Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5737
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5737, 760 aa
1>>>pF1KE5737 760 - 760 aa - 760 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3154+/-0.000965; mu= 19.9114+/- 0.058
mean_var=64.2547+/-13.165, 0's: 0 Z-trim(104.4): 25 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.160001
statistics sampled from 7846 (7870) to 7846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 2.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14137.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX ( 760) 5105 1187.7 0
CCDS59159.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX ( 666) 4466 1040.2 0
CCDS75208.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 791) 4220 983.4 0
CCDS34101.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 818) 4220 983.4 0
CCDS34100.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 866) 4118 959.9 0
CCDS48115.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX ( 816) 4103 956.4 0
CCDS14328.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX ( 746) 4080 951.1 0
CCDS58932.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 791) 2679 627.7 2.2e-179
CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7 ( 988) 702 171.4 6.2e-42
CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 869) 669 163.7 1.1e-39
CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 898) 669 163.7 1.1e-39
CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 854) 667 163.3 1.5e-39
CCDS168.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1 ( 687) 561 138.8 2.9e-32
CCDS41269.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 686) 549 136.0 2e-31
CCDS167.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 687) 549 136.0 2e-31
CCDS57973.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 644) 530 131.6 3.9e-30
CCDS54691.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 881) 516 128.4 4.8e-29
CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 781) 452 113.6 1.2e-24
CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 805) 452 113.6 1.2e-24
CCDS57974.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1 ( 517) 335 86.5 1.1e-16
>>CCDS14137.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX (760 aa)
initn: 5105 init1: 5105 opt: 5105 Z-score: 6360.8 bits: 1187.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5105; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDFHTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDFHTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDLAVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDLAVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 AAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 NMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 RMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 ELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 RPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 ARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE5 GLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN
730 740 750 760
>>CCDS59159.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX (666 aa)
initn: 4466 init1: 4466 opt: 4466 Z-score: 5564.5 bits: 1040.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4466; 100.0% identity (100.0% similar) in 666 aa overlap (95-760:1-666)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDLAVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFE
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIP
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSK
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFT
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTR
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTR
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVG
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 IGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTG
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 GLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRR
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 GEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQR
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 QEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQ
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760
pF1KE5 CLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN
640 650 660
>>CCDS75208.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 (791 aa)
initn: 4220 init1: 4220 opt: 4220 Z-score: 5256.5 bits: 983.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4220; 78.2% identity (94.9% similar) in 760 aa overlap (1-760:32-791)
10 20 30
pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDF
:.:.:....: .:.:.::::.: ::::.::
CCDS75 DASSDPYLPYDGGGDSIPLRELHKRGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 HTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDL
:::::.::: .: .:::.:.::.::: ::. ::: ::::::.:. : :: .:.:::.::.
CCDS75 HTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 AVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYI
:.:::::::::.::::.::.:::::: :::::::.::::: :. :.::...:.:: ..::
CCDS75 AADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVT
.::.:::.::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS75 MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTIT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGA
:::.:.::::::::::::::::::::.:: :: ::: ::.:.:::::::.::::::::::
CCDS75 LVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMA
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.
CCDS75 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLF
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 ELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYT
::::::::::::::::..::: :::::::::.:..:::::::::.:.::::.::.:::::
CCDS75 ELFPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIIVAAITAVIAFPNPYT
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALI
: .:::::.:::.::: ::::.:::: :: : .. ::::::::::.:::.:.::: ::::
CCDS75 RLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGIGVYSAIWQLCLALI
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 FKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADC
:::..:.::::.:.::::::::::.::::::.:::.::::::.::::.::..::. ::::
CCDS75 FKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFIFKEWCEVGADC
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 VTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEG
.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::..:::::.::::.::
CCDS75 ITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREG
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 IYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETD
::::::.::::::::.:.:::: :::.:::::::..:::.:::::.:::.:.:..:.::.
CCDS75 IYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETS
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 YNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHP
::::::..:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.:
CCDS75 YNGFPVIMSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRP
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 LKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMA
:::: ::..:::::::::::: ::::::::::::::::..:::::::::::.:::::: :
CCDS75 LKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTA
730 740 750 760 770 780
760
pF1KE5 NQDPESIMFN
:::: :::::
CCDS75 NQDPASIMFN
790
>>CCDS34101.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 (818 aa)
initn: 4220 init1: 4220 opt: 4220 Z-score: 5256.3 bits: 983.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4220; 78.2% identity (94.9% similar) in 760 aa overlap (1-760:59-818)
10 20 30
pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDF
:.:.:....: .:.:.::::.: ::::.::
CCDS34 LDGAGVIMDFQTSEDDNLLDGDTAVGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDF
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 HTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDL
:::::.::: .: .:::.:.::.::: ::. ::: ::::::.:. : :: .:.:::.::.
