FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5692, 501 aa
1>>>pF1KE5692 501 - 501 aa - 501 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6604+/-0.00038; mu= 21.8926+/- 0.024
mean_var=68.6628+/-13.891, 0's: 0 Z-trim(112.6): 110 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.154779
statistics sampled from 21459 (21590) to 21459 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 9.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004382 (OMIM: 602172) 7-alpha-hydroxycholest-4- ( 501) 3447 779.1 0
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NP_000771 (OMIM: 118455) cholesterol 7-alpha-monoo ( 504) 1087 252.1 2.7e-66
NP_004811 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxyc ( 506) 1006 234.0 7.6e-61
XP_016869491 (OMIM: 270800,603711,613812) PREDICTE ( 528) 987 229.8 1.5e-59
NP_001311041 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydro ( 460) 691 163.7 1.1e-39
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XP_005249228 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 420) 340 85.2 3.9e-16
NP_057677 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol 7-a ( 469) 340 85.3 4.2e-16
XP_016866410 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 471) 340 85.3 4.3e-16
NP_000777 (OMIM: 601637) lanosterol 14-alpha demet ( 509) 221 58.7 4.5e-08
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 219 58.3 6e-08
NP_001265668 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol ( 297) 200 53.8 7.9e-07
XP_016866414 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 335) 200 53.9 8.6e-07
XP_016866413 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 433) 200 54.0 1e-06
XP_016866412 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 435) 200 54.0 1e-06
NP_001265667 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol ( 449) 193 52.4 3.1e-06
XP_016866411 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 451) 193 52.4 3.1e-06
NP_001122062 (OMIM: 201910,613815) steroid 21-hydr ( 465) 181 49.8 2.1e-05
NP_000491 (OMIM: 201910,613815) steroid 21-hydroxy ( 495) 181 49.8 2.1e-05
NP_828847 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isofo ( 509) 180 49.6 2.6e-05
NP_899230 (OMIM: 608428,614974) cytochrome P450 26 ( 522) 179 49.4 3e-05
NP_063938 (OMIM: 605207,614416) cytochrome P450 26 ( 512) 172 47.8 8.9e-05
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 163 45.8 0.00035
NP_000093 (OMIM: 202110,609300) steroid 17-alpha-h ( 508) 160 45.1 0.00056
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 157 44.4 0.00088
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 156 44.2 0.001
XP_005264490 (OMIM: 605207,614416) PREDICTED: cyto ( 454) 154 43.7 0.0013
NP_000774 (OMIM: 602239) cytochrome P450 26A1 isof ( 497) 144 41.5 0.0066
XP_016856462 (OMIM: 614999) PREDICTED: cytochrome ( 470) 143 41.3 0.0074
>>NP_004382 (OMIM: 602172) 7-alpha-hydroxycholest-4-en-3 (501 aa)
initn: 3447 init1: 3447 opt: 3447 Z-score: 4159.2 bits: 779.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3447; 99.8% identity (99.8% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
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pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYRSVQGDH
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGSILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYRSVQGDH
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 EMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYILFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYILFTA
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pF1KE5 GYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGRLQRLFHKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGRLQRLFHKML
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWALLYLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWALLYLLK
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pF1KE5 HPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAPTLLRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAPTLLRLV
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pF1KE5 HEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPLPHVDPQRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPLPHVDPQRW
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE5 GFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
:::::::::::::::::::::
NP_004 GFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
490 500
>>NP_000952 (OMIM: 145500,601699) prostacyclin synthase (500 aa)
initn: 1290 init1: 907 opt: 1301 Z-score: 1569.4 bits: 299.9 E(85289): 1.1e-80
Smith-Waterman score: 1301; 40.9% identity (69.2% similar) in 506 aa overlap (4-499:3-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
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NP_000 MAWAALLGLLAALL--LLLLLSRRRTRRPGEPPLDLGSIPWLGYALDFGKDAASFLTRM
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYRSVQGDH
. ::::.::. .::.: : ..:: :. .. . . .::: :: :. ..: .:: :
NP_000 KEKHGDIFTILVGGRYVTVLLDPHSYDAVVWEPRTRLDFHAYAIFLMERIF---DVQLPH
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pF1KE5 EMIHSASTKH---LRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA-SCWHEDSLFRFCYYI
. ... : :. :.:.: .: :.: : . .: : ::: .:. : : .
