Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5732
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5732, 636 aa
1>>>pF1KE5732 636 - 636 aa - 636 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0702+/-0.00104; mu= 20.5481+/- 0.062
mean_var=67.5927+/-14.088, 0's: 0 Z-trim(103.8): 43 B-trim: 11 in 1/46
Lambda= 0.156000
statistics sampled from 7532 (7569) to 7532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 ( 636) 4311 979.8 0
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 602) 1833 422.1 1.1e-117
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 ( 614) 1809 416.7 4.6e-116
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 635) 1781 410.4 3.8e-114
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 632) 1773 408.6 1.3e-113
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 617) 1742 401.6 1.6e-111
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 628) 1742 401.6 1.6e-111
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 620) 1717 396.0 8e-110
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 721) 1717 396.0 9e-110
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5 ( 620) 1713 395.1 1.5e-109
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17 ( 630) 1655 382.0 1.3e-105
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 633) 1528 353.5 5.2e-97
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 652) 1528 353.5 5.3e-97
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1 ( 706) 1528 353.5 5.6e-97
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11 ( 797) 1487 344.3 3.7e-94
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX ( 520) 1460 338.1 1.8e-92
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16 ( 512) 1380 320.1 4.7e-87
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 ( 510) 1313 305.0 1.6e-82
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX ( 642) 1278 297.2 4.5e-80
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3 ( 599) 1269 295.2 1.7e-79
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 555) 731 174.1 4.6e-43
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 ( 200) 563 135.9 5e-32
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3 ( 208) 556 134.4 1.5e-31
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5 ( 628) 535 130.0 9.7e-30
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3 ( 592) 532 129.3 1.5e-29
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1 ( 727) 495 121.0 5.6e-27
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 623) 494 120.7 5.8e-27
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5 ( 634) 494 120.8 5.9e-27
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 730) 494 120.8 6.6e-27
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12 ( 289) 457 112.2 1e-24
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19 ( 736) 382 95.6 2.6e-19
>>CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5 (636 aa)
initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 5240.2 bits: 979.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4311; 99.8% identity (100.0% similar) in 636 aa overlap (1-636:1-636)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKKLQGAHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDLDVDFAAHRGNWTGKLDFLLSCIGYCVGLGNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKKLQGAHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDLDVDFAAHRGNWTGKLDFLLSCIGYCVGLGNV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 WRFPYRAYTNGGGAFLVPYFLMLAICGIPLFFLELSLGQFSSLGPLAVWKISPLFKGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WRFPYRAYTNGGGAFLVPYFLMLAICGIPLFFLELSLGQFSSLGPLAVWKISPLFKGAGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AMLLIVGLVAIYYNMIIAYVLFYLFASLTSDLPWEHCGNWWNTELCLEHRVSKDGNGALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AMLLIVGLVAIYYNMIIAYVLFYLFASLTSDLPWEHCGNWWNTELCLEHRVSKDGNGALP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LNLTCTVSPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLLAWVIVFLCILKGVKSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LNLTCTVSPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLLAWVIVFLCILKGVKSSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KVVYFTATFPYLILLMLLVRGVTLPGAWKGIQFYLTPQFHHLLSSKVWIEAALQIFYSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KVVYFTATFPYLILLMLLVRGVTLPGAWKGIQFYLTPQFHHLLSSKVWIEAALQIFYSLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VGFGGLLTFASYNTFHQNIYRDTFIVTLGNAITSILAGFAIFSVLGYMSQELGVPVDQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGFGGLLTFASYNTFHQNIYRDTFIVTLGNAITSILAGFAIFSVLGYMSQELGVPVDQVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KAGPGLAFVVYPQAMTMLPLSPFWSFLFFFMLLTLGLDSQFAFLETIVTAVTDEFPYYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KAGPGLAFVVYPQAMTMLPLSPFWSFLFFFMLLTLGLDSQFAFLETIVTAVTDEFPYYLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PKKAVFSGLICVAMYLMGLILTTDGGMYWLVLLDDYSASFGLMVVVITTCLAVTRVYGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PKKAVFSGLICVAMYLMGLILTTDGGMYWLVLLDDYSASFGLMVVVITTCLAVTRVYGIQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 RFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALLVYSIVKYQPSEYGSYRFPPWAELLGI