CCDS34 HTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDI
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 AVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYI
:.:::::::::.::::.::.:::::: :::::::.::::: :. :.::...:.:: ..::
CCDS34 AADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYI
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVT
.::.:::.::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS34 MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTIT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGA
:::.:.::::::::::::::::::::.:: :: ::: ::.:.:::::::.::::::::::
CCDS34 LVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGA
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMA
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.
CCDS34 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 ELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYT
::::::::::::::::..::: :::::::::.:..:::::::::.:.::::.::.:::::
CCDS34 ELFPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIIVAAITAVIAFPNPYT
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALI
: .:::::.:::.::: ::::.:::: :: : .. ::::::::::.:::.:.::: ::::
CCDS34 RLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGIGVYSAIWQLCLALI
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 FKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADC
:::..:.::::.:.::::::::::.::::::.:::.::::::.::::.::..::. ::::
CCDS34 FKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFIFKEWCEVGADC
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 VTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEG
.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::..:::::.::::.::
CCDS34 ITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREG
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 IYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETD
::::::.::::::::.:.:::: :::.:::::::..:::.:::::.:::.:.:..:.::.
CCDS34 IYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETS
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 YNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHP
::::::..:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.:
CCDS34 YNGFPVIMSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRP
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 LKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMA
:::: ::..:::::::::::: ::::::::::::::::..:::::::::::.:::::: :
CCDS34 LKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTA
750 760 770 780 790 800
760
pF1KE5 NQDPESIMFN
:::: :::::
CCDS34 NQDPASIMFN
810
>>CCDS34100.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 (866 aa)
initn: 4071 init1: 4071 opt: 4118 Z-score: 5128.7 bits: 959.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4118; 77.2% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (1-749:59-807)
10 20 30
pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDF
:.:.:....: .:.:.::::.: ::::.::
CCDS34 LDGAGVIMDFQTSEDDNLLDGDTAVGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDF
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 HTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDL
:::::.::: .: .:::.:.::.::: ::. ::: ::::::.:. : :: .:.:::.::.
CCDS34 HTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDI
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 AVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYI
:.:::::::::.::::.::.:::::: :::::::.::::: :. :.::...:.:: ..::
CCDS34 AADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYI
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVT
.::.:::.::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS34 MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTIT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGA
:::.:.::::::::::::::::::::.:: :: ::: ::.:.:::::::.::::::::::
CCDS34 LVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGA
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMA
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.
CCDS34 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 ELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYT
::::::::::::::::..::: :::::::::.:..:::::::::.:.::::.::.:::::
CCDS34 ELFPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIIVAAITAVIAFPNPYT
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALI
: .:::::.:::.::: ::::.:::: :: : .. ::::::::::.:::.:.::: ::::
CCDS34 RLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGIGVYSAIWQLCLALI
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 FKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADC
:::..:.::::.:.::::::::::.::::::.:::.::::::.::::.::..::. ::::
CCDS34 FKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFIFKEWCEVGADC
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 VTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEG
.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::..:::::.::::.::
CCDS34 ITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREG
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 IYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETD
::::::.::::::::.:.:::: :::.:::::::..:::.:::::.:::.:.:..:.::.
CCDS34 IYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETS
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 YNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHP
::::::..:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.:
CCDS34 YNGFPVIMSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRP
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 LKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMA
:::: ::..:::::::::::: ::::::::::::::::..: .:::::::..:.:. :.
CCDS34 LKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQLK
750 760 770 780 790 800
760
pF1KE5 NQDPESIMFN
CCDS34 QHVEPLAPPWHYNKKRYPPAYGPDGKPRPRFNNVQLNLTDEEREETEEEVYLLNSTTL
810 820 830 840 850 860
>>CCDS48115.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX (816 aa)
initn: 4104 init1: 2316 opt: 4103 Z-score: 5110.3 bits: 956.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4103; 77.4% identity (94.2% similar) in 758 aa overlap (3-760:60-816)
10 20 30
pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDFHT
:.:....:. .::::.::.: ::::.::.:
CCDS48 LMDIPATAMDFSMRDDVPPLDREVGEDKSYNGGGIGSSNRIMDFLEEPIPGVGTYDDFNT
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 IDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDLAV
:::.:::::: ::::.::.::::: : .:.:. ::.:::..:::::::.:.:::.::...
