Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5659
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5659, 493 aa
1>>>pF1KE5659 493 - 493 aa - 493 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3247+/-0.000385; mu= 18.0457+/- 0.024
mean_var=70.3955+/-14.121, 0's: 0 Z-trim(113.3): 183 B-trim: 423 in 1/52
Lambda= 0.152863
statistics sampled from 22327 (22513) to 22327 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 7.380
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 3355 749.3 5.8e-216
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 2015 453.8 5.2e-127
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 1988 447.8 3.2e-125
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 1972 444.3 3.7e-124
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 1972 444.3 3.7e-124
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 1938 436.8 6.8e-122
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 1694 382.9 9.4e-106
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 1694 382.9 9.4e-106
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 1671 377.9 3.6e-104
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 1671 377.9 4e-104
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 1611 364.7 3.5e-100
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 1610 364.4 4.1e-100
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 1586 359.1 1.3e-98
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 1576 356.9 7.3e-98
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 1553 351.9 2.5e-96
XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1441 327.2 6.8e-89
XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1441 327.2 6.8e-89
XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 1441 327.2 7.6e-89
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 1354 308.0 3.8e-83
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 1318 300.1 1e-80
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 1310 298.3 3e-80
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 1272 289.9 1.1e-77
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 1243 283.5 8.6e-76
XP_005258626 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 422) 1228 280.2 8.2e-75
XP_011524849 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 386) 1218 277.9 3.5e-74
XP_011524848 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 416) 1218 277.9 3.7e-74
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 1196 273.1 1.2e-72
XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 1162 265.6 2.2e-70
XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 1158 264.8 4.2e-70
NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 1154 263.9 7.6e-70
XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 1099 251.7 3.3e-66
XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 1091 250.0 1.3e-65
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 1067 244.7 4.6e-64
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 1010 232.0 1.8e-60
XP_011524855 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 456) 982 225.9 1.9e-58
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 976 224.6 4.6e-58
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 969 223.1 1.3e-57
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 969 223.1 1.4e-57
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 963 221.8 3.9e-57
NP_001122397 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 i ( 431) 930 214.4 5.1e-55
XP_011524857 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 415) 912 210.5 7.7e-54
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 879 203.2 1.1e-51
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 879 203.2 1.1e-51
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 879 203.2 1.1e-51
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 879 203.2 1.1e-51
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 879 203.2 1.1e-51
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 879 203.2 1.1e-51
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 879 203.2 1.1e-51
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 862 199.5 2.1e-50
NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 ( 446) 848 196.4 1.4e-49
>>NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precursor (493 aa)
initn: 3355 init1: 3355 opt: 3355 Z-score: 3998.2 bits: 749.3 E(85289): 5.8e-216
Smith-Waterman score: 3355; 99.6% identity (99.8% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLPAFHAHRDRGIIFNNGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLPAFHAHRDRGIIFNNGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNVI
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNVI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 EVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 ITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 FKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFGC
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARMELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFGC
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE5 IPPRYKLCVIPRS
:::::::::::::
NP_000 IPPRYKLCVIPRS
490
>>NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C19 p (490 aa)
initn: 2009 init1: 1640 opt: 2015 Z-score: 2401.2 bits: 453.8 E(85289): 5.2e-127
Smith-Waterman score: 2015; 57.5% identity (85.2% similar) in 485 aa overlap (8-491:5-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
:.:.. . :::.:.::: . .::::: :::.:::..:...:.. ::.: :
NP_000 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
.. .::::::: : .::::.:::..:::::.: .:::::: .: : .:.: ::.:.::
NP_000 SKIYGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
::.:::::: ::::.::::.. :.:.:.::. :.: ::::...: ::::..:::::::
NP_000 KRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
: .:.:.:.:::.:..:: :: .:::....::::.:. ::::... :.::.: :..::.
NP_000 ICSIIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
: .. . :.::::..:.: : :::. ::.:..:::::.. . .:......:.:::. :
NP_000 AFMESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
:::::::::::.::.:.:.::. :..:::.:::: .: : ..:: .::: ::::::.::
NP_000 GTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
.: :.:..::: .: :. ::.:::::::... .: :::.::.:::.:: : :.:::.:.:
NP_000 YIDLIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
.:: :.:: :::.:::.:.:::::: ::::.: :::.:::: :.::::.: .:. ::.
