Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5680
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5680, 519 aa
1>>>pF1KE5680 519 - 519 aa - 519 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0421+/-0.000825; mu= 14.4976+/- 0.049
mean_var=76.3699+/-15.278, 0's: 0 Z-trim(108.0): 70 B-trim: 83 in 1/51
Lambda= 0.146762
statistics sampled from 9879 (9950) to 9879 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 3464 743.0 2e-214
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 1879 407.4 2e-113
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 1674 363.9 2.2e-100
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 1004 222.1 1.1e-57
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 966 214.0 3.1e-55
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 962 213.2 4.9e-55
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 921 204.5 2e-52
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 904 200.9 3e-51
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 742 166.7 1e-40
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 716 161.2 4.3e-39
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 665 150.3 4.7e-36
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 603 137.2 4.3e-32
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 583 133.0 1e-30
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 577 131.7 2e-30
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 572 130.6 3.7e-30
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 571 130.4 4.6e-30
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 563 128.7 1.8e-29
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 550 126.0 1e-28
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 540 123.9 5e-28
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 500 115.4 1.7e-25
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 500 115.4 1.8e-25
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 500 115.4 1.9e-25
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 500 115.4 1.9e-25
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 500 115.4 1.9e-25
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 500 115.4 1.9e-25
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 419 98.3 2.8e-20
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 419 98.3 2.8e-20
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 400 94.2 3.9e-19
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 395 93.2 9.6e-19
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 395 93.2 9.8e-19
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 390 92.1 2e-18
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 382 90.4 6.5e-18
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 307 74.5 3.1e-13
>>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa)
initn: 3464 init1: 3464 opt: 3464 Z-score: 3963.3 bits: 743.0 E(32554): 2e-214
Smith-Waterman score: 3464; 99.6% identity (100.0% similar) in 519 aa overlap (1-519:1-519)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPMPSRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MPMPSRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 STMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LAISPYYVSLAVSEEPPEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 YGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQN
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YGDMVPRSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQN
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE5 TGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
490 500 510
>>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa)
initn: 1907 init1: 1303 opt: 1879 Z-score: 2149.6 bits: 407.4 E(32554): 2e-113
Smith-Waterman score: 1879; 62.6% identity (84.6% similar) in 447 aa overlap (35-474:34-480)
10 20 30 40 50
pF1KE5 SRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDA-----SPVDLKK
.::: .:::.... : .: : ..
CCDS13 LPGDNSDYDYSALSCTSDASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 EILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSA
.:.::::: .: :::.:::.:::.::..:. : ....:...::::: .::::::.:.:
CCDS13 RIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLH
::.:..:: :::: ::.::::::::::: :::: : ::. :: :. :.:.::. :... .
CCDS13 FGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVERE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RED--VLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVS
.:: . . :... :: .: : :: :::.::: :.::::::::::::.:::..:::.
CCDS13 EEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNI
: :::.:.:: ::.::.::. :. .::::..::.:::::: ::..:: .: :...::..
CCDS13 LSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 IDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGL
::..:: :::..: :. : .:.:::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 QTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMT
::::::.:::::::::::::: :::.::.::.:: :.: . ::::::: ::::.:.::
CCDS13 QTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 TVGYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRH
:::::::::.:.:::.:::::::::::.::::.::::::::.::::::.:::... :
CCDS13 TVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQ
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KE5 LQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
CCDS13 FLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN
490 500 510
>>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa)
initn: 1703 init1: 747 opt: 1674 Z-score: 1915.7 bits: 363.9 E(32554): 2.2e-100
Smith-Waterman score: 1674; 57.5% identity (78.8% similar) in 449 aa overlap (59-506:17-458)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 SPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKL
....::::: : : :..: : ::.:: .:
CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERL
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 RLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELA
: ::........::::: . .:::::::: :: .::..: :::: ::. :::.:..:::
CCDS12 RACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELA
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 YWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLR
::::.::.:::::::.: :. :: : : : : . .: :::
CCDS12 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEARAGPTER--GAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 EMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETI
..:.::.::: ::.:::.:. :::.:::.::.:::::.::::..:::: :: .:..::.
