Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5669
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5669, 534 aa
1>>>pF1KE5669 534 - 534 aa - 534 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2258+/-0.000356; mu= 19.6742+/- 0.022
mean_var=81.5816+/-16.323, 0's: 0 Z-trim(115.4): 15 B-trim: 73 in 2/52
Lambda= 0.141997
statistics sampled from 25828 (25840) to 25828 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 7.580
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_116035 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 ( 534) 3592 745.8 7.7e-215
NP_001317382 (OMIM: 608855) protein tweety homolog ( 513) 3280 681.8 1.3e-195
NP_443101 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 ( 213) 1445 305.6 9.8e-83
NP_079526 (OMIM: 608919) protein tweety homolog 3 ( 523) 1379 292.4 2.2e-78
XP_011513837 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein twe ( 526) 1332 282.8 1.8e-75
NP_065710 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 ( 450) 1227 261.2 4.7e-69
NP_001188390 (OMIM: 605784) protein tweety homolog ( 451) 1227 261.2 4.8e-69
NP_001005367 (OMIM: 605784) protein tweety homolog ( 460) 1147 244.8 4.1e-64
XP_016882515 (OMIM: 605784) PREDICTED: protein twe ( 365) 1005 215.7 2e-55
XP_016882514 (OMIM: 605784) PREDICTED: protein twe ( 375) 925 199.3 1.7e-50
XP_016868145 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein twe ( 491) 777 169.1 2.9e-41
XP_016868144 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein twe ( 494) 730 159.4 2.3e-38
>>NP_116035 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 isof (534 aa)
initn: 3592 init1: 3592 opt: 3592 Z-score: 3978.1 bits: 745.8 E(85289): 7.7e-215
Smith-Waterman score: 3592; 99.8% identity (99.8% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 VVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTEGQISTEVTRYYLYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTEGQISTEVTRYYLYC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSESSLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 SQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSESSLHQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHFTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 LTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHFTTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 NRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPVSE
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 NRDYDDIDDDDPFNPQAWRMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPVSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE5 YMNQAMLFGRNPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 YMNQAMLFGRNPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
490 500 510 520 530
>>NP_001317382 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 i (513 aa)
initn: 3280 init1: 3280 opt: 3280 Z-score: 3632.9 bits: 681.8 E(85289): 1.3e-195
Smith-Waterman score: 3280; 99.8% identity (99.8% similar) in 491 aa overlap (44-534:23-513)
20 30 40 50 60 70
pF1KE5 VVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNLIFLVAYLVCACHC
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSVVGQDRKSGSGCYLRWLLFLSLLFLGLVAAVCLGLNLIFLVAYLVCACHC
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 RRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQLMYSLDDANHTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQLMYSLDDANHTFS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 GIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGSVVVQLSGLPVWRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGSVVVQLSGLPVWRE
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 VTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKCLLASMLCCGALSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKCLLASMLCCGALSL
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 LLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTEGQISTEVTRYYLYCSQSGSSPFQQTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTEGQISTEVTRYYLYCSQSGSSPFQQTLT
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 TFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSESSLHQLTAMVDCRGLHKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSESSLHQLTAMVDCRGLHKD
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 YLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHFTTRNRDYDDIDDDDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHFTTRNRDYDDIDDDDPF
360 370 380 390 400 410
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 NPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPVSEYMNQAMLFGRNPR
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPQAWRMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPVSEYMNQAMLFGRNPR
420 430 440 450 460 470
500 510 520 530
pF1KE5 YENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
480 490 500 510
>>NP_443101 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 isof (213 aa)
initn: 1445 init1: 1445 opt: 1445 Z-score: 1606.3 bits: 305.6 E(85289): 9.8e-83
Smith-Waterman score: 1445; 99.5% identity (99.5% similar) in 213 aa overlap (322-534:1-213)
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 EVTRYYLYCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 MQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLL
10 20 30
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 NSSESSLHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 NSSESSLHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGP
40 50 60 70 80 90
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 RAWKHFTTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQ
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 RAWKHFTTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWRMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQ
100 110 120 130 140 150
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 TISNAPVSEYMNQAMLFGRNPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_443 TISNAPVSEYMNQAMLFGRNPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQ
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 FPA
:::
NP_443 FPA
>>NP_079526 (OMIM: 608919) protein tweety homolog 3 [Hom (523 aa)
initn: 1144 init1: 519 opt: 1379 Z-score: 1528.1 bits: 292.4 E(85289): 2.2e-78
Smith-Waterman score: 1379; 41.7% identity (72.6% similar) in 521 aa overlap (4-521:2-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
: :.: ::::: :: .:: : . ..: : : : .::..::.:: .: .::.:.:
NP_079 MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQ
.::. : : ::: . . . :: .: ...: :.: :...::::::.::.:: ..
