Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5711, 805 aa
1>>>pF1KE5711 805 - 805 aa - 805 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9056+/-0.000433; mu= 13.3275+/- 0.027
mean_var=119.8875+/-23.619, 0's: 0 Z-trim(114.6): 107 B-trim: 426 in 2/52
Lambda= 0.117135
statistics sampled from 24424 (24553) to 24424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.288), width: 16
Scan time: 12.120
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057196 (OMIM: 604532) polycystic kidney disease ( 805) 5401 924.6 0
NP_001240766 (OMIM: 604532) polycystic kidney dise ( 758) 4839 829.6 0
XP_016872364 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 710) 4429 760.3 0
XP_011538625 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 710) 4429 760.3 0
XP_011538627 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 687) 4403 755.9 1.3e-217
XP_016872365 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic ( 649) 3018 521.8 3.7e-147
NP_000288 (OMIM: 173910,613095) polycystin-2 [Homo ( 968) 2496 433.7 1.8e-120
XP_011530331 (OMIM: 173910,613095) PREDICTED: poly ( 728) 2293 399.3 3.1e-110
XP_011530332 (OMIM: 173910,613095) PREDICTED: poly ( 688) 2155 376.0 3.1e-103
NP_055201 (OMIM: 604669) polycystic kidney disease ( 613) 1904 333.6 1.6e-90
NP_001287850 (OMIM: 604669) polycystic kidney dise ( 624) 1904 333.6 1.7e-90
XP_016864832 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 604) 1898 332.5 3.3e-90
XP_011541620 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 590) 1807 317.2 1.4e-85
XP_011541623 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 564) 1758 308.9 4.1e-83
XP_016864833 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 564) 1758 308.9 4.1e-83
XP_011530330 (OMIM: 173910,613095) PREDICTED: poly ( 893) 1488 263.4 3.2e-69
NP_001245378 (OMIM: 604669) polycystic kidney dise ( 523) 1221 218.1 8e-56
XP_016864834 (OMIM: 604669) PREDICTED: polycystic ( 550) 1172 209.8 2.6e-53
NP_001245377 (OMIM: 604669) polycystic kidney dise ( 602) 831 152.2 6.2e-36
NP_001265354 (OMIM: 607894) polycystic kidney dise (1774) 708 131.7 2.7e-29
NP_443124 (OMIM: 607894) polycystic kidney disease (2459) 708 131.8 3.5e-29
NP_006062 (OMIM: 604670) polycystic kidney disease (2253) 407 80.9 6.7e-14
XP_005255427 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3288) 358 72.8 2.8e-11
XP_016878774 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3327) 358 72.8 2.8e-11
XP_011520839 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3329) 358 72.8 2.8e-11
XP_011520837 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (3603) 358 72.8 3e-11
XP_011520836 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4241) 358 72.8 3.5e-11
XP_011520834 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4287) 358 72.8 3.5e-11
NP_000287 (OMIM: 173900,601313) polycystin-1 isofo (4302) 358 72.8 3.5e-11
NP_001009944 (OMIM: 173900,601313) polycystin-1 is (4303) 358 72.8 3.5e-11
XP_011520832 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4311) 358 72.8 3.5e-11
XP_011520831 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4320) 358 72.8 3.5e-11
XP_011520830 (OMIM: 173900,601313) PREDICTED: poly (4321) 358 72.8 3.5e-11
NP_853514 (OMIM: 607895) polycystic kidney disease (1732) 250 54.3 5.2e-06
NP_612152 (OMIM: 609721) polycystic kidney disease (2849) 233 51.6 5.7e-05
XP_016867287 (OMIM: 609721) PREDICTED: polycystic (2920) 232 51.4 6.6e-05
NP_821138 (OMIM: 609120) cation channel sperm-asso ( 398) 178 41.8 0.0073
>>NP_057196 (OMIM: 604532) polycystic kidney disease 2-l (805 aa)
initn: 5401 init1: 5401 opt: 5401 Z-score: 4938.1 bits: 924.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5401; 100.0% identity (100.0% similar) in 805 aa overlap (1-805:1-805)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKKPEDEPQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKKPEDEPQET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLLTYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 AYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLLTYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 GHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 NGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 NGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 VFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 QPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 AVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 AVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 FVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 RVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 MRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFYMLTRRVLQLETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFYMLTRRVLQLETV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 LEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEV
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE5 PYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
:::::::::::::::::::::::::
NP_057 PYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
790 800
>>NP_001240766 (OMIM: 604532) polycystic kidney disease (758 aa)
initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839 Z-score: 4425.2 bits: 829.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4839; 100.0% identity (100.0% similar) in 727 aa overlap (79-805:32-758)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 QPKKPEDEPQETAYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYI
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPRRRHTGPRCPAAASISVKASEASLPCPLGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYI
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 VFLVDICLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFLVDICLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDS
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYS
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 PDKEEQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDKEEQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRAL
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 QEGLWLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEGLWLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNW
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DFFIVGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFFIVGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRT
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 LEVNRLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEVNRLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSS
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 TLARCAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLARCAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNA
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 IDNANRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDNANRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGY
490 500 510 520 530 540
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pF1KE5 NKTLLRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKTLLRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRD
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KE5 GNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFY
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710 720 730 740 750 760
pF1KE5 MLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPD
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800
pF1KE5 PWGVQGGQESEVPYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWGVQGGQESEVPYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
730 740 750
>>XP_016872364 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic kidn (710 aa)
initn: 4427 init1: 4427 opt: 4429 Z-score: 4051.1 bits: 760.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4429; 99.5% identity (99.7% similar) in 666 aa overlap (115-778:16-681)