NP_000 NFKKSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFA
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 CIPPRYKLCVIPRS
.:: :.:: ::
NP_000 SVPPFYQLCFIPV
480 490
>>NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isoform (490 aa)
initn: 1986 init1: 1635 opt: 1988 Z-score: 2369.0 bits: 447.8 E(85289): 3.2e-125
Smith-Waterman score: 1988; 57.3% identity (83.7% similar) in 485 aa overlap (8-491:5-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
:::.. . :.:.:.::: . :: :: :::::::..::..:.. ::.: .
NP_000 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
.. .:::::.: : . .::.:::.::::::.:. .::::::..: : .... ::.:.::
NP_000 SKVYGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
::.:::: : ::::.::::.. :.:.:.::. :.: ::::...: ::::..:::::::
NP_000 KRWKEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
: ...:. .:::.:..:: :: ::::...::.::.:. ::::... :::::: :. .:
NP_000 ICSVIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
: .: :: ::.:::..::: : ::. ::.:..::.:::. . .:.... .::.:.: :
NP_000 AYIKSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
::::::::::::::.:.::::. :..:::. :.: .: : ..::..::: :::::::::
NP_000 GTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
.: :.:.:::: .: :. :..:::::::... .: :::....:::.:: : : :::...:
NP_000 YIDLLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
.:: :::: :::.:::.: :::::: ::::.: .:::.:::: :::::::..:: .::
NP_000 NFKKSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFG
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 CIPPRYKLCVIPRS
.:: :.:: ::
NP_000 RVPPLYQLCFIPV
480 490
>>NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C9 pr (490 aa)
initn: 1966 init1: 1612 opt: 1972 Z-score: 2349.9 bits: 444.3 E(85289): 3.7e-124
Smith-Waterman score: 1972; 57.5% identity (83.7% similar) in 485 aa overlap (8-491:5-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
:.:.. . :::.:.::: . .::::: :::.:::..:. .:.: ::.: :
NP_000 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
.. .::::::: : . .::.:::.::::::.: .:::::: .: : .:.: ::.:.::
NP_000 SKVYGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
::.:::::: ::::.::::.. :.:.:.::. :.: ::::...: ::::..:::::::
NP_000 KKWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
: .:.:.:.:::.:..:: :: .:::...::.::.:. ::: .. :.::.: :..:::
NP_000 ICSIIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
: .: :. :.::::..:.: : :.:. ::.:..::::::. .:.... :..::: :
NP_000 AFMKSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
:::::::::::.::.:.:.::. :..:::.:::: .: : ..::..::: ::::::.::
NP_000 GTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
.: :.:..::: .: : ::.:::::::... .: :::.::.:::.:: : :.:::.:.:
NP_000 YIDLLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
.:: : :: :::.:::.:.::.:: ::::.: .:::.:::: :::::..: .:. ::.
NP_000 NFKKSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFA
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 CIPPRYKLCVIPRS
.:: :.:: ::
NP_000 SVPPFYQLCFIPV
480 490
>>XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cytochro (490 aa)
initn: 1966 init1: 1612 opt: 1972 Z-score: 2349.9 bits: 444.3 E(85289): 3.7e-124
Smith-Waterman score: 1972; 57.5% identity (83.7% similar) in 485 aa overlap (8-491:5-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
:.:.. . :::.:.::: . .::::: :::.:::..:. .:.: ::.: :
XP_016 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
.. .::::::: : . .::.:::.::::::.: .:::::: .: : .:.: ::.:.::
XP_016 SKVYGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
::.:::::: ::::.::::.. :.:.:.::. :.: ::::...: ::::..:::::::
XP_016 KKWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
: .:.:.:.:::.:..:: :: .:::...::.::.:. ::: .. :.::.: :..:::
XP_016 ICSIIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
: .: :. :.::::..:.: : :.:. ::.:..::::::. .:.... :..::: :
XP_016 AFMKSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
:::::::::::.::.:.:.::. :..:::.:::: .: : ..::..::: ::::::.::
XP_016 GTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
.: :.:..::: .: : ::.:::::::... .: :::.::.:::.:: : :.:::.:.:
XP_016 YIDLLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
.:: : :: :::.:::.:.::.:: ::::.: .:::.:::: :::::..: .:. ::.
XP_016 NFKKSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFA
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 CIPPRYKLCVIPRS
.:: :.:: ::
XP_016 SVPPFYQLCFIPV
480 490
>>NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isoform a (490 aa)
initn: 1938 init1: 1583 opt: 1938 Z-score: 2309.4 bits: 436.8 E(85289): 6.8e-122
Smith-Waterman score: 1938; 56.9% identity (82.1% similar) in 485 aa overlap (8-491:5-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
:.:.. .:.:: :.::: .::::: :::::::..:...:.: :::: .
