Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5658
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5658, 489 aa
1>>>pF1KE5658 489 - 489 aa - 489 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9179+/-0.000971; mu= 11.3707+/- 0.059
mean_var=118.3089+/-23.897, 0's: 0 Z-trim(109.4): 19 B-trim: 169 in 1/51
Lambda= 0.117914
statistics sampled from 10860 (10868) to 10860 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 ( 489) 3252 564.3 1.1e-160
CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 328) 1380 245.7 5.6e-65
CCDS43683.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 525) 1380 245.8 8.3e-65
CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 ( 569) 1380 245.9 8.8e-65
CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 331) 1294 231.1 1.4e-60
CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 299) 1275 227.8 1.2e-59
CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 ( 340) 1009 182.6 5.8e-46
>>CCDS2424.1 PRKAG3 gene_id:53632|Hs108|chr2 (489 aa)
initn: 3252 init1: 3252 opt: 3252 Z-score: 2998.5 bits: 564.3 E(32554): 1.1e-160
Smith-Waterman score: 3252; 99.8% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MEPGLEHALRRTPSWSSLGGSEHQEMSFLEQENSSSWPSPAVTSSSERIRGKRRAKALRW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 TRQKSVEEGEPPGQGEGPRSRPAAESTGLEATFPKTTPLAQADPAGVGTPPTGWDCLPSD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 CTASAAGSSTDDVELATEFPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS24 AQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANGVRAAPLWDSKKQSFVGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 IKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLS
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PAGIDALGA
:::::::::
CCDS24 PAGIDALGA
>>CCDS47752.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (328 aa)
initn: 1372 init1: 1372 opt: 1380 Z-score: 1280.0 bits: 245.7 E(32554): 5.6e-65
Smith-Waterman score: 1380; 63.0% identity (88.9% similar) in 316 aa overlap (169-483:4-319)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDE-LRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAM
:: ..:: .. . .:::::. : ::: .
CCDS47 MLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIV
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 ATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSP
::::::.::: :..::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: .:::::.::
CCDS47 PTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSP
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 LVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGN
.:::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.:::
CCDS47 MVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGN
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 VLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVD
.:.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::.
CCDS47 ALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVE
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 RRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPH
::.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:.
CCDS47 RRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKL
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480
pF1KE5 ESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA
: : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.:::
CCDS47 EILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
280 290 300 310 320
>>CCDS43683.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (525 aa)
initn: 1372 init1: 1372 opt: 1380 Z-score: 1277.0 bits: 245.8 E(32554): 8.3e-65
Smith-Waterman score: 1380; 63.0% identity (88.9% similar) in 316 aa overlap (169-483:201-516)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDE-LRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAM
:: ..:: .. . .:::::. : ::: .
CCDS43 PPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIV
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 ATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSP
::::::.::: :..::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: .:::::.::
CCDS43 PTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSP
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 LVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGN
.:::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.:::
CCDS43 MVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGN
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 VLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVD
.:.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::.
CCDS43 ALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVE
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 RRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPH
::.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:.
CCDS43 RRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKL
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
pF1KE5 ESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA
: : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.:::
CCDS43 EILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
480 490 500 510 520
>>CCDS5928.1 PRKAG2 gene_id:51422|Hs108|chr7 (569 aa)
initn: 1372 init1: 1372 opt: 1380 Z-score: 1276.5 bits: 245.9 E(32554): 8.8e-65
Smith-Waterman score: 1380; 63.0% identity (88.9% similar) in 316 aa overlap (169-483:245-560)
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 FPATEAWECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDE-LRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAM
:: ..:: .. . .:::::. : ::: .
CCDS59 PPLASPTHYAPSKAAALAAALGPAEAGMLEKLEFEDEAVEDSESGVYMRFMRSHKCYDIV
220 230 240 250 260 270
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 ATSSKLVIFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSP
::::::.::: :..::::::::::.:::::::.:::::::::::::::: .:::::.::
CCDS59 PTSSKLVVFDTTLQVKKAFFALVANGVRAAPLWESKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSP
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 LVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGN
.:::::.:.::::::::.::: :::::.:::. :::.:::.::::.::::::.::.:::
CCDS59 MVQIYELEEHKIETWRELYLQETFKPLVNISPDASLFDAVYSLIKNKIHRLPVIDPISGN
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 VLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVD
.:.::::::.::::..: : .:.:.:. .....:::::....: . .::. ::.:::.
CCDS59 ALYILTHKRILKFLQLFMSDMPKPAFMKQNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIKALNIFVE
400 410 420 430 440 450
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 RRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPH
::.::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::..: .::..:. .:::..:.
CCDS59 RRISALPVVDESGKVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDITVTQALQHRSQYFEGVVKCNKL
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470 480
pF1KE5 ESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA
: : ..:::.: .:::::.:.:.. ..:..:::::::::.:.:::
CCDS59 EILETIVDRIVRAEVHRLVVVNEADSIVGIISLSDILQALILTPAGAKQKETETE
520 530 540 550 560
>>CCDS8777.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (331 aa)
initn: 1326 init1: 1283 opt: 1294 Z-score: 1200.9 bits: 231.1 E(32554): 1.4e-60
Smith-Waterman score: 1294; 63.1% identity (86.6% similar) in 306 aa overlap (175-480:20-325)
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 WECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLV
: . . ..: ::. : ::: . ::::::
CCDS87 METVISSDSSPAVENEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLV
10 20 30 40
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 IFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEI
.::: :..::::::::.:.:::::::::::::::::::::::: .:::::.: ::::::.
