Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5666
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5666, 520 aa
1>>>pF1KE5666 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9186+/-0.0009; mu= 14.5903+/- 0.054
mean_var=68.6085+/-13.671, 0's: 0 Z-trim(105.5): 25 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.154841
statistics sampled from 8427 (8451) to 8427 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 2.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14261.1 MAOB gene_id:4129|Hs108|chrX ( 520) 3498 790.7 0
CCDS14260.1 MAOA gene_id:4128|Hs108|chrX ( 527) 2630 596.8 2e-170
CCDS59163.1 MAOA gene_id:4128|Hs108|chrX ( 394) 1996 455.1 6.5e-128
CCDS12787.1 IL4I1 gene_id:259307|Hs108|chr19 ( 567) 396 97.8 3.6e-20
CCDS12786.1 IL4I1 gene_id:259307|Hs108|chr19 ( 589) 396 97.8 3.7e-20
>>CCDS14261.1 MAOB gene_id:4129|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 3498 init1: 3498 opt: 3498 Z-score: 4221.3 bits: 790.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3498; 99.6% identity (99.8% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEARDHVGGRTYTLRNQKVKYVDLGGSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEARDRVGGRTYTLRNQKVKYVDLGGSY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VGPTQNRILRLAKELGLETYKVNEVERLIHHVKGKSYPFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGPTQNRILRLAKELGLETYKVNEVERLIHHVKGKSYPFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 TMDDMGREIQSDAPWKAPLAEEWDNMTMKELLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEV
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TMDDMGREIPSDAPWKAPLAEEWDNMTMKELLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TRENVLVETLNHEMYEAKYVISAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TRENVLVETLNHEMYEAKYVISAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 YKEPFWRKKDYCGTMIIDGEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YKEPFWRKKDYCGTMIIDGEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 LKKLCELYAKVLGSLEALEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKKLCELYAKVLGSLEALEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 IYFAGTETATHWSGYMEGAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IYFAGTETATHWSGYMEGAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE5 FLERHLPSVPGLLRLIGLTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FLERHLPSVPGLLRLIGLTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV
490 500 510 520
>>CCDS14260.1 MAOA gene_id:4128|Hs108|chrX (527 aa)
initn: 2628 init1: 2593 opt: 2630 Z-score: 3173.3 bits: 596.8 E(32554): 2e-170
Smith-Waterman score: 2630; 72.8% identity (90.3% similar) in 514 aa overlap (6-519:15-526)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEARDHVGGRTYTLRNQKV
::::.::::::..::::: . :..:.::::::.:::::::.::..:
CCDS14 MENQEKASIAGHMFDVVVIGGGISGLSAAKLLTEYGVSVLVLEARDRVGGRTYTIRNEHV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 KYVDLGGSYVGPTQNRILRLAKELGLETYKVNEVERLIHHVKGKSYPFRGPFPPVWNPIT
:::.::.::::::::::::.::::.:::::: :::...::::.::::: ::::::::.
CCDS14 DYVDVGGAYVGPTQNRILRLSKELGIETYKVNVSERLVQYVKGKTYPFRGAFPPVWNPIA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YLDHNNFWRTMDDMGREIQSDAPWKAPLAEEWDNMTMKELLDKLCWTESAKQLATLFVNL
:::.::.:::.:.::.:: .::::.: :..::.::::::.::.:::..:...: ::::.
CCDS14 YLDYNNLWRTIDNMGKEIPTDAPWEAQHADKWDKMTMKELIDKICWTKTARRFAYLFVNI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CVTAETHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKL
::.: :::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS14 NVTSEPHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIFSVTNGGQERKFVGGSGQVSERIMDLLGDQVKL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ERPVIYIDQTRENVLVETLNHEMYEAKYVISAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPL
..:: ..::. .:...:::::: :: ::::.:::::: :::: : :: :::.: :.:.