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALMVYSIVKYQPSEYGSYRFPPWAELLGI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LMGLLSCLMIPAGMLVAVLREEGSLWERLQQASRPAMDWGPSLEENRTGMYVATLAGSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LMGLLSCLMIPAGMLVAVLREEGSLWERLQQASRPAMDWGPSLEENRTGMYVATLAGSQS
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE5 PKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
610 620 630
>>CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12 (602 aa)
initn: 1762 init1: 905 opt: 1833 Z-score: 2226.4 bits: 422.1 E(32554): 1.1e-117
Smith-Waterman score: 1834; 48.5% identity (75.0% similar) in 573 aa overlap (11-578:15-573)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKKLQGAHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDLDVDFAAHRGNWTGKLDFLLSCIGYCVG
::: : .: ... : . .::.:..:..:.:: : .:
CCDS85 MDSRVSGTTSNGETKPVYP--VMEKKEE-------DGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LGNVWRFPYRAYTNGGGAFLVPYFLMLAICGIPLFFLELSLGQFSSLGPLAVW-KISPLF
::::::::: : ::::::..::...: ::::.:.:: .:::..: : ...: :: :.:
CCDS85 LGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KGAGAAMLLIVGLVAIYYNMIIAYVLFYLFASLTSDLPWEHCGNWWNTELCLEHRVSKDG
.: : : .:: :. .:: ...:..:::::.:.: :::: : . :::: :.: . .
CCDS85 EGIGYASQMIVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQKT---
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NGALPLNLTCTVSPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLLAWVIVFLCILKG
::.: . ..:: :.: : ::.: :.:: : .::.: ::::::::: ..:: ::
CCDS85 NGSLNGTSENATSPVIEFWERRVLKI--SDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VKSSGKVVYFTATFPYLILLMLLVRGVTLPGAWKGIQFYLTPQFHHLLSSKVWIEAALQI
:::.:::::::::::::.:..::.:::::::: .:::::: :.. .: . .::..:. ::
CCDS85 VKSTGKVVYFTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FYSLGVGFGGLLTFASYNTFHQNIYRDTFIVTLGNAITSILAGFAIFSVLGYMSQELGVP
:.:... .: : ...::: .:.: ::: . . . :. ::..:::::::.::.:::: :::
CCDS85 FFSFAICLGCLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VDQVAKAGPGLAFVVYPQAMTMLPLSPFWSFLFFFMLLTLGLDSQFAFLETIVTAVTDEF
...::..::::::..::.:..:::.::.:. ::::.. :::::::. .:..:::..: .
CCDS85 ISEVAESGPGLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMY
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 PYYLRPK--KAVFSGLICVAMYLMGLILTTDGGMYWLVLLDDYSAS-FGLMVVVITTCLA
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CCDS85 PHVFRKKNRREVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLC
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 VTRVYGIQRFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALLVYSIVKYQPSEYGS-YRF
:. ::: .:: .:. :.:..: .. :::::.::. : ...:..:: : :.. : .
CCDS85 VAWVYGAKRFYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTY
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 PPWAELLGILMGLLSCLMIPAGMLVAVLREEGSLWERLQQASRPAMDWGPSLEENRTGMY
: :.. :: :..: : . ::: : . .: . ::..: :: :
CCDS85 PWWGDALGWLLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPA
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630
pF1KE5 VATLAGSQSPKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
CCDS85 TPRTSLLRLTELESHC
590 600
>>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12 (614 aa)
initn: 1569 init1: 877 opt: 1809 Z-score: 2197.1 bits: 416.7 E(32554): 4.6e-116
Smith-Waterman score: 1809; 46.9% identity (75.6% similar) in 569 aa overlap (15-575:13-575)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKKLQGAHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDL-DVDFAAHRGNWTGKLDFLLSCIGYCVGLGN
: . .: . .: : : . ::.::.:..:.:: : .::::
CCDS85 MDGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VWRFPYRAYTNGGGAFLVPYFLMLAICGIPLFFLELSLGQFSSLGPLAVW-KISPLFKGA
:::::: : ::::::..:::... .::::.::::..:::..: : ...: :: :::.:
CCDS85 VWRFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GAAMLLIVGLVAIYYNMIIAYVLFYLFASLTSDLPWEHCGNWWNTELCLEHRVSKDGNGA
: : ..: . . .:: .:.:..:::::.:.::.::: :.:.:::: : . ....: :.