CCDS12 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 CVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSY
::::::.:: :: .::..:: :...:::::::::. :.:::: .. :.:..
CCDS12 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAG-----PGGTKL
230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 LEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPL
::..:::::.:::::.:::::::::::::..::::.:::.:::::::::: ::..::.::
CCDS12 LERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPL
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 VYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAF
:..::.: : .:.:.:::::::.:::::::::::::.:.:::.:::::::::::.:::
CCDS12 VHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAF
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 PATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLDPHVASEHE-LMNDVNDL
:.::::::::.:: :::..:.. . ::. . : : . . : .: :
CCDS12 PVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADA
400 410 420 430 440 450
510
pF1KE5 ILEGPALPIMHM
CCDS12 LWVRAGR
460
>>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa)
initn: 863 init1: 358 opt: 1004 Z-score: 1148.9 bits: 222.1 E(32554): 1.1e-57
Smith-Waterman score: 1004; 38.6% identity (70.1% similar) in 435 aa overlap (51-476:8-428)
30 40 50 60 70
pF1KE5 SPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKK-EILINVGGRRYLLPWSTLDR
:.: .... :: ::::: . : :: :
CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLR
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 FPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMC
:: .::..: ::.: : :..::::::. ..::.:::.: : .. : .::: .. :.:
CCDS62 FPETRLGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELC
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 ALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLL-RKLEELEEL--AKLHREDVLRQQRETRRPASH
..::..:. ::::.: .. :: . ::.: .: . .:.. . : .
CCDS62 VFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYND
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 SSRW-GLCMNRLREMV----ENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEED
.:.. : .. .:... .:: .. ..::. :::: : . ...:....::.. ..
CCDS62 ASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 QGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLA
::. .. . ::: . .:::..:. ::. : : .::.. ::.::...: :.:..:.
CCDS62 QGNPGEDPRF-EIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLV
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 VSEEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREF
:. . :. : ..: : .::: .::. ...::::: ::..:: :.. .:
CCDS62 VNLVVE---STPT----LANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEV
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 GLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPG
:::::.:.:.:..:: ..:. ::: .. : ..::: .::: .:::::::::.:: .. :
CCDS62 GLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGL--ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAG
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 QMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLD
...: . ::.:::....: : ::. ::: : ..:.::.. .:
CCDS62 KLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFY----RRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVN
390 400 410 420 430 440
500 510
pF1KE5 PHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
CCDS62 LRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
450 460 470
>>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa)
initn: 910 init1: 354 opt: 966 Z-score: 1105.2 bits: 214.0 E(32554): 3.1e-55
Smith-Waterman score: 966; 39.1% identity (67.8% similar) in 422 aa overlap (54-465:10-417)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 SQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLS
: . .. . .:::: . . ::: ::: .
CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHT
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 RLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSF
::.:: :.: : :..:::::. ..:..:::.:: : ...: .::: ...:.:..::
CCDS16 RLGKLLTCHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSF
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KE5 QEELAYWGIEEAHLERCCL-RKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQR-------ETRRPAS
.:. ::::.: .. :: : :: :. :. . .:: .. : .
CCDS16 CQEIEYWGINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKF
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 HSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGEC
. :.: ... .::: : .:..: :. : .. :..:: .: ... :. ::
CCDS16 DTLRFGQLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GEV
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 SRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVS--
. . :: :.:::. :. .:.. : . .:...::::::...: :.:..:::.
CCDS16 DDPV--LEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTK
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 EEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGL
:: :: .:..: :...:: .::. ...:::::.::..:: :.:. .: ::
CCDS16 EEESED---------IENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGL
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 LLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQM
:::::.:.:..:: :.: .::.. .. .:::: .::: :::::::::: : .. :..