CCDS48 IDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISA
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 DWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILN
::::::::.: ..::..::.:::.:...:::.::::: :..::.:... .::: :::.:
CCDS48 HWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVN
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 YLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLV
:.::.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS48 YFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLV
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPI
:.::::::::::::::::::::::.. :.:: :::.::::::::::::::::::::::
CCDS48 LAVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPI
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 GGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.. ::
CCDS48 GGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHLFEL
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 FPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQ
::::::.::::::.:::: ::::::.::::.::::::.::.::::::::.:.:: :::.
CCDS48 VPFILLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRM
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 STSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFK
:::::::::::::: :.::.:::: : : .. ..::::::::::.:::::::.::.:
CCDS48 STSELISELFNDCGLLDSSKLCDYENRFNTSKG-GELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILK
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 IVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVT
::.::::::::::::::::::::::::::..:.:.:::::.:..: .: .:: ::::.:
CCDS48 IVITIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYHQEWTVFNSWCSQGADCIT
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 PGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.::::
CCDS48 PGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIY
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 EAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYN
.:::.:::::::..:.::.:.::: :::.:::..: :.::::::::::::::.:.:: :.
CCDS48 DAHIRLNGYPFLEAKEEFAHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYS
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 GFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLK
::::::::.:.::.::. ::.::..:.:::..:.:.::.::.::::. : :: .: ::
CCDS48 GFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIENARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLK
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 LRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQ
:: ::.:::::::: :::: ::::::::::::::::..:::::::::::::.:.::::::
CCDS48 LRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQ
750 760 770 780 790 800
760
pF1KE5 DPESIMFN
::.::.::
CCDS48 DPDSILFN
810
>>CCDS14328.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX (746 aa)
initn: 4081 init1: 2293 opt: 4080 Z-score: 5082.2 bits: 951.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4080; 78.2% identity (94.2% similar) in 747 aa overlap (14-760:1-746)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDFHTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEF
::::.::.: ::::.::.::::.:::::: ::::.::.::::: : .
CCDS14 MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWAL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDLAVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNE
:.:. ::.:::..:::::::.:.:::.::... ::::::::.: ..::..::.:::.:..
CCDS14 IHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACG
.:::.::::: :..::.:... .::: :::.::.::.::::::::::::::.::::::::
CCDS14 VTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSS
::::::::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::::::::::::::::..
CCDS14 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALV
:.:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 AAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRR
::::::::::::::::::::::.::::.. :: ::::::.::::::.:::: ::::::.:
CCDS14 AAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKR
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDP
:::.::::::.::.::::::::.:.:: :::.:::::::::::::: :.::.:::: :
CCDS14 KTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFNDCGLLDSSKLCDYENRF
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 NMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAG
: .. ..::::::::::.:::::::.::.:::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NTSKG-GELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAG
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 RMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMF
:..:.:.:::::.:..: .: .:: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLLGVGMEQLAYYHQEWTVFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 ELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVM
::::::::::::::::.::::::::.:.::::.:::.:::::::..:.::.:.::: :::
CCDS14 ELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEFAHKTLAMDVM
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 RPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKN
.:::..: :.::::::::::::::.:.:: :.::::::::.:.::.::. ::.::..:.:
CCDS14 KPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIEN
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 ARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKL
::..:.:.::.::.::::. : :: .: :::: ::.:::::::: :::: ::::::::
CCDS14 ARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKL
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760
pF1KE5 GLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN
::::::::..:::::::::::::.:.::::::::.::.::
CCDS14 GLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN
710 720 730 740
>>CCDS58932.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 (791 aa)
initn: 2679 init1: 2679 opt: 2679 Z-score: 3334.1 bits: 627.7 E(32554): 2.2e-179
Smith-Waterman score: 4000; 74.7% identity (91.3% similar) in 760 aa overlap (1-760:59-791)
10 20 30
pF1KE5 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDF
:.:.:....: .:.:.::::.: ::::.::
CCDS58 LDGAGVIMDFQTSEDDNLLDGDTAVGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDF
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 HTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDL
:::::.::: .: .:::.:.::.::: ::. ::: ::::::.:. : :: .:.:::.::.
CCDS58 HTIDWVREKCKDRERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDI
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 AVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYI
:.:::::::::.::::.::.:::::: :::::::.::::: :. :.::...:.:: ..::
CCDS58 AADWMTDLKEGICLSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYI
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVT
.::.:::.::: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS58 MNYIMYIFWALSFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTIT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGA
:::.:.::::::::::::::::::::.:: :: ::: ::.:.:::
CCDS58 LVLAVASGLSLGKEGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREV---------------
270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 PIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMA
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 ------------SYYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLF
320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 ELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYT
::::::::::::::::..::: :::::::::.:..:::::::::.:.::::.::.:::::
CCDS58 ELFPFILLGVFGGLWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIIVAAITAVIAFPNPYT
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALI
: .:::::.:::.::: ::::.:::: :: : .. ::::::::::.:::.:.::: ::::
CCDS58 RLNTSELIKELFTDCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGIGVYSAIWQLCLALI
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 FKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADC
:::..:.::::.:.::::::::::.::::::.:::.::::::.::::.::..::. ::::
CCDS58 FKIIMTVFTFGIKVPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFIFKEWCEVGADC
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 VTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEG
.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::..:::::.::::.::
CCDS58 ITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREG
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 IYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETD
::::::.::::::::.:.:::: :::.:::::::..:::.:::::.:::.:.:..:.::.
CCDS58 IYEAHIRLNGYPFLDAKEEFTHTTLAADVMRPRRNDPPLAVLTQDNMTVDDIENMINETS
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 YNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHP
::::::..:..:.::.::: ::.: .::..::..:::::..: . :... : :::.::.:
CCDS58 YNGFPVIMSKESQRLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRP
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 LKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMA
:::: ::..:::::::::::: ::::::::::::::::..:::::::::::.:::::: :
CCDS58 LKLRSILDMSPFTVTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDILRHMAQTA
730 740 750 760 770 780
760
pF1KE5 NQDPESIMFN
:::: :::::
CCDS58 NQDPASIMFN
790
>>CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7 (988 aa)
initn: 636 init1: 235 opt: 702 Z-score: 866.3 bits: 171.4 E(32554): 6.2e-42
Smith-Waterman score: 744; 30.9% identity (62.9% similar) in 544 aa overlap (134-654:147-657)
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 LSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLF
::: .. : :..:... . :..
CCDS58 DGIFLVLLGLLMALVSWSMDYVSAKSLQAYKWSYAQMQPS-----LPLQFLVWVTFPLVL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 AFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGK
.... . ....: : ::::::.:::: : ... :: ... :.:.:. ..::. .::
CCDS58 ILFSALFCHLISPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTMKAFVAKVVALTAGLGSGIPVGK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 EGPLVHVACCCGNFFS---SLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLE
:::.::.: :. .: :.: .. ..:... :.::. ::.:.::::::.:
CCDS58 EGPFVHIASICAAVLSKFMSVFCGVYEQPYYYSDILTVGCAVGVGCCFGTPLGGVLFSIE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE5 EVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLV---LFYVEYHT--PWYMAELFPF
.: :: ... ::.:::: .::..: . .... .. :: .... :. . :: :
CCDS58 VTSTYFAVRNYWRGFFAATFSAFVFRVLAVWNKDAVTITALFRTNFRMDFPFDLKELPAF
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 ILLGVFGGLWGTLFI---RCNIAWCRRRKTTR--LGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYT
.:. :: :..:. : . :..:. :.:. .: .:: . : ...: .
CCDS58 AAIGICCGLLGAVFVYLHRQVMLGVRKHKALSQFLAKHRLLYPGIVTFVIASFTFPPGMG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE5 RQSTSEL-----ISELFNDCGALESSQLCDYINDP-NMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQ
. ..:: :: ::.. . . .:: .. . . : : :.: ..
CCDS58 QFMAGELMPREAISTLFDN------NTWVKHAGDPESLGQSAVWIHPR---VNVVIIIF-
420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 LALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWC
: ...:. ..: . : :: : :.: ...:: ::.:: : .:. : :.: .
CCDS58 --LFFVMKFWMSIVATTMPIPCGGFMPVFVLGAAFGRLVG---EIMAMLFPDGILFDDII
470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 RPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVAD
. :: ::..:::: :.:.. ::: .:: ::::: . .:.:.:.:.. .. ::.