CCDS85 GLASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDF-LNHSGAGT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 L-PL-NLTCTVSPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLLAWVIVFLCILKGV
. :. :.: :: :.: : :: : ..:: . : .::.: ::::::::: ..:: :::
CCDS85 VTPFENFT---SPVMEFWERRVLGI--TSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KSSGKVVYFTATFPYLILLMLLVRGVTLPGAWKGIQFYLTPQFHHLLSSKVWIEAALQIF
::.:::::::::::::.:..::.::::::::..:: .:: :.. .: . .::..:. :::
CCDS85 KSTGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YSLGVGFGGLLTFASYNTFHQNIYRDTFIVTLGNAITSILAGFAIFSVLGYMSQELGVPV
.:... : : ...::: .:.: :.: . . . :. ::..:::..::.::.:::: :::.
CCDS85 FSFAICQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 DQVAKAGPGLAFVVYPQAMTMLPLSPFWSFLFFFMLLTLGLDSQFAFLETIVTAVTDEFP
..::..::::::...:.:.::.::: .:: :::.::. :::::::. .: .::: : ::
CCDS85 SEVAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 YYLRP--KKAVFSGLICVAMYLMGLILTTDGGMYWLVLLDDYSAS-FGLMVVVITTCLAV
:: .. .. : : ::.::.:.:.:::: . :.: :..: . :. . . . .
CCDS85 RQLRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 TRVYGIQRFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALLVYSIVKYQPSEYGS-YRFP
. ::: .:: .:. :.:..: . ::::.:. :: ...:. :: : .:.. : .:
CCDS85 SWVYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 PWAELLGILMGLLSCLMIPAGMLVAVLREEGSLWERLQQASRPAMDWGPSLEENRTGMYV
::. .: ...: : . .: .....:. .: . .::.: :
CCDS85 PWGYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KE5 ATLAGSQSPKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
CCDS85 GRNFGPSPTREGLIAGEKETHL
600 610
>>CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX (635 aa)
initn: 1661 init1: 826 opt: 1781 Z-score: 2162.9 bits: 410.4 E(32554): 3.8e-114
Smith-Waterman score: 1781; 46.3% identity (74.0% similar) in 553 aa overlap (37-580:52-600)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 AHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDLDVDFAAHRGNWTGKLDFLLSCIGYCVGLGNVWRFPYR
: .:: ..::..::.:. :::::::::::
CCDS14 LIAPGPDGAPAKGDGPVGLGTPGGRLAVPPRETWTRQMDFIMSCVGFAVGLGNVWRFPYL
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AYTNGGGAFLVPYFLMLAICGIPLFFLELSLGQFSSLGPLAVWKISPLFKGAGAAMLLIV
: ::::.::.:: :. . :::.::::.::::: . : . ::.: ::::: : : ..::
CCDS14 CYKNGGGVFLIPYVLIALVGGIPIFFLEISLGQFMKAGSINVWNICPLFKGLGYASMVIV
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GLVAIYYNMIIAYVLFYLFASLTSDLPWEHCGNWWNTELCLEHRVSKDGNGALPLNLTCT
:: :..:. ..:: :.:. ::: ::. ::: :.: .: .: ::::
CCDS14 FYCNTYYIMVLAWGFYYLVKSFTTTLPWATCGHTWNTPDCVEIFRHEDCANASLANLTCD
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 V-----SPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLLAWVIVFLCILKGVKSSGK
:: :.: ::...: :. :: . :.. :::: ::.:..:. :::::.::
CCDS14 QLADRRSPVIEFWENKVLRLSG--GLEVPGALNWEVTLCLLACWVLVYFCVWKGVKSTGK
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VVYFTATFPYLILLMLLVRGVTLPGAWKGIQFYLTPQFHHLLSSKVWIEAALQIFYSLGV
.:::::::::..:..:::::: :::: :: .:: :.. .: : .:::.:. :::.: ..