NP_000 YSPSDEKARMKLTLLHRELQALTEAMYTNLHAVLL---GDATEAGSGWHEMGLLDFSYSF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 LFTAGYLSLFGYT------KDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVG
:. ::::.:.: ... :: ......: ::..: :.:... . : . ..
NP_000 LLRAGYLTLYGIEALPRTHESQAQDRVHSADVFHTFRQLDRLLPKLARGSLSVGDKDHMC
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pF1KE5 RLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPT
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NP_000 SVKSRLWKLLSPARLARRAHRSKWLESYLLHLEEMGVSEEMQARALVLQLWATQGNMGPA
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NP_000 AFWLLLFLLKNPEALAAVRGELESILWQAEQPVSQTTTLPQKVLDSTPVLDSVLSESLRL
300 310 320 330 340 350
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pF1KE5 RAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLN
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NP_000 TAAPFITREVVVDLAMPMADGREFNLRRGDRLLLFPFLSPQRDPEIYTDPEVFKYNRFLN
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pF1KE5 PNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDT
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NP_000 PDGSEKKDFYKDGKRLKNYNMPWGAGHNHCLGRSYAVNSIKQFVFLVLVHLDLELINADV
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KE5 PLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
.:. : .:.::: ::: ::: :::..:
NP_000 EIPEFDLSRYGFGLMQPEHDVPVRYRIRP
480 490 500
>>NP_000771 (OMIM: 118455) cholesterol 7-alpha-monooxyge (504 aa)
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Smith-Waterman score: 1087; 35.5% identity (69.7% similar) in 512 aa overlap (2-497:6-501)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGML--RQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMF
..:: ..::. :: .: :.:. ::::..: .:.:: :. : : .
NP_000 MMTTSLIWG-------IAIAACCCLWLILGIRRRQTGEPPLENGLIPYLGCALQFGANPL
10 20 30 40 50
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pF1KE5 EFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYR
:::. . ::: ::: .: :.: :. .:::. .: . .:. .. :.::.:
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NP_000 SIDPMDGNTTENINDTFIKTLQGHALNSLTESMMENLQRIMRPPVSSNSKTAAWVTEGMY
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::: ..: ::::..:: . .: .: : . .:..:: .:: .: .: : . ..
NP_000 SFCYRVMFEAGYLTIFGRDLTR-RDTQKAHILNNLDNFKQFDKVFPALVAGL--PIHMFR
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pF1KE5 VGRLQRLFHKML-SVSHS--QEKEGISNWLGNMLQFLRE--QGVPSAMQDKFNFMMLWAS
... : .:. :. : :..:.::. : .. .:: . . . . : ....::::
NP_000 TAHNAR--EKLAESLRHENLQKRESISE-LISLRMFLNDTLSTFDDLEKAKTHLVVLWAS
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pF1KE5 QGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETK---QSFAFKLGALQHTPVL
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NP_000 QANTIPATFWSLFQMIRNPEAMKAATEEVKRTLENAGQKVSLEGNPICLSQAELNDLPVL
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::...:.::: .: .: ..::.::.. .:. : .:. ::.::.: : .:.::.:.:.:
NP_000 DSIIKESLRLSSASLNIRTAKEDFTLHLEDGS-YNIRKDDIIALYPQL-MHLDPEIYPDP
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NP_000 LTFKYDRYLDENGKTKTTFYCNGLKLKYYYMPFGSGATICPGRLFAIHEIKQFLILMLSY
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pF1KE5 FDLELVDPDTPLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
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NP_000 FELELIEGQAKCPPLDQSRAGLGILPPLNDIEFKYKFKHL
470 480 490 500
>>NP_004811 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxychole (506 aa)
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Smith-Waterman score: 1006; 36.1% identity (66.9% similar) in 504 aa overlap (3-497:19-504)
10 20 30 40
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLG
: : .:.: :...: ::: . : ::: :::: :: .:.::
NP_004 MAGEVSAATGRFSLERLGLPGLALAAALLLLA--LCLL-VRRTRRPGEPPLIKGWLPYLG
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pF1KE5 HAMAFRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAK
.. .::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::... ..:. ...:.: ...