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 LTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLL--TYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPS
:.: :::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTSGILMKLKVSCPGCFLIVTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPS
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 DTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQ
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 LKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRL
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 TSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLVV
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 EFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYL
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 SSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMN
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 AVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQ
350 360 370 380 390 400
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 VENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIIND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIIND
410 420 430 440 450 460
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 TYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFT
470 480 490 500 510 520
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 NTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRS
530 540 550 560 570 580
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 IVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFYMLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFYMLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKG
590 600 610 620 630 640
750 760 770 780 790 800
pF1KE5 WLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEVPYKREEEALEERRLSRGEIPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPDPWGVQGGQESGEEGGLKHQTAGFPPSASAQAPSP
650 660 670 680 690 700
pF1KE5 QRS
XP_016 HPLHF
710
>>XP_011538625 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic kidn (710 aa)
initn: 4427 init1: 4427 opt: 4429 Z-score: 4051.1 bits: 760.3 E(85289): 0
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90 100 110 120 130 140
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:.: :::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTSGILMKLKVSCPGCFLIVTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTPS
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XP_011 LKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 HPLHF
710
>>XP_011538627 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic kidn (687 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 AEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::
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>>XP_016872365 (OMIM: 604532) PREDICTED: polycystic kidn (649 aa)
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:.: :::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 HPLHF
>>NP_000288 (OMIM: 173910,613095) polycystin-2 [Homo sap (968 aa)
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::: : : .: .: .. : :
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.: ..:. . . .:.:::::: : :... ::: :.:..::::..:..::. .
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:.::::: ::..::::..::.::: :: : : ..:...::: ::: :..: :::.:::
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.::. . ..:::.:::.::::::.:::.::: :: . .:.:..: :::::: ..:
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.. :::: ::::: : :. .:.: :::: ...:::.:::::: .:. .: . .:....
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:::::::..::::::::::::::::.::.::::::::.:::::.. .::::::...:::.
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..::.::: ::::::::::::..::.:.:. :.:: ::.:...::.::.:..:.:: .:.
NP_000 AACEIIFCFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVE
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:. ..:.. ::. .:: ::.:: :.::. ::..::.:::.::.:.::.::.:::.:..:
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::::..:::.::::.:.:::::.::.:::::..:::: .::::::::::::... :..:
NP_000 CAKDLFGFAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEA
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::.::: ::.:.:::.::.::::::::::::::::: .:: :: :..::::...::.:.:
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..:.:.:. :.:... :. : ...:... . :. ::.. :: : :::.:.::..
NP_000 VKLKLKKNTVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEI---EAIFTKYDQDGDQE
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pF1KE5 LDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSS--PQG----------KSGPEAARAGG
: :.:...::.:::.:: :. . .: : . : :.. :: . : :.
NP_000 LTEHEHQQMRDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGS
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pF1KE5 WVSG---EEFYMLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWK
:: ::: .:.::: ..: . ..::.:::: ::...::
NP_000 ISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVA
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NP_000 EDERLGRDSEIHREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSS
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>>XP_011530331 (OMIM: 173910,613095) PREDICTED: polycyst (728 aa)
initn: 1364 init1: 1054 opt: 2293 Z-score: 2100.2 bits: 399.3 E(85289): 3.1e-110
Smith-Waterman score: 2378; 55.1% identity (82.9% similar) in 637 aa overlap (121-740:1-632)
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pF1KE5 ENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTP-SDT-GVSF
: ::..::::..::.::: :: : : ..:
XP_011 MMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNF
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pF1KE5 QAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRND
...::: ::: :..: :::.::: .::. . ..:::.:::.::::::.:::.:::
XP_011 KTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTEAD-NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNG
40 50 60 70 80
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pF1KE5 SCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGG
:: . .:.:..: :::::: ..:.. :::: ::::: : :. .:.: :::: ...:::.
XP_011 SCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGPRNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGA
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:::::: .:. .: . .:....:::::::..::::::::::::::::.::.:::::::
XP_011 GYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTRATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATG
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:.:::::.. .::::::...:::...::.::: ::::::::::::..::.:.:. :.::
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::.:...::.::.:..:.:: .:. :. ..:.. ::. .:: ::.:: :.::. ::..::
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XP_011 FQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPIYFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVK
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pF1KE5 EELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLREL
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::.. :: : :::.:.::.. : :.:...::.:::.:: :. . .: : . :
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:.. :: . : :. :: ::: .:.::: ..: . ..::.::::
XP_011 PRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGSISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIV
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::...::
XP_011 KLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVAEDERLGRDSEIHREQMERLVREELERWESDDAASQI
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>>XP_011530332 (OMIM: 173910,613095) PREDICTED: polycyst (688 aa)
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>>NP_055201 (OMIM: 604669) polycystic kidney disease 2-l (613 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]