Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5672
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5672, 545 aa
1>>>pF1KE5672 545 - 545 aa - 545 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9420+/-0.000855; mu= 15.8142+/- 0.052
mean_var=95.0751+/-18.456, 0's: 0 Z-trim(108.7): 98 B-trim: 61 in 1/50
Lambda= 0.131535
statistics sampled from 10256 (10363) to 10256 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 3.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 3683 709.5 2.6e-204
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 1017 203.5 4.7e-52
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 989 198.2 1.8e-50
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 926 186.3 7.7e-47
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 904 182.1 1.4e-45
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 829 167.8 2.3e-41
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 806 163.4 4.9e-40
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 750 152.9 8.6e-37
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 726 148.3 1.9e-35
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 682 140.1 1.1e-32
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 676 139.0 2.2e-32
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 633 130.6 4.1e-30
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 606 125.5 1.4e-28
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 585 121.6 2.3e-27
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 565 117.7 3e-26
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 553 115.5 1.7e-25
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 553 115.6 1.9e-25
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 535 112.1 1.7e-24
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 534 111.9 2.2e-24
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 523 109.8 8e-24
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 417 89.7 1.1e-17
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 417 89.7 1.1e-17
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 408 88.1 4.1e-17
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 404 87.2 5.5e-17
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 404 87.2 5.6e-17
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 404 87.3 5.9e-17
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 404 87.3 5.9e-17
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 404 87.3 6e-17
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 404 87.3 6.1e-17
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 400 86.5 8.8e-17
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 392 84.9 2.5e-16
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 392 85.0 2.7e-16
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 376 82.0 2.4e-15
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 368 80.4 6.9e-15
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 368 80.5 7e-15
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 364 79.7 1.2e-14
>>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa)
initn: 3683 init1: 3683 opt: 3683 Z-score: 3781.5 bits: 709.5 E(32554): 2.6e-204
Smith-Waterman score: 3683; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLKQSERRRSWSYRPWNTTENEGSQHRRSICSLGARSGSQASIHGWTEGNYNYYIEEDED
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CCDS64 MLKQSERRRSWSYRPWNTTENEGSQHRRSICSLGARSGSQASIHGWTEGNYNYYIEEDED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFYG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 GIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLT
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PRQEN
:::::
CCDS64 PRQEN
>>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa)
initn: 1025 init1: 496 opt: 1017 Z-score: 1048.0 bits: 203.5 E(32554): 4.7e-52
Smith-Waterman score: 1102; 42.3% identity (70.5% similar) in 414 aa overlap (99-504:17-417)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT
.:.:::: . ..: : ::.::::.: :
CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLT
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW
:. : ::::: ::.:::.:..:. : ::: .: : :.. :: : .:. ::
CCDS16 CHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYW
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 GVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQ--HELRAQAQVEEAE------ELFRDMRFYG
:. . :: ..::..: :. : :.. .... ::. : : .:: :
CCDS16 GINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRF-G
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRP
:...: ::.: ..:: :...: . ::.:.::. .... :.:...:. . :
CCDS16 QLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNEDGEVDD-----P
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGH
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CCDS16 VLEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVD--TKE--
230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAM
.... . ..::: :.: :::::::::::::::.:::..: :::. :..:: ::::...
CCDS16 EESEDIENMGKVVQIL---RLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 GIFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAF
:: ::. .::::.: ....:.:: ::::..:..:::::: .: : :...: ::
CCDS16 GISIFSVLIYSVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIIC
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 GIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLT
::.. ..::.:..:::: ::.: :
CCDS16 GILVVALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFIT
400 410 420 430 440 450
>>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa)
initn: 1008 init1: 301 opt: 989 Z-score: 1019.4 bits: 198.2 E(32554): 1.8e-50
Smith-Waterman score: 989; 38.9% identity (67.5% similar) in 416 aa overlap (99-507:19-424)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT
. .:::: . .: : ::.::::::
CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW
:: : :::::.. :..:::.: .: : .:: .: : :. :: : .:. ::
CCDS62 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 GVRLKYTPRCCRICFEERRDE-LSERLKIQHELRAQ-AQVEEAEELFRDM-RFYGPQ---
:. . :: .. :. : .:. : . .. .. .: .. : .: :
CCDS62 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 -RRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRPI
::.:: ...: :: ...... : :. :.... ::.. ..: ..::. : : :
CCDS62 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGED--PR
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGHQ
.: :: . ...::.: . :.: .::. .: ..::::.::..:.:.:. :... . .
CCDS62 FEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVV----E
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 RGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAMG
:....:.:.:::: ::::::::::::::::::..: ::. :..:: :::....:
CCDS62 STPTLANLGRVAQVLR---LMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVG
290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 IFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFG
: ::...:..:.. . ...::: ::::.::..::::::. : : :.. : :: :
CCDS62 ISIFSVVAYTIEKE-ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 IILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLTP
:.. .::....:::: .: . : :
CCDS62 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS
400 410 420 430 440 450
>>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa)
initn: 594 init1: 594 opt: 926 Z-score: 954.4 bits: 186.3 E(32554): 7.7e-47
Smith-Waterman score: 926; 34.6% identity (66.0% similar) in 465 aa overlap (85-545:51-513)
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IEEDEDGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCE
.:. .: . .:::: .:.: .
CCDS13 DASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTT
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAGFPKTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLD
: :: ::::.: . :. . :..::::. .:.::::.:..: . .: .: : .:
CCDS13 LDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLR
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRA-QAQVEEAEELF
.: : ::: :::. . ::. . .. .:..: .. ..: : ... ...:
CCDS13 EMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 RDMRFYGPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGE
. : ::: ...:.: :.. .:... : :: :..: :...:. .... ::.