NP_079 LFLLFYSFWLC-CRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGS
::: ::.: .:.. : :. .. : : : . .:.: . :.... .: . .
NP_079 ATYSLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLET
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKC
.. ...: ::.... : :..:. ..::::.:: :..::..:::.. .:: . ::
NP_079 LLGYTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 LLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTE--GQISTEVTRYYL
.:... :.:.:..::..:. . ...:..::::: ::... ...: . .: .. .:::
NP_079 ILVGVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEED-LLAIQLLLNSSESS
:: ...:::: :. ..::. :: :: ::. .:: . : .: :: .: .::..: .
NP_079 ACSPRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLR-TVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHF
:..:::.::::.:: ::..::.:.::::..::.::.::::..:: ::...:. :..:..
NP_079 LQHLTALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQ-
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 TTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAP
:. : : .. : .:. .: : : .. :. : .:. ::.::. :.:.::::
NP_079 -KRGPDEDGEEEAAP-GPR---QAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 VSEYMNQAMLFGRNPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
:.:::.: : .::: ::.::::: ::::.:. :::: ::...
NP_079 VTEYMSQNANF-QNPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSGSH
480 490 500 510 520
>>XP_011513837 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein tweety (526 aa)
initn: 1097 init1: 519 opt: 1332 Z-score: 1476.0 bits: 282.8 E(85289): 1.8e-75
Smith-Waterman score: 1338; 40.8% identity (70.7% similar) in 532 aa overlap (4-532:2-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
: :.: ::::: :: .:: : . ..: : : : .::..::.:: .: .::.:.:
XP_011 MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQ
.::. : : ::: . . . :: .: ...: :.: :...::::::.::.:: ..
XP_011 LFLLFYSFWLC-CRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGS
::: ::.: .:.. : :. .. : : : . .:.: . :.... .: . .
XP_011 ATYSLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLET
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKC
.. ...: ::.... : :..:. ..::::.:: :..::..:::.. .:: . ::
XP_011 LLGYTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 LLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTE--GQISTEVTRYYL
.:... :.:.:..::..:. . ...:..::::: ::... ...: . .: .. .:::
XP_011 ILVGVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEED-LLAIQLLLNSSESS
:: ...:::: :. ..::. :: :: ::. .:: . : .: :: .: .::..: .
XP_011 ACSPRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLR-TVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHF
:..:::.::::.:: ::..::.:.::::..::.::.::::..:: ::...:. :..:..
XP_011 LQHLTALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQ-
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 TTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAP
:. : : .. : .:. .: : : .. :. : .:. ::.::. :.:.::::
XP_011 -KRGPDEDGEEEAAP-GPR---QAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 VSEYMNQAMLFGRNPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
:.:::.: : .::: ::.::::: ::::. ::.. : : : ::
XP_011 VTEYMSQNANF-QNPRCENTPLIGRESPPPS-------RYLAALDSG-SHAGWQFKPMDS
480 490 500 510 520
XP_011 ARTLW
>>NP_065710 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 isof (450 aa)
initn: 818 init1: 545 opt: 1227 Z-score: 1360.6 bits: 261.2 E(85289): 4.7e-69
Smith-Waterman score: 1227; 43.5% identity (74.5% similar) in 428 aa overlap (13-436:12-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
:: ::..:.. ..:.:: :.:.: .. ::..::... .:.. :::.:
NP_065 MGAPPGYRPSAWVHLLHQLPRADFQLRPVPSVFAPQEQEYQQALLLVAALAGLGLGLSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTK--QHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGA
::...::. : :: . .: . . :.::. .:: : :...:.::::::::.::.