NP_004 VVLNLRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSN
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pF1KE5 KLVLKVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA
::. :.:. ..: .:.: .: . :.: .: : :.:...:. :. . : .
NP_004 KLLEKAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SCWHEDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLL
. : :. :: :.: . ...: . ... . .:: .: ::: : .: ..
NP_004 TSWDTAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI-
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE5 WPREWLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNF
: : : : .. . .:... :.. ...: . . . :.. : .. ..
NP_004 -PIELL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHL
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 MMLWASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHT
.:::: .:: :: :::. :::.::::. :::.: ..: . . ..: ..: :
NP_004 GFLWASVANTIPTMFWAMYYLLRHPEAMAAVRDEIDRLLQSTGQKKGSGFPIHLTREQLD
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pF1KE5 PV--LDSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPD
. :.: . :.::: . : .:.:.:: ::. .: .: :.::..:.:: . .: ::.
NP_004 SLICLESSIFEALRLSSYSTTIRFVEEDLTLSSETG-DYCVRKGDLVAIFPPV-LHGDPE
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pF1KE5 IHPEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFIL
: : :.::::.. .:..:. ::: :::.. : ::.:.:.: :::::::: :.: ...
NP_004 IFEAPEEFRYDRFIE-DGKKKTTFFKRGKKLKCYLMPFGTGTSKCPGRFFALMEIKQLLV
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...:.::::..: : :. .. .: :: . :. :: :::..
NP_004 ILLTYFDLEIID-DKPIG-LNYSRLLFGIQYPDSDVLFRYKVKS
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>>XP_016869491 (OMIM: 270800,603711,613812) PREDICTED: 2 (528 aa)
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Smith-Waterman score: 987; 35.9% identity (66.4% similar) in 488 aa overlap (19-497:54-526)
10 20 30 40
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMA
: :: ::: :::: :: .:.:: ..
XP_016 TVDSIVALWEDIQLMLTDCNPLRQDLDIYTLQLPEKTCLRRPGEPPLIKGWLPYLGVVLN
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50 60 70 80 90 100
pF1KE5 FRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVL
.::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::... ..:. ...:.: ...::.
XP_016 LRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSNKLLE
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 KVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWH
:.:. ..: .:.: .: . :.: .: : :.:...:. :. . : .. :
XP_016 KAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKTTSWD
150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 EDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPRE
:. :: :.: . ...: . ... . .:: .: ::: : .: .. : :
XP_016 TAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI--PIE
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 WLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNFMMLW
: : .. . .:... :.. ...: . . . :.. : .. .. .::
XP_016 LL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHLGFLW
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KE5 ASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPV--
:: .:: :: :::. :::.::::. :::.: ..: . . ..: ..: : .