CCDS87 VFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYEL
50 60 70 80 90 100
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 EQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTH
:.::::::::.::: ::::: :::: :::.:: .::.:.::::::.:: :::.:.::::
CCDS87 EEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTH
110 120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 KRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVDRRVSALP
::.::::..: . .:.: :. .....: :::. ..:.: :.:. .:: :::..::::::
CCDS87 KRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALP
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 VVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVI
::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::.:: .::..:. .::::.: ::.: .:
CCDS87 VVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETII
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480
pF1KE5 DRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA
.:... .:::::.:::.. . :.::::::::::::.
CCDS87 NRLVEAEVHRLVVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP
290 300 310 320 330
>>CCDS55824.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1301 init1: 1258 opt: 1275 Z-score: 1184.0 bits: 227.8 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 1275; 64.8% identity (88.1% similar) in 293 aa overlap (188-480:1-293)
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 ALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLVIFDTMLEIKKAFF
:. : ::: . ::::::.::: :..:::::
CCDS55 MKSHRCYDLIPTSSKLVVFDTSLQVKKAFF
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 ALVANSVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFILVLHRYYRSPLVQIYEIEQHKIETWREIYL
:::.:.:::::::::::::::::::::::: .:::::.: ::::::.:.::::::::.::
CCDS55 ALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVGMLTITDFINILHRYYKSALVQIYELEEHKIETWREVYL
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 QGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVSGNVLHILTHKRLLKFLHIFGSL
: ::::: :::: :::.:: .::.:.::::::.:: :::.:.::::::.::::..: .
CCDS55 QDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPESGNTLYILTHKRILKFLKLFITE
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 LPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIFVDRRVSALPVVNECGQVVGLYS
.:.: :. .....: :::. ..:.: :.:. .:: :::..::::::::.: :.:: .::
CCDS55 FPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIFVQHRVSALPVVDEKGRVVDIYS
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQPHESLGEVIDRIAREQVHRLVL
.::::.:::..:::.::.:: .::..:. .::::.: ::.: .:.:... .:::::.
CCDS55 KFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCYLHETLETIINRLVEAEVHRLVV
220 230 240 250 260 270
460 470 480
pF1KE5 VDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA
:::.. . :.::::::::::::.
CCDS55 VDENDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP
280 290
>>CCDS55825.1 PRKAG1 gene_id:5571|Hs108|chr12 (340 aa)
initn: 1322 init1: 1008 opt: 1009 Z-score: 938.7 bits: 182.6 E(32554): 5.8e-46
Smith-Waterman score: 1266; 61.3% identity (84.1% similar) in 315 aa overlap (175-480:20-334)
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 WECELEGLLEERPALCLSPQAPFPKLGWDDELRKPGAQIYMRFMQEHTCYDAMATSSKLV
: . . ..: ::. : ::: . ::::::
CCDS55 METVISSDSSPAVENEHPQETPESNNSVYTSFMKSHRCYDLIPTSSKLV
10 20 30 40
210 220 230 240 250
pF1KE5 IFDTMLEIKKAFFALVANSVRAAPLWDSKKQSFV---------GMLTITDFILVLHRYYR
.::: :..::::::::.:.::::::::::::::: ::::::::: .:::::.
CCDS55 VFDTSLQVKKAFFALVTNGVRAAPLWDSKKQSFVVLRALSCPLGMLTITDFINILHRYYK
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KE5 SPLVQIYEIEQHKIETWREIYLQGCFKPLVSISPNDSLFEAVYTLIKNRIHRLPVLDPVS
: ::::::.:.::::::::.::: ::::: :::: :::.:: .::.:.::::::.:: :
CCDS55 SALVQIYELEEHKIETWREVYLQDSFKPLVCISPNASLFDAVSSLIRNKIHRLPVIDPES
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KE5 GNVLHILTHKRLLKFLHIFGSLLPRPSFLYRTIQDLGIGTFRDLAVVLETAPILTALDIF
::.:.::::::.::::..: . .:.: :. .....: :::. ..:.: :.:. .:: ::
CCDS55 GNTLYILTHKRILKFLKLFITEFPKPEFMSKSLEELQIGTYANIAMVRTTTPVYVALGIF
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 VDRRVSALPVVNECGQVVGLYSRFDVIHLAAQQTYNHLDMSVGEALRQRTLCLEGVLSCQ
:..::::::::.: :.:: .::.::::.:::..:::.::.:: .::..:. .::::.:
CCDS55 VQHRVSALPVVDEKGRVVDIYSKFDVINLAAEKTYNNLDVSVTKALQHRSHYFEGVLKCY
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480
pF1KE5 PHESLGEVIDRIAREQVHRLVLVDETQHLLGVVSLSDILQALVLSPAGIDALGA
::.: .:.:... .:::::.:::.. . :.::::::::::::.
CCDS55 LHETLETIINRLVEAEVHRLVVVDENDVVKGIVSLSDILQALVLTGGEKKP
290 300 310 320 330 340
489 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:36:20 2016 done: Tue Nov 8 05:36:20 2016
Total Scan time: 2.910 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]