEYKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DEVEDERYDEEEEAERDRLNIKSPFSLSHVPHGKKKLHGEYKN
670 680 690 700
>>CCDS12747.1 GYS1 gene_id:2997|Hs108|chr19 (737 aa)
initn: 3496 init1: 2727 opt: 3547 Z-score: 3513.5 bits: 660.7 E(32554): 2.2e-189
Smith-Waterman score: 3547; 72.5% identity (91.7% similar) in 688 aa overlap (5-684:5-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRGRSLSVTSLGGLPQWEVEELPVEELLLFEVAWEVTNKVGGIYTVIQTKAKTTADEWG
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CCDS12 MPLNRTLSMSSLPGLEDWE-DEFDLENAVLFEVAWEVANKVGGIYTVLQTKAKVTGDEWG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ENYFLIGPYFEHNMKTQVEQCEPVNDAVRRAVDAMNKHGCQVHFGRWLIEGSPYVVLFDI
.::::.::: :....:::: : . :..:..:.::..::.:.::::::::.: :::.:.
CCDS12 DNYFLVGPYTEQGVRTQVELLEAPTPALKRTLDSMNSKGCKVYFGRWLIEGGPLVVLLDV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 GYSAWNLDRWKGDLWEACSVGIPYHDREANDMLIFGSLTAWFLKEVTDHADGK-YVVAQF
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CCDS12 GASAWALERWKGELWDTCNIGVPWYDREANDAVLFGFLTTWFLGEFLAQSEEKPHVVAHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HEWQAGIGLILSRARKLPIATIFTTHATLLGRYLCAANIDFYNHLDKFNIDKEAGERQIY
::: ::.:: : :::.::.:::::::::::::::::. .::::.:..::.::::::::::
CCDS12 HEWLAGVGLCLCRARRLPVATIFTTHATLLGRYLCAGAVDFYNNLENFNVDKEAGERQIY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HRYCMERASVHCAHVFTTVSEITAIEAEHMLKRKPDVVTPNGLNVKKFSAVHEFQNLHAM
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CCDS12 HRYCMERAAAHCAHVFTTVSQITAIEAQHLLKRKPDIVTPNGLNVKKFSAMHEFQNLHAQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YKARIQDFVRGHFYGHLDFDLEKTLFLFIAGRYEFSNKGADIFLESLSRLNFLLRMHKSD
:::::.::::::::::::.:.:::..::::::::::::::.:::.:.:::.:::.. :.
CCDS12 SKARIQEFVRGHFYGHLDFNLDKTLYFFIAGRYEFSNKGADVFLEALARLNYLLRVNGSE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ITVVVFFIMPAKTNNFNVETLKGQAVRKQLWDVAHSVKEKFGKKLYDALLRGEIPDLNDI
:::.::::::.::::::::::::::::::::.:..::::::.:::..:: : .::.: .
CCDS12 QTVVAFFIMPARTNNFNVETLKGQAVRKQLWDTANTVKEKFGRKLYESLLVGSLPDMNKM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 LDRDDLTIMKRAIFSTQRQSLPPVTTHNMIDDSTDPILSTIRRIGLFNNRTDRVKVILHP
::..:.:.::::::.:::::.::: ::::.:::.::::.:::::::::. .::::::.::
CCDS12 LDKEDFTMMKRAIFATQRQSFPPVCTHNMLDDSSDPILTTIRRIGLFNSSADRVKVIFHP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 EFLSSTSPLLPMDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSVTTNLSGFGCFMQ
:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::.
CCDS12 EFLSSTSPLLPVDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSISTNLSGFGCFME
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 EHVADPTAYGIYIVDRRFRSPDDSCNQLTKFLYGFCKQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWR
::.:::.::::::.:::::: ::::.:::.:::.::.::::::::::::::::::::::.
CCDS12 EHIADPSAYGIYILDRRFRSLDDSCSQLTSFLYSFCQQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 YLGRYYQHARHLTLSRAFPDKFHVELTSPPTTEGFKYPRPSSVPPSPSGSQASSP-QSSD
::::::. :::..::.:::..: : . ...:..::::.::::::: :. ::: :: :
CCDS12 YLGRYYMSARHMALSKAFPEHFTYEPNEADAAQGYRYPRPASVPPSPSLSRHSSPHQSED
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KE5 VED------EVEDERYDEEEEAERDRLNIKSPFSLSHVPHGKKKLHGEYKN
:: : . :::::.::: .:: ::..:
CCDS12 EEDPRNGPLEEDGERYDEDEEAAKDRRNIRAPEWPRRASCTSSTSGSKRNSVDTATSSSL
660 670 680 690 700 710
CCDS12 STPSEPLSPTSSLGEERN
720 730
>>CCDS54292.1 GYS1 gene_id:2997|Hs108|chr19 (673 aa)
initn: 3176 init1: 2727 opt: 2810 Z-score: 2784.2 bits: 525.6 E(32554): 9.2e-149
Smith-Waterman score: 3077; 66.7% identity (83.6% similar) in 687 aa overlap (5-684:5-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLRGRSLSVTSLGGLPQWEVEELPVEELLLFEVAWEVTNKVGGIYTVIQTKAKTTADEWG
:.::..:: :: .:: .:. .:. .::::::::.:::::::::.:::::.:.::::
CCDS54 MPLNRTLSMSSLPGLEDWE-DEFDLENAVLFEVAWEVANKVGGIYTVLQTKAKVTGDEWG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ENYFLIGPYFEHNMKTQVEQCEPVNDAVRRAVDAMNKHGCQVHFGRWLIEGSPYVVLFDI
.::::.::: :....:::: : . :..:..:.::..::.