CCDS16 LLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDD-HTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKL
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 VALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLDPH
.: . :. :::..:.: : ::. ::. : . :
CCDS16 IASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYA
390 400 410 420 430 440
500 510
pF1KE5 VASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
CCDS16 QRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK
450 460 470 480 490
>>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa)
initn: 1085 init1: 284 opt: 962 Z-score: 1101.6 bits: 213.2 E(32554): 4.9e-55
Smith-Waterman score: 1152; 44.0% identity (70.7% similar) in 416 aa overlap (61-465:11-409)
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 METPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRL
...:::: :: : : ::: :.:.:.
CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG
10 20 30 40
100 110 120 130 140
pF1KE5 CRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAA-GKLVLLQEMCALSFQEELAY
::: ......:::::.. .:.:::: ::: :. .. . ::: . .:: ::: .:. :
CCDS42 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 WGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRP----ASHSSRWGLCMN
::.: :::: :: :.: .. . . . . :: :. :: :. : :: ..
CCDS42 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVL--GRDEARPGGAEAAPSRRW---LE
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 RLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLR-AEEDQGECSRKCYYIFI
:.:. :.: :.: ....: .:..:: .. : ::.::.:: : : :. . . :
CCDS42 RMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSR---I
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 VETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPS
.:.::..::. : .::. ...::.: . ::::::.:::.:::.:. .. :.
CCDS42 IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGEN-----
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 GSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITL
: :...:..::::: .::..:..:::: .::::::::..:: ::. .::.:. ::...
CCDS42 --SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAI
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430
pF1KE5 FSPLVYVAEKESGRVLE-----FTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSI
:: : . :. : :: ::::::. ::.:::::::::::: : .:::.... .
CCDS42 FSALSQLLEH--GLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCV
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 LSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLDPHVASEHE
.:::...:.: : :.:.: . : :::
CCDS42 VSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
390 400 410 420
>>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa)
initn: 940 init1: 291 opt: 921 Z-score: 1054.5 bits: 204.5 E(32554): 2e-52
Smith-Waterman score: 1144; 43.4% identity (69.6% similar) in 424 aa overlap (61-465:11-420)
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 METPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRL
...:::: :: : : ::: :.:.:.
CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG
10 20 30 40
100 110 120 130 140
pF1KE5 CRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAA-GKLVLLQEMCALSFQEELAY
::: ......:::::.. .:.:::: ::: :. .. . ::: . .:: ::: .:. :
CCDS18 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 WGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRP----ASHSSRWGLCMN
::.: :::: :: :.: .. . . . . :: :. :: :. : :: ..
CCDS18 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVL--GRDEARPGGAEAAPSRRW---LE
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 RLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLR-AEEDQGECSRKCYYIF-
:.:. :.: :.: ....: .:..:: .. : ::.::.:: : : :. . . :
CCDS18 RMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310
pF1KE5 -------IVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEP
:.:.::..::. : .::. ...::.: . ::::::.:::.:::.:. ..
CCDS18 PGREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFT
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 PEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLL
:. : :...:..::::: .::..:..:::: .::::::::..:: ::. .::.
CCDS18 GEN-------SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLV
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 FLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLE-----FTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPG
:. ::...:: : . :. : :: ::::::. ::.:::::::::::: : .:::
CCDS18 FICVAMAIFSALSQLLEH--GLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPG
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 QMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLD
.... ..:::...:.: : :.:.: . : :::
CCDS18 RILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
390 400 410 420 430
500 510
pF1KE5 PHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
>>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa)
initn: 654 init1: 344 opt: 904 Z-score: 1033.5 bits: 200.9 E(32554): 3e-51
Smith-Waterman score: 904; 34.4% identity (65.4% similar) in 456 aa overlap (52-499:90-544)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 PWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFP
..: : . . .::::. : : . : ::
CCDS64 DGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFP
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 LSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCAL
.::..: : . ..:::::.:...:.::::.:..: .. .: .: :..:. .:
CCDS64 KTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPR
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 SFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSR-W
: :::.:::.. . ::: . .. .:: : :...: . : : . .. : .
CCDS64 RFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFY
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 GLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCY
: :: ...:.: :.. .:... : :: ...:.: ..:. ... . ::: .