NP_065 IFIAVYLIRFCCCRPPEPPGSKIPSPGGGCVTWSCIVALLAGCTGIGIGFYGNSETSDGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YQLMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMA
:: .: ::::.: :: :: :.... .. .:. : :.. : . . . . ...:
NP_065 SQLSSALLHANHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GSVVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRS
... ::.:: :. : . ........:: ::::.:.::..:.:..::.. :::::.:
NP_065 EAAAQQLQGLAFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KCLLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVT--EGQISTEVTRY
: :. : . : :.:::.:.. ....::. :::: :: ..::.: : .:... :
NP_065 KWLVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YLYCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSES
:: :... :.:::: :: ::::.... :. :: . ::: : .:.. ::... :: .:.
NP_065 YLLCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SLHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKH
..:::.:.. ::.::::: :: :.: :.:.:::.: :::.:.: :..: .:. ::::
NP_065 NFHQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWAL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 FTTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNA
: . :::: :::::::::
NP_065 FPPSD-DYDDTDDDDPFNPQESKRFVQWQSSI
420 430 440 450
>>NP_001188390 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 i (451 aa)
initn: 818 init1: 545 opt: 1227 Z-score: 1360.6 bits: 261.2 E(85289): 4.8e-69
Smith-Waterman score: 1227; 43.5% identity (74.5% similar) in 428 aa overlap (13-436:12-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
:: ::..:.. ..:.:: :.:.: .. ::..::... .:.. :::.:
NP_001 MGAPPGYRPSAWVHLLHQLPRADFQLRPVPSVFAPQEQEYQQALLLVAALAGLGLGLSL
10 20 30 40 50
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pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTK--QHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGA
::...::. : :: . .: . . :.::. .:: : :...:.::::::::.::.
NP_001 IFIAVYLIRFCCCRPPEPPGSKIPSPGGGCVTWSCIVALLAGCTGIGIGFYGNSETSDGV
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:: .: ::::.: :: :: :.... .. .:. : :.. : . . . . ...:
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... ::.:: :. : . ........:: ::::.:.::..:.:..::.. :::::.:
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180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 KCLLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVT--EGQISTEVTRY
: :. : . : :.:::.:.. ....::. :::: :: ..::.: : .:... :
NP_001 KWLVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YLYCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSES
:: :... :.:::: :: ::::.... :. :: . ::: : .:.. ::... :: .:.
NP_001 YLLCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEG
300 310 320 330 340 350
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pF1KE5 SLHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKH
..:::.:.. ::.::::: :: :.: :.:.:::.: :::.:.: :..: .:. ::::
NP_001 NFHQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWAL
360 370 380 390 400 410
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pF1KE5 FTTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNA
: . :::: :::::::::
NP_001 FPPSD-DYDDTDDDDPFNPQQESKRFVQWQSSI
420 430 440 450
>>NP_001005367 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 i (460 aa)
initn: 738 init1: 528 opt: 1147 Z-score: 1271.9 bits: 244.8 E(85289): 4.1e-64
Smith-Waterman score: 1147; 42.4% identity (74.3% similar) in 413 aa overlap (13-421:12-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
:: ::..:.. ..:.:: :.:.: .. ::..::... .:.. :::.:
NP_001 MGAPPGYRPSAWVHLLHQLPRADFQLRPVPSVFAPQEQEYQQALLLVAALAGLGLGLSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTK--QHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGA
::...::. : :: . .: . . :.::. .:: : :...:.::::::::.::.
