FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5676, 579 aa
1>>>pF1KE5676 579 - 579 aa - 579 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5636+/-0.00126; mu= 19.2281+/- 0.076
mean_var=143.0034+/-26.399, 0's: 0 Z-trim(106.4): 111 B-trim: 42 in 1/49
Lambda= 0.107251
statistics sampled from 8869 (8979) to 8869 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS64882.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 716) 1803 291.7 2.1e-78
CCDS34884.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 735) 1803 291.7 2.1e-78
CCDS64883.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 672) 1801 291.4 2.5e-78
CCDS83287.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 715) 818 139.3 1.6e-32
CCDS6113.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 739) 818 139.3 1.6e-32
CCDS6112.1 ADAM9 gene_id:8754|Hs108|chr8 ( 819) 780 133.5 1e-30
CCDS47846.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 787) 774 132.5 1.9e-30
CCDS58103.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 742) 671 116.6 1.1e-25
CCDS31319.2 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 824) 671 116.6 1.2e-25
CCDS34865.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 775) 654 114.0 7.2e-25
CCDS6045.1 ADAM7 gene_id:8756|Hs108|chr8 ( 754) 646 112.7 1.7e-24
CCDS9804.1 ADAM21 gene_id:8747|Hs108|chr14 ( 722) 645 112.5 1.8e-24
CCDS7654.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 738) 622 109.0 2.2e-23
CCDS7653.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 909) 622 109.1 2.5e-23
CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5 ( 918) 601 105.9 2.4e-22
CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 633) 590 103.9 6.1e-22
CCDS3823.1 ADAM29 gene_id:11086|Hs108|chr4 ( 820) 591 104.2 6.4e-22
CCDS1088.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 772) 590 104.1 6.9e-22
CCDS58032.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 796) 590 104.1 7e-22
CCDS1084.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 814) 590 104.1 7.1e-22
CCDS58031.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 824) 590 104.1 7.2e-22
CCDS1086.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 838) 590 104.1 7.3e-22
CCDS1085.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 839) 590 104.1 7.3e-22
CCDS44236.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 862) 590 104.1 7.4e-22
CCDS1087.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 863) 590 104.1 7.4e-22
CCDS63219.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 812) 589 103.9 7.9e-22
CCDS13058.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 813) 589 103.9 7.9e-22
CCDS2369.1 ADAM23 gene_id:8745|Hs108|chr2 ( 832) 587 103.6 1e-21
CCDS43610.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 859) 587 103.7 1e-21
CCDS43609.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 870) 587 103.7 1e-21
CCDS43608.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 899) 587 103.7 1e-21
CCDS47637.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 906) 587 103.7 1e-21
CCDS47830.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 540) 574 101.4 3.1e-21
CCDS82139.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 ( 569) 553 98.2 3e-20
CCDS11486.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 ( 769) 553 98.3 3.7e-20
CCDS58102.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 733) 541 96.4 1.3e-19
CCDS55225.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 182) 486 87.1 2e-17
CCDS83286.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 688) 413 76.6 1.1e-13
CCDS907.1 ADAM30 gene_id:11085|Hs108|chr1 ( 790) 352 67.2 8.5e-11
>>CCDS64882.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 (716 aa)
initn: 2341 init1: 1774 opt: 1803 Z-score: 1521.1 bits: 291.7 E(32554): 2.1e-78
Smith-Waterman score: 3331; 78.6% identity (78.6% similar) in 641 aa overlap (76-579:76-716)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 SYKIVIEGKPYTVNLMQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SYKIVIEGKPYTVNLMQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSV
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 VMVSTCTGLRGVLQFENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VMVSTCTGLRGVLQFENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSF
110 120 130 140 150 160
170