CCDS64 GPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLR
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KE5 YIFI-VETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPED
:. :: .:...:.::. ::.... : .: .. ::..:..:: : :..: . :
CCDS64 PILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEG
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 GKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLA
.: . . . ::: ::::.: .::. ...::::: ::...:.:.:.: .. : ::::.:
CCDS64 HQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIA
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 VAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSI
..: :: :: .:.. . .::.:: :.::: .:..::::::: :.. :.. :. :
CCDS64 MGIFTFSAAVYSVEHDVPST-NFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCI
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 LSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQN-----TGPASECEL-LDPH
::.. ..: . ... :: : .:: . : : : .:: : .:.
CCDS64 AFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQ
480 490 500 510 520 530
500 510
pF1KE5 VASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
.. ..:
CCDS64 LTPRQEN
540
>>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa)
initn: 835 init1: 401 opt: 742 Z-score: 844.6 bits: 166.7 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 1169; 39.2% identity (70.1% similar) in 485 aa overlap (31-502:1-466)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPMPSRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDL---
: . :: . :.. .: :::.
CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRS
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ---KKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFD
.... ::::: . . : ::::.: .::.::: : ..: ....::::. . .:.:::
CCDS62 KTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFD
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 RSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEE
: :.:: :..: .::: ...::::::: .:: ::::.: .:: :: . .: :...:
CCDS62 RHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNR---LREMVENPQSGLPGKVFACLSILFV
.:.:: ..:: .. . : .. : ...:.:.:.. .:..: .::::.
CCDS62 --ELRREAETMREREGEEFDNTC-----CPDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFI
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFF
. ....: ..:.:.:. .. :. . . . ::..:.:::..:. :::... .: .::
CCDS62 VLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDN-RQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFF
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KE5 QGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLE--KVGLVLRVLRALRILYVMR
.::::.::.::: ::::.. ..: :..: :. .: :....: .::: ...
CCDS62 KGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTE---------SNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILK
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 LARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASY
::::: :::.::.:.:: :.:::.::::..: .:: ::. :::. . .:::::::.
CCDS62 LARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDED-ATKFTSIPASF
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 WWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQE
::: :.::::::::. :... :..:. ..:.:..:.: : ..::. : : :....
CCDS62 WWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510
pF1KE5 QLQAR--LRHLQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
.. : :.. . .: .: : : ::..
CCDS62 AIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAF-ARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSR
440 450 460 470 480 490
CCDS62 WKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQ
500 510 520 530 540 550
>>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa)
initn: 1005 init1: 397 opt: 716 Z-score: 815.3 bits: 161.2 E(32554): 4.3e-39
Smith-Waterman score: 1135; 38.2% identity (71.3% similar) in 477 aa overlap (38-504:4-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 GGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDL------KKEI
:. . :....: :... ....
CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFG
.:::: . . : ::::.: .::.::: : ... ....::::. :..:.:::: :.::
CCDS13 RLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFT
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHRE
:..: .:.: ...:::::::..:: ::::.: .:: :: . .: :...: .:.::
CCDS13 SILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE--ELKRE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVS
..:: .. . . ..: ...:.:.:.. .:..: .::.:.. ....: ..
CCDS13 AETLREREGEEFDNTCC--AEKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLN
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDIL
:.:.:.. .. :. : . ::..:.:::..:. :::... : .::.:::: ::.:
CCDS13 TLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KE5 AISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLE--KVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQT
:: ::::.. ..: :..: :. .: :....: .::: ...::::: :::.
CCDS13 AILPYYVTIFLTE---------SNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQS
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTV
::.:.:: :.:::.::::..: .:: ::. :::. . .: :::::.::: :.::::
CCDS13 LGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDT-KFKSIPASFWWATITMTTV
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 GYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQAR--LRH
::::. :... :..:. ..:.:..:.: : ..::. : : :.... .. : :..
CCDS13 GYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALER
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510
pF1KE5 LQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
. .: .. : . : :.:. :
CCDS13 AKRNGSIVSMNMKDAFARSI-EMMDIVVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSE
440 450 460 470 480 490
519 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:48:16 2016 done: Tue Nov 8 05:48:17 2016
Total Scan time: 3.590 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]