CCDS13 EGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGH
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLE
. . .. :: .:.:.:.::.:::: ..:. : :: :.:.::::::: :. ::..
CCDS13 CSQMCHNVFI-VESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVD
270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGC
.. .. : . . ::: ::::.: .::. ...::::: ::...:.: :.: .. :
CCDS13 GAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGL
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 LLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVP-STNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRF
::::. ..: :. .: .:... : .::.:: .:::.....::::::: :.. :.
CCDS13 LLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQV
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 FAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKA-YEYTTIRRERGEVNFM-QRARKKIAE
:. : ::.: ..:.. ... :: : .:: : . .:: . .. : . .. ..
CCDS13 VALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSD
440 450 460 470 480 490
540
pF1KE5 CLLGSNPQLTPRQEN
:.:: . : :..:
CCDS13 ILFGSASSDT-RDNN
500 510
>>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa)
initn: 654 init1: 344 opt: 904 Z-score: 931.7 bits: 182.1 E(32554): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 904; 34.4% identity (65.8% similar) in 456 aa overlap (90-544:52-499)
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 DGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFP
..: : . . .::::. : : . : ::
CCDS10 PWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFP
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPR
.::..: : . ..:::::.:...:.::::.:..: .. .: .: :..:. .:
CCDS10 LSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCAL
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFY
: :::.:::.. . ::: . .. .:: : :...: . : : . .. : .
CCDS10 SFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSR-W
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLR
: :: ...:.: :.. .:... : :: ...:.: ..:. ... . ::: .
CCDS10 GLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCY
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 PILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEG
:. :: .:...:.::. ::.... : .: .. ::..:..:: : :..: . :
CCDS10 YIFI-VETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPED
270 280 290 300 310
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CCDS10 GERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLA
320 330 340 350 360 370
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pF1KE5 MGIFTFSAAVYSVEHDVPST-NFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCI
..: :: :: .:.. . .::.:: :.::: .:..::::::: :.. :.. :. :
CCDS10 VAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRSVPGQMVALSSI
380 390 400 410 420 430
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pF1KE5 AFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQ
::.. ..: . ... :: : .:: . : : .: . .:: : .:.
CCDS10 LSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLR----HLQNT-GPASECEL-LDPH
440 450 460 470 480 490
540
pF1KE5 LTPRQEN
.. ..:
CCDS10 VASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
500 510
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:. : .::::... .:::::: .: .. . . : : .: : .:.
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:.:: :. .:.: ::.::. .. .: .::.::.:.: .:. . .. ...... :
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: .: .:.:.:: : ..:. . . .:.. ::..::.:: : :...:. :::
CCDS42 RSRI---IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTG
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:. : . ..: .:::.:.:::: ..::::: ::...:.::..::... ::.:
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: ... ::: .:: :. ..: ::.:: . ::. .:..::::::::: : ::..
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pF1KE5 AFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLL
. .:.. ::.: ..::...:..: . : .::
CCDS42 GGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
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540
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CCDS18 HGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEM
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:::.. . :: .:: :..:.. . . . ..: : :: :
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:.:: :. .:.: ::.::. .. .: .::.::.:.: .:. . .. ......
CCDS18 PSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDD
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:: .: .: .:.:.:: : ..:. . . .:.. ::..::.:: : :.
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..:. ::::. : . ..: .:::.:.:::: ..::::: ::...:.::..::
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CCDS18 REMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMY
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: : ::... .:.. ::.: ..::...:..: . : .::
CCDS18 PITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
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.: : :.. :: ::.:. :::. ::: . :: :::: : .... . : .
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::. .:: .:..:...:: :..::. . : :: :.. :..::.::
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::.:. ::.: ..: .::. . .::....:.::.: .:.:::.:::::::..:.:
CCDS63 LPFYITLLVESLSG-----SQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMT
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. :::..:: ::::...:: ::.. : .:...:.:.::..: .::::..:..::::::.
CCDS63 ITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDI
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:.: :.. ::.:: ::.. ..::.:. ..:: : :: : .. .::
CCDS63 RPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNI
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pF1KE5 ARKKIAECLLGSNPQLTPRQEN
CCDS63 ATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF
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CCDS12 GHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGI
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..: :..:.: .. .: .:: :..:.: :.:. ... . .:: .: : .. .: .:.
CCDS12 DNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFV-LETVCV
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..:..:.::: .. . : :. ::..:..:.::.:..::: .: : : . .
CCDS12 AWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPG---GTKL--LE
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..: :::..: .:.. ...::::: :::..:.:.:.: .. : ::::. ... :. :.
CCDS12 RAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVH
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.:... . .:...: :.:::..:..::::::: :.. :. :. : ::.: ..:.
CCDS12 LAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPV
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. ... :: ::.::
CCDS12 TSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALW
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CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKI
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CCDS62 NVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSI
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::: .: : ... .: : .:: :::. : ::. .........:.:. . :
CCDS62 LNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETM
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. .:.::. : .:..::.:.::: :::::: ....: :...:..::.:::
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CCDS62 LPELQETDEFGQLN-DNRQ-LAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLL
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CCDS62 FTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYG
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:.::.: ::.. . :: :... ..:: :. :.::..:.. : : . ::: .
CCDS62 DIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREA-----L
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.::..
CCDS62 ERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]