CCDS58 YK----ILPGGYAVIGAAALTGAVSH-TVSTAVICFELTGQIAHILPMMVAVILANMVAQ
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 AFGKEGIYEAHIHLNGYPFL-DVK-DEFTHRTL-ATDVM-RPRRGEPPLSVLTQDSMTVE
.. . ..:.. :... :.: :. ..... :. . :.: : . ... :.:
CCDS58 SL-QPSLYDSIIQVKKLPYLPDLGWNQLSKYTIFVEDIMVRDVK-------FVSASYTYG
580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 DVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEP
...::.. : . .:.: :.:: :.: ..: ::
CCDS58 ELRTLLQTTTVKTLPLVDSKDSMILLGSVERSELQALLQRHLCPERRLRAAQEMARKLSE
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 PELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKK
CCDS58 LPYDGKARLAGEGLPGAPPGRPESFAFVDEDEDEDLSGKSELPPSLALHPSTTAPLSPEE
690 700 710 720 730 740
>>CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 (869 aa)
initn: 446 init1: 262 opt: 669 Z-score: 825.9 bits: 163.7 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 779; 30.0% identity (61.0% similar) in 587 aa overlap (129-687:115-672)
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 KEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYIL
: :.: .: : .:.:: ..
CCDS54 SRVGEDWIFLVLLGLLMALVSWVMDYAIAACLQAQQWMSRGLNTS-----ILLQYLAWVT
90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 WALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSG
. ... .........:: : ::::::.:::: : ... :: :.. :.. :. ...::
CCDS54 YPVVLITFSAGFTQILAPQAVGSGIPEMKTILRGVVLKEYLTLKTFIAKVIGLTCALGSG
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LSLGKEGPLVHVACCCGNFFS---SLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGV
. ::::::.::.: :. ..: :::. .::.. :.:.:: :.::. :.::::::
CCDS54 MPLGKEGPFVHIASMCAALLSKFLSLFGGIYENESRNTEMLAAACAVGVGCCFAAPIGGV
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 LFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSR---LVLFYVEYHT--PWYMA
:::.: .: .: ... ::.:::: .:: .: . .. .. .:: .... :. .
CCDS54 LFSIEVTSTFFAVRNYWRGFFAATFSAFIFRVLAVWNRDEETITALFKTRFRLDFPFDLQ
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380
pF1KE5 ELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCN---IAWCRRRKTTR--LGKYPVLEVIVVTAITAIIAY
:: : ..:. .:. :.::. : . :..:: : . .: .:: . . ...
CCDS54 ELPAFAVIGIASGFGGALFVYLNRKIVQVMRKQKTINRFLMRKRLLFPALVTLLISTLTF
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 PNPYTR-----QSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYT
: . . : .: . ::.. .... : . .. :. .. . : : ..:.
CCDS54 PPGFGQFMAGQLSQKETLVTLFDNRTWVRQG-LVEELEPPSTSQAWN--PPR---ANVFL
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 AMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIF
. :.. ...:. .. .. . .: : :.: ...:: ::.:: :..: : :
CCDS54 T---LVIFILMKFWMSALATTIPVPCGAFMPVFVIGAAFGRLVG---ESMAAWFPDGI--
440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 RNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSK
.. ..:: ::.::::: :.::. ::: .::.::::: . .:.:.: :.. ..
CCDS54 --HTDSSTYRIVPGGYAVVGAAALAGAVTH-TVSTAVIVFELTGQIAHILPVMIAVILAN
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610
pF1KE5 WVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTH---RTLATDVMRPRRGEPPLSVLTQDSM
::... . ..:.. :... :.: : :. . :.: : : ... :
CCDS54 AVAQSL-QPSLYDSIIRIKKLPYLPELGWGRHQQYRVRVEDIMV--RDVPHVAL----SC
550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
pF1KE5 TVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELIL----AIKNARQRQ---EGIVS
: .:.. ...: . .: : .: :.: .: ... .. ::.:: : ..
CCDS54 TFRDLRLALHRTKGRMLALVESPESMILLGSIERSQVVALLGAQLSPARRRQHMQERRAT
600 610 620 630 640 650
680 690 700 710 720 730
pF1KE5 NSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRS
.. .: : : :
CCDS54 QTSPLSDQEGPPTPEASVCFQVNTEDSAFPAARGETHKPLKPALKRGPSVTRNLGESPTG
660 670 680 690 700 710
760 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:14:29 2016 done: Tue Nov 8 06:14:30 2016
Total Scan time: 2.920 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]