pF1KE5 KLQSVE------------------------------------------------------
::::::
CCDS64 KLQSVEYNHMGSDTTVVAQKVFQLIGLTNAIFVSFNITIILSSLELWIDENKIATTGEAN
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 -----------------------------------------------------HPRTISL
:::::::
CCDS64 ELLHTFLRWKTSYLVLRPHDVAFLLVYREKSNYVGATFQGKMCDANYAGGVVLHPRTISL
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ESLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ESLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFIS
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAG
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SNCAEGPCCENCLFMSKERMCRPSFEECDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SNCAEGPCCENCLFMSKERMCRPSFEECDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWIC
410 420 430 440 450 460
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 IDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCEAD------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCEADNLQCGK
470 480 490 500 510 520
420 430 440
pF1KE5 ------------------------GHLCIAVEFASDHADSQKMWIKDGTSCGSNKVCRNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LICKYVGKFLLQIPRATIIYANISGHLCIAVEFASDHADSQKMWIKDGTSCGSNKVCRNQ
530 540 550 560 570 580
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 RCVSSSYLGYDCTTDKCNDRGVCNNKKHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RCVSSSYLGYDCTTDKCNDRGVCNNKKHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPV
590 600 610 620 630 640
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 AIPARLPERRYIENIYHSKPMRWPFFLFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWRTEDYSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AIPARLPERRYIENIYHSKPMRWPFFLFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWRTEDYSSD
650 660 670 680 690 700
570
pF1KE5 EQPESESEPKG
:::::::::::
CCDS64 EQPESESEPKG
710
>--
initn: 492 init1: 492 opt: 492 Z-score: 424.8 bits: 88.8 E(32554): 2.4e-17
Smith-Waterman score: 492; 100.0% identity (100.0% similar) in 75 aa overlap (1-75:1-75)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MWRVLFLLSGLGGLRMDSNFDSLPVQITVPEKIRSIIKEGIESQASYKIVIEGKPYTVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MWRVLFLLSGLGGLRMDSNFDSLPVQITVPEKIRSIIKEGIESQASYKIVIEGKPYTVNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQF
:::::::::::::::
CCDS64 MQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQF
70 80 90 100 110 120
>>CCDS34884.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 (735 aa)
initn: 2339 init1: 1774 opt: 1803 Z-score: 1521.0 bits: 291.7 E(32554): 2.1e-78
Smith-Waterman score: 3150; 75.7% identity (75.7% similar) in 641 aa overlap (95-579:95-735)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQFENVS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQFENVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 YGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVE-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVEPQQDFAKYIEMHV
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ------------------------------------------------------------
CCDS34 IVEKQLYNHMGSDTTVVAQKVFQLIGLTNAIFVSFNITIILSSLELWIDENKIATTGEAN
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 -----------------------------------------------------HPRTISL
:::::::
CCDS34 ELLHTFLRWKTSYLVLRPHDVAFLLVYREKSNYVGATFQGKMCDANYAGGVVLHPRTISL
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ESLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ESLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFIS
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAG
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SNCAEGPCCENCLFMSKERMCRPSFEECDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SNCAEGPCCENCLFMSKERMCRPSFEECDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWIC
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 IDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCEAD------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCEADNLQCGK
490 500 510 520 530 540
420 430 440
pF1KE5 ------------------------GHLCIAVEFASDHADSQKMWIKDGTSCGSNKVCRNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LICKYVGKFLLQIPRATIIYANISGHLCIAVEFASDHADSQKMWIKDGTSCGSNKVCRNQ
550 560 570 580 590 600
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 RCVSSSYLGYDCTTDKCNDRGVCNNKKHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RCVSSSYLGYDCTTDKCNDRGVCNNKKHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPV
610 620 630 640 650 660
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 AIPARLPERRYIENIYHSKPMRWPFFLFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWRTEDYSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AIPARLPERRYIENIYHSKPMRWPFFLFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWRTEDYSSD
670 680 690 700 710 720
570
pF1KE5 EQPESESEPKG
:::::::::::
CCDS34 EQPESESEPKG
730
>--
initn: 635 init1: 635 opt: 635 Z-score: 544.3 bits: 111.0 E(32554): 5.4e-24
Smith-Waterman score: 635; 100.0% identity (100.0% similar) in 94 aa overlap (1-94:1-94)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MWRVLFLLSGLGGLRMDSNFDSLPVQITVPEKIRSIIKEGIESQASYKIVIEGKPYTVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MWRVLFLLSGLGGLRMDSNFDSLPVQITVPEKIRSIIKEGIESQASYKIVIEGKPYTVNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVEHPRTISLES
CCDS34 ENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVEPQQDFAKYI
130 140 150 160 170 180
>>CCDS64883.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 (672 aa)
initn: 2118 init1: 1753 opt: 1801 Z-score: 1519.7 bits: 291.4 E(32554): 2.5e-78
Smith-Waterman score: 2909; 74.0% identity (74.0% similar) in 611 aa overlap (95-579:95-672)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQFENVS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQFENVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 YGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVE-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVEPQQDFAKYIEMHV
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ------------------------------------------------------------
CCDS64 IVEKQLYNHMGSDTTVVAQKVFQLIGLTNAIFVSFNITIILSSLELWIDENKIATTGEAN
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 -----------------------------------------------------HPRTISL
:::::::
CCDS64 ELLHTFLRWKTSYLVLRPHDVAFLLVYREKSNYVGATFQGKMCDANYAGGVVLHPRTISL
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ESLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ESLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFIS
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAG
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 SNCAEGPCCENCLFMSKERMCRPSFEECDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SNCAEGPCCENCLFMSKERMCRPSFEECDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWIC
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 IDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCEADGHLCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCE--------
490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 VEFASDHADSQKMWIKDGTSCGSNKVCRNQRCVSSSYLGYDCTTDKCNDRGVCNNKKHCH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 -------------------------VCRNQRCVSSSYLGYDCTTDKCNDRGVCNNKKHCH
540 550 560 570
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 CSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPVAIPARLPERRYIENIYHSKPMRWPFFLFIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPVAIPARLPERRYIENIYHSKPMRWPFFLFIP
580 590 600 610 620 630
540 550 560 570
pF1KE5 FFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWRTEDYSSDEQPESESEPKG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWRTEDYSSDEQPESESEPKG
640 650 660 670
>--
initn: 635 init1: 635 opt: 635 Z-score: 544.7 bits: 110.9 E(32554): 5.1e-24
Smith-Waterman score: 635; 100.0% identity (100.0% similar) in 94 aa overlap (1-94:1-94)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MWRVLFLLSGLGGLRMDSNFDSLPVQITVPEKIRSIIKEGIESQASYKIVIEGKPYTVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MWRVLFLLSGLGGLRMDSNFDSLPVQITVPEKIRSIIKEGIESQASYKIVIEGKPYTVNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVEHPRTISLES
CCDS64 ENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESRDLSFKLQSVEPQQDFAKYI
130 140 150 160 170 180
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50 60 70 80 90 100
pF1KE5 KIVIEGKPYTVNLMQKNFLPHNFRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVM
:: .. .. :. :::::: .:.: :
CCDS83 IITIDGQPYTLHLGKQSFLPQNFLVYTYNETGSLHSVSPYFMMHCHYQGYAAEFPNSFVT
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 VSTCTGLRGVLQFENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLY--NEKDIESRDLSF
.: :.:::: :::::.::::::.:::. :::.:::.:.. .::. : . : ..: .