CCDS14 NHPVTHVDQSSDNIIIETLNHEHYECKYVINAIPPTLTAKIHFRPELPAERNQLIQRLPM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GSVIKCIVYYKEPFWRKKDYCGTMIIDGEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARK
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CCDS14 GAVIKCMMYYKEAFWKKKDYCGCMIIEDEDAPISITLDDTKPDGSLPAIMGFILARKADR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LARLTKEERLKKLCELYAKVLGSLEALEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYG
::.: :: : ::.:::::::::: :::.::::::::::::::::::::.::::::.::::
CCDS14 LAKLHKEIRKKKICELYAKVLGSQEALHPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTAYFPPGIMTQYG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 RVLRQPVDRIYFAGTETATHWSGYMEGAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVD
::.:::: ::.::::::::.::::::::::::::::::.:...::. : .:: .:::: :
CCDS14 RVIRQPVGRIFFAGTETATKWSGYMEGAVEAGERAAREVLNGLGKVTEKDIWVQEPESKD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE5 VPAQPITTTFLERHLPSVPGLLRLIGLTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV
::: :: :: ::.:::: :::..::..: :.:::::. .: :: :
CCDS14 VPAVEITHTFWERNLPSVSGLLKIIGFST--SVTALGFVLYKYKLLPRS
490 500 510 520
>>CCDS59163.1 MAOA gene_id:4128|Hs108|chrX (394 aa)
initn: 1994 init1: 1959 opt: 1996 Z-score: 2409.9 bits: 455.1 E(32554): 6.5e-128
Smith-Waterman score: 1996; 72.2% identity (88.9% similar) in 395 aa overlap (125-519:1-393)
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 KSYPFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWRTMDDMGREIQSDAPWKAPLAEEWDNMTMKELLDK
::.:: .::::.: :..::.::::::.::
CCDS59 MGKEIPTDAPWEAQHADKWDKMTMKELIDK
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGGQERKFVGGS
.:::..:...: ::::. ::.: :::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::
CCDS59 ICWTKTARRFAYLFVNINVTSEPHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIFSVTNGGQERKFVGGS
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 GQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQTRENVLVETLNHEMYEAKYVISAIPPTLGMKIHF
:::::::::::::.:::..:: ..::. .:...:::::: :: ::::.:::::: ::::
CCDS59 GQVSERIMDLLGDQVKLNHPVTHVDQSSDNIIIETLNHEHYECKYVINAIPPTLTAKIHF
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 NPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVYYKEPFWRKKDYCGTMIIDGEEAPVAYTLDDTKPE
: :: :::.: :.:.:.::::..:::: ::.:::::: :::. :.::.. :::::::.
CCDS59 RPELPAERNQLIQRLPMGAVIKCMMYYKEAFWKKKDYCGCMIIEDEDAPISITLDDTKPD
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 GNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEERLKKLCELYAKVLGSLEALEPVHYEEKNWCEEQYS
:. ::::::::.:: .::.: :: : ::.:::::::::: :::.:::::::::::::::
CCDS59 GSLPAIMGFILARKADRLAKLHKEIRKKKICELYAKVLGSQEALHPVHYEEKNWCEEQYS
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 GGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDRIYFAGTETATHWSGYMEGAVEAGERAAREILHAM
:::::.::::::.::::::.:::: ::.::::::::.::::::::::::::::::.:...
CCDS59 GGCYTAYFPPGIMTQYGRVIRQPVGRIFFAGTETATKWSGYMEGAVEAGERAAREVLNGL
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 GKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTTFLERHLPSVPGLLRLIGLTTIFSATALGFLAHKR
::. : .:: .:::: :::: :: :: ::.:::: :::..::..: :.:::::. .:
CCDS59 GKVTEKDIWVQEPESKDVPAVEITHTFWERNLPSVSGLLKIIGFST--SVTALGFVLYKY
340 350 360 370 380
520
pF1KE5 GLLVRV
:: :
CCDS59 KLLPRS
390
>>CCDS12787.1 IL4I1 gene_id:259307|Hs108|chr19 (567 aa)
initn: 343 init1: 190 opt: 396 Z-score: 475.7 bits: 97.8 E(32554): 3.6e-20
Smith-Waterman score: 411; 24.4% identity (55.5% similar) in 488 aa overlap (7-475:62-527)
10 20 30
pF1KE5 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEAR
:.:::.:..:..:::.: :.: .:..:::
CCDS12 PFEKCMQDPDYEQLLKVVTWGLNRTLKPQRVIVVGAGVAGLVAAKVLSDAGHKVTILEAD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 DHVGGRTYTLRNQKVKYVDLGGSYVGPTQNRIL-RLAKELGLETYKVNEVER----LIHH
...::: .: :.:.. .. :.. :...::: .: . :::. : .. .. .:.
CCDS12 NRIGGRIFTYRDQNTGWIGELGAMRMPSSHRILHKLCQGLGLNLTKFTQYDKNTWTEVHE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140
pF1KE5 VKGKSY-----PFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWRTMDDMGREIQSDAPWKAPLAEEWDNM
:: ..: : . . . . .. . .... ..... . :: ....
CCDS12 VKLRNYVVEKVPEKLGYALRPQEKGHSPEDIYQMALNQALKDLKALGCRKA--MKKFERH
160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 TMKE-LLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGG
:. : :: . .. : :: ... .....: ... . . . ..
CCDS12 TLLEYLLGEGNLSRPAVQL---------LGDVMSEDGFFYLSFAEALRAHSCL---SDRL
210 220 230 240 250
210 220 230 240 250
pF1KE5 QERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQTRENVLVE------TLNHEMYEAKY
: ..::: . . ... :. : :. ::. . : ..: :. . : .. .:
CCDS12 QYSRIVGGWDLLPRALLSSLSGLVLLNAPVVAMTQGPHDVHVQIETSPPARNLKVLKADV
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 VI-SAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVYYKEPFWRKKDYCGTMIID
:. .: :.. .: :.:::: .. . :. . : .. ...::::.. : .