NP_000 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLPAFH-AHRDRGIIFNNG
.. .:::::.: : . .::.:::.::::::.: .::::::. : . . ::: .::
NP_000 SKVYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
::.:::::::::::.::::.. :.:.:.::: :.: ::::...: ::::..:::::::
NP_000 KRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
: ...:.:.:::.:..:: :: :::::..:..::.:. :::: .. .::.: ::.:::
NP_000 ICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
: .. :. :.::::. ::: : :::. ::.:..::.:: . . ....... :::::: :
NP_000 ALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
::::::::::::::.:.:.::. :..::::.::: : : ..::..::: :::::::::
NP_000 GTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
. :::...:: .: :: ::.:::::::... : :::.:..:::.:. : : :::..::
NP_000 YSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
.:: :::: :::.:::.:::::::: ::::.: .:::.:::: . : :... . . :.
NP_000 NFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIV
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 CIPPRYKLCVIPRS
.:: :..: ::
NP_000 SLPPSYQICFIPV
480 490
>>NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 1699 init1: 1583 opt: 1694 Z-score: 2019.6 bits: 382.9 E(85289): 9.4e-106
Smith-Waterman score: 1694; 57.9% identity (82.7% similar) in 416 aa overlap (77-491:4-419)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 QLELKNIPKSFTRLAQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLPAF
.::.:::.::::::.: .::::::. :
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPIS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 H-AHRDRGIIFNNGPAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQP
. . ::: .:: ::.:::::::::::.::::.. :.:.:.::: :.: ::::...:
NP_001 QRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FDPTFLIGCAPCNVIADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFL
::::..:::::::: ...:.:.:::.:..:: :: :::::..:..::.:. :::: ..
NP_001 CDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 HYLPGSHRKVIKNVAEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYT
.::.: ::.:::: .. :. :.::::. ::: : :::. ::.:..::.:: . . ..
NP_001 DCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 MDGITVTVADLFFAGTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQ
..... :::::: :::::::::::::::.:.:.::. :..::::.::: : : ..::.
NP_001 IENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRS
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 EMPYMDAVVHEIQRFITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPD
.::: :::::::::. :::...:: .: :: ::.:::::::... : :::.:..:::.
NP_001 HMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPN
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 PEKFKPEHFLNENGKFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVD
:. : : :::..::.:: :::: :::.:::.:::::::: ::::.: .:::.:::: . :
NP_001 PNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDD
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE5 PKDIDLSPIHIGFGCIPPRYKLCVIPRS
:... . . :. .:: :..: ::
NP_001 LKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 1699 init1: 1583 opt: 1694 Z-score: 2019.6 bits: 382.9 E(85289): 9.4e-106
Smith-Waterman score: 1694; 57.9% identity (82.7% similar) in 416 aa overlap (77-491:4-419)
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 QLELKNIPKSFTRLAQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLPAF
.::.:::.::::::.: .::::::. :
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPIS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 H-AHRDRGIIFNNGPAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQP
. . ::: .:: ::.:::::::::::.::::.. :.:.:.::: :.: ::::...:
NP_001 QRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FDPTFLIGCAPCNVIADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFL
::::..:::::::: ...:.:.:::.:..:: :: :::::..:..::.:. :::: ..
NP_001 CDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 HYLPGSHRKVIKNVAEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYT
.::.: ::.:::: .. :. :.::::. ::: : :::. ::.:..::.:: . . ..
NP_001 DCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 MDGITVTVADLFFAGTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQ
..... :::::: :::::::::::::::.:.:.::. :..::::.::: : : ..::.
NP_001 IENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRS
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 EMPYMDAVVHEIQRFITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPD
.::: :::::::::. :::...:: .: :: ::.:::::::... : :::.:..:::.
NP_001 HMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPN
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 PEKFKPEHFLNENGKFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVD
:. : : :::..::.:: :::: :::.:::.:::::::: ::::.: .:::.:::: . :
NP_001 PNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDD
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE5 PKDIDLSPIHIGFGCIPPRYKLCVIPRS
:... . . :. .:: :..: ::
NP_001 LKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precursor (491 aa)
initn: 1654 init1: 1383 opt: 1671 Z-score: 1991.2 bits: 377.9 E(85289): 3.6e-104
Smith-Waterman score: 1671; 47.7% identity (78.5% similar) in 493 aa overlap (1-492:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
:....... ::. : ::... . ... .::::: :: :.:::. : ... :.:.:
NP_000 MDSISTAILLLLLALVCLLLTL--SSRDKGKLPPGPRPLSILGNLLLLCSQDMLTSLTKL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLPAFHAH-RDRGIIFNNG
....: ..:...: .:.::. ::.::::::.: .::::::: ::: . :: :..:
NP_000 SKEYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEALVDQGEEFSGRGDYPAFFNFTKGNGIAFSSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 PAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
:: .:.::. :::.::::.. : :: .:. ::: ::::.:.::::::... . :.