CCDS14 IVYFTATFPYVVLVVLLVRGVLLPGALDGIIYYLKPDWSKLGSPQVWIDAGTQIFFSYAI
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GFGGLLTFASYNTFHQNIYRDTFIVTLGNAITSILAGFAIFSVLGYMSQELGVPVDQVAK
:.:.: ...::: :..: :.:..:..: :. ::..:::..::.::.:. : :: ...::.
CCDS14 GLGALTALGSYNRFNNNCYKDAIILALINSGTSFFAGFVVFSILGFMAAEQGVHISKVAE
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410
pF1KE5 AGPGLAFVVYPQAMTMLPLSPFWSFLFFFMLLTLGLDSQFAFLETIVTAVTDEFP--YYL
.::::::..::.:.:..:..:.:. ::::::: :::::::. .: ..:.. : .: ::.
CCDS14 SGPGLAFIAYPRAVTLMPVAPLWAALFFFMLLLLGLDSQFVGVEGFITGLLDLLPASYYF
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 RPKKAVFSGLICVAMYLMGLILTTDGGMYWLVLLDDYSAS-FGLMVVVITTCLAVTRVYG
: .. . .: :. ... : ..:::::: . :.: :::: :. .. :..:. :::
CCDS14 RFQREISVALCCALCFVIDLSMVTDGGMYVFQLFDYYSASGTTLLWQAFWECVVVAWVYG
440 450 460 470 480 490
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 IQRFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALLVYSIVKYQPSEYG-SYRFPPWAEL
.:: :: :.:..: ... :: :..: . ........: :.: :. .: .: :.:
CCDS14 ADRFMDDIACMIGYRPCPWMKWCWSFFTPLVCMGIFIFNVVYYEPLVYNNTYVYPWWGEA
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540 550 560 570 580 590
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.: ..: : : .: .: .:: .:.. :: :. ..: ::
CCDS14 MGWAFALSSMLCVPLHLLGCLLRAKGTMAERWQHLTQPI--WGLHHLEYRAQDADVRGLT
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630
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CCDS14 TLTPVSESSKVVVVESVM
620 630
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10 20 30 40 50 60
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: :.: ::.:..:..:.:: : .:::::
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::::: : :::::::.:: ... ::::.:::: .::::.: : .. : :. :::.: :
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: .: . . .:: .:.:...::: .:..::: ::. :::: :.: . . .: .
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..: ..:: :.: . :: : :.:: :..::.: :::: ::.: ..:: ::.::.
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.. .: : ...:::....: ::: ... :. ::..::::::::::.:. : :::. .:
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:..::::::..::.:.::.::::.:. :::.::. :::::::. .:..::::.: .: .
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pF1KE5 RP--KKAVFSGLICVAMYLMGLILTTDGGMYWLVLLDDYSAS-FGLMVVVITTCLAVTRV
: .. .. . : :..::.. :.:::: . :.:.:.:: . :. :.: :. . :
CCDS26 RRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVAIFECICIGWV
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pF1KE5 YGIQRFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALLVYSIVKYQPSEYGS-YRFPPWA
:: .:: .:. :.:..: .. ::....:. ..... ..::.: .:.. : .: :.
CCDS26 YGSNRFYDNIEDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKYNNIYTYPAWG
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.: ::.: : : :: . ..: . ::.: :.::. . :. :
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pF1KE5 AGSQSPKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
CCDS26 DCDAKLKSDGTIAAITEKETHF
620 630
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. ..... . ::::.:::::..:::.::..:..:::.::::::: .::. :: .:..:
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. :::.:: :::.:::.::: :..::::: : .: :::..... : :::...::::::
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pF1KE5 VLGYMSQELGVPVDQVAKAGPGLAFVVYPQAMTMLPLSPFWSFLFFFMLLTLGLDSQFAF
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.:...:...:.: : .: .:. . . .:..:. : ::.: :.::: ..:. ...