CCDS12 VLLTASGPAVK-RITFSPPLPRHMQEALRRLHYVPATKVFLSFRRPFWREEHIEGGH--S
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 GEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEERLKKLCELYAKVLGSL-EA
. . : . . :: . .. . : .: :..:: :. . : . : . .
CCDS12 NTDRPSRMIFYPPPREGALL-LASYTWSDAAAAFAGLSREEALRLALDDVAALHGPVVRQ
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 LEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDRIYFAGTETATHWSGYME
: : : :.:.: : ... ::.. : :::::: .:: . :..:
CCDS12 LWDGTGVVKRWAEDQHSQGGFVVQ-PPALWQTEKDDWTVPYGRIYFAGEHTA-YPHGWVE
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 GAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTTFLERHLPSVPGLLRLIG
::... ::: .: : : .. . : .. :. .:
CCDS12 TAVKSALRAAIKINSRKG--PASDTASPEGHASDMEGQGHVHGVASSPSHDLAKEEGSHP
500 510 520 530 540
500 510 520
pF1KE5 LTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV
CCDS12 PVQGQLSLQNTTHTRTSH
550 560
>>CCDS12786.1 IL4I1 gene_id:259307|Hs108|chr19 (589 aa)
initn: 343 init1: 190 opt: 396 Z-score: 475.4 bits: 97.8 E(32554): 3.7e-20
Smith-Waterman score: 411; 24.4% identity (55.5% similar) in 488 aa overlap (7-475:84-549)
10 20 30
pF1KE5 MSNKCDVVVVGGGISGMAAAKLLHDSGLNVVVLEAR
:.:::.:..:..:::.: :.: .:..:::
CCDS12 PFEKCMQDPDYEQLLKVVTWGLNRTLKPQRVIVVGAGVAGLVAAKVLSDAGHKVTILEAD
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 DHVGGRTYTLRNQKVKYVDLGGSYVGPTQNRIL-RLAKELGLETYKVNEVER----LIHH
...::: .: :.:.. .. :.. :...::: .: . :::. : .. .. .:.
CCDS12 NRIGGRIFTYRDQNTGWIGELGAMRMPSSHRILHKLCQGLGLNLTKFTQYDKNTWTEVHE
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140
pF1KE5 VKGKSY-----PFRGPFPPVWNPITYLDHNNFWRTMDDMGREIQSDAPWKAPLAEEWDNM
:: ..: : . . . . .. . .... ..... . :: ....
CCDS12 VKLRNYVVEKVPEKLGYALRPQEKGHSPEDIYQMALNQALKDLKALGCRKA--MKKFERH
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 TMKE-LLDKLCWTESAKQLATLFVNLCVTAETHEVSALWFLWYVKQCGGTTRIISTTNGG
:. : :: . .. : :: ... .....: ... . . . ..
CCDS12 TLLEYLLGEGNLSRPAVQL---------LGDVMSEDGFFYLSFAEALRAHSCL---SDRL
240 250 260 270
210 220 230 240 250
pF1KE5 QERKFVGGSGQVSERIMDLLGDRVKLERPVIYIDQTRENVLVE------TLNHEMYEAKY
: ..::: . . ... :. : :. ::. . : ..: :. . : .. .:
CCDS12 QYSRIVGGWDLLPRALLSSLSGLVLLNAPVVAMTQGPHDVHVQIETSPPARNLKVLKADV
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 VI-SAIPPTLGMKIHFNPPLPMMRNQMITRVPLGSVIKCIVYYKEPFWRKKDYCGTMIID
:. .: :.. .: :.:::: .. . :. . : .. ...::::.. : .
CCDS12 VLLTASGPAVK-RITFSPPLPRHMQEALRRLHYVPATKVFLSFRRPFWREEHIEGGH--S
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 GEEAPVAYTLDDTKPEGNYAAIMGFILAHKARKLARLTKEERLKKLCELYAKVLGSL-EA
. . : . . :: . .. . : .: :..:: :. . : . : . .
CCDS12 NTDRPSRMIFYPPPREGALL-LASYTWSDAAAAFAGLSREEALRLALDDVAALHGPVVRQ
400 410 420 430 440 450
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 LEPVHYEEKNWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGRVLRQPVDRIYFAGTETATHWSGYME
: : : :.:.: : ... ::.. : :::::: .:: . :..:
CCDS12 LWDGTGVVKRWAEDQHSQGGFVVQ-PPALWQTEKDDWTVPYGRIYFAGEHTA-YPHGWVE
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 GAVEAGERAAREILHAMGKIPEDEIWQSEPESVDVPAQPITTTFLERHLPSVPGLLRLIG
::... ::: .: : : .. . : .. :. .:
CCDS12 TAVKSALRAAIKINSRKG--PASDTASPEGHASDMEGQGHVHGVASSPSHDLAKEEGSHP
520 530 540 550 560 570
500 510 520
pF1KE5 LTTIFSATALGFLAHKRGLLVRV
CCDS12 PVQGQLSLQNTTHTRTSH
580
520 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:41:04 2016 done: Tue Nov 8 05:41:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]