CCDS83 LSICSGLRGFLQFENISYGIEPVESSARFEHIIYQMKNNDPNVSILAVNYSHIWQKDQPY
110 120 130 140 150 160
170
pF1KE5 K--------------------------------------LQSVE----------------
: :.:.:
CCDS83 KVPLNSQIKNLSKLLPQYLEIYIIVEKALMFTQFKLTVILSSLELWSNENQISTSGDADD
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 ----------------------------HPR------------------------TISLE
::. .:.::
CCDS83 ILQRFLAWKRDYLILRPHDIAYLLVYRKHPKYVGATFPGTVCNKSYDAGIAMYPDAIGLE
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFISK
...::.::::.:..:.:::::..: : :.:::: ::. :: :::::::..:. .:.::
CCDS83 GFSVIIAQLLGLNVGLTYDDITQCFCLRATCIMNHEAVSASGRKIFSNCSMHDYRYFVSK
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAGS
...::.. :.:. ..: ::::. ::..::::::....: . . ::: ::..:..
CCDS83 FETKCLQKLSNLQPLHQNQPVCGNGILESNEECDCGNKNECQF--KKCCDYNTCKLKGSV
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 NCAEGPCCEN-CLFMSKERMCRPSFE-ECDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWI
.:. :::: . : . :: :.. :::. :::::.:..: . :. .:. : :.
CCDS83 KCGSGPCCTSKCELSIAGTPCRKSIDPECDFTEYCNGTSSNCVPDTYALNGRLCKLGTAY
410 420 430 440 450 460
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CIDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCE-------
: .: :.. :.::. ::: .. .: :....:: . : :::...: ::
CCDS83 CYNGQCQTTDNQCAKIFGKGAQGAPFACFKEVNSLHERSENCGFKNSQPLPCERKDVLCG
470 480 490 500 510 520
420 430 440
pF1KE5 -------------ADG----------HLCIAVEFASD-HAD-SQKMWIKDGTSCGSNKVC
.:. :.:... .:. ..: ... .. ::: :: . :
CCDS83 KLACVQPHKNANKSDAQSTVYSYIQDHVCVSIATGSSMRSDGTDNAYVADGTMCGPEMYC
530 540 550 560 570 580
450 460 470 480 490 500
pF1KE5 RNQRCVSSSYLGYDCT-TDKCNDRGVCNNKKHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGN
:. : . .::.:. : ::. .:.::: .:.: .. ::::. : ::::::.::
CCDS83 VNKTCRKVHLMGYNCNATTKCKGKGICNNFGNCQCFPGHRPPDCKFQFGS-PGGSIDDGN
590 600 610 620 630 640
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 FPPVAIPARLPERRYIENIYHSKPMRW---PFFLFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWR
: . : :. :... : : .:.::::.: ..: ... . ..
CCDS83 FQKSG-------DFYTEKGYNTHWNNWFILSFCIFLPFFIVFTTVIFKRNEISKSCNREN
650 660 670 680 690
570
pF1KE5 TEDYSSDEQPESESEPKG
.: :. . . :::. :
CCDS83 AE-YNRNSSVVSESDDVGH
700 710
>>CCDS6113.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 (739 aa)
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150 160 170 180 190 200
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.: .:.::...::.::::.:..:.:::::.
CCDS61 LLVYRKHPKYVGATFPGTVCNKSYDAGIAMYPDAIGLEGFSVIIAQLLGLNVGLTYDDIT
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210 220 230 240 250 260
pF1KE5 KCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFISKQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVC
.: : :.:::: ::. :: :::::::..:. .:.:: ...::.. :.:. ..: ::
CCDS61 QCFCLRATCIMNHEAVSASGRKIFSNCSMHDYRYFVSKFETKCLQKLSNLQPLHQNQPVC
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 GNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAGSNCAEGPCCEN-CLFMSKERMCR
::. ::..::::::....: . . ::: ::..:.. .:. :::: . : . ::
CCDS61 GNGILESNEECDCGNKNECQF--KKCCDYNTCKLKGSVKCGSGPCCTSKCELSIAGTPCR
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:.. :::. :::::.:..: . :. .:. : :. : .: :.. :.::. ::: ..
CCDS61 KSIDPECDFTEYCNGTSSNCVPDTYALNGRLCKLGTAYCYNGQCQTTDNQCAKIFGKGAQ
460 470 480 490 500 510
380 390 400 410
pF1KE5 FGPSECYSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCE--------------------ADG------
.: :....:: . : :::...: :: .:.