NP_000 DRWKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILEEGSFLLAELRKTEGEPFDPTFVLSRSVSNI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
: ..:: ..:::.::..: .. :.:.::...:.:: .::. :::.: ..:: :.....:
NP_000 ICSVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQIMSSPWGELYDIFPSLLDWVPGPHQRIFQNF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
... ... :..:. :::: :::. .:.:..: .::.. . :: . .:. .:.:.
NP_000 KCLRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCFLTKMAEEKEDPLSHFHMDTLLMTTHNLLFG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
::.:.::::....: :::::... ...:::: :.: .:.::.::: ::: :::.::.::
NP_000 GTKTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEIDLVVGRARLPALKDRAAMPYTDAVIHEVQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
: ..: ::::..:::: :::.:::::: :. :..: :: ..: :..:.:::::. :
NP_000 FADIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDVITLLNTVHYDPSQFLTPQEFNPEHFLDANQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
.:: : : :::.:.:.: ::.::: :::: : :::: :.:.:: :.::::.:. :.:
NP_000 SFKKSPAFMPFSAGRRLCLGESLARMELFLYLTAILQSFSLQPLGAPEDIDLTPLSSGLG
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE5 CIPPRYKLCVIPRS
.: ..::. ::
NP_000 NLPRPFQLCLRPR
480 490
>>XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome P450 (566 aa)
initn: 1654 init1: 1383 opt: 1671 Z-score: 1990.3 bits: 377.9 E(85289): 4e-104
Smith-Waterman score: 1671; 47.7% identity (78.5% similar) in 493 aa overlap (1-492:76-566)
10 20 30
pF1KE5 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSW
:....... ::. : ::... . ...
XP_016 REGKSQGRWKGGISDVLSHFALHTPAAAFTMDSISTAILLLLLALVCLLLTL--SSRDKG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 NLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRLAQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEAL
.::::: :: :.:::. : ... :.:.:....: ..:...: .:.::. ::.::::::
XP_016 KLPPGPRPLSILGNLLLLCSQDMLTSLTKLSKEYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEAL
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140
pF1KE5 LDYKDEFSGRGDLPAFHAH-RDRGIIFNNGPAWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQR
.: .::::::: ::: . :: :..: :: .:.::. :::.::::.. : :: .
XP_016 VDQGEEFSGRGDYPAFFNFTKGNGIAFSSGDRWKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILE
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 EAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNVIADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHL
:. ::: ::::.:.::::::... . :.: ..:: ..:::.::..: .. :.:.::..
XP_016 EGSFLLAELRKTEGEPFDPTFVLSRSVSNIICSVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQI
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 LSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNVAEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCL
.:.:: .::. :::.: ..:: :.....: ... ... :..:. :::: :::. .:.
XP_016 MSSPWGELYDIFPSLLDWVPGPHQRIFQNFKCLRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCF
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 LVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFAGTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEI
:..: .::.. . :: . .:. .:.:.::.:.::::....: :::::... ...:::
XP_016 LTKMAEEKEDPLSHFHMDTLLMTTHNLLFGGTKTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEI
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 DRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQRFITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVV
: :.: .:.::.::: ::: :::.::.::: ..: ::::..:::: :::.:::::: :
XP_016 DLVVGRARLPALKDRAAMPYTDAVIHEVQRFADIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDV
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 VPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENGKFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARTELFL
. :..: :: ..: :..:.:::::. : .:: : : :::.:.:.: ::.::: ::::
XP_016 ITLLNTVHYDPSQFLTPQEFNPEHFLDANQSFKKSPAFMPFSAGRRLCLGESLARMELFL
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490
pF1KE5 LLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFGCIPPRYKLCVIPRS
: :::: :.:.:: :.::::.:. :.: .: ..::. ::
XP_016 YLTAILQSFSLQPLGAPEDIDLTPLSSGLGNLPRPFQLCLRPR
530 540 550 560
493 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:36:59 2016 done: Tue Nov 8 05:37:00 2016
Total Scan time: 7.380 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]