NP_001 IFIAVYLIRFCCCRPPEPPGSKIPSPGGGCVTWSCIVALLAGCTGIGIGFYGNSETSDGV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YQLMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMA
:: .: ::::.: :: :: :.... .. .:. : :.. : . . . . ...:
NP_001 SQLSSALLHANHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GSVVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRS
... ::.:: :. : . ........:: ::::.:.::..:.:..::.. :::::.:
NP_001 EAAAQQLQGLAFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KCLLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVT--EGQISTEVTRY
: :. : . : :.:::.:.. ....::. :::: :: ..::.: : .:... :
NP_001 KWLVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YLYCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSES
:: :... :.:::: :: ::::.... :. :: . ::: : .:.. ::... :: .:.
NP_001 YLLCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SLHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKH
..:::.:.. ::.::::: :: :.: :.:.:::.: :::.:.: :..: .:. ::::
NP_001 NFHQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWAL
360 370 380 390 400 410
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pF1KE5 FTTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNA
: ::
NP_001 FPPRNPSALCSGSRLSEPLLPAGLEPGSPLRSFPGCRRRPH
420 430 440 450 460
>>XP_016882515 (OMIM: 605784) PREDICTED: protein tweety (365 aa)
initn: 587 init1: 496 opt: 1005 Z-score: 1116.1 bits: 215.7 E(85289): 2e-55
Smith-Waterman score: 1005; 44.0% identity (73.9% similar) in 348 aa overlap (91-436:7-353)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQ
: . . :...:.::::::::.::. :
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pF1KE5 LMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGS
: .: ::::.: :: :: :.... .. .:. : :.. : . . . . ...: .
XP_016 LSSALLHANHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQAEA
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pF1KE5 VVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKC
.. ::.:: :. : . ........:: ::::.:.::..:.:..::.. :::::.::
XP_016 AAQQLQGLAFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQSKW
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pF1KE5 LLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVT--EGQISTEVTRYYL
:. : . : :.:::.:.. ....::. :::: :: ..::.: : .:... :::
XP_016 LVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSYYL
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pF1KE5 YCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSESSL
:... :.:::: :: ::::.... :. :: . ::: : .:.. ::... :: .:...
XP_016 LCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEGNF
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 HQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHFT
:::.:.. ::.::::: :: :.: :.:.:::.: :::.:.: :..: .:. :::: :
XP_016 HQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWALFP
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pF1KE5 TRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPV
. :::: :::::::::
XP_016 PSD-DYDDTDDDDPFNPQESKRFVQWQSSI
340 350 360
>>XP_016882514 (OMIM: 605784) PREDICTED: protein tweety (375 aa)
initn: 495 init1: 467 opt: 925 Z-score: 1027.3 bits: 199.3 E(85289): 1.7e-50
Smith-Waterman score: 925; 42.6% identity (73.6% similar) in 333 aa overlap (91-421:7-339)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQ
: . . :...:.::::::::.::. :
XP_016 MEKVRLWRGSESRAAICTGIGIGFYGNSETSDGVSQ
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGS
: .: ::::.: :: :: :.... .. .:. : :.. : . . . . ...: .
XP_016 LSSALLHANHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQAEA
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKC
.. ::.:: :. : . ........:: ::::.:.::..:.:..::.. :::::.::
XP_016 AAQQLQGLAFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQSKW
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290
pF1KE5 LLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVT--EGQISTEVTRYYL
:. : . : :.:::.:.. ....::. :::: :: ..::.: : .:... :::
XP_016 LVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSYYL
160 170 180 190 200 210
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pF1KE5 YCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEEDLLAIQLLLNSSESSL
:... :.:::: :: ::::.... :. :: . ::: : .:.. ::... :: .:...
XP_016 LCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEGNF
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 HQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHFT
:::.:.. ::.::::: :: :.: :.:.:::.: :::.:.: :..: .:. :::: :
XP_016 HQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWALFP
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 TRNRDYDDIDDDDPFNPQAWCMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPV
::
XP_016 PRNPSALCSGSRLSEPLLPAGLEPGSPLRSFPGCRRRPH
340 350 360 370
534 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]