CCDS10 MEAVITGLADDFQVLKRHRK-LFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSIL
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pF1KE5 VVVITTCLAVTRVYGIQRFCRDIHMMLGFKPGLYFRACWLFLSPATLLALLVYSIVKYQP
.:. ..:. ::..:: ::..:.::.::::.: :: :.::: :: ..: ::....:
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: .: :::::. .: ..: : ...: .. : .::::::: . :
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610
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10 20 30 40
pF1KE5 MKKLQGAHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDLDVDFAAHRGNWTGKLDFL
:..: : :: : : .: :.:::
CCDS54 NGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRD-GD-------AQPRETWGKKIDFL
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CCDS54 VWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCT
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pF1KE5 EHRVSKDGNGALPLNLTC----TVSPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLL
. .. ::.. : : .:. :.. : :::.. :.:: . : .:.: :::..
CCDS54 DPKLL---NGSVLGNHTKYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMV
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pF1KE5 AWVIVFLCILKGVKSSGKVVYFTATFPYLILLMLLVRGVTLPGAWKGIQFYLTPQFHHLL
. ..... . ::::.:::::..:::.::..:..:::.::::::: .::. :: .:..:
CCDS54 VVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLK
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pF1KE5 SSKVWIEAALQIFYSLGVGFGGLLTFASYNTFHQNIYRDTFIVTLGNAITSILAGFAIFS
. :::.:: :::.:::.::: :..::::: : .: :::..... : :::...::::::
CCDS54 EATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFS
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.::::..: : ...:: : ::.:..::.:.. : : ::. .:: :::.:::::...
CCDS54 ILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGG
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CCDS54 MEAVITGLADDFQVLKRHRK-LFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSIL
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CCDS54 FAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKP
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pF1KE5 SEYGSYRFPPWAELLGILMGLLSCLMIPAGMLVAVLREEGSLWERLQQASRPAMDWGPSL
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CCDS54 LTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVA
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pF1KE5 EENRTGMYVATLAGSQSPKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
CCDS54 QRDIRQFQMKTRQGRRRATNSCQISC
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CCDS33 LCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASVV
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::.:. .:: .:.:.. .::: :. ..::: ::.. ::: :.: . :. . . .. :
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CCDS33 FTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLG
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.. ...::: .. : ::: ... :. ::...::::::.::.:.:: :: . .::..::
CCDS33 AMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGP
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CCDS33 GLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYR
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CCDS33 REIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDN
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. :. :.:..:: ... : ..:. .. ...:.::: : :. .: .: :: ::
CCDS33 LYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGW
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..: : : .: ... . . :: . :.. :
CCDS33 SLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGA
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pF1KE5 PKPLMVHMRKYGGITSFENTAIEVDREIAEEEESMM
CCDS33 LVKPTHIIVETMM
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>>CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3 (721 aa)
initn: 1319 init1: 851 opt: 1717 Z-score: 2084.2 bits: 396.0 E(32554): 9e-110
Smith-Waterman score: 1717; 45.3% identity (74.1% similar) in 545 aa overlap (36-575:141-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 GAHLRKPVTPDLLMTPSDQGDVDLDVDFAAHRGNWTGKLDFLLSCIGYCVGLGNVWRFPY
.: .:..:.::.:: : :::::::::::
CCDS77 LKDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPY
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pF1KE5 RAYTNGGGAFLVPYFLMLAICGIPLFFLELSLGQFSSLGPLAVW-KISPLFKGAGAAMLL
: :::::::.:::..: :.:.::::. .::..: : .. : :: :::.: : : ..
CCDS77 LCYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASVV
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::.:. .:: .:.:.. .::: :. ..::: ::.. ::: :.: . :. . . .. :
CCDS77 IVSLLNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISST
240 250 260 270 280 290
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pF1KE5 CTVSPSEEYWSRYVLHIQGSQGIGSPGEIRWNLCLCLLLAWVIVFLCILKGVKSSGKVVY
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