CCDS61 GAPFACFKEVNSLHERSENCGFKNSQPLPCERKDVLCGKLACVQPHKNANKSDAQSTVYS
520 530 540 550 560 570
420 430 440 450 460
pF1KE5 ----HLCIAVEFASD-HAD-SQKMWIKDGTSCGSNKVCRNQRCVSSSYLGYDCT-TDKCN
:.:... .:. ..: ... .. ::: :: . : :. : . .::.:. : ::.
CCDS61 YIQDHVCVSIATGSSMRSDGTDNAYVADGTMCGPEMYCVNKTCRKVHLMGYNCNATTKCK
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pF1KE5 DRGVCNNKKHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPVAIPARLPERRYIENIYHS
.:.::: .:.: .. ::::. : ::::::.::: . : :. :..
CCDS61 GKGICNNFGNCQCFPGHRPPDCKFQFGS-PGGSIDDGNFQKSG-------DFYTEKGYNT
640 650 660 670 680
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pF1KE5 KPMRW---PFFLFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWRTEDYSSDEQPESESEPKG
. : : .:.::::.: ..: ... . .. .: :. . . :::. :
CCDS61 HWNNWFILSFCIFLPFFIVFTTVIFKRNEISKSCNRENAE-YNRNSSVVSESDDVGH
690 700 710 720 730
>--
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:. .: ::. :: :. . ... ...:::.::.: .: : . : :.:.:.:::..:
CCDS61 MFLLLALLTELGRLQAHEGSEGIFLHVTVPRKIKSNDSEVSERKMIYIITIDGQPYTLHL
10 20 30 40 50 60
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...:::.:: ::.:. :: .. .. :. :::::: .:.: : .: :.:::: :::
CCDS61 GKQSFLPQNFLVYTYNETGSLHSVSPYFMMHCHYQGYAAEFPNSFVTLSICSGLRGFLQF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 ENVSYGIEPLESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLY--NEKDIESRDLSFKLQSVEHPRTISL
::.::::::.:::. :::.:::.:.. .::. : . : ..: .:. : . ..
CCDS61 ENISYGIEPVESSARFEHIIYQMKNNDPNVSILAVNYSHIWQKDQPYKV-----PLNSQI
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..:. .: : : .
CCDS61 KNLSKLLPQYLEIYIIVEKALYDYMGSEMMAVTQKIVQVIGLVNTMFTQFKLTVILSSLE
180 190 200 210 220 230
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CCDS61 KKGFGGTAGMAFVGTVCSRSHAGGINVFGQITVETFASIVAHELGHNLGMNHDDGRDCSC
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.. :::: : :: . ::.:: ::: .. .. ..:: : :. : .. . :::
CCDS61 GAKSCIMNSGA---SGSRNFSSCSAEDFEKLTLNKGGNCLLNIPKPDEAYSAPS-CGNKL
370 380 390 400 410 420
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pF1KE5 LEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAGSNCAEGPCCENCLFMSKERMCRPSFEE
..::::::::: ..: : . ::. .::..:. ..:: : ::..: :. .:: . :
CCDS61 VDAGEECDCGTPKECEL--DPCCEGSTCKLKSFAECAYGDCCKDCRFLPGGTLCRGKTSE
430 440 450 460 470
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::.:::::::: : . ..:.:.:: :. : .:.:. : :: ::.... .:..:
CCDS61 CDVPEYCNGSSQFCQPDVFIQNGYPCQNNKAYCYNGMCQYYDAQCQVIFGSKAKAAPKDC
480 490 500 510 520 530
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pF1KE5 YSHLNSKTDVSGNCGISDSGYTQCEADGHLC---------------IAVEFASDHADSQK
. ..::: : ::::.: . : .: . . :: :. . . . . :
CCDS61 FIEVNSKGDRFGNCGFSGNEYKKCATGNALCGKLQCENVQEIPVFGIVPAIIQTPSRGTK
540 550 560 570 580 590
440 450 460 470
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: ...::.::..:.::: .::..: :.::: ..: :. .::::..