CCDS54 DNYFLVGPYTEQGVRTQVELLEAPTPALKRTLDSMNSKGCK-------------------
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GYSAWNLDRWKGDLWEACSVGIPYHDREANDMLIFGSLTAWFLKEVTDHADGKYVVAQFH
:: . .. .:::.::
CCDS54 -----------------------------------------FLAQSEEKP---HVVAHFH
110
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EWQAGIGLILSRARKLPIATIFTTHATLLGRYLCAANIDFYNHLDKFNIDKEAGERQIYH
:: ::.:: : :::.::.:::::::::::::::::. .::::.:..::.:::::::::::
CCDS54 EWLAGVGLCLCRARRLPVATIFTTHATLLGRYLCAGAVDFYNNLENFNVDKEAGERQIYH
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RYCMERASVHCAHVFTTVSEITAIEAEHMLKRKPDVVTPNGLNVKKFSAVHEFQNLHAMY
:::::::..::::::::::.::::::.:.::::::.:::::::::::::.::::::::.
CCDS54 RYCMERAAAHCAHVFTTVSQITAIEAQHLLKRKPDIVTPNGLNVKKFSAMHEFQNLHAQS
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 KARIQDFVRGHFYGHLDFDLEKTLFLFIAGRYEFSNKGADIFLESLSRLNFLLRMHKSDI
:::::.::::::::::::.:.:::..::::::::::::::.:::.:.:::.:::.. :.
CCDS54 KARIQEFVRGHFYGHLDFNLDKTLYFFIAGRYEFSNKGADVFLEALARLNYLLRVNGSEQ
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 TVVVFFIMPAKTNNFNVETLKGQAVRKQLWDVAHSVKEKFGKKLYDALLRGEIPDLNDIL
:::.::::::.::::::::::::::::::::.:..::::::.:::..:: : .::.: .:
CCDS54 TVVAFFIMPARTNNFNVETLKGQAVRKQLWDTANTVKEKFGRKLYESLLVGSLPDMNKML
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 DRDDLTIMKRAIFSTQRQSLPPVTTHNMIDDSTDPILSTIRRIGLFNNRTDRVKVILHPE
:..:.:.::::::.:::::.::: ::::.:::.::::.:::::::::. .::::::.:::
CCDS54 DKEDFTMMKRAIFATQRQSFPPVCTHNMLDDSSDPILTTIRRIGLFNSSADRVKVIFHPE
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 FLSSTSPLLPMDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSVTTNLSGFGCFMQE
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::.:
CCDS54 FLSSTSPLLPVDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSISTNLSGFGCFMEE
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 HVADPTAYGIYIVDRRFRSPDDSCNQLTKFLYGFCKQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWRY
:.:::.::::::.:::::: ::::.:::.:::.::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS54 HIADPSAYGIYILDRRFRSLDDSCSQLTSFLYSFCQQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWKY
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650
pF1KE5 LGRYYQHARHLTLSRAFPDKFHVELTSPPTTEGFKYPRPSSVPPSPSGSQASSP-QSSDV
:::::. :::..::.:::..: : . ...:..::::.::::::: :. ::: :: :
CCDS54 LGRYYMSARHMALSKAFPEHFTYEPNEADAAQGYRYPRPASVPPSPSLSRHSSPHQSEDE
540 550 560 570 580 590
660 670 680 690 700
pF1KE5 ED------EVEDERYDEEEEAERDRLNIKSPFSLSHVPHGKKKLHGEYKN
:: : . :::::.::: .:: ::..:
CCDS54 EDPRNGPLEEDGERYDEDEEAAKDRRNIRAPEWPRRASCTSSTSGSKRNSVDTATSSSLS
600 610 620 630 640 650
CCDS54 TPSEPLSPTSSLGEERN
660 670
703 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:15:09 2016 done: Tue Nov 8 06:15:09 2016
Total Scan time: 3.850 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]