XP_016 ASVANTIPTMFWAMYYLLRHPEAMAAVRDEIDRLLQSTGQKKGSGFPIHLTREQLDSLIC
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 LDSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPE
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XP_016 LESSIFEALRLSSYSTTIRFVEEDLTLSSETG-DYCVRKGDLVAIFPPV-LHGDPEIFEA
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400 410 420 430 440 450
pF1KE5 PTVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVT
: :.::::.. .:..:. ::: :::.. : ::.:.:.: :::::::: :.: ......:
XP_016 PEEFRYDRFIE-DGKKKTTFFKRGKKLKCYLMPFGTGTSKCPGRFFALMEIKQLLVILLT
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460 470 480 490 500
pF1KE5 HFDLELVDPDTPLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
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XP_016 YFDLEIID-DKPIG-LNYSRLLFGIQYPDSDVLFRYKVKS
500 510 520
>>NP_001311041 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxych (460 aa)
initn: 496 init1: 249 opt: 691 Z-score: 833.7 bits: 163.7 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 691; 33.7% identity (64.3% similar) in 412 aa overlap (3-403:19-415)
10 20 30 40
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLG
: : .:.: :...: ::: . : ::: :::: :: .:.::
NP_001 MAGEVSAATGRFSLERLGLPGLALAAALLLLA--LCLL-VRRTRRPGEPPLIKGWLPYLG
10 20 30 40 50
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pF1KE5 HAMAFRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAK
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NP_001 VVLNLRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSN
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pF1KE5 KLVLKVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA
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NP_001 KLLEKAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SCWHEDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLL
. : :. :: :.: . ...: . ... . .:: .: ::: : .: ..
NP_001 TSWDTAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI-
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230 240 250 260 270
pF1KE5 WPREWLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNF
: : : : .. . .:... :.. ...: . . . :.. : .. ..
NP_001 -PIELL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHL
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 MMLWASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHT
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pF1KE5 PV--LDSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPD
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NP_001 SLICLESSIFEALRLSSYSTTIRFVEEDLTLSSETG-DYCVRKGDLVAIFPPV-LHGDPE
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pF1KE5 IH--PEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLF
: :: ::.
NP_001 IFEAPEQTVLTGETRGMEITELSNLYFCTAYSREKWRRERRKIHTHILVYLIILQ
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initn: 272 init1: 151 opt: 340 Z-score: 411.3 bits: 85.2 E(85289): 3.6e-16
Smith-Waterman score: 340; 24.7% identity (58.9% similar) in 360 aa overlap (7-360:3-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
... ...: : : : .:... .:: :: .::.: .. : : .::...
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10 20 30 40 50
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: :.: .::: :. .::: . ... .::. .:.:: ....: .. . ..: .
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pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
:: .. .. .:.... . . : . : ..: ..: . . :. .
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120 130 140 150 160 170
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:.: . ... . . : : . . : . . . ......:::: .:. :..::.
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XP_011 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
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.. : :
XP_011 VITRKVVKPVEILVVCSVRGSDVYYFNTL
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>>XP_005249228 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxychole (420 aa)
initn: 345 init1: 151 opt: 340 Z-score: 410.6 bits: 85.2 E(85289): 3.9e-16
Smith-Waterman score: 431; 25.6% identity (57.1% similar) in 445 aa overlap (7-443:3-417)
10 20 30 40 50 60
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... ...: : : : .:... .:: :: .::.: .. : : .::...
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10 20 30 40 50
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pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGY-RSV-QG
: :.: .::: :. .::: . ... .::. .:.:: ....: .. . ..: .
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pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
:: .. .. .:.... . . : . : ..: ..: . . :. .
XP_005 LHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHG-TMDLNNLVRHLLYPVTVNM
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:.: . ... . . : : . . : . . . ......:::: .:. :..::.
XP_005 FEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWT
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: :.:.::. .:. : ..:.:.: :... . :.. .. : ::.::.:
XP_005 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
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pF1KE5 TLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGS
.. : : .: .:.. ::.: : :. .: .: ::: .:: .:. . :
XP_005 VITRKV-----VKPVEILNYIIPSGDLLMLSPFW-LHRNPKYFPEPELFKPERWKKANLE
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pF1KE5 RK--VDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPL
.. .: : : .::: ::.:
XP_005 KHSFLDCF----------MAFGSGKFQCPARKGF
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pF1KE5 PHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
>>NP_057677 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol 7-alpha (469 aa)
initn: 428 init1: 151 opt: 340 Z-score: 410.0 bits: 85.3 E(85289): 4.2e-16
Smith-Waterman score: 519; 26.5% identity (58.0% similar) in 498 aa overlap (7-496:3-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
... ...: : : : .:... .:: :: .::.: .. : : .::...