CCDS61 CWGVDFQLGSDVPDPGMVNEGTKCGAGKICRNFQCVDASVLNYDCDVQKKCHGHGVCNSN
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480 490 500 510 520 530
pF1KE5 KHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSGNFPPVAIPARLPERRYIENIYHSKPMRWPFF
:.::: .. ::.: ... :::.::: : ... .. . . ::
CCDS61 KNCHCENGWAPPNCETKGY---GGSVDSG-----------PTYNEMNTALRDGLLVF-FF
660 670 680 690 700
540 550 560 570
pF1KE5 LFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQR---KKWRTEDYSSD--EQPESESEPKG
:..: .: :... .. . .. : .: :.. : :: .: . .:
CCDS61 LIVP--LIVCAIFIFIKRDQLWRSYFRKKRSQTYESDGKNQANPSRQPGSVPRHVSPVTP
710 720 730 740 750 760
CCDS61 PREVPIYANRFAVPTYAAKQPQQFPSRPPPPQPKVSSQGNLIPARPAPAPPLYSSLT
770 780 790 800 810
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pF1KE5 FRVYSYSGTGIMKPLDQDFQNFCHYQGYIEGYPKSVVMVSTCTGLRGVLQFENVSYGIEP
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CCDS47 NFMIYLYNQGSMNTYSSDIQTQCYYQGNIEGYPDSMVTLSTCSGLRGILQFENVSYGIEP
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160
pF1KE5 LESSVGFEHVIYQVKHKKADVSLYNEKDIESR-----------------DL---------
:::.: :.::.:..:.. :.... ..... . ::
CCDS47 LESAVEFQHVLYKLKNEDNDIAIFIDRSLKEQPMDDNIFISEKSEPAVPDLFPLYLEMHI
140 150 160 170 180 190
170
pF1KE5 ---------------------------------SFK----LQSVE---------------
.:: :.:.:
CCDS47 VVDKTLYDYWGSDSMIVTNKVIEIVGLANSMFTQFKVTIVLSSLELWSDENKISTVGEAD
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 -----------------------------------------------------HPRTISL
.:. :.:
CCDS47 ELLQKFLEWKQSYLNLRPHDIAYLLIYMDYPRYLGAVFPGTMCITRYSAGVALYPKEITL
260 270 280 290 300 310
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pF1KE5 ESLAVILAQLLSLSMGITYDDINKCQCSGAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFIS
:..:::..:.:.::.::.::: .::::: ..::::::... .::: ::.::...: .:::
CCDS47 EAFAVIVTQMLALSLGISYDDPKKCQCSESTCIMNPEVVQSNGVKTFSSCSLRSFQNFIS
320 330 340 350 360 370
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pF1KE5 KQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAKLEAGEECDCGTEQDCALIGETCCDIATCRFKAG
. .::.:.:... . . ::::..::..: :::::: .:. .:::. :: .: :
CCDS47 NVGVKCLQNKPQMQKK-SPKPVCGNGRLEGNEICDCGTEAQCG--PASCCDFRTCVLKDG
380 390 400 410 420
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..: .: ::..: .... ::: . :::. : :::.: : . . .: : :..:
CCDS47 AKCYKGLCCKDCQILQSGVECRPKAHPECDIAENCNGTSPECGPDITLINGLSCKNNKFI
430 440 450 460 470 480
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pF1KE5 CIDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSECYSHLNSKTDVSGNCGIS-DSGYTQC-------
: :: : . : .: ..::: . .: :: ...:..: :::: . .. :. :
CCDS47 CYDGDCHDLDARCESVFGKGSRNAPFACYEEIQSQSDRFGNCGRDRNNKYVFCGWRNLIC