NP_057 MELISPTVIIILGCLALFLLLQRKNLRRPPCIKGWIPWIGVGFEFGKAPLEFIEKA
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pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGY-RSV-QG
: :.: .::: :. .::: . ... .:: ..:.:: ....: .. . ..: .
NP_057 RIKYGPIFTVFAMGNRMTFVTEEEGINVFLK--SKKVDFELAVQNIVYRTASIPKNVFLA
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pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
:: .. .. .:.... . . : . : ..: ..: . . :. .
NP_057 LHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHG-TMDLNNLVRHLLYPVTVNM
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 LFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGR-LQRL
::. :::. .: : ... : ... : .. .:. :: :.: . . . .:
NP_057 LFNK---SLFSTNKKKIKEFHQYFQVYDEDFEYGSQLPE---CLL--RNWSKSKKWFLEL
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pF1KE5 FHKML-SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWA
:.: . ... . . : : . . : . . . ......:::: .:. :..::.
NP_057 FEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWT
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pF1KE5 LLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAP
: :.:.::. .:. : ..:.:.: :... . :.. .. : ::.::.:
NP_057 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
290 300 310 320 330 340
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pF1KE5 TLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGS
.. : : .: .:.. ::.: : :. .: .: ::: .:: .:. . :
NP_057 VITRKV-----VKPVEILNYIIPSGDLLMLSPFW-LHRNPKYFPEPELFKPERWKKANLE
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pF1KE5 RK--VDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPL
.. .: : : .::: ::.:.::: ::.. :.:.. ..: :.:: :
NP_057 KHSFLDCF----------MAFGSGKFQCPARWFALLEVQMCIILILYKYDCSLLDP---L
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pF1KE5 PHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
:. . . :. :: . :..:.
NP_057 PKQSYLHL-VGVPQPEGQCRIEYKQRI
450 460
>>XP_016866410 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxychole (471 aa)
initn: 345 init1: 151 opt: 340 Z-score: 410.0 bits: 85.3 E(85289): 4.3e-16
Smith-Waterman score: 431; 25.6% identity (57.1% similar) in 445 aa overlap (7-443:3-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
... ...: : : : .:... .:: :: .::.: .. : : .::...
XP_016 MELISPTVIIILGCLALFLLLQRKNLRRPPCIKGWIPWIGVGFEFGKAPLEFIEKA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGY-RSV-QG
: :.: .::: :. .::: . ... .::. .:.:: ....: .. . ..: .
XP_016 RIKYGPIFTVFAMGNRMTFVTEEEGINVFLKS--KKVDFELAVQNIVYRTASIPKNVFLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
:: .. .. .:.... . . : . : ..: ..: . . :. .
XP_016 LHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHG-TMDLNNLVRHLLYPVTVNM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGR-LQRL
::. :::. .: : ... : ... : .. .:. :: :.: . . . .:
XP_016 LFNK---SLFSTNKKKIKEFHQYFQVYDEDFEYGSQLPE---CLL--RNWSKSKKWFLEL
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FHKML-SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWA
:.: . ... . . : : . . : . . . ......:::: .:. :..::.
XP_016 FEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWT
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 LLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAP
: :.:.::. .:. : ..:.:.: :... . :.. .. : ::.::.:
XP_016 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGS
.. : : .: .:.. ::.: : :. .: .: ::: .:: .:. . :
XP_016 VITRKV-----VKPVEILNYIIPSGDLLMLSPFW-LHRNPKYFPEPELFKPERWKKANLE
350 360 370 380 390
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pF1KE5 RK--VDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPL
.. .: : : .::: ::.:
XP_016 KHSFLDCF----------MAFGSGKFQCPARKTNRKEQHEPPDFFRNCSLQSEESHYSRQ
400 410 420 430 440
480 490 500
pF1KE5 PHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
XP_016 SHIKLYDLNGGIRRRVFSVEENFFE
450 460 470
501 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:53:09 2016 done: Tue Nov 8 05:53:11 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]