490 500 510 520 530 540
410 420 430 440
pF1KE5 --------------EADGHL---------CIAVEFASDHADSQKMWIKDGTSCGSNKVCR
. .: . ::.:.. .. . . .:.:..: ..::
CCDS47 GRLVCTYPTRKPFHQENGDVIYAFVRDSVCITVDYKLPRTVPDPLAVKNGSQCDIGRVCV
550 560 570 580 590 600
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pF1KE5 NQRCVSSSYL---GYDCTTDKCNDRGVCNNKKHCHCSASYLPPDCSVQSDLWPGGSIDSG
:..:: : . .. :. ..:. .:::.....:::: .: ::.:...: : ::
CCDS47 NRECVESRIIKASAHVCS-QQCSGHGVCDSRNKCHCSPGYKPPNCQIRSK---GFSI---
610 620 630 640 650 660
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pF1KE5 NFPPVAIPARLPERRYIENIYHSKPMRW--PFFLFIPFFIIFCVLIAIMVKVNFQRKKWR
:: . . .: . : :.. .:..:. . .: . : :::
CCDS47 -FPEEDMGS------IMERASGKTENTWLLGFLIALPILIV----TTAIVLARKQLKKWF
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570
pF1KE5 TEDYSSDEQPESESEPKG
... .: : :::. .:
CCDS47 AKE---EEFPSSESKSEGSTQTYASQSSSEGSTQTYASQTRSESSSQADTSKSKSEDSAE
720 730 740 750 760
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initn: 725 init1: 251 opt: 671 Z-score: 574.3 bits: 116.6 E(32554): 1.1e-25
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160 170 180 190 200
pF1KE5 SLYNEKDIESRDLSFKLQSVEHPRTISLESLAVILAQLLSLSMGITYDD-INKCQCS---
.: .:. .. ..:. .:. .. :.:.
CCDS58 GTTVGFARVSAMCSHSSGAVNQDHSKNPVGVACTMAHEMGHNLGMDHDENVQGCRCQERF
300 310 320 330 340 350
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pF1KE5 -GAVCIMNPEAIHFSGVKIFSNCSFEDFAHFISKQKSQCLHNQPRLDPFFKQQAVCGNAK
.. ::: .: : ..::.:: . :. . .: :: : : :. . ::::
CCDS58 EAGRCIMAG-SIGSSFPRMFSDCSQAYLESFLERPQSVCLANAPDLSHLVGGP-VCGNLF
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.: ::.:::: .:: . ::. .::.. :..::.: ::..: ..:::. .
CCDS58 VERGEQCDCGPPEDCR---NRCCNSTTCQLAEGAQCAHGTCCQECKVKPAGELCRPKKDM
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pF1KE5 CDLPEYCNGSSASCPENHYVQTGHPCGLNQWICIDGVCMSGDKQCTDTFGKEVEFGPSEC
::: :.:.: :::. . ..: :: . : .:.: . .:: .: . . :
CCDS58 CDLEEFCDGRHPECPEDAFQENGTPC--SGGYCYNGACPTLAQQCQAFWGPGGQAAEESC
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.:. :. .: : : ::.. . .::. : : :. . .
CCDS58 FSY-----DILPGCKASRYRADMCGVLQCKGGQQPLGRAICIVDVCHALTTEDGTAYEPV
540 550 560 570 580
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.:: :: .::: . :: . : . .:.. .:...::::.:..::: :.. :: :.
CCDS58 PEGTRCGPEKVCWKGRCQDLHVYRSSNCSA-QCHNHGVCNHKQECHCHAGWAPPHCAKLL
590 600 610 620 630 640
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:.. : .. :. :. : :
CCDS58 TEVHAGCQPRAGQGRGS-SPIQGPPRAGPHHPPGPARPTPGLLGGSEEAAPCSSGHCVQP
650 660 670 680 690 700
>>CCDS31319.2 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 (824 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]